More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_0002 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_0002  DNA polymerase III, beta subunit  100 
 
 		 372 aa  757    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000138199  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0002  DNA polymerase III, beta subunit  67.83 
 
 		 373 aa  512  1e-144  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00126039  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0002  DNA polymerase III, beta subunit  61.29 
 
 		 372 aa  479  1e-134  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0002  DNA polymerase III, beta subunit  62.2 
 
 		 373 aa  478  1e-134  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.394263  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0002  DNA polymerase III, beta subunit  60.75 
 
 		 372 aa  476  1e-133  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0618208  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0002  DNA polymerase III, beta subunit  60.22 
 
 		 372 aa  473  1e-132  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0001  DNA polymerase III, beta subunit  60.22 
 
 		 372 aa  467  9.999999999999999e-131  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0872728  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0002  DNA polymerase III, beta subunit  52.42 
 
 		 372 aa  425  1e-118  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000259068  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0002  DNA polymerase III, beta subunit  40.42 
 
 		 375 aa  305  6e-82  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.301651  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0002  DNA polymerase III, beta subunit  40.42 
 
 		 375 aa  305  8.000000000000001e-82  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0002  DNA polymerase III, beta subunit  40.42 
 
 		 375 aa  305  1.0000000000000001e-81  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0002  DNA polymerase III, beta subunit  40.73 
 
 		 376 aa  298  1e-79  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0002  DNA polymerase III, beta subunit  38.74 
 
 		 376 aa  278  9e-74  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0002  DNA polymerase III, beta subunit  36.19 
 
 		 365 aa  274  2.0000000000000002e-72  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0014  DNA-directed DNA polymerase  38.24 
 
 		 366 aa  262  8e-69  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000733559  hitchhiker  0.000643873 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0002  DNA polymerase III subunit beta  37.4 
 
 		 373 aa  259  4e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.125376 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0002  DNA polymerase III, beta subunit  37.7 
 
 		 366 aa  257  2e-67  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000000103765  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0002  DNA polymerase III, beta subunit  37.7 
 
 		 366 aa  257  2e-67  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000634429  hitchhiker  0.000143129 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0002  DNA polymerase III, beta subunit  37.7 
 
 		 366 aa  257  2e-67  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000000637071  unclonable  0.00000000000326658 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0002  DNA polymerase III, beta subunit  37.7 
 
 		 366 aa  257  2e-67  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000848773  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0002  DNA polymerase III subunit beta  36.63 
 
 		 372 aa  257  2e-67  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.142435  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0002  DNA polymerase III, beta subunit  38.3 
 
 		 366 aa  256  5e-67  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000490932  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0002  DNA polymerase III, beta subunit  38.03 
 
 		 366 aa  256  6e-67  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000472427  hitchhiker  0.00139326 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0010  DNA polymerase III, beta subunit  37.77 
 
 		 366 aa  255  9e-67  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000642144  hitchhiker  0.00000000134313 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0002  DNA polymerase III, beta subunit  37.77 
 
 		 366 aa  255  9e-67  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000577304  unclonable  0.000000000023362 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0002  DNA polymerase III subunit beta  36.6 
 
 		 373 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0823829  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0708  DNA polymerase III subunit beta  37.23 
 
 		 371 aa  254  2.0000000000000002e-66  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.147601  normal  0.843721 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2239  DNA polymerase III subunit beta  36.7 
 
 		 373 aa  253  3e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0102545  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0009  DNA polymerase III, beta subunit  37.77 
 
 		 366 aa  253  4.0000000000000004e-66  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0002  DNA polymerase III, beta subunit  37.87 
 
 		 366 aa  252  7e-66  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000136085  unclonable  0.00000000917615 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3047  DNA polymerase III subunit beta  36.19 
 
 		 371 aa  252  9.000000000000001e-66  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.579013  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0007  DNA-directed DNA polymerase  37.43 
 
 		 366 aa  251  1e-65  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000118658  unclonable  0.000000000121971 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0004  DNA polymerase III subunit beta  36.27 
 
 		 372 aa  250  2e-65  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000114385  unclonable  5.12755e-25 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0002  DNA polymerase III, beta subunit  37.17 
 
 		 366 aa  250  2e-65  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000158001  unclonable  0.00000341195 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0002  DNA polymerase III, beta subunit  36.9 
 
 		 366 aa  249  5e-65  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.00000000544098  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2795  DNA polymerase III subunit beta  36.6 
 
 		 370 aa  248  9e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.924667  normal  0.594035 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0002  DNA polymerase III subunit beta  36.36 
 
 		 365 aa  247  2e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.0000000590568  unclonable  0.00000000000512174 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0002  DNA polymerase III subunit beta  36.8 
 
 		 367 aa  246  3e-64  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.186277  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3705  DNA polymerase III subunit beta  36.7 
 
 		 372 aa  246  3e-64  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0432616 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0002  DNA polymerase III, beta subunit  37.17 
 
 		 366 aa  246  4e-64  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000267756  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3374  DNA polymerase III subunit beta  33.69 
 
 		 372 aa  246  4.9999999999999997e-64  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3032  DNA polymerase III, beta subunit  36.19 
 
 		 366 aa  246  6e-64  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0002  DNA polymerase III, beta subunit  37.14 
 
 		 366 aa  246  6e-64  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000000200886  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0002  DNA polymerase III subunit beta  32.89 
 
 		 372 aa  245  9e-64  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.474691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0003  DNA polymerase III subunit beta  33.69 
 
 		 372 aa  244  9.999999999999999e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.295963  hitchhiker  0.00000350231 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0002  DNA polymerase III, beta subunit  37.5 
 
 		 367 aa  242  6e-63  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0004  DNA polymerase III subunit beta  34.76 
 
 		 385 aa  242  6e-63  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.638398  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0011  DNA polymerase III subunit beta  36.97 
 
 		 367 aa  242  7.999999999999999e-63  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.12322  hitchhiker  0.00002839 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0002  DNA polymerase III subunit beta  36.97 
 
 		 367 aa  242  7.999999999999999e-63  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.123405  normal  0.0743731 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0002  DNA polymerase III subunit beta  36.97 
 
 		 367 aa  241  1e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.121469  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0002  DNA polymerase III subunit beta  35.56 
 
 		 372 aa  242  1e-62  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000275643  normal  0.722211 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0002  DNA polymerase III, beta subunit  35.56 
 
 		 366 aa  240  2e-62  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000466477  normal  0.315264 
 
 
-
 
NC_004310  BR0002  DNA polymerase III subunit beta  34.49 
 
 		 397 aa  240  2.9999999999999997e-62  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.41342  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1343  DNA polymerase III subunit beta  33.51 
 
 		 372 aa  240  2.9999999999999997e-62  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0002  DNA polymerase III, beta subunit  35.73 
 
 		 367 aa  240  2.9999999999999997e-62  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.00000000146926  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0002  DNA polymerase III, beta subunit  34.78 
 
 		 369 aa  239  5e-62  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0012  DNA polymerase III subunit beta  33.16 
 
 		 372 aa  239  5.999999999999999e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0002  DNA polymerase III subunit beta  33.33 
 
 		 366 aa  239  5.999999999999999e-62  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.366013 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3543  DNA polymerase III subunit beta  33.96 
 
 		 372 aa  238  9e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0002  DNA polymerase III subunit beta  34.67 
 
 		 373 aa  238  9e-62  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0966551  normal  0.572668 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0816  DNA polymerase III, beta subunit  34.95 
 
 		 366 aa  238  1e-61  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.731986  normal  0.187979 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0002  DNA polymerase III subunit beta  34.22 
 
 		 397 aa  238  1e-61  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00789927  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0002  DNA polymerase III subunit beta  34.4 
 
 		 373 aa  238  1e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0861969  hitchhiker  0.000000929484 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4329  DNA polymerase III subunit beta  33.69 
 
 		 372 aa  237  2e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2506  DNA polymerase III subunit beta  35.47 
 
 		 366 aa  237  2e-61  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.000000000000126636  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0004  DNA polymerase III subunit beta  36.17 
 
 		 367 aa  237  2e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0351  DNA polymerase III subunit beta  33.42 
 
 		 412 aa  237  3e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.203557  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0003  DNA polymerase III subunit beta  35.53 
 
 		 373 aa  237  3e-61  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.174848  normal  0.920378 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1226  DNA polymerase III, beta subunit  35.39 
 
 		 366 aa  237  3e-61  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.123805  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2834  DNA polymerase III subunit beta  32.62 
 
 		 372 aa  236  4e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0002  DNA polymerase III subunit beta  36.97 
 
 		 367 aa  236  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0002  DNA polymerase III subunit beta  36.97 
 
 		 367 aa  236  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000396971  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0003  DNA polymerase III subunit beta  35.79 
 
 		 373 aa  236  5.0000000000000005e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.991791  normal  0.512948 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0002  DNA polymerase III subunit beta  35.79 
 
 		 373 aa  236  6e-61  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.969312  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1437  DNA polymerase III subunit beta  36.24 
 
 		 374 aa  235  9e-61  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0137  DNA polymerase III subunit beta  37.07 
 
 		 366 aa  234  1.0000000000000001e-60  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.00000108126  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4592  DNA polymerase III subunit beta  33.42 
 
 		 372 aa  233  3e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0352599 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00020  DNA polymerase III subunit beta  37.33 
 
 		 367 aa  233  5e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0002  DNA polymerase III, beta subunit  36.83 
 
 		 368 aa  233  6e-60  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00000008266  decreased coverage  0.00275233 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0002  DNA polymerase III subunit beta  35.54 
 
 		 374 aa  232  7.000000000000001e-60  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0002  DNA polymerase III subunit beta  36.46 
 
 		 367 aa  232  9e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0002  DNA polymerase III subunit beta  32.35 
 
 		 372 aa  231  1e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0002  DNA polymerase III, beta subunit  34.96 
 
 		 367 aa  231  2e-59  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.870835  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0002  DNA polymerase III subunit beta  33.6 
 
 		 372 aa  231  2e-59  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0002  DNA polymerase III subunit beta  33.16 
 
 		 372 aa  231  2e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.120269  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0002  DNA polymerase III subunit beta  37.07 
 
 		 367 aa  231  2e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0002  DNA polymerase III, beta subunit  35.29 
 
 		 367 aa  231  2e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00000485336  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00020  DNA polymerase III subunit beta  36.73 
 
 		 367 aa  230  3e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0002  DNA polymerase III subunit beta  32.89 
 
 		 372 aa  230  4e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0002  DNA polymerase III, beta subunit  37.43 
 
 		 366 aa  229  6e-59  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.348811  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03482  DNA polymerase III subunit beta  32.53 
 
 		 366 aa  227  2e-58  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00003  DNA polymerase III, beta subunit  36.36 
 
 		 366 aa  228  2e-58  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0000112219  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002008  DNA polymerase III beta subunit  33.95 
 
 		 366 aa  227  2e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000997729  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0102  DNA polymerase III subunit beta  35.31 
 
 		 367 aa  227  2e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3240  DNA polymerase III subunit beta  35.31 
 
 		 367 aa  227  3e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.551286  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00443  DNA polymerase III subunit beta  33.68 
 
 		 366 aa  226  3e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0002  DNA polymerase III subunit beta  35.31 
 
 		 367 aa  226  4e-58  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.18752  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2236  DNA polymerase III subunit beta  35.31 
 
 		 367 aa  226  4e-58  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0002  DNA polymerase III subunit beta  35.31 
 
 		 367 aa  226  4e-58  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.645907  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0088  DNA polymerase III subunit beta  35.31 
 
 		 367 aa  226  4e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>