More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_2279 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008751  Dvul_2279  HflK protein  100 
 
 
378 aa  769  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2674  HflK protein  69.63 
 
 
388 aa  538  1e-152  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0162976 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2946  HflK protein  66.29 
 
 
359 aa  458  1e-128  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0866  HflK protein  59.9 
 
 
387 aa  439  1e-122  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0134837  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0263  HflK protein  56.47 
 
 
360 aa  420  1e-116  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0486  HflK protein  52.04 
 
 
361 aa  382  1e-105  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.333714 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1573  HflK protein  45.1 
 
 
367 aa  296  5e-79  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  4.27817e-07  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2203  HflK  45.9 
 
 
407 aa  276  5e-73  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1981  hflK protein  44.7 
 
 
403 aa  271  2e-71  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.245892  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1664  HflK protein  41.32 
 
 
385 aa  262  7e-69  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0743516 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2728  HflK protein  40.82 
 
 
385 aa  260  3e-68  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2588  HflK-like protein  46.6 
 
 
413 aa  260  3e-68  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0268051  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1090  HflK protein  37.89 
 
 
405 aa  258  1e-67  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4005  HflK protein  41.57 
 
 
383 aa  256  6e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.906349  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1050  hflK protein  45.03 
 
 
357 aa  254  2e-66  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3352  HflK protein  41.06 
 
 
389 aa  253  4e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.154635 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2458  HflK protein  43 
 
 
398 aa  253  5e-66  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0761893 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2349  HflK  40.94 
 
 
382 aa  252  6e-66  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.384267  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0843  HflK  44.04 
 
 
355 aa  251  1e-65  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3262  HflK protein  41.93 
 
 
383 aa  251  1e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.264682  normal  0.260183 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0603  HflK  42.72 
 
 
395 aa  250  3e-65  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.425074 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6097  protease activity modulator HflK  44.12 
 
 
379 aa  246  3e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0664  HflK protein  40.4 
 
 
395 aa  246  3e-64  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.119349  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0445  HflK protein  41.97 
 
 
399 aa  246  6e-64  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.713082  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0831  hflK protein  41.81 
 
 
344 aa  243  3e-63  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.604081  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3384  HflK protein  40.88 
 
 
359 aa  241  1e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.16512  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2978  HflK  41.98 
 
 
436 aa  240  2e-62  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.750881  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1284  HflK protein  40.55 
 
 
503 aa  241  2e-62  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2038  HflK protein  39.25 
 
 
390 aa  240  3e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.989603  normal  0.793303 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0604  HflK protein  41.76 
 
 
368 aa  238  2e-61  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0450848 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0673  HflK protein  41.72 
 
 
498 aa  238  2e-61  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3383  HflK protein  42.63 
 
 
433 aa  236  4e-61  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1107  HflK protein  42.96 
 
 
308 aa  236  5e-61  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0999  HflK protein  42.96 
 
 
308 aa  235  8e-61  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1730  HflK protein  40.16 
 
 
389 aa  231  2e-59  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000348315 
 
 
-
 
NC_004310  BR1397  hflK protein  40.44 
 
 
382 aa  230  3e-59  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1587  HflK protein  39.59 
 
 
391 aa  229  5e-59  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  unclonable  2.87062e-07 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1353  band 7 protein:stomatin  40.17 
 
 
384 aa  226  4e-58  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.792313  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0164  HflK protein  42.35 
 
 
347 aa  224  2e-57  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  5.64548e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0899  HflK protein  40.68 
 
 
393 aa  224  3e-57  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0975444  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3678  HflK protein  41.94 
 
 
350 aa  223  3e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3613  HflK protein  41.94 
 
 
350 aa  223  4e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2099  HflK protein  38.24 
 
 
447 aa  223  5e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.080069 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1066  HflK protein  40.06 
 
 
477 aa  223  6e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.544735  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0630  HflK protein  41.29 
 
 
309 aa  222  8e-57  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0701  HflK protein  38.54 
 
 
389 aa  222  9e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.704502  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3522  HflK protein  41.55 
 
 
378 aa  221  1e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1794  HflK protein  41.58 
 
 
383 aa  222  1e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.301305  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2262  HflK protein  38.2 
 
 
333 aa  222  1e-56  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.5812e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1222  hypothetical protein  40.53 
 
 
447 aa  221  2e-56  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0015724  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1158  HflK protein  39.74 
 
 
475 aa  220  3e-56  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2818  HFLK protein  38.66 
 
 
383 aa  220  3e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.44638  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1989  hypothetical protein  40.4 
 
 
435 aa  219  5e-56  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.757808  normal  0.0447269 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2011  HflK protein  38.97 
 
 
378 aa  219  5e-56  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.166821  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2079  HflK  38.76 
 
 
457 aa  219  7e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1089  HflK protein  38.51 
 
 
386 aa  219  7e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0604271 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1879  HflK protein  39.47 
 
 
471 aa  218  1e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.239775  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2601  HflK protein  39.47 
 
 
474 aa  218  2e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.373557  normal  0.662751 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07560  membrane bound protease regulator HflK  38.22 
 
 
351 aa  217  3e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00092  serine protease  39.42 
 
 
401 aa  217  3e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0574  HflK  37.22 
 
 
400 aa  216  6e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.872643 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1749  HflK protein  38.86 
 
 
376 aa  215  1e-54  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.254466  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2300  HflK protein  39.53 
 
 
464 aa  214  1e-54  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.194929  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2760  hflK protein  39.47 
 
 
395 aa  215  1e-54  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.467094  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5012  HflK protein  38.16 
 
 
464 aa  215  1e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.967957  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1942  HflK protein  39.41 
 
 
406 aa  215  1e-54  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1321  HflK protein  37.2 
 
 
331 aa  215  1e-54  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.132959  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2018  HflK protein  40.38 
 
 
362 aa  215  1e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0184  HflK protein  35.8 
 
 
350 aa  214  2e-54  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.464888  normal  0.739242 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0560  HflK protein  35.83 
 
 
379 aa  214  2e-54  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  5.08673e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1431  HflK protein  38.1 
 
 
471 aa  213  3e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.936066 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1561  HflK protein  40.89 
 
 
397 aa  213  4e-54  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.920628  hitchhiker  1.45898e-09 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1886  hflK protein  40.89 
 
 
397 aa  213  4e-54  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1177  HflK protein  38.82 
 
 
451 aa  213  5e-54  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.621922 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0575  HflK protein  36.78 
 
 
459 aa  213  5e-54  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.289879  hitchhiker  3.63385e-10 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1097  HflK protein  38.82 
 
 
451 aa  213  5e-54  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5671  protease subunit HflK  37.79 
 
 
399 aa  213  6e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002261  HflK protein  39.07 
 
 
401 aa  213  6e-54  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0330443  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4683  HflK protein  38.46 
 
 
393 aa  212  7e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65280  protease subunit HflK  37.46 
 
 
400 aa  211  1e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4768  HflK protein  38.13 
 
 
393 aa  211  1e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0073  HflK protein  38.1 
 
 
452 aa  211  2e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.715541  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4944  HflK protein  37.79 
 
 
393 aa  211  2e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00499727 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0605  hflK protein  35.73 
 
 
381 aa  211  2e-53  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4892  HflK protein  38.13 
 
 
405 aa  211  2e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.42676  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2800  HflK protein  40.92 
 
 
360 aa  211  2e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.182223  normal  0.400207 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3344  HflK protein  40.94 
 
 
370 aa  210  3e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.405881  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3765  HflK protein  35.85 
 
 
379 aa  210  4e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  2.2736e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3891  HflK protein  35.85 
 
 
379 aa  210  4e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  4.65537e-05  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0600  HflK protein  35.46 
 
 
381 aa  209  4e-53  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0138092  hitchhiker  0.00143389 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2780  HflK protein  39.29 
 
 
379 aa  210  4e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.224376 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3430  HflK protein  35.46 
 
 
381 aa  210  4e-53  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0909026  normal  0.0445873 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3708  HflK protein  35.85 
 
 
379 aa  210  4e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  7.88714e-05  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0665  HflK protein  35.8 
 
 
322 aa  209  6e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4940  hflK protein  36.57 
 
 
395 aa  209  6e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0637  HflK protein  36.49 
 
 
389 aa  209  8e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0128609 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2024  HflK protein  38.74 
 
 
379 aa  209  8e-53  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3023  hflK protein  35.29 
 
 
377 aa  208  1e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000561401  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3309  HflK protein  35.41 
 
 
386 aa  206  4e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2541  HflK protein  39.6 
 
 
362 aa  207  4e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>