More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hore_04810 on replicon NC_011899
Organism: Halothermothrix orenii H 168



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011899  Hore_04810  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
423 aa  839    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.332463  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1726  major facilitator transporter  39.38 
 
 
421 aa  310  2.9999999999999997e-83  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1785  major facilitator transporter  39.9 
 
 
422 aa  310  4e-83  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00132489  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1145  major facilitator transporter  39.86 
 
 
436 aa  295  9e-79  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.667647  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0530  major facilitator superfamily MFS_1  36.98 
 
 
443 aa  282  8.000000000000001e-75  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43281  MFS family transporter: sugar  38.7 
 
 
488 aa  275  1.0000000000000001e-72  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.210537  normal  0.0304903 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43351  MFS family transporter: sugar  33.49 
 
 
444 aa  228  1e-58  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43234  MFS family transporter: metabolite  33.49 
 
 
444 aa  228  1e-58  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.104794 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44298  predicted protein  30.9 
 
 
1736 aa  196  6e-49  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_32014  predicted protein  28.79 
 
 
467 aa  171  2e-41  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1109  major facilitator transporter  26.38 
 
 
426 aa  155  2e-36  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4054  major facilitator transporter  24.03 
 
 
437 aa  139  7e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0519542 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2242  major facilitator transporter  24.14 
 
 
432 aa  135  1.9999999999999998e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2382  major facilitator transporter  28.57 
 
 
466 aa  134  3.9999999999999996e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.321963  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3971  major facilitator transporter  26.14 
 
 
475 aa  132  9e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0239086 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3590  major facilitator transporter  27.15 
 
 
474 aa  129  1.0000000000000001e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0293443  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0004  major facilitator transporter  26.72 
 
 
428 aa  106  6e-22  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.44219  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4101  major facilitator superfamily MFS_1  25 
 
 
426 aa  104  3e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1905  major facilitator transporter  27.3 
 
 
426 aa  102  1e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3989  major facilitator superfamily transporter  24.03 
 
 
426 aa  101  3e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4131  major facilitator superfamily MFS_1  23.79 
 
 
426 aa  100  5e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0903  major facilitator transporter  24.76 
 
 
440 aa  100  5e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0333563  normal  0.084831 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2215  major facilitator superfamily MFS_1  26.23 
 
 
413 aa  99.8  9e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0909109  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2012  major facilitator superfamily MFS_1  26.4 
 
 
413 aa  97.8  3e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000197881 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3250  major facilitator transporter  25.26 
 
 
433 aa  89.7  9e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.613026 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2122  major facilitator transporter  26.29 
 
 
461 aa  89  2e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4299  major facilitator transporter  25 
 
 
413 aa  88.6  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.881294  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1938  major facilitator transporter  22.33 
 
 
443 aa  88.2  3e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.829808  normal  0.641646 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5194  Permeases of the major facilitator superfamily  24.16 
 
 
436 aa  87.4  4e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2246  major facilitator superfamily MFS_1  26.7 
 
 
427 aa  86.7  7e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3566  major facilitator superfamily MFS_1  23.57 
 
 
422 aa  83.6  0.000000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.457003  normal  0.431414 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1834  major facilitator transporter  29.28 
 
 
418 aa  83.6  0.000000000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.711974  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1482  major facilitator superfamily MFS_1  25.7 
 
 
451 aa  83.2  0.000000000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000115751  n/a   
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0010  major facilitator family transporter  26.24 
 
 
471 aa  82.8  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3192  major facilitator transporter  26.24 
 
 
442 aa  82.8  0.00000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.010233 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3479  major facilitator transporter  28.52 
 
 
450 aa  82  0.00000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3221  major facilitator transporter  23.24 
 
 
416 aa  82  0.00000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00772282 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3497  major facilitator superfamily MFS_1  28.41 
 
 
398 aa  81.6  0.00000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0360  major facilitator transporter  26.47 
 
 
578 aa  81.6  0.00000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.826159 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2172  major facilitator transporter  24.46 
 
 
452 aa  81.6  0.00000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.072779 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3933  major facilitator transporter  30.34 
 
 
399 aa  80.9  0.00000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000233422  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2676  major facilitator superfamily MFS_1  26.49 
 
 
432 aa  80.9  0.00000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.164208  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0045  major facilitator transporter  21.19 
 
 
444 aa  80.9  0.00000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0327786  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4105  major facilitator family transporter  25.37 
 
 
479 aa  80.5  0.00000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1254  general substrate transporter  26.57 
 
 
449 aa  80.5  0.00000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2115  major facilitator transporter  26.44 
 
 
451 aa  80.5  0.00000000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.740368  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1653  major facilitator superfamily MFS_1  25.59 
 
 
392 aa  79.3  0.0000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0146262  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5178  major facilitator transporter  27.27 
 
 
457 aa  79.3  0.0000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1901  major facilitator superfamily MFS_1  23.14 
 
 
405 aa  79.3  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.209847  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5212  major facilitator transporter  28.5 
 
 
399 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000114177  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0227  major facilitator transporter  28.34 
 
 
438 aa  78.2  0.0000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.358089  normal  0.545029 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2913  major facilitator transporter  24.81 
 
 
454 aa  78.6  0.0000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1729  major facilitator transporter  23.34 
 
 
453 aa  78.2  0.0000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0313  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.65 
 
 
531 aa  77.4  0.0000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00303369  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3077  major facilitator transporter  25.57 
 
 
441 aa  77.8  0.0000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.163799  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0585  major facilitator transporter  26.91 
 
 
542 aa  77.4  0.0000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.895306  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1823  major facilitator transporter  24.22 
 
 
442 aa  77  0.0000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.112408  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4260  putative hydroxybenzoate transporter  25.31 
 
 
461 aa  77.4  0.0000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.932507 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1728  major facilitator transporter  23.85 
 
 
461 aa  76.6  0.0000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5547  major facilitator family transporter  29.95 
 
 
399 aa  76.6  0.0000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000869498  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5115  major facilitator family transporter  29.95 
 
 
399 aa  76.6  0.0000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000159613  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5599  major facilitator family transporter  29.41 
 
 
399 aa  76.6  0.0000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000105464  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02171  transport transmembrane protein  20.78 
 
 
448 aa  76.6  0.0000000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.115532  normal  0.0335477 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0434  major facilitator superfamily MFS_1  29.05 
 
 
446 aa  76.3  0.0000000000009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000104713  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5271  major facilitator family transporter  28.88 
 
 
399 aa  76.3  0.000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000222558  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5098  major facilitator family transporter  28.88 
 
 
399 aa  76.3  0.000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.20566e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1786  major facilitator family transporter  24.62 
 
 
428 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1616  major facilitator transporter  25.36 
 
 
432 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00456978  normal  0.253258 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5668  major facilitator family transporter  28.88 
 
 
399 aa  76.3  0.000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000000480591  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5543  major facilitator family transporter  28.88 
 
 
399 aa  76.3  0.000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000723204  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5513  major facilitator family transporter  28.88 
 
 
399 aa  76.3  0.000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5409  major facilitator family transporter  28.88 
 
 
399 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000725853  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1535  major facilitator transporter  29.89 
 
 
449 aa  75.5  0.000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1604  major facilitator family transporter  24.62 
 
 
445 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.797909  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1625  major facilitator family transporter  24.62 
 
 
445 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2862  major facilitator transporter  24.37 
 
 
448 aa  75.5  0.000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.114949  normal  0.0171068 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1479  major facilitator transporter  21.33 
 
 
405 aa  74.7  0.000000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.675029 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0670  general substrate transporter  23.23 
 
 
459 aa  74.3  0.000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.753041 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7588  major facilitator transporter  23.3 
 
 
490 aa  73.9  0.000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2493  major facilitator transporter  22.4 
 
 
465 aa  73.9  0.000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0270873  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1269  major facilitator superfamily MFS_1  26.41 
 
 
428 aa  73.9  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0508  major facilitator transporter  23.45 
 
 
438 aa  73.2  0.000000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0836573  normal  0.693468 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3455  major facilitator transporter  25.6 
 
 
430 aa  73.6  0.000000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4147  major facilitator transporter  25.23 
 
 
423 aa  73.6  0.000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.517871 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3528  major facilitator transporter  22.19 
 
 
468 aa  73.2  0.000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.168718 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1404  general substrate transporter  27.05 
 
 
428 aa  73.2  0.000000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5576  major facilitator family transporter  25 
 
 
432 aa  73.2  0.000000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1311  major facilitator transporter  26.44 
 
 
428 aa  72.4  0.00000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00188583  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3878  major facilitator transporter  26.14 
 
 
428 aa  72.8  0.00000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.957409 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3374  major facilitator superfamily MFS_1  31.94 
 
 
398 aa  72.8  0.00000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000527195  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3774  major facilitator transporter  25.31 
 
 
428 aa  72.8  0.00000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.108427 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1895  major facilitator transporter  24.21 
 
 
451 aa  72.8  0.00000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.004098  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3311  major facilitator transporter  21.07 
 
 
474 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.799238  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6357  major facilitator transporter  19.71 
 
 
441 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.673805  normal  0.425262 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3965  major facilitator transporter  22.17 
 
 
413 aa  72.4  0.00000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.748751  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4099  major facilitator transporter  26.75 
 
 
428 aa  72  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.594069  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2518  major facilitator transporter  26.06 
 
 
437 aa  72  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3291  major facilitator superfamily MFS_1  25.24 
 
 
430 aa  71.6  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2684  major facilitator family transporter  23.93 
 
 
429 aa  72  0.00000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1388  major facilitator family transporter  24.61 
 
 
398 aa  72  0.00000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>