More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_3371 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008782  Ajs_4021  RND efflux system outer membrane lipoprotein  97.73 
 
 
483 aa  820  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.227062  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3371  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  100 
 
 
484 aa  934  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.00556392  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4662  RND efflux system outer membrane lipoprotein  63.18 
 
 
480 aa  533  1e-150  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2412  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  54.66 
 
 
498 aa  409  1e-113  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.376385  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3900  RND efflux system outer membrane lipoprotein  58.26 
 
 
488 aa  409  1e-113  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.362136  normal  0.120633 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4106  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  51.18 
 
 
485 aa  375  1e-102  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0438089  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4545  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  44.89 
 
 
525 aa  323  3e-87  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3473  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  44.89 
 
 
525 aa  323  3e-87  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0809824  normal  0.12883 
 
 
-
 
NC_003296  RS05806  putative outer membrane lipoprotein  42.04 
 
 
490 aa  305  2e-81  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.300905 
 
 
-
 
NC_003296  RS01780  outer membrane CHANEL lipoprotein  43.87 
 
 
522 aa  304  2e-81  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2135  putative outer membrane channel lipoprotein  48.26 
 
 
483 aa  301  2e-80  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0693732  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2620  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  43.84 
 
 
476 aa  297  3e-79  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.250647  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2969  RND efflux system outer membrane lipoprotein  43.64 
 
 
521 aa  286  6e-76  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0473901 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7487  nodulation protein T precursor  37.77 
 
 
490 aa  282  8e-75  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5661  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  38.53 
 
 
474 aa  264  2e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.434988 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3560  RND efflux system outer membrane lipoprotein  32.64 
 
 
493 aa  192  1e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1872  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  30.23 
 
 
509 aa  174  3e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3547  RND efflux system outer membrane lipoprotein  34.62 
 
 
477 aa  174  3e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.138729  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1415  RND efflux system outer membrane lipoprotein NodT  35.68 
 
 
520 aa  172  2e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2429  RND efflux system outer membrane lipoprotein  33.83 
 
 
467 aa  171  2e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.41681  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2485  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  30.79 
 
 
487 aa  172  2e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.072827  normal  0.13209 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3093  outer membrane protein  31.81 
 
 
503 aa  170  5e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  7.56103e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6200  multidrug efflux system outer membrane subunit  30.11 
 
 
504 aa  170  6e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.584656  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0814  outer membrane protein  32.02 
 
 
479 aa  168  2e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2819  outer membrane protein OprJ  31.25 
 
 
468 aa  166  1e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.980235 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2240  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  29.35 
 
 
518 aa  165  2e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2616  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  31.41 
 
 
501 aa  163  6e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2799  RND efflux system outer membrane lipoprotein  31.06 
 
 
495 aa  160  3e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3184  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  32.85 
 
 
475 aa  159  9e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2189  RND efflux system outer membrane lipoprotein  31.53 
 
 
496 aa  159  1e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.250734  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5237  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  30.98 
 
 
516 aa  159  1e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.776503  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0887  RND efflux system outer membrane lipoprotein  29.85 
 
 
586 aa  159  1e-37  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  4.21492e-05  hitchhiker  2.63613e-05 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2899  RND efflux system outer membrane lipoprotein  32.62 
 
 
504 aa  157  3e-37  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2332  RND efflux system outer membrane lipoprotein  31.29 
 
 
496 aa  157  4e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1595  multidrug efflux system outer membrane subunit  29.23 
 
 
520 aa  157  5e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3919  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  32.82 
 
 
489 aa  156  7e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1407  RND efflux system outer membrane lipoprotein  32.33 
 
 
488 aa  156  9e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.380774 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5135  RND efflux system outer membrane lipoprotein  33.26 
 
 
493 aa  155  1e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.523851  normal  0.980288 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1919  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  31.22 
 
 
482 aa  156  1e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.328582  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4060  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  27.62 
 
 
492 aa  154  2e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1481  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  27.62 
 
 
491 aa  154  2e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.290116  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3582  RND efflux transporter  31.06 
 
 
496 aa  155  2e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.109729  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2756  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  31.19 
 
 
469 aa  154  3e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0415066  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2924  RND efflux system outer membrane lipoprotein  33.05 
 
 
511 aa  154  4e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2756  outer membrane efflux protein  30 
 
 
490 aa  154  5e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.158368  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2451  RND efflux system outer membrane lipoprotein  33.33 
 
 
514 aa  154  5e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.628376 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5856  RND efflux system outer membrane lipoprotein  33.97 
 
 
493 aa  152  1e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0649  RND efflux system outer membrane lipoprotein  28.7 
 
 
496 aa  152  2e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.814679  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5505  RND efflux system outer membrane lipoprotein  28.7 
 
 
496 aa  152  2e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.130053  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0699  hypothetical protein  27.52 
 
 
489 aa  151  2e-35  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0783  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  30.93 
 
 
493 aa  151  3e-35  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.436637  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0719  hypothetical protein  27.52 
 
 
479 aa  151  3e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2162  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  29.46 
 
 
475 aa  150  6e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0722212  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2139  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  31.67 
 
 
517 aa  149  7e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.971447 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0387  Fis family transcriptional regulator  31.67 
 
 
492 aa  149  1e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6027  nodulation protein T precursor  29.36 
 
 
483 aa  149  2e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3811  RND efflux system outer membrane lipoprotein  33.04 
 
 
476 aa  148  2e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.521708  normal  0.399123 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2564  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  31.34 
 
 
495 aa  147  4e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.248386  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5238  outer membrane protein OprM  31.94 
 
 
475 aa  147  5e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2742  RND efflux system outer membrane lipoprotein  26.82 
 
 
517 aa  146  7e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1391  RND efflux system outer membrane lipoprotein  30.71 
 
 
485 aa  146  7e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.228401  normal  0.164456 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2820  RND efflux system outer membrane lipoprotein  26.82 
 
 
517 aa  146  7e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0851  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  28.7 
 
 
504 aa  146  9e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0745  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  31.04 
 
 
477 aa  145  1e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.321053 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1891  outer membrane efflux protein OprA  33.87 
 
 
513 aa  145  1e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.271004  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1086  RND efflux system outer membrane lipoprotein  32.92 
 
 
482 aa  146  1e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.981132  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3157  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  28.13 
 
 
480 aa  145  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3706  RND efflux system outer membrane lipoprotein  34.4 
 
 
498 aa  145  2e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0175295 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1591  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  28.15 
 
 
481 aa  145  2e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  unclonable  2.92967e-07 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3590  RND efflux system outer membrane lipoprotein NodT  30.04 
 
 
491 aa  145  2e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2428  RND efflux system outer membrane lipoprotein  29.52 
 
 
509 aa  144  2e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.440095 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1397  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  30.25 
 
 
483 aa  145  2e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0470639  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31920  putative outer membrane protein  29.71 
 
 
498 aa  145  2e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.964531  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2524  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  30.04 
 
 
489 aa  144  3e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.670028  normal  0.773524 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6520  RND efflux system outer membrane lipoprotein  31.57 
 
 
500 aa  144  3e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.128206 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1155  MFS efflux system, outer membrane porin  32.43 
 
 
511 aa  144  3e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0159689  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0890  outer membrane protein  33.33 
 
 
480 aa  144  3e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.189882  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2809  RND efflux system outer membrane lipoprotein  27.92 
 
 
497 aa  144  4e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5742  RND efflux system outer membrane lipoprotein  31.38 
 
 
497 aa  144  4e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.238393  normal  0.954317 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2443  RND efflux system outer membrane lipoprotein  34.27 
 
 
544 aa  144  4e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.167735  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1577  outer membrane efflux protein, OprM  27.44 
 
 
606 aa  144  5e-33  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  5.43553e-07  normal  0.404493 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0105  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  30.59 
 
 
457 aa  144  5e-33  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.265235  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0400  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  28.51 
 
 
494 aa  144  5e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0316  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  30.79 
 
 
481 aa  143  8e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.464824  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3604  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  35.64 
 
 
483 aa  143  9e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2162  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  32 
 
 
489 aa  142  9e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1759  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  27.65 
 
 
600 aa  142  9e-33  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  9.01075e-05  normal  0.0327712 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1703  RND efflux system outer membrane lipoprotein NodT  28.89 
 
 
486 aa  142  1e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.416377  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0321  RND efflux system outer membrane lipoprotein  31.12 
 
 
480 aa  142  1e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.877077 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2371  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  32.07 
 
 
482 aa  141  2e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.774787 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1660  hypothetical protein  33.11 
 
 
516 aa  142  2e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.077421  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1905  outer membrane efflux protein OprA  33.11 
 
 
516 aa  142  2e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2340  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  27.73 
 
 
502 aa  141  2e-32  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27410  putative outer membrane protein precursor  30.21 
 
 
479 aa  141  2e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.721932  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2059  Outer membrane efflux protein  33.11 
 
 
513 aa  141  2e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.26387  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2711  outer membrane lipoprotein precursor  29.03 
 
 
499 aa  142  2e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.299078  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60820  outer membrane protein OprJ  30.72 
 
 
479 aa  141  3e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2713  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  33.01 
 
 
477 aa  141  3e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.249401  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3271  outer membrane efflux protein OprA  31.53 
 
 
467 aa  140  3e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1231  RND efflux system outer membrane lipoprotein  28.48 
 
 
486 aa  140  4e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0812696  normal  0.324306 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>