More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_3218 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_3218  Fmu (Sun) domain-containing protein  100 
 
 
470 aa  961    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3160  NOL1/NOP2/sun family RNA methylase  44.51 
 
 
456 aa  383  1e-105  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2172  RNA methylase, NOL1/NOP2/sun family  43.24 
 
 
471 aa  370  1e-101  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000128077  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1591  RNA methylase, NOL1/NOP2/sun family  41.77 
 
 
454 aa  352  7e-96  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.558771  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1219  RNA methylase, NOL1/NOP2/sun family  40 
 
 
455 aa  352  8e-96  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2580  RNA methylase, NOL1/NOP2/sun family  40.41 
 
 
454 aa  346  6e-94  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2792  Fmu (Sun) domain-containing protein  37.23 
 
 
488 aa  337  2.9999999999999997e-91  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000540709  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1267  Fmu (Sun) domain protein  38.51 
 
 
460 aa  313  3.9999999999999997e-84  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0979  NOL1/NOP2/sun family RNA methylase  38.05 
 
 
460 aa  305  2.0000000000000002e-81  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1306  RNA methylase NOL1/NOP2/sun family  39.42 
 
 
457 aa  299  7e-80  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.085217 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1328  RNA methylase, NOL1/NOP2/sun family  38.63 
 
 
457 aa  293  5e-78  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.13819  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0901  Fmu (Sun) domain-containing protein  37.07 
 
 
455 aa  271  2e-71  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1104  tRNA and rRNA cytosine-C5-methylase  34.43 
 
 
458 aa  262  8.999999999999999e-69  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1005  rRNA methyltransferase, putative  35.85 
 
 
436 aa  258  1e-67  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00439767  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0692  tRNA and rRNA cytosine-C5-methylase  34.4 
 
 
470 aa  257  4e-67  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.010029  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0993  NOL1/NOP2/sun family protein  34.03 
 
 
436 aa  244  3e-63  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000219997  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1865  tRNA and rRNA cytosine-C5-methylase  31.75 
 
 
468 aa  223  6e-57  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.92386  decreased coverage  0.000437678 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2064  Fmu (Sun) domain protein  32.59 
 
 
479 aa  219  7.999999999999999e-56  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5890  Fmu (Sun) domain protein  32.23 
 
 
453 aa  189  9e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.133324  hitchhiker  0.00389453 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6488  Fmu (Sun) domain protein  30.26 
 
 
464 aa  184  3e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.799417 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02352  rRNA (cytosine-C(5)-)-methyltransferase RsmF  30.06 
 
 
501 aa  181  2e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1583  rRNA (cytosine-C(5)-)-methyltransferase RsmF  29.93 
 
 
486 aa  177  4e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.855297  normal  0.597939 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2113  rRNA (cytosine-C(5)-)-methyltransferase RsmF  36.21 
 
 
503 aa  177  4e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000343432 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1110  rRNA (cytosine-C(5)-)-methyltransferase RsmF  29.92 
 
 
503 aa  177  4e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.153136  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2103  rRNA (cytosine-C(5)-)-methyltransferase RsmF  30.41 
 
 
481 aa  175  9.999999999999999e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0235271  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01806  predicted methyltransferase  35.76 
 
 
479 aa  174  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.88495  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1797  rRNA (cytosine-C(5)-)-methyltransferase RsmF  35.76 
 
 
481 aa  174  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.396046  normal  0.0585336 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01794  hypothetical protein  35.76 
 
 
479 aa  174  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1926  rRNA (cytosine-C(5)-)-methyltransferase RsmF  35.76 
 
 
481 aa  174  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.79578  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2064  rRNA (cytosine-C(5)-)-methyltransferase RsmF  35.76 
 
 
481 aa  174  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.2344  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1281  rRNA (cytosine-C(5)-)-methyltransferase RsmF  29.48 
 
 
479 aa  173  5e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0638049  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003425  ribosomal RNA small subunit methyltransferase F  29.65 
 
 
478 aa  173  5e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.837447  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1807  RNA methylase, NOL1/NOP2/sun family  35.43 
 
 
481 aa  173  7.999999999999999e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0366277  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1840  rRNA (cytosine-C(5)-)-methyltransferase RsmF  35.57 
 
 
482 aa  172  1e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1352  rRNA (cytosine-C(5)-)-methyltransferase RsmF  35.43 
 
 
481 aa  172  1e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.312061  normal  0.0948873 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1993  rRNA (cytosine-C(5)-)-methyltransferase RsmF  29.48 
 
 
513 aa  171  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.956035 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2695  RNA methylase, NOL1/NOP2/sun family  40.22 
 
 
325 aa  172  2e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1989  rRNA (cytosine-C(5)-)-methyltransferase RsmF  29.28 
 
 
513 aa  171  3e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00458134 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1848  rRNA (cytosine-C(5)-)-methyltransferase RsmF  34.84 
 
 
484 aa  171  3e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1465  rRNA (cytosine-C(5)-)-methyltransferase RsmF  29.28 
 
 
479 aa  170  5e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.331125  normal  0.160256 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2051  rRNA (cytosine-C(5)-)-methyltransferase RsmF  34.75 
 
 
513 aa  170  5e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.390449  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2039  rRNA (cytosine-C(5)-)-methyltransferase RsmF  28.16 
 
 
467 aa  170  5e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.137623  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2405  rRNA (cytosine-C(5)-)-methyltransferase RsmF  28.72 
 
 
480 aa  169  7e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2568  rRNA (cytosine-C(5)-)-methyltransferase RsmF  29.3 
 
 
479 aa  169  7e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.401694  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0432  NOL1/NOP2/sun family protein  29.75 
 
 
468 aa  168  2e-40  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.218549 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2136  rRNA (cytosine-C(5)-)-methyltransferase RsmF  32.9 
 
 
484 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2079  rRNA (cytosine-C(5)-)-methyltransferase RsmF  33.76 
 
 
481 aa  165  1.0000000000000001e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0620  Fmu (Sun) domain-containing protein  35.52 
 
 
474 aa  164  3e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00109548 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1665  rRNA (cytosine-C(5)-)-methyltransferase RsmF  30.96 
 
 
509 aa  164  4.0000000000000004e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1752  sun protein  35.9 
 
 
444 aa  163  5.0000000000000005e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.731166  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2609  rRNA (cytosine-C(5)-)-methyltransferase RsmF  30.8 
 
 
474 aa  162  1e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1927  rRNA (cytosine-C(5)-)-methyltransferase RsmF  30.34 
 
 
488 aa  162  1e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0056  Fmu (Sun) domain-containing protein  38.77 
 
 
485 aa  162  1e-38  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1538  rRNA (cytosine-C(5)-)-methyltransferase RsmF  33.23 
 
 
473 aa  162  2e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.317347  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1770  rRNA (cytosine-C(5)-)-methyltransferase RsmF  30.89 
 
 
510 aa  161  2e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.475142  normal  0.596617 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1740  rRNA (cytosine-C(5)-)-methyltransferase RsmF  31.64 
 
 
510 aa  161  3e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0282  NOL1/NOP2/sun family RNA methylase  36.64 
 
 
302 aa  160  4e-38  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2236  rRNA (cytosine-C(5)-)-methyltransferase RsmF  29.07 
 
 
484 aa  160  5e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2210  rRNA (cytosine-C(5)-)-methyltransferase RsmF  30.11 
 
 
505 aa  158  2e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0241  Sun protein  38.24 
 
 
451 aa  158  2e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB02220  nucleolus protein, putative  33.55 
 
 
695 aa  157  4e-37  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0735574  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2046  rRNA (cytosine-C(5)-)-methyltransferase RsmF  32.56 
 
 
505 aa  155  2e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.362171  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_25394  predicted protein  32.42 
 
 
528 aa  154  2.9999999999999998e-36  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2311  sun protein  32.34 
 
 
452 aa  152  8.999999999999999e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.362668  hitchhiker  0.000826968 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1954  sun protein  33.7 
 
 
444 aa  152  1e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2448  rRNA (cytosine-C(5)-)-methyltransferase RsmF  29.11 
 
 
505 aa  152  1e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_2054  predicted protein  34.01 
 
 
485 aa  152  1e-35  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1896  rRNA (cytosine-C(5)-)-methyltransferase RsmF  29.38 
 
 
505 aa  151  2e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.167738 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2644  rRNA (cytosine-C(5)-)-methyltransferase RsmF  33.67 
 
 
478 aa  151  2e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0597695 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1986  rRNA (cytosine-C(5)-)-methyltransferase RsmF  28.57 
 
 
478 aa  150  3e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0149307 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2455  rRNA (cytosine-C(5)-)-methyltransferase RsmF  28.54 
 
 
505 aa  151  3e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2568  rRNA (cytosine-C(5)-)-methyltransferase RsmF  29.11 
 
 
505 aa  150  6e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.378579  normal  0.101279 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0700  RNA methylase, NOL1/NOP2/sun family  34.32 
 
 
321 aa  150  7e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04801  Sun protein (Fmu protein)  32.29 
 
 
448 aa  149  1.0000000000000001e-34  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.273951  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08073  nucleolar RNA methyltransferase (Nop2), putative (AFU_orthologue; AFUA_5G01760)  32.41 
 
 
788 aa  148  2.0000000000000003e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.322316  normal  0.90309 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04221  Sun protein (Fmu protein)  34.8 
 
 
432 aa  148  2.0000000000000003e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0666  RNA methylase, NOL1/NOP2/sun family  35.29 
 
 
302 aa  148  2.0000000000000003e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.728996  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0762  tRNA and rRNA cytosine-C5-methylase  35.25 
 
 
438 aa  147  3e-34  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000298868 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3612  sun protein  31.05 
 
 
464 aa  147  5e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1437  sun protein  32.56 
 
 
430 aa  146  6e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1485  RNA methylase, NOL1/NOP2/sun family  34 
 
 
314 aa  146  7.0000000000000006e-34  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0007  ribosomal RNA methyltransferase NOP2  31.76 
 
 
336 aa  146  7.0000000000000006e-34  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.138281 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2033  RNA methylase, NOL1/NOP2/sun family  35.14 
 
 
302 aa  146  8.000000000000001e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0859  sun protein  33.21 
 
 
452 aa  146  9e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_91345  nucleolar RNA methyltransferase  32.18 
 
 
625 aa  145  1e-33  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.179856 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0571  sun protein  32.94 
 
 
455 aa  145  2e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0809795  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0682  sun protein  31.34 
 
 
443 aa  145  2e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0449767  normal  0.911889 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0526  tRNA (cytosine-5-)-methyltransferase  34.48 
 
 
499 aa  145  2e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3528  sun protein  33.58 
 
 
448 aa  144  3e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1758  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase  32.1 
 
 
438 aa  144  4e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0962  sun protein  36.04 
 
 
451 aa  144  4e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.316292  normal  0.597237 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1591  sun protein  35.43 
 
 
452 aa  144  5e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04881  Sun protein (Fmu protein)  30.21 
 
 
437 aa  143  5e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.929228  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2224  rRNA (cytosine-C(5)-)-methyltransferase RsmF  31.7 
 
 
481 aa  144  5e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.508935 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0066  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase:Nop2p  35.48 
 
 
446 aa  143  6e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1228  RNA methylase, NOL1/NOP2/sun family  29.56 
 
 
339 aa  142  9.999999999999999e-33  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1707  sun protein  31.23 
 
 
453 aa  141  1.9999999999999998e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2830  RNA methylase, NOL1/NOP2/sun family  33.1 
 
 
305 aa  140  3.9999999999999997e-32  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.82296  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3594  sun protein  33.21 
 
 
448 aa  140  3.9999999999999997e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0853  Fmu (Sun) domain protein  32.48 
 
 
422 aa  140  3.9999999999999997e-32  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>