214 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_0027 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_0027  MMPL domain protein  100 
 
 		 352 aa  684    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.232375 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0519  MMPL  47.29 
 
 		 674 aa  206  4e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0531  MMPL domain-containing protein  47.29 
 
 		 674 aa  206  4e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0509  MMPL domain-containing protein  46.9 
 
 		 674 aa  204  2e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.10227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0224  MMPL domain-containing protein  47.99 
 
 		 678 aa  204  2e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.525426  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0683  MMPL domain-containing protein  50.2 
 
 		 679 aa  187  3e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.316421 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3129  MMPL domain-containing protein  40.99 
 
 		 707 aa  167  2e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3333  MMPL domain protein  45.26 
 
 		 686 aa  162  1e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0169676  normal  0.526199 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01110  predicted RND superfamily drug exporter  42.03 
 
 		 711 aa  154  2.9999999999999998e-36  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0967  MMPL domain protein  49.18 
 
 		 576 aa  148  1.0000000000000001e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.100325 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7115  MMPL domain-containing protein  37.5 
 
 		 699 aa  147  3e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.910736  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4241  MMPL domain protein  37.88 
 
 		 709 aa  147  4.0000000000000006e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.682094  normal  0.157718 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3356  MMPL domain-containing protein  40.65 
 
 		 708 aa  142  6e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0136207 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4493  MMPL domain protein  39.1 
 
 		 358 aa  135  9e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.617386  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0114  MMPL domain-containing protein  38.83 
 
 		 673 aa  131  2.0000000000000002e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37330  predicted RND superfamily drug exporter  37.1 
 
 		 699 aa  130  3e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.366571 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3628  MMPL domain protein  32.27 
 
 		 737 aa  128  2.0000000000000002e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0905  MMPL domain protein  36.15 
 
 		 713 aa  125  2e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3812  MMPL domain-containing protein  32.27 
 
 		 753 aa  124  3e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.443864  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0225  MMPL domain-containing protein  35.2 
 
 		 745 aa  122  9.999999999999999e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.196903  normal  0.86442 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3120  MMPL domain-containing protein  36.19 
 
 		 699 aa  115  1.0000000000000001e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.184679  hitchhiker  0.00179324 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2997  hypothetical protein  31.75 
 
 		 777 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2920  MMPL domain-containing protein  36.33 
 
 		 706 aa  114  3e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2330  MMPL domain protein  29.23 
 
 		 730 aa  112  8.000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.949575  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4975  MMPL domain protein  36.79 
 
 		 682 aa  109  7.000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2627  MMPL domain protein  32.97 
 
 		 701 aa  107  2e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.606801  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15430  predicted RND superfamily drug exporter  34.32 
 
 		 775 aa  102  7e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.246156  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3419  MMPL domain-containing protein  33.75 
 
 		 714 aa  99.4  8e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.825697 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0347  MMPL domain-containing protein  34.09 
 
 		 713 aa  99  1e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.553023  normal  0.0108424 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0335  MMPL domain protein  32.06 
 
 		 702 aa  98.2  2e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.114406 
 
 
-
 
NC_002936  DET0872  MmpL family membrane protein  29.89 
 
 		 981 aa  97.1  4e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0881306  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_775  membrane protein, MmpL family  28.62 
 
 		 974 aa  95.9  1e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2666  MMPL  47.58 
 
 		 778 aa  94.7  2e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.1973 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2251  MMPL domain-containing protein  32.86 
 
 		 702 aa  95.1  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0500894  decreased coverage  0.00962037 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6559  drug exporter of the RND superfamily-like protein  40.85 
 
 		 812 aa  93.6  5e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00116362 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3618  MMPL domain-containing protein  30.75 
 
 		 712 aa  91.7  2e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15430  predicted RND superfamily drug exporter  31.15 
 
 		 733 aa  89  1e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.023361  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2105  MMPL domain protein  33.22 
 
 		 762 aa  88.6  1e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.174165  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0091  MMPL domain protein  31.41 
 
 		 712 aa  85.9  9e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0263056  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3796  MMPL domain-containing protein  33.09 
 
 		 714 aa  85.9  0.000000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0152473 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1049  MMPL domain protein  26.42 
 
 		 723 aa  84  0.000000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.700963  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1512  MMPL domain-containing protein  25.5 
 
 		 713 aa  82.8  0.000000000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.625812  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0790  MMPL domain-containing protein  27.78 
 
 		 974 aa  80.5  0.00000000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18860  predicted RND superfamily drug exporter  32.32 
 
 		 764 aa  79.7  0.00000000000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.697244  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9047  drug exporter of the RND superfamily-like protein  30.04 
 
 		 697 aa  79.3  0.00000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4418  transport protein  27.56 
 
 		 948 aa  78.6  0.0000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.063936  normal  0.179465 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0066  MMPL domain protein  27.73 
 
 		 882 aa  77.4  0.0000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.82197  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1936  transport protein  30.69 
 
 		 941 aa  77  0.0000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5187  MMPL domain protein  28.24 
 
 		 780 aa  76.6  0.0000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4632  MMPL domain-containing protein  29.27 
 
 		 681 aa  76.6  0.0000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.839502 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0312  MMPL domain-containing protein  28.96 
 
 		 1028 aa  76.3  0.0000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4841  MMPL  27.91 
 
 		 1022 aa  75.5  0.000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0784394  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4929  MMPL domain-containing protein  27.91 
 
 		 1022 aa  75.5  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.559096  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4247  MMPL domain-containing protein  31.13 
 
 		 726 aa  74.3  0.000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0552437  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2705  transport protein  27.05 
 
 		 957 aa  74.3  0.000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.899884 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4595  MMPL domain-containing protein  28.53 
 
 		 1040 aa  73.9  0.000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10518  transmembrane transport protein mmpL2  26.77 
 
 		 968 aa  72.8  0.000000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.930398 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2637  MMPL domain protein  26.6 
 
 		 1013 aa  71.6  0.00000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12363  transmembrane transport protein mmpL9  25.25 
 
 		 962 aa  71.6  0.00000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10456  transmembrane transport protein mmpL4  24.05 
 
 		 967 aa  70.9  0.00000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2424  membrane protein, MmpL family  42.22 
 
 		 743 aa  70.5  0.00000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.693163 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2177  MmpL family membrane protein  42.22 
 
 		 743 aa  70.9  0.00000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000358784  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2163  MmpL family integral membrane protein  42.22 
 
 		 743 aa  70.9  0.00000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.605092  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2442  MmpL family membrane protein  42.22 
 
 		 743 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.181468  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2243  MmpL family membrane protein  42.22 
 
 		 743 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2407  MmpL family membrane protein  42.22 
 
 		 743 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.874429  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5599  MMPL  24.91 
 
 		 945 aa  69.3  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_6000  MMPL domain-containing protein  24.91 
 
 		 945 aa  69.3  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000163798 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3833  transport protein  27.94 
 
 		 944 aa  68.9  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3435  transport protein  23.3 
 
 		 968 aa  69.3  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.541306  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2507  membrane protein, MmpL family  42.22 
 
 		 743 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.387064  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10690  transmembrane transport protein mmpL5  29.52 
 
 		 964 aa  68.6  0.0000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2220  MMPL domain-containing protein  29.84 
 
 		 743 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.243308  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2958  membrane protein, MmpL family  41.48 
 
 		 743 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000505534 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3189  transport protein  25.48 
 
 		 968 aa  68.2  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.172033 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2374  membrane protein, MmpL family  41.48 
 
 		 743 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11207  transmembrane transport protein mmpL10  29.41 
 
 		 1002 aa  66.6  0.0000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0269  MMPL domain protein  40.65 
 
 		 700 aa  66.2  0.0000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1508  MMPL domain-containing protein  33.86 
 
 		 704 aa  64.7  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.765397  normal  0.0844824 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5174  transport protein  23.58 
 
 		 968 aa  64.7  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.927661  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5263  transport protein  23.58 
 
 		 968 aa  64.7  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5555  transport protein  23.58 
 
 		 968 aa  64.7  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.188099  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10407  transmembrane transport protein mmpL1  30.54 
 
 		 958 aa  65.1  0.000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.665513  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0464  MmpL11  25.29 
 
 		 978 aa  62.8  0.000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.01751  normal  0.274602 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3564  MMPL domain protein  36.87 
 
 		 727 aa  62.4  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.643651 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3196  MMPL domain-containing protein  30.65 
 
 		 1049 aa  62  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4044  queuine tRNA-ribosyltransferase  27.49 
 
 		 1382 aa  61.6  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2900  MMPL domain-containing protein  27.56 
 
 		 1003 aa  62  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.689966  normal  0.0696558 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0580  putative transporter  24.88 
 
 		 1109 aa  60.1  0.00000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0665985  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0246  transport protein  26.17 
 
 		 998 aa  59.7  0.00000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.792517  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3401  transport protein  29.06 
 
 		 955 aa  59.7  0.00000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.057109  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2163  MMPL domain-containing protein  27.27 
 
 		 1013 aa  59.7  0.00000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0256  transport protein  26.17 
 
 		 998 aa  59.7  0.00000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.321706  decreased coverage  0.00659163 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3464  transport protein  29.06 
 
 		 955 aa  59.7  0.00000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0593599 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0236  transport protein  26.17 
 
 		 998 aa  59.7  0.00000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.414899  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3412  transport protein  29.06 
 
 		 955 aa  59.7  0.00000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0674616  normal  0.562796 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1297  hypothetical protein  28.3 
 
 		 380 aa  59.7  0.00000008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1057  transport protein  24.92 
 
 		 963 aa  58.9  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3029  transport protein  25.3 
 
 		 959 aa  58.9  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1791  MMPL domain protein  32.07 
 
 		 750 aa  58.5  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0350577  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>