155 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_1755 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013204  Elen_1755  type II secretion system protein  100 
 
 
306 aa  612  9.999999999999999e-175  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0468876  normal  0.156837 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0881  type II secretion system protein  31.48 
 
 
296 aa  116  5e-25  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1681  type II secretion system protein  35.87 
 
 
327 aa  115  7.999999999999999e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000554602 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1275  type II secretion system protein  35.87 
 
 
327 aa  114  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4618  type II secretion system protein  32.6 
 
 
325 aa  112  6e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.347884 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3211  type II secretion system protein  29.43 
 
 
332 aa  112  7.000000000000001e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.515921 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4480  type II secretion system protein  29.64 
 
 
335 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2117  type II secretion system protein  30.39 
 
 
323 aa  110  4.0000000000000004e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.215511  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0794  TadB protein  31.15 
 
 
322 aa  108  1e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0805  type II secretion system protein  33.16 
 
 
332 aa  108  2e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2934  type II secretion system protein  32.13 
 
 
310 aa  106  4e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.898697  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0301  type II secretion system protein  30 
 
 
322 aa  106  4e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.83716  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4192  type II secretion system protein  28.57 
 
 
335 aa  106  4e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2926  type II secretion system protein  31.27 
 
 
316 aa  105  8e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.194464  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0423  type II secretion system protein  26.55 
 
 
327 aa  105  9e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2648  type II secretion system protein  32.18 
 
 
325 aa  105  1e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.846327  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1904  putative Flp pilus assembly protein TadB  30 
 
 
322 aa  105  1e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0239588  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0553  type II secretion system protein  30 
 
 
322 aa  105  1e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2824  type II secretion system protein  31.93 
 
 
320 aa  104  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0587  type II secretion system protein  31.67 
 
 
325 aa  104  2e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.292089  normal  0.415996 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1851  type II secretion system protein  29.96 
 
 
660 aa  104  2e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00122698  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2649  type II secretion system protein  31.95 
 
 
310 aa  103  5e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1753  Flp pilus assembly protein TadB  30.11 
 
 
325 aa  101  1e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0800  type II secretion system protein  30.1 
 
 
322 aa  102  1e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0640  type II secretion system protein  32.57 
 
 
325 aa  101  1e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.295246 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2353  type II secretion system protein  28.28 
 
 
323 aa  100  2e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.173092  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5325  type II secretion system protein  35.54 
 
 
326 aa  100  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.61312  hitchhiker  0.00813406 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4614  type II secretion system protein  33.18 
 
 
329 aa  100  3e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1108  type II secretion system protein  28.83 
 
 
321 aa  98.6  1e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.143075  normal  0.274836 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2556  type II secretion system protein  29.35 
 
 
325 aa  97.8  2e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.460971  normal  0.349812 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1529  type II secretion system protein  29.64 
 
 
330 aa  97.8  2e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1125  type II secretion system protein  28.52 
 
 
322 aa  98.2  2e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0517135  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0654  TadB protein  29.69 
 
 
322 aa  97.1  3e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.179736 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2350  type II secretion system protein  29.24 
 
 
322 aa  96.7  5e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.363474 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1054  type II secretion system protein  29.26 
 
 
320 aa  95.1  1e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2912  type II secretion system protein  32.26 
 
 
320 aa  95.5  1e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3207  type II secretion system protein  29.26 
 
 
320 aa  94.4  2e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.19811 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4445  type II secretion system protein  27.87 
 
 
309 aa  94.7  2e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00467148 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3092  type II secretion system protein  33.75 
 
 
325 aa  94.4  2e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2967  type II secretion system protein  33.75 
 
 
325 aa  94.4  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.350744  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1042  Type II secretion system F domain protein  29.67 
 
 
313 aa  94  3e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.205171  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1317  Flp pilus assembly protein TadB  33.75 
 
 
325 aa  94  3e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0237  type II secretion system protein  22.46 
 
 
328 aa  94  3e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.383042  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4156  type II secretion system protein  33.15 
 
 
323 aa  94  3e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.625918  normal  0.530435 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6365  type II secretion system protein  32.35 
 
 
325 aa  94  3e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7194  Flp pilus assembly protein TadB  29.1 
 
 
325 aa  93.6  4e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0666217  normal  0.429019 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3351  type II secretion system protein  30.9 
 
 
335 aa  93.2  4e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0727  type II secretion system protein  25.68 
 
 
337 aa  93.2  5e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.352668  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3421  Type II secretion system F domain protein  31.33 
 
 
310 aa  92.4  8e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.735611  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6299  type II secretion system protein  32.9 
 
 
325 aa  92.4  9e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1523  type II secretion system protein  28.27 
 
 
328 aa  91.7  1e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1832  type II secretion system protein  28.49 
 
 
316 aa  92  1e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1499  type II secretion system protein  32.47 
 
 
321 aa  91.7  1e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.698875  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3965  type II secretion system protein  30.73 
 
 
320 aa  92  1e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.264844 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6003  type II secretion system protein  32.9 
 
 
325 aa  92  1e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0603  type II secretion system protein  27.02 
 
 
338 aa  90.1  4e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.512211  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6777  type II secretion system protein  31.86 
 
 
325 aa  90.5  4e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.270969  normal  0.612228 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2699  type II secretion system protein  32.41 
 
 
321 aa  90.1  4e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1018  type II secretion system protein  30.83 
 
 
336 aa  90.1  5e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5491  type II secretion system protein  36.25 
 
 
325 aa  89.4  8e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1780  type II secretion system protein  26.96 
 
 
324 aa  89  1e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.131583 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1076  type II secretion system protein  25.71 
 
 
324 aa  88.6  1e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.195162  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0213  component of type IV pilus  26.21 
 
 
334 aa  88.6  1e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2308  Type II secretion system F domain protein  29.24 
 
 
284 aa  88.6  1e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4865  type II secretion system protein  29.48 
 
 
324 aa  88.2  1e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3356  type II secretion system protein  25.35 
 
 
336 aa  88.6  1e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4395  type II secretion system protein  32.73 
 
 
317 aa  87.8  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.925008  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3795  type II secretion system protein  27.62 
 
 
325 aa  87.8  2e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.187172  normal  0.96616 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2275  Flp pilus assembly protein TadB  32.28 
 
 
325 aa  87.4  3e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0651  putative tight adherence TadB-related transmembrane protein  27.42 
 
 
325 aa  87  4e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.280791 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2737  type II secretion system protein  31.37 
 
 
321 aa  85.5  9e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0544  type II secretion system protein  29.95 
 
 
325 aa  85.5  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.106661  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0993  type II secretion system protein  29.85 
 
 
322 aa  84.7  0.000000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.146883  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1126  type II secretion system protein  25.29 
 
 
310 aa  84.7  0.000000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0371029  normal  0.497639 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0387  type II secretion system protein  25.9 
 
 
324 aa  83.6  0.000000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.88705  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1160  Type II secretion system F domain protein  25.29 
 
 
323 aa  83.2  0.000000000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4204  type II secretion system protein  25.33 
 
 
324 aa  82.8  0.000000000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0804917  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2364  hypothetical protein  28.82 
 
 
321 aa  82.8  0.000000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.288668  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4189  type II secretion system protein  25.75 
 
 
325 aa  82.8  0.000000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.54214  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2922  putative type II secretion system protein F  28.09 
 
 
282 aa  82.4  0.000000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.840651  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3524  type II secretion system protein  25.68 
 
 
324 aa  82  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3010  type II secretion system protein  30.64 
 
 
321 aa  81.6  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2115  type II secretion system protein  29.51 
 
 
279 aa  81.3  0.00000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1917  type II secretion system protein  27.8 
 
 
321 aa  81.3  0.00000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.258716  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2640  type II secretion system protein  29.02 
 
 
316 aa  80.9  0.00000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7035  putative pilus assembly protein  25.68 
 
 
324 aa  80.1  0.00000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.611985 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2484  type II secretion system protein  25.87 
 
 
323 aa  80.1  0.00000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2570  type II secretion system protein  25.62 
 
 
314 aa  80.1  0.00000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2707  type II secretion system protein  25.87 
 
 
323 aa  79.7  0.00000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.608864  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2487  type II secretion system protein  27.23 
 
 
306 aa  79.7  0.00000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.744941  hitchhiker  0.000224716 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5121  type II secretion system protein  24.57 
 
 
332 aa  80.1  0.00000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0725578 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3794  type II secretion system protein  27.33 
 
 
327 aa  80.1  0.00000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.927579  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3717  type II secretion system protein  24.66 
 
 
324 aa  79.3  0.00000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.20351  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2380  type II secretion system protein  26.64 
 
 
322 aa  79.3  0.00000000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.316858  normal  0.875213 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6877  type II secretion system protein  26.4 
 
 
282 aa  79  0.00000000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.44202  normal  0.236488 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1814  type II secretion system protein  25.58 
 
 
285 aa  77.8  0.0000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0127821  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1724  type II secretion system protein  25.67 
 
 
315 aa  77  0.0000000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1205  type II secretion system protein  25.5 
 
 
535 aa  76.6  0.0000000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.499257  hitchhiker  0.000000000038758 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4347  type II secretion system protein  25.41 
 
 
275 aa  75.9  0.0000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.277812  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2762  type II secretion system protein  25.49 
 
 
333 aa  75.9  0.0000000000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.58237 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>