More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_1267 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013385  Adeg_1267  Fmu (Sun) domain protein  100 
 
 
460 aa  917    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2580  RNA methylase, NOL1/NOP2/sun family  45.15 
 
 
454 aa  370  1e-101  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0979  NOL1/NOP2/sun family RNA methylase  43.3 
 
 
460 aa  365  1e-99  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1591  RNA methylase, NOL1/NOP2/sun family  40.49 
 
 
454 aa  352  1e-95  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.558771  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3160  NOL1/NOP2/sun family RNA methylase  40.39 
 
 
456 aa  350  2e-95  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2172  RNA methylase, NOL1/NOP2/sun family  39.57 
 
 
471 aa  346  6e-94  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000128077  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1306  RNA methylase NOL1/NOP2/sun family  47.24 
 
 
457 aa  333  4e-90  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.085217 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1328  RNA methylase, NOL1/NOP2/sun family  46.03 
 
 
457 aa  318  1e-85  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.13819  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2792  Fmu (Sun) domain-containing protein  38.22 
 
 
488 aa  314  1.9999999999999998e-84  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000540709  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3218  Fmu (Sun) domain-containing protein  38.92 
 
 
470 aa  310  2.9999999999999997e-83  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1219  RNA methylase, NOL1/NOP2/sun family  35.31 
 
 
455 aa  299  6e-80  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0901  Fmu (Sun) domain-containing protein  37.66 
 
 
455 aa  290  3e-77  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1104  tRNA and rRNA cytosine-C5-methylase  33.04 
 
 
458 aa  256  4e-67  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0692  tRNA and rRNA cytosine-C5-methylase  34.03 
 
 
470 aa  255  1.0000000000000001e-66  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.010029  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1005  rRNA methyltransferase, putative  33.41 
 
 
436 aa  236  8e-61  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00439767  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0993  NOL1/NOP2/sun family protein  31.88 
 
 
436 aa  235  1.0000000000000001e-60  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000219997  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2064  Fmu (Sun) domain protein  38.2 
 
 
479 aa  219  7.999999999999999e-56  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5890  Fmu (Sun) domain protein  34.4 
 
 
453 aa  196  8.000000000000001e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.133324  hitchhiker  0.00389453 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1936  NOL1/NOP2/sun family RNA methylase  30.85 
 
 
481 aa  183  7e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00306451  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0620  Fmu (Sun) domain-containing protein  34.4 
 
 
474 aa  178  2e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00109548 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2405  rRNA (cytosine-C(5)-)-methyltransferase RsmF  32.36 
 
 
480 aa  174  2.9999999999999996e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0056  Fmu (Sun) domain-containing protein  33.91 
 
 
485 aa  173  5e-42  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1865  tRNA and rRNA cytosine-C5-methylase  28.96 
 
 
468 aa  172  1e-41  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.92386  decreased coverage  0.000437678 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0007  ribosomal RNA methyltransferase NOP2  33.12 
 
 
336 aa  170  6e-41  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.138281 
 
 
-
 
NC_002950  PG0432  NOL1/NOP2/sun family protein  33.19 
 
 
468 aa  169  1e-40  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.218549 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1281  rRNA (cytosine-C(5)-)-methyltransferase RsmF  31.33 
 
 
479 aa  166  5.9999999999999996e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0638049  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6488  Fmu (Sun) domain protein  27.9 
 
 
464 aa  166  8e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.799417 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2051  rRNA (cytosine-C(5)-)-methyltransferase RsmF  31.33 
 
 
513 aa  166  9e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.390449  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1465  rRNA (cytosine-C(5)-)-methyltransferase RsmF  31.33 
 
 
479 aa  166  9e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.331125  normal  0.160256 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1352  rRNA (cytosine-C(5)-)-methyltransferase RsmF  31.4 
 
 
481 aa  165  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.312061  normal  0.0948873 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003425  ribosomal RNA small subunit methyltransferase F  28.05 
 
 
478 aa  165  2.0000000000000002e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.837447  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0282  NOL1/NOP2/sun family RNA methylase  38.91 
 
 
302 aa  165  2.0000000000000002e-39  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01806  predicted methyltransferase  30.94 
 
 
479 aa  164  3e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.88495  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1228  RNA methylase, NOL1/NOP2/sun family  31.83 
 
 
339 aa  164  3e-39  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1752  sun protein  34.29 
 
 
444 aa  164  3e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.731166  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2064  rRNA (cytosine-C(5)-)-methyltransferase RsmF  30.94 
 
 
481 aa  164  3e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.2344  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1993  rRNA (cytosine-C(5)-)-methyltransferase RsmF  31.11 
 
 
513 aa  164  3e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.956035 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0241  Sun protein  39.3 
 
 
451 aa  164  3e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01794  hypothetical protein  30.94 
 
 
479 aa  164  3e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1989  rRNA (cytosine-C(5)-)-methyltransferase RsmF  31.11 
 
 
513 aa  164  4.0000000000000004e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00458134 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1840  rRNA (cytosine-C(5)-)-methyltransferase RsmF  30.64 
 
 
482 aa  163  5.0000000000000005e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0666  RNA methylase, NOL1/NOP2/sun family  35.74 
 
 
302 aa  164  5.0000000000000005e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.728996  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3612  sun protein  38.21 
 
 
464 aa  163  7e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1826  Fmu (Sun) domain protein  36.12 
 
 
447 aa  162  1e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.14033  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1532  sun protein  31.06 
 
 
449 aa  162  1e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2568  rRNA (cytosine-C(5)-)-methyltransferase RsmF  30.72 
 
 
479 aa  161  2e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.401694  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2079  rRNA (cytosine-C(5)-)-methyltransferase RsmF  31.5 
 
 
481 aa  161  2e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2103  rRNA (cytosine-C(5)-)-methyltransferase RsmF  30.86 
 
 
481 aa  161  2e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0235271  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2609  rRNA (cytosine-C(5)-)-methyltransferase RsmF  29.68 
 
 
474 aa  161  2e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02352  rRNA (cytosine-C(5)-)-methyltransferase RsmF  27.72 
 
 
501 aa  160  3e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2033  RNA methylase, NOL1/NOP2/sun family  36.08 
 
 
302 aa  161  3e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1740  rRNA (cytosine-C(5)-)-methyltransferase RsmF  30.04 
 
 
510 aa  160  4e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2644  rRNA (cytosine-C(5)-)-methyltransferase RsmF  28.41 
 
 
478 aa  160  5e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0597695 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2236  rRNA (cytosine-C(5)-)-methyltransferase RsmF  27.45 
 
 
484 aa  160  5e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1538  rRNA (cytosine-C(5)-)-methyltransferase RsmF  27.84 
 
 
473 aa  160  6e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.317347  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1807  RNA methylase, NOL1/NOP2/sun family  30.63 
 
 
481 aa  159  8e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0366277  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1926  rRNA (cytosine-C(5)-)-methyltransferase RsmF  30.63 
 
 
481 aa  159  8e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.79578  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1797  rRNA (cytosine-C(5)-)-methyltransferase RsmF  30.63 
 
 
481 aa  159  8e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.396046  normal  0.0585336 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2039  rRNA (cytosine-C(5)-)-methyltransferase RsmF  28.86 
 
 
467 aa  159  9e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.137623  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1986  rRNA (cytosine-C(5)-)-methyltransferase RsmF  28.29 
 
 
478 aa  159  1e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0149307 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0900  sun protein  41.26 
 
 
457 aa  159  1e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1110  rRNA (cytosine-C(5)-)-methyltransferase RsmF  29.06 
 
 
503 aa  158  2e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.153136  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1770  rRNA (cytosine-C(5)-)-methyltransferase RsmF  30.82 
 
 
510 aa  158  2e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.475142  normal  0.596617 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3242  sun protein  37.36 
 
 
452 aa  158  2e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0117569  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0341  RNA methylase, NOL1/NOP2/sun family  37.95 
 
 
302 aa  157  4e-37  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1437  sun protein  31.48 
 
 
430 aa  157  4e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1583  rRNA (cytosine-C(5)-)-methyltransferase RsmF  28.51 
 
 
486 aa  157  4e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.855297  normal  0.597939 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1665  rRNA (cytosine-C(5)-)-methyltransferase RsmF  29.84 
 
 
509 aa  157  5.0000000000000005e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0526  tRNA (cytosine-5-)-methyltransferase  42.52 
 
 
499 aa  156  6e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1896  rRNA (cytosine-C(5)-)-methyltransferase RsmF  29.49 
 
 
505 aa  156  7e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.167738 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3373  Sun protein  36.21 
 
 
448 aa  156  9e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2448  rRNA (cytosine-C(5)-)-methyltransferase RsmF  28.51 
 
 
505 aa  156  9e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0066  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase:Nop2p  35.81 
 
 
446 aa  155  1e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0682  sun protein  34.38 
 
 
443 aa  155  1e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0449767  normal  0.911889 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2210  rRNA (cytosine-C(5)-)-methyltransferase RsmF  29.05 
 
 
505 aa  154  2e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2455  rRNA (cytosine-C(5)-)-methyltransferase RsmF  28.73 
 
 
505 aa  154  2e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1485  RNA methylase, NOL1/NOP2/sun family  35.12 
 
 
314 aa  155  2e-36  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1737  Fmu (Sun) domain-containing protein  35.76 
 
 
465 aa  155  2e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0208  Fmu (Sun)  33.77 
 
 
416 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0562281  normal  0.314079 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2568  rRNA (cytosine-C(5)-)-methyltransferase RsmF  28.95 
 
 
505 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.378579  normal  0.101279 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3159  Fmu (Sun)/ nucleolar NOL1/Nop2p  35.2 
 
 
420 aa  154  4e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.876186  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3217  Fmu (Sun) domain-containing protein  36.36 
 
 
417 aa  153  5e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2695  RNA methylase, NOL1/NOP2/sun family  36.79 
 
 
325 aa  152  8e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1848  rRNA (cytosine-C(5)-)-methyltransferase RsmF  33.75 
 
 
484 aa  152  8.999999999999999e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1758  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase  34.35 
 
 
438 aa  152  1e-35  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0859  sun protein  37.4 
 
 
452 aa  152  1e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04801  Sun protein (Fmu protein)  34.35 
 
 
448 aa  152  1e-35  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.273951  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1291  Fmu (Sun) domain protein  39.46 
 
 
427 aa  151  2e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0647518  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3805  Fmu (Sun)  36.7 
 
 
417 aa  151  2e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4706  sun protein  33.33 
 
 
446 aa  152  2e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0571  sun protein  28.48 
 
 
455 aa  150  3e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0809795  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0193  sun protein  35.77 
 
 
448 aa  150  4e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000593735  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2311  sun protein  35.5 
 
 
452 aa  150  5e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.362668  hitchhiker  0.000826968 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0741  Fmu (Sun) domain-containing protein  35.47 
 
 
418 aa  150  5e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3594  sun protein  34.55 
 
 
448 aa  150  6e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0941  Fmu (Sun) domain-containing protein  38.38 
 
 
478 aa  150  7e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.225173  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3183  Fmu (Sun)  34.97 
 
 
429 aa  150  7e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3528  sun protein  34.18 
 
 
448 aa  149  8e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3045  sun protein  36.07 
 
 
452 aa  149  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04811  Sun protein (Fmu protein)  33.62 
 
 
438 aa  149  1.0000000000000001e-34  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>