More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_4149 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013216  Dtox_4149  hypothetical protein  100 
 
 
218 aa  446  1.0000000000000001e-124  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.247441  hitchhiker  0.00000117092 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0454  secretion protein HlyD  54.13 
 
 
217 aa  259  2e-68  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0099  biotin/lipoyl attachment domain-containing protein  41.12 
 
 
220 aa  191  5e-48  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2323  secretion protein HlyD  43.54 
 
 
231 aa  183  2.0000000000000003e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000671168  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2016  secretion protein HlyD family protein  35.78 
 
 
517 aa  147  1.0000000000000001e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2447  hypothetical protein  36.87 
 
 
212 aa  145  6e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2377  hypothetical protein  36.49 
 
 
215 aa  144  8.000000000000001e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2423  hypothetical protein  36.49 
 
 
215 aa  144  8.000000000000001e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1834  multidrug resistance protein A  37.21 
 
 
212 aa  140  9.999999999999999e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00170419  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2429  Multidrug resistance efflux pump-like protein  38.89 
 
 
214 aa  140  1.9999999999999998e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.310054  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1945  drug transporter, putative  35.59 
 
 
215 aa  136  3.0000000000000003e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3255  multidrug resistance protein A  36.51 
 
 
217 aa  132  5e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2910  biotin/lipoyl attachment domain-containing protein  35.75 
 
 
228 aa  126  2.0000000000000002e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000263786  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4677  hypothetical protein  34.39 
 
 
217 aa  121  6e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000225895  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0560  hypothetical protein  34.39 
 
 
217 aa  122  6e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000264688  hitchhiker  1.67598e-16 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4465  hypothetical protein  33.86 
 
 
217 aa  121  9e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.147837  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4300  multidrug resistance protein A  33.86 
 
 
217 aa  121  9e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000026909  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4311  multidrug resistance protein A  33.86 
 
 
217 aa  121  9e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.276592  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4693  hypothetical protein  33.86 
 
 
217 aa  121  9e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000853008  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4813  hypothetical protein  33.86 
 
 
217 aa  121  9e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0590873  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4684  hypothetical protein  33.86 
 
 
217 aa  121  9e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.12554e-48 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4700  hypothetical protein  32.56 
 
 
217 aa  120  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000255246  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2020  secretion protein HlyD family protein  41.29 
 
 
366 aa  116  3e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1013  secretion protein HlyD  44.53 
 
 
394 aa  114  8.999999999999998e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0558  secretion protein HlyD family protein  41.61 
 
 
375 aa  112  4.0000000000000004e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1203  secretion protein HlyD family protein  39.71 
 
 
325 aa  112  5e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0133764  normal  0.454228 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1512  secretion protein HlyD family protein  40.62 
 
 
405 aa  110  1.0000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3969  secretion protein HlyD family protein  35.37 
 
 
352 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3843  secretion protein HlyD family protein  35.37 
 
 
352 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3787  secretion protein HlyD family protein  35.37 
 
 
352 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2691  secretion protein HlyD family protein  35.62 
 
 
369 aa  108  6e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.955062  normal  0.402733 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0482  secretion protein HlyD family protein  35.37 
 
 
352 aa  108  7.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4494  secretion protein HlyD family protein  39.13 
 
 
374 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.001486  normal  0.244602 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1481  multidrug resistance protein, putative  36.24 
 
 
372 aa  107  1e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.318452  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2180  secretion protein HlyD  39.82 
 
 
408 aa  107  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3253  secretion protein HlyD family protein  39.5 
 
 
373 aa  107  1e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0524  HlyD family secretion protein  33.74 
 
 
301 aa  106  2e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4903  secretion protein HlyD family protein  41.01 
 
 
359 aa  106  2e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0736  major facilitator superfamily multidrug efflux pump membrane fusion protein  38.69 
 
 
375 aa  106  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7473  secretion protein HlyD family protein  35.57 
 
 
390 aa  106  3e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3361  secretion protein HlyD family protein  38.66 
 
 
373 aa  106  3e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0055  multidrug resistance protein A  38.26 
 
 
332 aa  106  3e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0064  secretion protein HlyD family protein  37.42 
 
 
346 aa  106  3e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4416  secretion protein HlyD family protein  39.13 
 
 
366 aa  105  4e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.401076  normal  0.621386 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3406  secretion protein HlyD  39.85 
 
 
419 aa  105  4e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0814588  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1375  secretion protein HlyD  40 
 
 
374 aa  105  5e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0634631  hitchhiker  0.000428617 
 
 
-
 
NC_003296  RS00899  putative multidrug resistance transmembrane protein  37.4 
 
 
363 aa  105  6e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.359729  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0040  multidrug resistance protein A  39.87 
 
 
342 aa  105  6e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.984941  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4226  secretion protein HlyD family protein  35.4 
 
 
411 aa  105  6e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4521  secretion protein HlyD family protein  36.84 
 
 
351 aa  105  7e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.170966 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1980  secretion protein HlyD  36.23 
 
 
411 aa  105  7e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.539609  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2705  secretion protein HlyD family protein  40.91 
 
 
368 aa  105  8e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0522  secretion protein HlyD family protein  33.54 
 
 
351 aa  105  8e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.889598  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3509  secretion protein HlyD family protein  33.54 
 
 
351 aa  104  9e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3406  secretion protein HlyD family protein  36.84 
 
 
358 aa  104  1e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3595  secretion protein HlyD  38.81 
 
 
404 aa  103  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.766279  normal  0.905523 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0523  secretion protein HlyD family protein  33.54 
 
 
351 aa  104  1e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3091  secretion protein HlyD family protein  32.97 
 
 
334 aa  103  2e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2634  secretion protein HlyD family protein  41.48 
 
 
375 aa  102  3e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1632  secretion protein HlyD family protein  39.04 
 
 
368 aa  103  3e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.201734  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3613  secretion protein HlyD family protein  39.69 
 
 
422 aa  102  3e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.281428  hitchhiker  0.00219458 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0561  secretion protein HlyD family protein  40.77 
 
 
348 aa  102  4e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1157  major facilitator superfamily multidrug efflux pump membrane fusion protein  37.23 
 
 
344 aa  102  4e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3095  secretion protein HlyD  39.16 
 
 
410 aa  102  4e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0094  secretion protein HlyD family protein  37.01 
 
 
328 aa  102  4e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3632  secretion protein HlyD family protein  36.3 
 
 
363 aa  102  5e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0402  HlyD family secretion protein  37.59 
 
 
348 aa  102  5e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.111756  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0108  HlyD family secretion protein  34.25 
 
 
413 aa  102  6e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.736551  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2982  secretion protein HlyD family protein  38.93 
 
 
400 aa  102  6e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5486  secretion protein HlyD family protein  36.3 
 
 
363 aa  102  6e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.707329  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4400  hypothetical protein  33.33 
 
 
217 aa  101  7e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0106934  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0452  secretion protein HlyD family protein  38.28 
 
 
352 aa  101  7e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0660  secretion protein HlyD family protein  34.39 
 
 
402 aa  101  7e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5592  HlyD family multidrug resistance protein  37.12 
 
 
381 aa  101  7e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.306614  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2921  secretion protein HlyD family protein  35.77 
 
 
344 aa  102  7e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4975  secretion protein HlyD family protein  35.56 
 
 
363 aa  101  8e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.710374  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3793  secretion protein HlyD  37.31 
 
 
373 aa  100  1e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.167137  normal  0.620261 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6488  secretion protein HlyD family protein  34.19 
 
 
394 aa  101  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4202  hypothetical protein  32.91 
 
 
355 aa  100  1e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3990  secretion protein HlyD family protein  33.7 
 
 
383 aa  100  2e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.302523  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3768  secretion protein HlyD family protein  35.56 
 
 
364 aa  100  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.20986 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0238  secretion protein HlyD  36.57 
 
 
375 aa  100  2e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4584  secretion protein HlyD family protein  36.09 
 
 
402 aa  100  2e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6769  secretion protein HlyD family protein  35.29 
 
 
393 aa  100  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.238192  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4608  secretion protein HlyD  35.56 
 
 
364 aa  100  2e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1605  secretion protein HlyD family protein  38.93 
 
 
366 aa  100  2e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3755  secretion protein HlyD family protein  35.56 
 
 
364 aa  100  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.178549  normal  0.103625 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3706  secretion protein HlyD family protein  37.78 
 
 
348 aa  99.8  3e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0616  secretion protein HlyD  45.22 
 
 
388 aa  99.4  3e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.77466  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0618  secretion protein HlyD family protein  37.8 
 
 
392 aa  100  3e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2630  secretion protein HlyD family protein  39.52 
 
 
366 aa  99.4  3e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0794256  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4511  secretion protein HlyD family protein  37.04 
 
 
397 aa  99.4  4e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.654674 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0499  secretion protein HlyD family protein  35.95 
 
 
364 aa  99  4e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3442  secretion protein HlyD family protein  32.35 
 
 
421 aa  99  5e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.711294 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4061  secretion protein HlyD family protein  37.78 
 
 
422 aa  99  5e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1100  secretion protein HlyD family protein  34.76 
 
 
443 aa  98.2  7e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0175972 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5998  secretion protein HlyD family protein  34.62 
 
 
394 aa  98.2  8e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4682  secretion protein HlyD family protein  35.82 
 
 
372 aa  97.8  1e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.384444  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4283  secretion protein HlyD family protein  35.25 
 
 
365 aa  97.8  1e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.638187  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3316  secretion protein HlyD family protein  40 
 
 
423 aa  97.8  1e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.226121 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>