More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_0620 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008340  Mlg_0620  Fmu (Sun) domain-containing protein  100 
 
 
474 aa  949    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00109548 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0056  Fmu (Sun) domain-containing protein  47.33 
 
 
485 aa  389  1e-107  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0526  tRNA (cytosine-5-)-methyltransferase  44.47 
 
 
499 aa  351  2e-95  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1485  RNA methylase, NOL1/NOP2/sun family  44.84 
 
 
314 aa  247  3e-64  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0341  RNA methylase, NOL1/NOP2/sun family  43 
 
 
302 aa  233  7.000000000000001e-60  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0666  RNA methylase, NOL1/NOP2/sun family  42.52 
 
 
302 aa  232  1e-59  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.728996  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2033  RNA methylase, NOL1/NOP2/sun family  42.52 
 
 
302 aa  230  4e-59  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2830  RNA methylase, NOL1/NOP2/sun family  41.91 
 
 
305 aa  229  7e-59  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.82296  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0282  NOL1/NOP2/sun family RNA methylase  41.95 
 
 
302 aa  227  4e-58  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1591  RNA methylase, NOL1/NOP2/sun family  37.96 
 
 
454 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.558771  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2695  RNA methylase, NOL1/NOP2/sun family  38.51 
 
 
325 aa  178  2e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1267  Fmu (Sun) domain protein  34.4 
 
 
460 aa  178  2e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2580  RNA methylase, NOL1/NOP2/sun family  40.96 
 
 
454 aa  175  1.9999999999999998e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1936  NOL1/NOP2/sun family RNA methylase  34.97 
 
 
481 aa  165  1.0000000000000001e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00306451  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0700  RNA methylase, NOL1/NOP2/sun family  36.02 
 
 
321 aa  166  1.0000000000000001e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1328  RNA methylase, NOL1/NOP2/sun family  41.06 
 
 
457 aa  165  2.0000000000000002e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.13819  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3218  Fmu (Sun) domain-containing protein  35.4 
 
 
470 aa  164  3e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1306  RNA methylase NOL1/NOP2/sun family  39.22 
 
 
457 aa  161  2e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.085217 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3160  NOL1/NOP2/sun family RNA methylase  35.16 
 
 
456 aa  159  8e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1219  RNA methylase, NOL1/NOP2/sun family  30.26 
 
 
455 aa  159  8e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2172  RNA methylase, NOL1/NOP2/sun family  32.87 
 
 
471 aa  159  9e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000128077  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08073  nucleolar RNA methyltransferase (Nop2), putative (AFU_orthologue; AFUA_5G01760)  35.69 
 
 
788 aa  159  1e-37  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.322316  normal  0.90309 
 
 
-
 
NC_006684  CNB02220  nucleolus protein, putative  33.9 
 
 
695 aa  158  2e-37  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0735574  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0007  ribosomal RNA methyltransferase NOP2  32.29 
 
 
336 aa  158  2e-37  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.138281 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0979  NOL1/NOP2/sun family RNA methylase  35.41 
 
 
460 aa  156  6e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_2054  predicted protein  33.23 
 
 
485 aa  154  2e-36  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0066  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase:Nop2p  34.14 
 
 
446 aa  152  1e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_91345  nucleolar RNA methyltransferase  34.01 
 
 
625 aa  151  3e-35  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.179856 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3373  Sun protein  34.2 
 
 
448 aa  150  7e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2064  Fmu (Sun) domain protein  31.97 
 
 
479 aa  149  1.0000000000000001e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0901  Fmu (Sun) domain-containing protein  38.98 
 
 
455 aa  149  2.0000000000000003e-34  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_37206  predicted protein  30.94 
 
 
698 aa  148  3e-34  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.55659  normal  0.224947 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_36629  predicted protein  32.98 
 
 
700 aa  147  4.0000000000000006e-34  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.562122  hitchhiker  0.00135175 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0941  Fmu (Sun) domain-containing protein  35.08 
 
 
478 aa  147  4.0000000000000006e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.225173  normal 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27152  predicted protein  32.98 
 
 
700 aa  147  4.0000000000000006e-34  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.652588  normal  0.205318 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1108  RNA methylase, NOL1/NOP2/sun family  34.21 
 
 
301 aa  147  5e-34  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000188231  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1104  tRNA and rRNA cytosine-C5-methylase  26.89 
 
 
458 aa  146  6e-34  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0692  tRNA and rRNA cytosine-C5-methylase  34.82 
 
 
470 aa  146  7.0000000000000006e-34  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.010029  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2792  Fmu (Sun) domain-containing protein  29.47 
 
 
488 aa  143  7e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000540709  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1228  RNA methylase, NOL1/NOP2/sun family  29.22 
 
 
339 aa  142  9e-33  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1752  sun protein  32.98 
 
 
444 aa  142  9.999999999999999e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.731166  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND00130  tRNA (cytosine-5-)-methyltransferase, putative  28.97 
 
 
764 aa  142  1.9999999999999998e-32  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0303135  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0243  tRNA/rRNA cytosine-C5-methylase  34.81 
 
 
454 aa  142  1.9999999999999998e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31007  predicted protein  32.23 
 
 
655 aa  142  1.9999999999999998e-32  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.906185  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2749  NOL1/NOP2/sun family protein  34.16 
 
 
319 aa  141  3e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3433  Fmu (Sun) domain-containing protein  34.52 
 
 
424 aa  139  8.999999999999999e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.593781 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1707  sun protein  31.54 
 
 
453 aa  139  1e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1986  rRNA (cytosine-C(5)-)-methyltransferase RsmF  26.33 
 
 
478 aa  139  1e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0149307 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1826  Fmu (Sun) domain protein  33.45 
 
 
447 aa  138  2e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.14033  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3612  sun protein  32.01 
 
 
464 aa  137  3.0000000000000003e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1437  sun protein  32.13 
 
 
430 aa  137  4e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2039  rRNA (cytosine-C(5)-)-methyltransferase RsmF  30.69 
 
 
467 aa  136  6.0000000000000005e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.137623  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3528  sun protein  31.94 
 
 
448 aa  136  8e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0974  rRNA small subunit methyltransferase B  32.08 
 
 
420 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2109  rRNA small subunit methyltransferase B  32.08 
 
 
420 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.324014  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2239  NOL1/NOP2/sun family protein  32.08 
 
 
420 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0571  sun protein  29.02 
 
 
455 aa  135  1.9999999999999998e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0809795  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1127  NOL1/NOP2/Sun family protein  32.08 
 
 
420 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0962  sun protein  33.45 
 
 
451 aa  135  1.9999999999999998e-30  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.316292  normal  0.597237 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2405  rRNA (cytosine-C(5)-)-methyltransferase RsmF  31.43 
 
 
480 aa  135  1.9999999999999998e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1030  rRNA small subunit methyltransferase B  32.08 
 
 
420 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.478848  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0150  sun protein  34.17 
 
 
449 aa  135  1.9999999999999998e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.958214  normal  0.637853 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0970  rRNA small subunit methyltransferase B  32.08 
 
 
420 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2655  rRNA small subunit methyltransferase B  32.08 
 
 
420 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.768959  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01806  predicted methyltransferase  30.48 
 
 
479 aa  134  3e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.88495  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01794  hypothetical protein  30.48 
 
 
479 aa  134  3e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1281  rRNA (cytosine-C(5)-)-methyltransferase RsmF  30.16 
 
 
479 aa  134  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0638049  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2064  rRNA (cytosine-C(5)-)-methyltransferase RsmF  30.48 
 
 
481 aa  134  3e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.2344  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3159  Fmu (Sun)/ nucleolar NOL1/Nop2p  32.91 
 
 
420 aa  134  3.9999999999999996e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.876186  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0810  NOL1/NOP2/Sun family protein  31.29 
 
 
419 aa  134  3.9999999999999996e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1954  sun protein  36.43 
 
 
444 aa  134  5e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3594  sun protein  31.6 
 
 
448 aa  133  5e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2103  rRNA (cytosine-C(5)-)-methyltransferase RsmF  30.48 
 
 
481 aa  134  5e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0235271  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2721  Fmu (Sun) domain protein  32.08 
 
 
465 aa  134  5e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1352  rRNA (cytosine-C(5)-)-methyltransferase RsmF  30.48 
 
 
481 aa  133  6e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.312061  normal  0.0948873 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1807  RNA methylase, NOL1/NOP2/sun family  30.16 
 
 
481 aa  133  9e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0366277  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2332  Fmu (Sun) domain protein  32.08 
 
 
465 aa  132  9e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.797213  normal  0.318929 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0773  NOL1/NOP2/sun family protein  33.45 
 
 
420 aa  133  9e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0193  sun protein  31.6 
 
 
448 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000593735  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1279  Fmu (Sun) domain protein  30.72 
 
 
423 aa  132  1.0000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0241  Sun protein  33.33 
 
 
451 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1993  rRNA (cytosine-C(5)-)-methyltransferase RsmF  30.16 
 
 
513 aa  132  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.956035 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1989  rRNA (cytosine-C(5)-)-methyltransferase RsmF  30.16 
 
 
513 aa  132  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00458134 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1465  rRNA (cytosine-C(5)-)-methyltransferase RsmF  29.84 
 
 
479 aa  131  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.331125  normal  0.160256 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2051  rRNA (cytosine-C(5)-)-methyltransferase RsmF  29.84 
 
 
513 aa  131  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.390449  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5370  Fmu (Sun) domain-containing protein  30.42 
 
 
470 aa  132  2.0000000000000002e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.503548 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_25394  predicted protein  32.21 
 
 
528 aa  131  2.0000000000000002e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1322  sun protein  34.27 
 
 
451 aa  131  2.0000000000000002e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3242  sun protein  32.74 
 
 
452 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0117569  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2100  Fmu (Sun) domain-containing protein  32.92 
 
 
423 aa  131  2.0000000000000002e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.917704  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1926  rRNA (cytosine-C(5)-)-methyltransferase RsmF  30.16 
 
 
481 aa  130  3e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.79578  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2453  hypothetical protein  31.82 
 
 
417 aa  131  3e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0993  NOL1/NOP2/sun family protein  34.73 
 
 
436 aa  131  3e-29  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000219997  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1797  rRNA (cytosine-C(5)-)-methyltransferase RsmF  30.16 
 
 
481 aa  130  3e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.396046  normal  0.0585336 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1279  sun protein  32.53 
 
 
444 aa  131  3e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.19762 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3688  sun protein  32.29 
 
 
444 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.66831  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3156  Fmu (Sun) domain protein  31.91 
 
 
419 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00826214  normal  0.0267746 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2877  Fmu (Sun)  33.54 
 
 
466 aa  130  5.0000000000000004e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.514648 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0741  Fmu (Sun) domain-containing protein  32.65 
 
 
418 aa  130  6e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3045  sun protein  30.45 
 
 
452 aa  130  6e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>