More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_2580 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012793  GWCH70_1591  RNA methylase, NOL1/NOP2/sun family  67.77 
 
 
454 aa  660    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.558771  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2580  RNA methylase, NOL1/NOP2/sun family  100 
 
 
454 aa  931    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3160  NOL1/NOP2/sun family RNA methylase  49.67 
 
 
456 aa  444  1e-123  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0979  NOL1/NOP2/sun family RNA methylase  46.48 
 
 
460 aa  416  9.999999999999999e-116  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2172  RNA methylase, NOL1/NOP2/sun family  45.42 
 
 
471 aa  406  1.0000000000000001e-112  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000128077  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0901  Fmu (Sun) domain-containing protein  47.73 
 
 
455 aa  400  9.999999999999999e-111  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2792  Fmu (Sun) domain-containing protein  41.86 
 
 
488 aa  374  1e-102  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000540709  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1104  tRNA and rRNA cytosine-C5-methylase  43.29 
 
 
458 aa  373  1e-102  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1267  Fmu (Sun) domain protein  45.15 
 
 
460 aa  370  1e-101  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0692  tRNA and rRNA cytosine-C5-methylase  43.1 
 
 
470 aa  356  5e-97  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.010029  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0993  NOL1/NOP2/sun family protein  42.83 
 
 
436 aa  354  2e-96  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000219997  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1005  rRNA methyltransferase, putative  43.52 
 
 
436 aa  349  5e-95  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00439767  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3218  Fmu (Sun) domain-containing protein  40.82 
 
 
470 aa  345  7e-94  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1219  RNA methylase, NOL1/NOP2/sun family  39.65 
 
 
455 aa  345  1e-93  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1328  RNA methylase, NOL1/NOP2/sun family  43.52 
 
 
457 aa  327  2.0000000000000001e-88  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.13819  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1306  RNA methylase NOL1/NOP2/sun family  42.64 
 
 
457 aa  324  2e-87  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.085217 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2064  Fmu (Sun) domain protein  38.48 
 
 
479 aa  269  5.9999999999999995e-71  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1865  tRNA and rRNA cytosine-C5-methylase  32.49 
 
 
468 aa  243  3.9999999999999997e-63  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.92386  decreased coverage  0.000437678 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5890  Fmu (Sun) domain protein  35.4 
 
 
453 aa  229  1e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.133324  hitchhiker  0.00389453 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6488  Fmu (Sun) domain protein  31.65 
 
 
464 aa  224  4e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.799417 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003425  ribosomal RNA small subunit methyltransferase F  33.75 
 
 
478 aa  214  2.9999999999999995e-54  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.837447  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1110  rRNA (cytosine-C(5)-)-methyltransferase RsmF  33.69 
 
 
503 aa  214  2.9999999999999995e-54  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.153136  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2568  rRNA (cytosine-C(5)-)-methyltransferase RsmF  32.36 
 
 
479 aa  213  4.9999999999999996e-54  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.401694  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2224  rRNA (cytosine-C(5)-)-methyltransferase RsmF  31.93 
 
 
481 aa  213  7e-54  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.508935 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2103  rRNA (cytosine-C(5)-)-methyltransferase RsmF  32.57 
 
 
481 aa  212  1e-53  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0235271  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1993  rRNA (cytosine-C(5)-)-methyltransferase RsmF  32.71 
 
 
513 aa  211  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.956035 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02352  rRNA (cytosine-C(5)-)-methyltransferase RsmF  33.13 
 
 
501 aa  211  2e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2064  rRNA (cytosine-C(5)-)-methyltransferase RsmF  32.36 
 
 
481 aa  210  4e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.2344  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01806  predicted methyltransferase  32.36 
 
 
479 aa  210  5e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.88495  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0432  NOL1/NOP2/sun family protein  34.12 
 
 
468 aa  210  5e-53  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.218549 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01794  hypothetical protein  32.36 
 
 
479 aa  210  5e-53  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1807  RNA methylase, NOL1/NOP2/sun family  32.15 
 
 
481 aa  209  1e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0366277  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1797  rRNA (cytosine-C(5)-)-methyltransferase RsmF  32.36 
 
 
481 aa  209  1e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.396046  normal  0.0585336 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1926  rRNA (cytosine-C(5)-)-methyltransferase RsmF  32.36 
 
 
481 aa  209  1e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.79578  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2051  rRNA (cytosine-C(5)-)-methyltransferase RsmF  32.5 
 
 
513 aa  208  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.390449  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1465  rRNA (cytosine-C(5)-)-methyltransferase RsmF  32.5 
 
 
479 aa  208  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.331125  normal  0.160256 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1352  rRNA (cytosine-C(5)-)-methyltransferase RsmF  32.15 
 
 
481 aa  208  2e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.312061  normal  0.0948873 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1989  rRNA (cytosine-C(5)-)-methyltransferase RsmF  32.5 
 
 
513 aa  208  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00458134 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1583  rRNA (cytosine-C(5)-)-methyltransferase RsmF  31.6 
 
 
486 aa  207  3e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.855297  normal  0.597939 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1281  rRNA (cytosine-C(5)-)-methyltransferase RsmF  32.22 
 
 
479 aa  206  6e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0638049  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1848  rRNA (cytosine-C(5)-)-methyltransferase RsmF  32.02 
 
 
484 aa  205  1e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2405  rRNA (cytosine-C(5)-)-methyltransferase RsmF  31.46 
 
 
480 aa  203  4e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1538  rRNA (cytosine-C(5)-)-methyltransferase RsmF  33.05 
 
 
473 aa  198  1.0000000000000001e-49  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.317347  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2609  rRNA (cytosine-C(5)-)-methyltransferase RsmF  32.37 
 
 
474 aa  196  1e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2113  rRNA (cytosine-C(5)-)-methyltransferase RsmF  31.87 
 
 
503 aa  195  1e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000343432 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1665  rRNA (cytosine-C(5)-)-methyltransferase RsmF  33.48 
 
 
509 aa  195  1e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1770  rRNA (cytosine-C(5)-)-methyltransferase RsmF  32.83 
 
 
510 aa  194  2e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.475142  normal  0.596617 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1740  rRNA (cytosine-C(5)-)-methyltransferase RsmF  32.61 
 
 
510 aa  192  7e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2448  rRNA (cytosine-C(5)-)-methyltransferase RsmF  32.03 
 
 
505 aa  192  1e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2455  rRNA (cytosine-C(5)-)-methyltransferase RsmF  32.33 
 
 
505 aa  192  1e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2210  rRNA (cytosine-C(5)-)-methyltransferase RsmF  31.56 
 
 
505 aa  191  2e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2568  rRNA (cytosine-C(5)-)-methyltransferase RsmF  32.13 
 
 
505 aa  191  2e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.378579  normal  0.101279 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2644  rRNA (cytosine-C(5)-)-methyltransferase RsmF  32.19 
 
 
478 aa  191  2.9999999999999997e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0597695 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2039  rRNA (cytosine-C(5)-)-methyltransferase RsmF  32.05 
 
 
467 aa  190  4e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.137623  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1896  rRNA (cytosine-C(5)-)-methyltransferase RsmF  31.7 
 
 
505 aa  189  7e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.167738 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1986  rRNA (cytosine-C(5)-)-methyltransferase RsmF  31.65 
 
 
478 aa  189  1e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0149307 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2136  rRNA (cytosine-C(5)-)-methyltransferase RsmF  30.47 
 
 
484 aa  187  2e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1840  rRNA (cytosine-C(5)-)-methyltransferase RsmF  31 
 
 
482 aa  184  2.0000000000000003e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2079  rRNA (cytosine-C(5)-)-methyltransferase RsmF  37.69 
 
 
481 aa  185  2.0000000000000003e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2695  RNA methylase, NOL1/NOP2/sun family  37.42 
 
 
325 aa  181  2e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2236  rRNA (cytosine-C(5)-)-methyltransferase RsmF  30.97 
 
 
484 aa  179  1e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2749  NOL1/NOP2/sun family protein  38.34 
 
 
319 aa  176  6e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0620  Fmu (Sun) domain-containing protein  40.96 
 
 
474 aa  175  1.9999999999999998e-42  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00109548 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1936  NOL1/NOP2/sun family RNA methylase  29.78 
 
 
481 aa  174  2.9999999999999996e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00306451  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2046  rRNA (cytosine-C(5)-)-methyltransferase RsmF  33.08 
 
 
505 aa  171  3e-41  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.362171  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1927  rRNA (cytosine-C(5)-)-methyltransferase RsmF  29.6 
 
 
488 aa  170  4e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0666  RNA methylase, NOL1/NOP2/sun family  37.89 
 
 
302 aa  170  5e-41  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.728996  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0700  RNA methylase, NOL1/NOP2/sun family  34.69 
 
 
321 aa  166  1.0000000000000001e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0056  Fmu (Sun) domain-containing protein  33.74 
 
 
485 aa  165  2.0000000000000002e-39  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0526  tRNA (cytosine-5-)-methyltransferase  34.19 
 
 
499 aa  162  1e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3612  sun protein  35.53 
 
 
464 aa  161  2e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_2054  predicted protein  35.45 
 
 
485 aa  161  3e-38  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1485  RNA methylase, NOL1/NOP2/sun family  35.57 
 
 
314 aa  160  5e-38  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2311  sun protein  32.48 
 
 
452 aa  159  9e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.362668  hitchhiker  0.000826968 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0962  sun protein  36.05 
 
 
451 aa  159  1e-37  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.316292  normal  0.597237 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1228  RNA methylase, NOL1/NOP2/sun family  34.58 
 
 
339 aa  157  3e-37  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0282  NOL1/NOP2/sun family RNA methylase  36.59 
 
 
302 aa  157  5.0000000000000005e-37  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0341  RNA methylase, NOL1/NOP2/sun family  41.74 
 
 
302 aa  156  6e-37  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_25394  predicted protein  33.45 
 
 
528 aa  156  8e-37  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0007  ribosomal RNA methyltransferase NOP2  32.36 
 
 
336 aa  154  2.9999999999999998e-36  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.138281 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2033  RNA methylase, NOL1/NOP2/sun family  39.91 
 
 
302 aa  153  5e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1954  sun protein  39.73 
 
 
444 aa  152  8.999999999999999e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1752  sun protein  35.81 
 
 
444 aa  152  1e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.731166  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2830  RNA methylase, NOL1/NOP2/sun family  37.35 
 
 
305 aa  152  1e-35  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.82296  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1108  RNA methylase, NOL1/NOP2/sun family  38.75 
 
 
301 aa  150  6e-35  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000188231  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_91345  nucleolar RNA methyltransferase  35.33 
 
 
625 aa  150  7e-35  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.179856 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0066  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase:Nop2p  34.6 
 
 
446 aa  148  2.0000000000000003e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0900  sun protein  34.14 
 
 
457 aa  148  2.0000000000000003e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0682  sun protein  31.56 
 
 
443 aa  147  3e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0449767  normal  0.911889 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4706  sun protein  31.91 
 
 
446 aa  147  4.0000000000000006e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1457  NOL1/NOP2/sun family RNA methylase  41.94 
 
 
335 aa  146  6e-34  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1712  sun protein  31.62 
 
 
442 aa  146  7.0000000000000006e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.212482  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0571  sun protein  34.65 
 
 
455 aa  145  1e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0809795  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1994  ribosomal RNA small subunit methyltransferase B  31.62 
 
 
442 aa  144  2e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0241  Sun protein  37.78 
 
 
451 aa  144  3e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1591  sun protein  33.09 
 
 
452 aa  144  3e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0209  rRNA methyltransferase RsmB (sun protein), putative  33.76 
 
 
428 aa  144  4e-33  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4428  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase  31.25 
 
 
449 aa  143  5e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0577  Fmu (Sun) domain-containing protein  32.61 
 
 
419 aa  142  8e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.124221 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3433  Fmu (Sun) domain-containing protein  35.84 
 
 
424 aa  143  8e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.593781 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>