More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_1655 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_1655  ABC transporter related  100 
 
 		 374 aa  728    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.334849  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2080  ABC transporter related  70.89 
 
 		 388 aa  508  1e-143  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.669128 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2220  ABC transporter related protein  72.95 
 
 		 308 aa  403  1e-111  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000054865  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5991  ABC transporter, ATP-binding protein  68.38 
 
 		 302 aa  379  1e-104  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.171427  normal  0.144114 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2730  ABC transporter-related protein  63.7 
 
 		 309 aa  367  1e-100  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.110102 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3680  ABC transporter related  60.62 
 
 		 319 aa  365  1e-100  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.764168  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1974  ABC transporter-like protein  69.07 
 
 		 308 aa  362  8e-99  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.495936 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2380  ABC transporter related protein  63.34 
 
 		 338 aa  361  9e-99  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.719921  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5162  ABC transporter related  63.73 
 
 		 312 aa  360  2e-98  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.91236  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1989  ABC-type multidrug transport system ATPase componen  66.89 
 
 		 309 aa  359  4e-98  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2469  ABC transporter related  63.01 
 
 		 310 aa  357  2.9999999999999997e-97  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.182364  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2433  ABC transporter related  63.01 
 
 		 310 aa  356  3.9999999999999996e-97  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.555917  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2478  ABC transporter related  63.01 
 
 		 310 aa  356  3.9999999999999996e-97  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2251  ABC transporter related  63.67 
 
 		 308 aa  351  1e-95  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000349445 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16100  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  64.16 
 
 		 308 aa  350  3e-95  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.252835  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11486  antibiotic ABC transporter ATP-binding protein  64.04 
 
 		 313 aa  345  1e-93  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.576168  normal  0.635651 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2512  ABC transporter related protein  61.15 
 
 		 310 aa  332  7.000000000000001e-90  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2965  ABC transporter related protein  63.55 
 
 		 313 aa  331  1e-89  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2270  ABC transporter related  57.39 
 
 		 314 aa  321  9.999999999999999e-87  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0194765  normal  0.0896073 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2545  ABC transporter related  56.23 
 
 		 315 aa  312  6.999999999999999e-84  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.107905  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21980  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  58.56 
 
 		 304 aa  304  1.0000000000000001e-81  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.110747  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2919  ABC transporter related  61.67 
 
 		 334 aa  289  7e-77  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.748186  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1355  ABC transporter related protein  50.91 
 
 		 299 aa  266  2.9999999999999995e-70  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.79712  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0824  ABC transporter related protein  52.61 
 
 		 306 aa  256  4e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1668  ABC transporter related protein  54.6 
 
 		 329 aa  255  9e-67  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0326508  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2398  ABC transporter related protein  49.65 
 
 		 300 aa  251  1e-65  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000000133291  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2342  ABC transporter related  52.51 
 
 		 319 aa  251  1e-65  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.2832 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1138  ABC transporter related  48.8 
 
 		 311 aa  246  4.9999999999999997e-64  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.129025  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9332  ABC transporter related protein  49.48 
 
 		 299 aa  235  1.0000000000000001e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.45815 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4919  ABC transporter related protein  49.64 
 
 		 302 aa  233  3e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0999062  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2101  ABC transporter related  48.04 
 
 		 322 aa  228  1e-58  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0274  ABC transporter related protein  47.08 
 
 		 303 aa  228  2e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3544  ABC transporter related  48.41 
 
 		 302 aa  227  2e-58  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0818201  normal  0.548154 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1843  ABC transporter related  46.08 
 
 		 322 aa  225  1e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000163971 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0172  ABC transporter related  47.74 
 
 		 322 aa  221  9.999999999999999e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0720  ABC transporter related  43.96 
 
 		 305 aa  220  3e-56  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00029064  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_700  ABC transporter, ATP-binding protein  43.29 
 
 		 305 aa  216  5e-55  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.365383  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3320  ABC transporter related protein  44.92 
 
 		 331 aa  216  7e-55  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0794  ABC transporter, ATP-binding protein  43.29 
 
 		 305 aa  214  1.9999999999999998e-54  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00734303  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0612  ABC transporter related protein  47.92 
 
 		 314 aa  212  7.999999999999999e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.787595  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3802  ABC transporter related  45.7 
 
 		 330 aa  211  1e-53  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.550833  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5131  ABC transporter related protein  44.82 
 
 		 301 aa  210  4e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.135595  normal  0.223967 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0278  ABC transporter related  37.33 
 
 		 308 aa  209  4e-53  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.833844  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0191  ABC transporter related  46.5 
 
 		 305 aa  209  7e-53  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.668087  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4231  ABC transporter related  39.73 
 
 		 304 aa  204  2e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4559  ABC transporter related protein  44.6 
 
 		 285 aa  201  1.9999999999999998e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.995467  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14590  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  54.19 
 
 		 331 aa  201  1.9999999999999998e-50  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.294178  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0482  ABC transporter related  43.77 
 
 		 322 aa  201  1.9999999999999998e-50  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0554  ABC transporter related  37.41 
 
 		 305 aa  200  3e-50  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.31573  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11470  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  55.71 
 
 		 321 aa  199  5e-50  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.160218  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0540  ABC transporter related  37.07 
 
 		 301 aa  199  7.999999999999999e-50  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3622  ABC transporter related  48.47 
 
 		 290 aa  199  1.0000000000000001e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2960  ABC transporter related protein  43.39 
 
 		 314 aa  195  9e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00870565  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4004  ABC transporter related  49.31 
 
 		 282 aa  195  1e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0853449  hitchhiker  0.000219352 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3107  ABC transporter related protein  48.46 
 
 		 323 aa  195  1e-48  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000248355 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0910  ABC transporter-like protein  49.75 
 
 		 284 aa  193  5e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29910  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  46.37 
 
 		 313 aa  192  7e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.880888  normal  0.697642 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5630  ABC transporter related protein  44.48 
 
 		 302 aa  192  1e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.694537  normal  0.578056 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3067  ABC transporter related  44.6 
 
 		 254 aa  191  1e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0284  ABC transporter, ATPase subunit  41.61 
 
 		 310 aa  191  2e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0349  ABC transporter related protein  44.44 
 
 		 301 aa  189  5e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.172507  normal  0.855348 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4747  ABC transporter related protein  52.71 
 
 		 237 aa  188  1e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.667529 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33070  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  40.6 
 
 		 286 aa  187  2e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.468184  normal  0.320706 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4203  ABC transporter related  40.34 
 
 		 741 aa  187  2e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.746448  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1549  ABC transporter related  40.13 
 
 		 319 aa  187  3e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.819341  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0151  ABC transporter related  35.74 
 
 		 283 aa  186  4e-46  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4397  ABC transporter related protein  48.82 
 
 		 301 aa  186  5e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.355124  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3480  ABC transporter-like protein  41.16 
 
 		 319 aa  186  6e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1687  ABC transporter, ATP-binding protein  47.87 
 
 		 280 aa  186  8e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2680  ABC transporter related protein  45.86 
 
 		 297 aa  185  1.0000000000000001e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0609  ABC transporter related protein  41.31 
 
 		 301 aa  185  1.0000000000000001e-45  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0095  ABC transporter related  37.33 
 
 		 310 aa  184  2.0000000000000003e-45  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00000602484  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0704  ABC transporter related  43.22 
 
 		 256 aa  182  7e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.187193  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1677  ABC transporter, ATPase subunit  39.2 
 
 		 353 aa  179  5.999999999999999e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.42394 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0291  ABC-type multidrug transport system ATPase component  37.67 
 
 		 324 aa  179  9e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2940  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.83 
 
 		 335 aa  178  1e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.121696 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1027  ABC transporter related protein  53.23 
 
 		 317 aa  178  1e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.87943  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0713  ABC transporter related  35.86 
 
 		 295 aa  178  1e-43  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3102  ABC transporter related  41.95 
 
 		 300 aa  177  2e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00319499  hitchhiker  0.0000545387 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7343  ABC transporter related  48.28 
 
 		 284 aa  176  6e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00991324 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5477  ABC transporter related protein  39.17 
 
 		 330 aa  176  6e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4255  ABC transporter related  40.14 
 
 		 312 aa  176  7e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3573  ABC transporter related  38.22 
 
 		 326 aa  176  7e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0525989  normal  0.645045 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2471  ABC transporter related protein  45.91 
 
 		 302 aa  176  8e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0608955  hitchhiker  0.00400758 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2609  ABC transporter related protein  40.14 
 
 		 303 aa  175  9.999999999999999e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000000416385  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2430  ABC transporter related  41.3 
 
 		 303 aa  175  9.999999999999999e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0400473  normal  0.675282 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16220  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  39.32 
 
 		 323 aa  174  1.9999999999999998e-42  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.4304  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2585  ABC transporter related  40.4 
 
 		 308 aa  174  1.9999999999999998e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.345311  normal  0.0961797 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0144  ABC transporter related protein  43.96 
 
 		 300 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.113236 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0195  ABC transporter related  46.86 
 
 		 263 aa  173  2.9999999999999996e-42  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.61853  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4160  ABC transporter related  40.88 
 
 		 314 aa  173  3.9999999999999995e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1776  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  40.27 
 
 		 319 aa  173  3.9999999999999995e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.179608 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1267  ABC transporter-like protein  40.14 
 
 		 303 aa  173  5e-42  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.684433 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3547  ABC transporter-like protein  43.86 
 
 		 290 aa  173  5e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.757976 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5534  ABC transporter, ATP-binding protein  33.92 
 
 		 300 aa  172  5.999999999999999e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3874  ABC transporter-related protein  33.92 
 
 		 300 aa  172  7.999999999999999e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.987197  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3171  ABC transporter related  51.76 
 
 		 294 aa  172  7.999999999999999e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0428846 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0040  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  40.67 
 
 		 321 aa  172  9e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5600  ABC transporter ATP-binding protein  33.92 
 
 		 300 aa  172  1e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7156  ABC transporter related protein  47.66 
 
 		 281 aa  171  1e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.023596 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>