More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_2849 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_2849  hydrolase  100 
 
 		 206 aa  423  1e-117  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.391468  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2451  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  65.05 
 
 		 212 aa  290  8e-78  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1766  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  64.56 
 
 		 206 aa  287  1e-76  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00317051 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0937  HAD family hydrolase  67.33 
 
 		 206 aa  285  5e-76  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2069  HAD family hydrolase  64.18 
 
 		 212 aa  266  2e-70  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.827654  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2933  HAD family hydrolase  59.02 
 
 		 210 aa  261  4.999999999999999e-69  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.954117  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2784  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  58.62 
 
 		 208 aa  256  2e-67  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2242  phosphatases  37.81 
 
 		 256 aa  141  7e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1876  phosphatases  46 
 
 		 221 aa  139  3e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000282708  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1697  HAD family hydrolase  39.68 
 
 		 224 aa  123  2e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.264529  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0404  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  39.7 
 
 		 224 aa  122  3e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1666  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  34.81 
 
 		 236 aa  120  9.999999999999999e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.695428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0021  hydrolase  40.44 
 
 		 218 aa  119  3e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.993674  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2173  HAD family hydrolase  41.4 
 
 		 232 aa  115  3e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0277554  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0604  hydrolase  34.16 
 
 		 238 aa  111  6e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0148  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  34.22 
 
 		 247 aa  106  2e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0660196 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1900  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  34.01 
 
 		 221 aa  97.1  2e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.65867  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3854  phosphoglycolate phosphatase  47.83 
 
 		 252 aa  78.2  0.00000000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00525883  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03237  phosphoglycolate phosphatase  46.74 
 
 		 252 aa  77.4  0.0000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0328  phosphoglycolate phosphatase  46.74 
 
 		 252 aa  77.4  0.0000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3581  phosphoglycolate phosphatase  46.74 
 
 		 252 aa  77.4  0.0000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.284383  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4689  phosphoglycolate phosphatase  46.74 
 
 		 252 aa  77.4  0.0000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.663349  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03189  hypothetical protein  46.74 
 
 		 252 aa  77.4  0.0000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0328  phosphoglycolate phosphatase  46.74 
 
 		 252 aa  77.4  0.0000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.372389  normal  0.201922 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3762  phosphoglycolate phosphatase  46.74 
 
 		 252 aa  77.4  0.0000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.40481  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3661  phosphoglycolate phosphatase  46.74 
 
 		 252 aa  77  0.0000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.29844  normal  0.025681 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3788  phosphoglycolate phosphatase  44.57 
 
 		 252 aa  73.6  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3754  phosphoglycolate phosphatase  43.48 
 
 		 252 aa  70.9  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3681  phosphoglycolate phosphatase  43.48 
 
 		 252 aa  70.9  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.123155  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3679  phosphoglycolate phosphatase  43.48 
 
 		 252 aa  71.2  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.966867  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3850  phosphoglycolate phosphatase  43.48 
 
 		 252 aa  70.9  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0095  HAD family hydrolase  29.12 
 
 		 212 aa  69.3  0.00000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0416  phosphoglycolate phosphatase  32.98 
 
 		 272 aa  67.8  0.0000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0450  phosphoglycolate phosphatase  32.98 
 
 		 272 aa  67.4  0.0000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.416285 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2847  phosphoglycolate phosphatase  27.27 
 
 		 227 aa  67  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.212796  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2481  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  30.32 
 
 		 207 aa  67  0.0000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3246  phosphoglycolate phosphatase  27.27 
 
 		 227 aa  67  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.181824  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3798  phosphoglycolate phosphatase  40.22 
 
 		 253 aa  65.9  0.0000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0419361 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0447  phosphoglycolate phosphatase  32.09 
 
 		 272 aa  65.9  0.0000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.558752 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4786  phosphoglycolate phosphatase  32.09 
 
 		 272 aa  64.7  0.0000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.602175 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2449  HAD family hydrolase  26.32 
 
 		 217 aa  63.5  0.000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0190416  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00226  hypothetical phosphatase/phosphohexomutase  28.65 
 
 		 194 aa  62.8  0.000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3737  haloacid dehalogenase-like hydrolase  27.66 
 
 		 254 aa  62.4  0.000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43120  phosphoglycolate phosphatase, PGPase  27.04 
 
 		 291 aa  61.6  0.000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.691617  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4527  phosphoglycolate phosphatase  22.95 
 
 		 216 aa  61.6  0.000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0267  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  28.73 
 
 		 220 aa  60.8  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.583067  normal  0.103324 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0391  phosphoglycolate phosphatase  29.63 
 
 		 216 aa  61.2  0.00000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3998  phosphoglycolate phosphatase  31.22 
 
 		 226 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.739792  normal  0.543367 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0343  phosphoglycolate phosphatase  40.22 
 
 		 233 aa  60.5  0.00000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2575  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  28.57 
 
 		 197 aa  60.5  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0567  phosphoglycolate phosphatase  36.45 
 
 		 266 aa  59.7  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1730  phosphoglycolate phosphatase  36.46 
 
 		 238 aa  59.7  0.00000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2591  HAD family hydrolase  39.56 
 
 		 220 aa  59.7  0.00000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000123522  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0605  haloacid dehalogenase/epoxide hydrolase family protein  28.34 
 
 		 212 aa  59.7  0.00000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0457  phosphoglycolate phosphatase  36.46 
 
 		 227 aa  59.7  0.00000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1973  phosphoglycolate phosphatase  28.65 
 
 		 213 aa  59.3  0.00000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.662433 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0347  phosphoglycolate phosphatase  29.26 
 
 		 235 aa  58.9  0.00000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4525  phosphatase  26.49 
 
 		 208 aa  58.9  0.00000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0945  putative 2-phosphoglycolate phosphatase  27.32 
 
 		 226 aa  58.5  0.00000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2290  HAD family hydrolase  26.63 
 
 		 223 aa  58.5  0.00000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.783453  normal  0.134252 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0265  phosphoglycolate phosphatase  41.25 
 
 		 232 aa  58.2  0.00000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.210779  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2370  phosphoglycolate phosphatase  41.11 
 
 		 227 aa  57.4  0.0000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3699  phosphoglycolate phosphatase  37.5 
 
 		 226 aa  57.4  0.0000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3103  HAD family hydrolase  29.36 
 
 		 562 aa  58.2  0.0000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1187  phosphoglycolate phosphatase  27.47 
 
 		 218 aa  57.4  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00990405  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07930  phosphoglycolate phosphatase  29.26 
 
 		 272 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00282972 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1092  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  28.99 
 
 		 212 aa  57.8  0.0000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0752  phosphoglycolate phosphatase  28.72 
 
 		 272 aa  57  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1824  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1 family protein  24.19 
 
 		 213 aa  56.6  0.0000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0490965  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4610  phosphoglycolate phosphatase  36.63 
 
 		 272 aa  57  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0141  beta-phosphoglucomutase  21.35 
 
 		 214 aa  57.4  0.0000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2878  phosphoglycolate phosphatase  29.15 
 
 		 226 aa  57  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5953  phosphoglycolate phosphatase  36.19 
 
 		 257 aa  57  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0174691 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0460  phosphoglycolate phosphatase  26.6 
 
 		 229 aa  57.4  0.0000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0934432  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1483  HAD family hydrolase  27.81 
 
 		 224 aa  56.2  0.0000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0762089  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0927  HAD family hydrolase  25.37 
 
 		 210 aa  56.6  0.0000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03140  phosphoglycolate phosphatase  30.48 
 
 		 216 aa  56.2  0.0000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2007  HAD family hydrolase  38.05 
 
 		 222 aa  56.2  0.0000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0473  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  34.38 
 
 		 211 aa  56.6  0.0000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000148872  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4498  HAD-superfamily hydrolase subfamily IA, variant 3  25.58 
 
 		 223 aa  56.2  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.511661  normal  0.0143777 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1650  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1 family protein  23.66 
 
 		 213 aa  55.8  0.0000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1661  AHBA synthesis associated protein  36 
 
 		 214 aa  55.8  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.49792 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4055  phosphoglycolate phosphatase  40.91 
 
 		 234 aa  55.8  0.0000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0278697  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1543  HAD family hydrolase  26.67 
 
 		 218 aa  56.2  0.0000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.290377 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1517  HAD family hydrolase  29.67 
 
 		 216 aa  55.8  0.0000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0520  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  36.26 
 
 		 217 aa  55.8  0.0000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0673  HAD family hydrolase  22.99 
 
 		 211 aa  55.5  0.0000005  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10830  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  27.55 
 
 		 296 aa  55.5  0.0000005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3878  phosphoglycolate phosphatase  40.91 
 
 		 234 aa  55.1  0.0000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46650  phosphoglycolate phosphatase  29.21 
 
 		 233 aa  55.5  0.0000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0809  HAD family hydrolase  31.96 
 
 		 218 aa  55.1  0.0000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0525  HAD family hydrolase  27.64 
 
 		 209 aa  55.1  0.0000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00124351  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1470  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1 family protein  23.12 
 
 		 213 aa  55.1  0.0000008  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.000674726  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1518  HAD family hydrolase  29.79 
 
 		 226 aa  55.1  0.0000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.0020263  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0710  phosphoglycolate phosphatase  25.4 
 
 		 218 aa  54.7  0.0000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.113573  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0058  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  35.38 
 
 		 203 aa  54.7  0.0000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00166064  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3691  phosphoglycolate phosphatase  39.51 
 
 		 227 aa  54.7  0.0000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0293  phosphoglycolate phosphatase  39.51 
 
 		 227 aa  54.3  0.000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0440  phosphoglycolate phosphatase  35.51 
 
 		 235 aa  54.3  0.000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.433387 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0919  HAD family hydrolase  28.11 
 
 		 209 aa  53.9  0.000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.000975491  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>