More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_0831 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_0831  outer membrane efflux protein  100 
 
 		 419 aa  846    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3409  outer membrane efflux protein  64.2 
 
 		 419 aa  527  1e-148  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000155286  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0224  outer membrane efflux protein  62.05 
 
 		 419 aa  518  1e-146  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000720591  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3710  outer membrane efflux protein  60.95 
 
 		 419 aa  478  1e-134  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0950  outer membrane efflux protein  49.16 
 
 		 424 aa  373  1e-102  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1177  outer membrane efflux protein  30.19 
 
 		 427 aa  180  4.999999999999999e-44  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3165  outer membrane efflux protein  33.25 
 
 		 445 aa  150  4e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.391786  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2969  outer membrane efflux protein  34.91 
 
 		 443 aa  150  5e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.725894  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3057  outer membrane efflux protein  33.01 
 
 		 440 aa  149  7e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.969203  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1633  outer membrane efflux protein  27.74 
 
 		 420 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.159543  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3465  Outer membrane efflux protein  27.38 
 
 		 441 aa  131  3e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1698  outer membrane efflux protein  29.47 
 
 		 433 aa  130  5.0000000000000004e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.572085  normal  0.0641673 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2629  outer membrane efflux protein  27.17 
 
 		 421 aa  129  7.000000000000001e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.111539  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2704  outer membrane efflux protein  30.28 
 
 		 423 aa  129  9.000000000000001e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1606  outer membrane efflux protein  27.97 
 
 		 421 aa  127  4.0000000000000003e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1723  outer membrane efflux protein  28.54 
 
 		 436 aa  127  5e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0096  outer membrane efflux protein  26.3 
 
 		 441 aa  123  6e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2633  outer membrane efflux protein  26.17 
 
 		 424 aa  121  3e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1482  outer membrane efflux protein  26.81 
 
 		 426 aa  119  9.999999999999999e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.979092  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1629  outer membrane efflux protein  28.8 
 
 		 438 aa  118  1.9999999999999998e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1165  Outer membrane efflux protein  29.46 
 
 		 462 aa  118  1.9999999999999998e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0837  outer membrane efflux protein  26.98 
 
 		 462 aa  117  5e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1376  Outer membrane efflux protein  27.1 
 
 		 435 aa  116  6e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.109779  hitchhiker  0.00244241 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0954  outer membrane efflux protein  24.88 
 
 		 463 aa  115  2.0000000000000002e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1617  outer membrane efflux protein  24 
 
 		 467 aa  113  7.000000000000001e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1727  type I secretion outer membrane protein, TolC family  27.06 
 
 		 452 aa  112  2.0000000000000002e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000000826676  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0833  outer membrane efflux protein  25.93 
 
 		 496 aa  110  5e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0162  outer membrane efflux protein  27 
 
 		 433 aa  110  6e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0066  outer membrane efflux protein  25.94 
 
 		 436 aa  108  1e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0627  outer membrane efflux protein, putative  24.13 
 
 		 470 aa  108  2e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.173588  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3429  outer membrane efflux protein  26.48 
 
 		 442 aa  108  2e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.437271  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2154  outer membrane protein CyaE, putative  27.85 
 
 		 453 aa  107  4e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0066  outer membrane efflux protein  24.51 
 
 		 443 aa  107  4e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1990  outer membrane efflux protein  26.24 
 
 		 471 aa  107  5e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.154832  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0814  outer membrane efflux protein  26.2 
 
 		 460 aa  106  9e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0071  outer membrane efflux protein  26.21 
 
 		 441 aa  104  4e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6770  outer membrane efflux protein  27.08 
 
 		 488 aa  103  7e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3801  outer membrane efflux protein  25.93 
 
 		 449 aa  103  8e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.233057 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1967  outer membrane efflux protein  27.23 
 
 		 443 aa  102  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000399706  normal  0.35271 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1884  outer membrane efflux protein  23.5 
 
 		 483 aa  101  3e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5506  outer membrane efflux protein  24.72 
 
 		 451 aa  99.8  9e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.307266  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1946  outer membrane efflux protein  28.24 
 
 		 431 aa  98.6  2e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4284  outer membrane efflux protein  26.4 
 
 		 447 aa  97.8  3e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3129  Outer membrane efflux protein  27.15 
 
 		 446 aa  98.2  3e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000215977  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4306  outer membrane efflux protein  27.34 
 
 		 447 aa  97.4  4e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0961  Outer membrane protein-like  25.92 
 
 		 491 aa  97.4  4e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0234127  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3973  outer membrane efflux protein  27.36 
 
 		 513 aa  97.1  5e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0704049 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1761  hypothetical protein  26.5 
 
 		 576 aa  97.1  5e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0094  outer membrane efflux protein, putative  23.84 
 
 		 501 aa  96.7  8e-19  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0379352 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0620  outer membrane efflux protein  25.48 
 
 		 435 aa  95.9  1e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.0000193694  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0494  FusA/NodT family protein  25.77 
 
 		 426 aa  94.7  3e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.690015  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0733  outer membrane efflux protein, putative  28.05 
 
 		 463 aa  93.2  8e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2664  outer membrane efflux protein  25.23 
 
 		 1496 aa  92.8  1e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0364  outer membrane channel protein  25.35 
 
 		 500 aa  92.8  1e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1393  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  24.82 
 
 		 461 aa  92  2e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4004  acriflavin resistance protein  25.12 
 
 		 1470 aa  92  2e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2517  Outer membrane efflux protein  24.24 
 
 		 455 aa  91.7  2e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0940003  normal  0.677218 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4153  outer membrane efflux protein  27.57 
 
 		 447 aa  91.7  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2098  putative outer membrane protein tolC  26.61 
 
 		 456 aa  90.9  3e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1054  outer membrane efflux protein  24.7 
 
 		 514 aa  90.9  4e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000452487  normal  0.217723 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0283  outer membrane efflux protein  24.94 
 
 		 439 aa  90.5  4e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00367785 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0768  outer membrane efflux protein  26.13 
 
 		 423 aa  89.7  8e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.151036  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4579  outer membrane efflux protein  25.65 
 
 		 515 aa  89.7  9e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0188996  decreased coverage  0.000000771093 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3937  outer membrane efflux protein  24.76 
 
 		 447 aa  89  1e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00157367 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3184  outer membrane efflux protein  26.48 
 
 		 460 aa  89  1e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0733975  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3378  outer membrane efflux protein  24.59 
 
 		 498 aa  89  2e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.106709 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0391  Outer membrane efflux family protein  28.15 
 
 		 437 aa  88.6  2e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3853  outer membrane efflux protein  26.16 
 
 		 447 aa  88.6  2e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1266  outer membrane efflux protein  23.71 
 
 		 444 aa  87  5e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0921  outer membrane efflux protein  29.29 
 
 		 435 aa  86.7  7e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.837868 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1040  outer membrane efflux protein  27.08 
 
 		 583 aa  86.7  8e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4114  outer membrane efflux protein  25 
 
 		 519 aa  86.3  8e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.865486  normal  0.0282956 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1525  outer membrane efflux protein  28.19 
 
 		 442 aa  85.9  0.000000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000580745  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2121  Outer membrane efflux protein  25.07 
 
 		 509 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3645  outer membrane efflux protein  24.92 
 
 		 514 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.784148  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5578  outer membrane efflux protein  24.92 
 
 		 514 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0232692  hitchhiker  0.00628536 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4722  outer membrane efflux protein  24.92 
 
 		 514 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0674524  decreased coverage  0.00195148 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3056  outer membrane efflux protein  24.94 
 
 		 485 aa  85.5  0.000000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.111107 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4205  TolC family type I secretion outer membrane protein  23.68 
 
 		 431 aa  84.7  0.000000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.668787  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4260  outer membrane efflux protein  23.94 
 
 		 438 aa  84.3  0.000000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0762  outer membrane efflux protein  25.15 
 
 		 446 aa  84.7  0.000000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1361  Outer membrane efflux protein  22.73 
 
 		 416 aa  84  0.000000000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.824117  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1145  outer membrane efflux protein  24.02 
 
 		 439 aa  84.3  0.000000000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000127734  normal  0.206163 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0057  outer membrane protein, putative  24.52 
 
 		 470 aa  83.6  0.000000000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2365  outer membrane efflux protein  24.64 
 
 		 482 aa  84  0.000000000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.316372 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0433  type I secretion outer membrane protein, TolC family protein  24.26 
 
 		 469 aa  84  0.000000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.462048  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1749  outer membrane efflux protein  22.56 
 
 		 458 aa  83.6  0.000000000000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1407  RND efflux system outer membrane lipoprotein  27.61 
 
 		 488 aa  83.6  0.000000000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.380774 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2024  TolC family type I secretion outer membrane protein  26.35 
 
 		 465 aa  82.4  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0945  secretion protein  25.85 
 
 		 472 aa  82.4  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2047  type I secretion outer membrane protein  24.94 
 
 		 616 aa  81.6  0.00000000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1015  outer membrane protein  23.95 
 
 		 488 aa  81.6  0.00000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  1.22355e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3261  type I secretion outer membrane protein, TolC  20.96 
 
 		 469 aa  81.6  0.00000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.537181 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0335  FusA/NodT family protein  26.33 
 
 		 436 aa  81.6  0.00000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.73563  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3468  outer membrane efflux protein  25.06 
 
 		 448 aa  82  0.00000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.000163735  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0139  TolC family type I secretion outer membrane protein  24.94 
 
 		 616 aa  82.4  0.00000000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2885  RND efflux system outer membrane lipoprotein  25.79 
 
 		 495 aa  81.3  0.00000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.183945  normal  0.24109 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3627  outer membrane efflux protein  23.93 
 
 		 461 aa  81.3  0.00000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.433273  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1384  outer membrane efflux protein  25.72 
 
 		 435 aa  81.3  0.00000000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.642492  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2883  TolC family type I secretion outer membrane protein  25.23 
 
 		 442 aa  80.9  0.00000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00170075  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>