More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_5150 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_5150  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  100 
 
 		 1124 aa  2293    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.910447  normal  0.74946 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0996  alpha amylase family protein  40.28 
 
 		 998 aa  658    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.621113  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1694  putative pullulanase  39.3 
 
 		 1429 aa  649    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3061  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  41.99 
 
 		 946 aa  645    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.57883  normal  0.116697 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0560  putative pullulanase precursor  39.3 
 
 		 1432 aa  649    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.594398  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1316  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  40.13 
 
 		 1440 aa  699    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0748066 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0096  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  42.19 
 
 		 891 aa  674    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.380747  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1413  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  43.76 
 
 		 1117 aa  731    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.960844 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3074  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  40.13 
 
 		 1440 aa  700    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000101349 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2488  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  44.77 
 
 		 1176 aa  718    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.331345 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3767  alpha-1,6-glucosidases, pullulanase-type  43.42 
 
 		 1025 aa  687    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001089  putative pullulanase precursor  43.81 
 
 		 1329 aa  798    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4105  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  46.52 
 
 		 1035 aa  795    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0287  alpha-1,6-glucosidases, pullulanase-type  41.14 
 
 		 1441 aa  726    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04828  pullulanase  43.37 
 
 		 1328 aa  788    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3338  Type II secretory pathway pullulanase PulA and related glycosidase-like protein  41.99 
 
 		 1942 aa  647    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0998506 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1941  alpha-1,6-glucosidases, pullulanase-type  36.9 
 
 		 1450 aa  627  1e-178  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01882  putative pullulanase  37.86 
 
 		 1472 aa  619  1e-175  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3513  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  40 
 
 		 1331 aa  607  9.999999999999999e-173  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0648874  normal  0.682211 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0747  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  40.21 
 
 		 1891 aa  602  1e-170  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2273  pullulanase  44.65 
 
 		 717 aa  598  1e-169  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06650  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  39.31 
 
 		 1248 aa  592  1e-167  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2329  Alpha-1,6-glucosidases, pullulanase-type  37.54 
 
 		 991 aa  586  1e-166  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0783894  normal  0.0180008 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2521  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  40.16 
 
 		 1975 aa  580  1e-164  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39745  predicted protein  38.39 
 
 		 1062 aa  573  1.0000000000000001e-162  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2712  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  39.49 
 
 		 2156 aa  575  1.0000000000000001e-162  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.971607  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28060  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  39.32 
 
 		 2068 aa  556  1e-157  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.329007  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1170  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  42.87 
 
 		 1855 aa  556  1e-157  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1522  pullulanase precursor  26.92 
 
 		 655 aa  241  5.999999999999999e-62  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0360874  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19550  pullulanase, type I  32.05 
 
 		 874 aa  226  2e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0609  pullulanase, type I  31.18 
 
 		 1136 aa  221  6e-56  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0177218  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0061  pullulanase, type I  27.59 
 
 		 899 aa  217  9.999999999999999e-55  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2304  pullulanase, type I  30.74 
 
 		 1043 aa  215  3.9999999999999995e-54  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2416  pullulanase, type I  31.68 
 
 		 856 aa  213  1e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00697767  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2542  pullulanase  33.56 
 
 		 852 aa  213  2e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.814075  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2463  pullulanase  33.56 
 
 		 850 aa  213  2e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.116162  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2728  pullulanase  33.56 
 
 		 852 aa  213  2e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00354349  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2737  putative pullulanase  33.56 
 
 		 852 aa  213  2e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.31165e-23 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2498  pullulanase  33.33 
 
 		 852 aa  211  8e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00309415  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1803  pullulanase, type I  29.4 
 
 		 655 aa  209  3e-52  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.248563  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2761  pullulanase, putative  32.72 
 
 		 848 aa  207  8e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00586404  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2741  putative pullulanase  33.33 
 
 		 852 aa  207  1e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0379063  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2552  putative pullulanase  32.26 
 
 		 852 aa  207  1e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000407246  decreased coverage  0.0000000000706623 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2786  pullulanase, type I  32.87 
 
 		 848 aa  206  1e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0751626  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2331  pullulanase, type I  31.16 
 
 		 647 aa  206  2e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0610  pullulanase, type I  37.03 
 
 		 1888 aa  206  2e-51  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13880  pullulanase, type I  28.41 
 
 		 640 aa  205  3e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0959  pullulanase, type I  30.45 
 
 		 843 aa  206  3e-51  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.557051  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0978  pullulanase, type I  29.22 
 
 		 843 aa  199  4.0000000000000005e-49  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.912818  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0459  pullulanase, type I  30.96 
 
 		 842 aa  195  5e-48  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.712908  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0057  pullulanase, type I  30.36 
 
 		 928 aa  193  1e-47  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1427  pullulanase, type I  29.84 
 
 		 841 aa  192  2.9999999999999997e-47  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.671793  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0681  pullulanase, type I  32.5 
 
 		 718 aa  192  4e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0448  pullulanase, type I  30.85 
 
 		 825 aa  185  5.0000000000000004e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1298  pullulanase, type I  26.63 
 
 		 669 aa  184  6e-45  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0421  pullulanase, type I  31.43 
 
 		 601 aa  177  7e-43  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1087  pullulanase family protein  28.43 
 
 		 2638 aa  176  1.9999999999999998e-42  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1558  pullulanase precursor  24.53 
 
 		 1064 aa  169  2.9999999999999998e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.430377  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0852  pullulanase, putative  29.53 
 
 		 766 aa  168  4e-40  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.865256  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1839  putative pullulanase  24.78 
 
 		 1064 aa  169  4e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0872  pullulanase, type I  25.69 
 
 		 640 aa  168  5.9999999999999996e-40  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3365  pullulanase, type I  29.72 
 
 		 712 aa  158  7e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4814  putative pullulanase  29.82 
 
 		 713 aa  156  2e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4837  putative pullulanase  30 
 
 		 713 aa  156  2e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.837132  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0422  putative pullulanase  30.08 
 
 		 713 aa  155  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4597  pullulanase  30.51 
 
 		 713 aa  155  5e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4953  pullulanase  30.51 
 
 		 713 aa  155  5e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4844  pullulanase, putative  30 
 
 		 713 aa  154  8e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4452  pullulanase  30.26 
 
 		 713 aa  154  8.999999999999999e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4434  pullulanase  30.26 
 
 		 713 aa  154  1e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4819  putative pullulanase  30.26 
 
 		 713 aa  154  1e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4533  pullulanase, type I  29.63 
 
 		 713 aa  152  3e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0868  pullulanase, extracellular  25.62 
 
 		 776 aa  137  9.999999999999999e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1216  pullulanase, putative  28.74 
 
 		 1252 aa  129  2.0000000000000002e-28  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0305928  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7550  glycogen debranching enzyme GlgX  27.01 
 
 		 702 aa  95.9  4e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.317676  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0805  glycogen debranching enzyme GlgX  27.15 
 
 		 693 aa  94.7  8e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6811  glycogen debranching enzyme GlgX  26.87 
 
 		 702 aa  93.6  2e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.37065 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0419  glycogen debranching enzyme GlgX  27.15 
 
 		 696 aa  91.7  7e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3439  glycogen debranching enzyme GlgX  26.52 
 
 		 708 aa  90.9  1e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000156565 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3070  glycogen debranching enzyme GlgX  25 
 
 		 686 aa  89.7  3e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0162429 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0822  glycogen debranching enzyme GlgX  26.59 
 
 		 706 aa  89  4e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2517  glycogen debranching enzyme  26.1 
 
 		 774 aa  88.6  6e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.467247 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3828  glycoside hydrolase family 13 protein  30.77 
 
 		 817 aa  86.7  0.000000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.535052 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0101  alpha-amylase family protein  23.36 
 
 		 714 aa  84.7  0.000000000000009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0681  glycogen debranching enzyme GlgX  24.44 
 
 		 700 aa  84  0.00000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2094  alpha amylase domain-containing protein  25.57 
 
 		 701 aa  83.6  0.00000000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.159475  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6067  glycogen debranching enzyme GlgX  27.9 
 
 		 701 aa  84  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0573704  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13761  putative isoamylase  23.55 
 
 		 689 aa  83.2  0.00000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1401  glycogen debranching protein GlgX  24.36 
 
 		 701 aa  82.8  0.00000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2956  glycogen debranching enzyme GlgX  22.3 
 
 		 697 aa  82.8  0.00000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.490165 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1074  glycogen debranching enzyme GlgX  25 
 
 		 711 aa  80.9  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.652944 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1740  glycogen debranching protein GlgX  25.2 
 
 		 706 aa  80.9  0.0000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.152679  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0086  isoamylase  24.68 
 
 		 694 aa  80.9  0.0000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05691  putative isoamylase  24.24 
 
 		 704 aa  81.3  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1885  glycogen debranching enzyme GlgX  25.85 
 
 		 727 aa  80.9  0.0000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1775  glycogen debranching enzyme GlgX  25.38 
 
 		 701 aa  80.1  0.0000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.318288  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0548  glycogen debranching enzyme GlgX  23.43 
 
 		 729 aa  80.5  0.0000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1045  glycogen debranching enzyme GlgX  25 
 
 		 711 aa  80.5  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0577  alpha amylase domain-containing protein  26.06 
 
 		 692 aa  79.7  0.0000000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5016  glycogen debranching enzyme GlgX  24.38 
 
 		 706 aa  79.7  0.0000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>