95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_1110 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_1110  phage shock protein C, PspC  100 
 
 
190 aa  378  1e-104  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000317198  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0522  phage shock protein C, PspC  37.97 
 
 
164 aa  89.7  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.854498  normal  0.422706 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4864  phage shock protein C, PspC  40.87 
 
 
184 aa  89  4e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0646459  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4670  phage shock protein C, PspC  36.88 
 
 
143 aa  82.4  0.000000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1926  phage shock protein C, PspC  38.28 
 
 
174 aa  80.1  0.00000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000470088  unclonable  0.00000000972351 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0912  phage shock protein C, PspC  40.2 
 
 
85 aa  76.6  0.0000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00715108 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1275  phage shock protein C, PspC  33.69 
 
 
169 aa  73.2  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0715782  normal  0.19244 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3130  phage shock protein C, PspC  33.33 
 
 
177 aa  71.2  0.000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2330  phage shock protein C, PspC  38.68 
 
 
92 aa  68.6  0.00000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.399837 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4462  phage shock protein C, PspC  56.14 
 
 
86 aa  65.9  0.0000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0822  stress-responsive transcriptional regulator  46.77 
 
 
95 aa  62.8  0.000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.55702  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1174  PspC domain-containing protein  46.77 
 
 
82 aa  62.8  0.000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.447328  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2420  phage shock protein C, PspC  53.45 
 
 
65 aa  60.8  0.00000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2350  phage shock protein C, PspC  52.63 
 
 
194 aa  60.5  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0579  hypothetical protein  45.9 
 
 
240 aa  60.5  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.702691  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2455  phage shock protein C, PspC  41.3 
 
 
81 aa  58.9  0.00000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.129612  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2822  phage shock protein C, PspC  50 
 
 
97 aa  57.8  0.00000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1000  phage shock protein C, PspC  46.03 
 
 
64 aa  57.8  0.00000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.290499 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2935  phage shock protein C, PspC  48.21 
 
 
71 aa  57  0.0000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000000394883  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2855  putative stress-responsive transcriptional regulator  45.45 
 
 
86 aa  55.5  0.0000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2157  phage shock protein C, PspC  28.89 
 
 
138 aa  55.5  0.0000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0661  phage shock protein C, PspC  43.33 
 
 
119 aa  54.7  0.0000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1233  phage shock protein C, PspC  39.66 
 
 
152 aa  54.3  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.233266  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4222  phage shock protein C, PspC  42.11 
 
 
103 aa  53.9  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.155341  normal  0.0141639 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3608  PspC domain-containing protein  47.54 
 
 
419 aa  53.5  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4438  putative signal transduction histidine kinase  39.19 
 
 
394 aa  52.8  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.175729  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1319  phage shock protein C, PspC  44.83 
 
 
165 aa  52.8  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1273  phage shock protein C, PspC  42.11 
 
 
58 aa  53.1  0.000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000116909  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4227  putative signal transduction histidine kinase  41.67 
 
 
394 aa  52.4  0.000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1254  putative signal transduction histidine kinase  44.64 
 
 
458 aa  52  0.000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.473052  normal  0.219719 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4820  phage shock protein C, PspC  47.37 
 
 
66 aa  52  0.000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0660  phage shock protein C, PspC  46.67 
 
 
81 aa  51.6  0.000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.765283  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0914  putative signal transduction histidine kinase  42.31 
 
 
466 aa  51.6  0.000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3236  PspC domain protein  43.28 
 
 
129 aa  51.2  0.000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2032  phage shock protein C, PspC  43.86 
 
 
61 aa  51.2  0.000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.152024  normal  0.0853583 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4439  phage shock protein C, PspC  41.82 
 
 
306 aa  50.4  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.124889  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4632  hypothetical protein  38.98 
 
 
61 aa  50.1  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1660  phage shock protein C, PspC  46.43 
 
 
127 aa  50.1  0.00002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1770  putative stress-responsive transcriptional regulator  41.89 
 
 
427 aa  49.7  0.00002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4630  hypothetical protein  38.98 
 
 
61 aa  50.1  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1775  putative stress-responsive transcriptional regulator, PspC  41.94 
 
 
70 aa  50.4  0.00002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.218822  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0072  phage shock protein C, PspC  41.67 
 
 
161 aa  50.1  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5232  putative signal transduction histidine kinase  44.44 
 
 
400 aa  49.7  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0452492  hitchhiker  0.00276259 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3459  PspC domain protein  42.62 
 
 
244 aa  48.9  0.00004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0516361 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2743  phage shock protein C, PspC  31.11 
 
 
847 aa  48.9  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00338438  hitchhiker  0.000000294429 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4332  phage shock protein C, PspC  37.29 
 
 
61 aa  48.9  0.00005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0468  PspC domain protein  35.48 
 
 
515 aa  48.9  0.00005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3366  phage shock protein C  36.71 
 
 
127 aa  48.5  0.00005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4612  hypothetical protein  37.29 
 
 
61 aa  48.5  0.00005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0623  hypothetical protein  37.29 
 
 
61 aa  48.5  0.00005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.592118  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0196  phage shock protein C, PspC  28.75 
 
 
578 aa  48.5  0.00006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.695474  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2555  phage shock protein C, PspC  45.31 
 
 
67 aa  48.1  0.00007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2843  phage shock protein C, PspC  35.59 
 
 
68 aa  48.1  0.00007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000296758  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4239  stress-responsive transcriptional regulator PspC  37.29 
 
 
61 aa  48.1  0.00008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4399  hypothetical protein  37.29 
 
 
61 aa  48.1  0.00008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4251  stress-responsive transcriptional regulator  37.29 
 
 
61 aa  48.1  0.00008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1594  phage shock protein C, PspC  44.64 
 
 
127 aa  48.1  0.00008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4616  hypothetical protein  37.29 
 
 
61 aa  48.1  0.00008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4739  hypothetical protein  37.29 
 
 
61 aa  48.1  0.00008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1339  phage shock protein C, PspC  43.1 
 
 
62 aa  47.8  0.00009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00304001  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0588  hypothetical protein  42.19 
 
 
81 aa  47.8  0.0001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.108358  hitchhiker  0.00051768 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04810  signal transduction histidine kinase  35.71 
 
 
481 aa  47.8  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01260  putative stress-responsive transcriptional regulator  40.68 
 
 
140 aa  47.4  0.0001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3554  phage shock protein C, PspC  37.1 
 
 
77 aa  47.4  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.385576  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2312  phage shock protein C, PspC  36.51 
 
 
76 aa  46.6  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2882  phage shock protein C, PspC  44.64 
 
 
114 aa  46.6  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.390226 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1045  hypothetical protein  40.68 
 
 
79 aa  46.6  0.0002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1324  phage shock protein C, PspC  35.14 
 
 
107 aa  46.6  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1319  phage shock protein C, PspC  46.94 
 
 
74 aa  46.6  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0768012  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5725  putative signal transduction histidine kinase  48.15 
 
 
398 aa  46.2  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.333911  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3932  phage shock protein C, PspC  40.74 
 
 
96 aa  46.2  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.923929  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09558  hypothetical protein  33.33 
 
 
582 aa  45.4  0.0004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.501669  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0475  stress-responsive transcriptional regulator  40.35 
 
 
61 aa  45.4  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0436  phage shock protein C, PspC  34.18 
 
 
452 aa  45.8  0.0004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000000115043  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0585  phage shock protein C, PspC  46.3 
 
 
77 aa  45.4  0.0005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00837163  hitchhiker  0.00408687 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4996  phage shock protein C, PspC  43.55 
 
 
98 aa  45.1  0.0006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1158  phage shock protein C, PspC  37.5 
 
 
124 aa  45.1  0.0006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0450  phage shock protein C, PspC  40 
 
 
84 aa  44.7  0.0007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.902434  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3206  phage shock protein C, PspC  35.59 
 
 
61 aa  43.9  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.849771  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3002  phage shock protein C, PspC  27.59 
 
 
153 aa  43.9  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.681381  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1024  phage shock protein C, PspC  46.67 
 
 
233 aa  44.3  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01250  putative stress-responsive transcriptional regulator  40 
 
 
256 aa  44.3  0.001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1049  phage shock protein C, PspC  50 
 
 
105 aa  43.5  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.116328  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0367  phage shock protein C  37.93 
 
 
70 aa  43.1  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0047  phage shock protein C, PspC  36.21 
 
 
59 aa  43.5  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0280  hypothetical protein  41.67 
 
 
491 aa  43.1  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.274206  normal  0.0175316 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3205  phage shock protein C, PspC  40.74 
 
 
96 aa  43.5  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.236376 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1253  phage shock protein C, PspC  47.62 
 
 
464 aa  43.5  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.21534  normal  0.216039 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2047  putative stress-responsive transcriptional regulator  34.94 
 
 
87 aa  42.7  0.003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2778  PspC domain-containing protein  36.59 
 
 
77 aa  42.4  0.004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000150595  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4257  phage shock protein C, PspC  29.33 
 
 
847 aa  42  0.005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.198729 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21470  phage shock protein C, PspC  40 
 
 
140 aa  42  0.006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3000  phage shock protein C, PspC  40.82 
 
 
547 aa  41.2  0.008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3770  phage shock protein C  32.91 
 
 
150 aa  41.6  0.008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.289973  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0849  phage shock protein C, PspC  32.56 
 
 
147 aa  41.2  0.009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>