186 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_2863 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_2863  AsmA family protein  100 
 
 		 711 aa  1392    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2162  AsmA family protein  32.01 
 
 		 701 aa  311  4e-83  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.152966  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1028  hypothetical protein  31.34 
 
 		 725 aa  297  4e-79  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.632611  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2265  hypothetical protein  28.94 
 
 		 812 aa  234  5e-60  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2948  AsmA family protein  27.45 
 
 		 712 aa  206  1e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.50394  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2694  AsmA family protein  29.09 
 
 		 699 aa  194  5e-48  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.264  normal  0.390099 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4921  AsmA family protein  26.16 
 
 		 747 aa  173  7.999999999999999e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00010257 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4900  AsmA  25.38 
 
 		 741 aa  173  1e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0312  AsmA family protein  26.33 
 
 		 748 aa  172  2e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0287  AsmA family protein  26.71 
 
 		 748 aa  171  5e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000233767 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0307  AsmA family protein  27.16 
 
 		 748 aa  170  1e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0304017 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2483  AsmA family protein  25.82 
 
 		 742 aa  169  2e-40  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4258  AsmA family protein  25.88 
 
 		 741 aa  166  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000475178 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5341  hypothetical protein  25.3 
 
 		 741 aa  164  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1852  AsmA family protein  25.71 
 
 		 797 aa  163  1e-38  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04540  hypothetical protein  25.45 
 
 		 748 aa  162  2e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0321  AsmA  24.81 
 
 		 740 aa  160  9e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.188121  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67975  hypothetical protein  24.24 
 
 		 750 aa  160  9e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.302933  normal  0.0556453 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1953  AsmA family protein  24.72 
 
 		 682 aa  157  5.0000000000000005e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.279291  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2178  AsmA family protein  26.95 
 
 		 695 aa  156  2e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5883  hypothetical protein  24.77 
 
 		 750 aa  155  2e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3175  AsmA family protein  25.51 
 
 		 741 aa  152  2e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1140  AsmA family protein  26.26 
 
 		 732 aa  147  5e-34  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.999799  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0521  AsmA  24.39 
 
 		 789 aa  140  1e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0754  AsmA family protein  24.47 
 
 		 745 aa  140  1e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002984  AsmA protein  23.52 
 
 		 695 aa  133  1.0000000000000001e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2566  asmA protein  24.86 
 
 		 606 aa  131  5.0000000000000004e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2024  AsmA  24.26 
 
 		 614 aa  130  8.000000000000001e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000524921  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0557  asmA protein  24.18 
 
 		 703 aa  127  9e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00432882  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2372  AsmA protein  24.48 
 
 		 606 aa  125  3e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00905663  normal  0.0519979 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2526  AsmA  28.72 
 
 		 893 aa  119  1.9999999999999998e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0552  AsmA family protein  26.23 
 
 		 677 aa  117  5e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.259696  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02923  hypothetical protein  23.12 
 
 		 695 aa  117  5e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2229  putative outer membrane assembly protein  21.96 
 
 		 719 aa  116  2.0000000000000002e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.87964  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0159  AsmA family protein  27.37 
 
 		 794 aa  112  2.0000000000000002e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1851  AsmA family protein  22.97 
 
 		 709 aa  108  3e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.997541 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2331  AsmA family protein  26.81 
 
 		 607 aa  99.4  2e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00854787  hitchhiker  0.00634925 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2056  AsmA family protein  26.67 
 
 		 607 aa  99  3e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.399142  hitchhiker  0.00088344 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1993  AsmA family protein  26.5 
 
 		 607 aa  97.4  7e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2008  AsmA family protein  26.5 
 
 		 607 aa  97.4  8e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0960641  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1004  AsmA family protein  25.65 
 
 		 502 aa  97.1  1e-18  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000644102  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1134  ASMA  25.65 
 
 		 508 aa  97.1  1e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.038364  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2116  AsmA family protein  38.69 
 
 		 614 aa  96.7  1e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.738267  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2614  AsmA family protein  35.77 
 
 		 606 aa  95.9  2e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.745873  normal  0.322867 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1682  hypothetical protein  24.93 
 
 		 1095 aa  95.9  3e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.175691  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1332  AsmA family protein  26.9 
 
 		 696 aa  92  4e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.176392  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2209  AsmA family protein  33.66 
 
 		 606 aa  90.9  8e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0212  hypothetical protein  25.5 
 
 		 1217 aa  90.5  1e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0447715 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1985  AsmA family protein  33.12 
 
 		 611 aa  87.8  6e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0885974  normal  0.0733894 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2409  AsmA family protein  28.52 
 
 		 612 aa  87.8  6e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.278474  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2241  AsmA family protein  32.65 
 
 		 606 aa  87.4  9e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.104222  normal  0.355768 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1887  AsmA protein  25.91 
 
 		 604 aa  87.4  9e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.510755  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2164  AsmA family protein  32.65 
 
 		 606 aa  87  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0565997  normal  0.411123 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6831  putative asmA protein, assembly of outer membrane proteins  24.61 
 
 		 645 aa  81.3  0.00000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0946528  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1773  AsmA family protein  38.94 
 
 		 608 aa  80.9  0.00000000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000090206  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1019  outer membrane protein assembly protein AsmA  26.67 
 
 		 640 aa  79.7  0.0000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0118  AsmA  20.77 
 
 		 762 aa  73.6  0.00000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.413911  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3055  AsmA family protein  27.04 
 
 		 657 aa  71.2  0.00000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.655109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1745  hypothetical protein  24.2 
 
 		 482 aa  70.5  0.00000000009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1009  hypothetical protein  22.29 
 
 		 656 aa  70.1  0.0000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.526606 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4747  AsmA family protein  21.45 
 
 		 678 aa  69.3  0.0000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0711  AsmA family protein  28.31 
 
 		 609 aa  68.6  0.0000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2869  putative assembly protein  25.16 
 
 		 604 aa  67  0.000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4857  AsmA family protein  24.22 
 
 		 688 aa  66.2  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000523424 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2254  hypothetical protein  25.21 
 
 		 632 aa  66.6  0.000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.134961  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1291  putative assembly protein  25.65 
 
 		 611 aa  65.5  0.000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4914  AsmA family protein  25.49 
 
 		 688 aa  65.1  0.000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000550525 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4735  AsmA family protein  24.22 
 
 		 688 aa  65.1  0.000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000197359 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0854  AsmA family protein  25.21 
 
 		 715 aa  65.1  0.000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000000187162  hitchhiker  0.00000372454 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0651  AsmA  23.24 
 
 		 646 aa  63.9  0.000000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.639423 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0590  uncharacterized protein involved in outer membrane biogenesis  27.35 
 
 		 826 aa  63.5  0.00000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1703  AsmA family protein  24.8 
 
 		 782 aa  62.8  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2006  hypothetical protein  32.41 
 
 		 660 aa  62.8  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0368531  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0716  AsmA family protein  32.41 
 
 		 660 aa  62.8  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.194292 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3103  AsmA family protein  25.75 
 
 		 675 aa  62.8  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.596916  normal  0.117573 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1309  AsmA family protein  28.22 
 
 		 830 aa  61.6  0.00000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2319  AsmA family protein  28.22 
 
 		 830 aa  61.6  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2268  AsmA family protein  28.22 
 
 		 818 aa  62  0.00000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.1369  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3040  putative assembly protein  23.58 
 
 		 611 aa  61.6  0.00000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1796  AsmA family protein  28.22 
 
 		 830 aa  61.6  0.00000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.147838  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0099  AsmA family protein  28.22 
 
 		 830 aa  61.6  0.00000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.483374  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2151  AsmA family protein  28.22 
 
 		 830 aa  61.6  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1067  AsmA family protein  28.22 
 
 		 830 aa  61.6  0.00000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.103538  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01970  predicted assembly protein  20.81 
 
 		 617 aa  61.6  0.00000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01959  hypothetical protein  20.81 
 
 		 617 aa  61.6  0.00000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2188  AsmA family protein  28.22 
 
 		 824 aa  61.6  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0079  AsmA  23.6 
 
 		 669 aa  61.2  0.00000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.178612  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1659  AsmA family protein  22.34 
 
 		 1191 aa  61.2  0.00000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.242862 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5601  hypothetical protein  34.15 
 
 		 689 aa  61.2  0.00000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02380  AsmA family protein  28.57 
 
 		 677 aa  60.8  0.00000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2204  putative assembly protein  22.69 
 
 		 617 aa  60.5  0.0000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64510  hypothetical protein  32.93 
 
 		 689 aa  60.1  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1593  AsmA family protein  20.52 
 
 		 617 aa  59.3  0.0000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00514431  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1181  AsmA  24.36 
 
 		 667 aa  59.3  0.0000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.256758  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1577  putative assembly protein  20.52 
 
 		 617 aa  59.3  0.0000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.190719  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0996  putative assembly protein  20.52 
 
 		 617 aa  59.3  0.0000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2357  putative assembly protein  20.52 
 
 		 617 aa  59.3  0.0000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2678  putative assembly protein  19.83 
 
 		 615 aa  59.7  0.0000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.462778  normal  0.273138 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2209  AsmA  26.78 
 
 		 1077 aa  58.9  0.0000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1578  putative assembly protein  23.49 
 
 		 611 aa  58.5  0.0000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.976931  normal  0.530891 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>