More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_1957 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_3060  translation initiation factor IF-2  55.72 
 
 		 896 aa  640    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.382802  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1645  translation initiation factor IF-2  64.3 
 
 		 692 aa  763    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0509218  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0059  translation initiation factor IF-2  56.41 
 
 		 997 aa  671    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1588  translation initiation factor IF-2  57.67 
 
 		 883 aa  696    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0169841  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3628  translation initiation factor IF-2  56.4 
 
 		 887 aa  649    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.206324 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0457  translation initiation factor IF-2  51.65 
 
 		 1161 aa  876    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1106  translation initiation factor IF-2  51.57 
 
 		 896 aa  664    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0836  translation initiation factor IF-2  65.4 
 
 		 720 aa  760    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3239  translation initiation factor IF-2  54.8 
 
 		 880 aa  640    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.432211  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3860  translation initiation factor IF-2  64.33 
 
 		 686 aa  758    Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000141928  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3851  translation initiation factor IF-2  64.33 
 
 		 686 aa  758    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.970916  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1155  translation initiation factor IF-2  65.62 
 
 		 732 aa  770    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000874472  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1329  translation initiation factor IF-2  63.19 
 
 		 705 aa  736    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0381  translation initiation factor IF-2  46.88 
 
 		 927 aa  656    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2165  translation initiation factor IF-2  47.51 
 
 		 959 aa  646    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.34369  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1204  translation initiation factor IF-2  55.28 
 
 		 885 aa  644    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3664  translation initiation factor IF-2  64.33 
 
 		 686 aa  759    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3554  translation initiation factor IF-2  64.67 
 
 		 686 aa  760    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3572  translation initiation factor IF-2  64.67 
 
 		 686 aa  760    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1061  translation initiation factor IF-2  54.7 
 
 		 975 aa  637    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0461842  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1132  translation initiation factor IF-2  55.74 
 
 		 738 aa  653    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00703147  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3751  translation initiation factor IF-2  55.05 
 
 		 729 aa  650    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00372327  unclonable  0.0000243777 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2433  translation initiation factor IF-2  50.86 
 
 		 1079 aa  716    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.189984  normal  0.802602 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0926  translation initiation factor IF-2  58.2 
 
 		 888 aa  808    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0148793  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1630  translation initiation factor IF-2  51.25 
 
 		 956 aa  654    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3676  translation initiation factor IF-2  55.93 
 
 		 971 aa  985    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.156109  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0697  translation initiation factor IF-2  56.14 
 
 		 922 aa  659    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.248102  normal  0.307496 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1302  translation initiation factor IF-2  54.38 
 
 		 986 aa  723    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.454709  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1740  translation initiation factor IF-2  54.37 
 
 		 975 aa  635    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.12282  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1915  translation initiation factor IF-2  54.37 
 
 		 975 aa  635    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.697386  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03396  translation initiation factor IF-2  54.95 
 
 		 894 aa  648    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2748  translation initiation factor IF-2  54.55 
 
 		 984 aa  643    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07840  translation initiation factor IF-2  61.25 
 
 		 686 aa  710    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1555  translation initiation factor IF-2  53.81 
 
 		 947 aa  717    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000482401  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3911  translation initiation factor IF-2  64.67 
 
 		 686 aa  758    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.188142  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1779  translation initiation factor IF-2  52.13 
 
 		 915 aa  639    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0123912  normal  0.0703365 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1762  translation initiation factor IF-2  54.53 
 
 		 975 aa  636    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.599583  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1462  translation initiation factor IF-2  53.9 
 
 		 1022 aa  636    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.887341  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1444  translation initiation factor 2 (bIF-2)  59.41 
 
 		 673 aa  666    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000295252  normal  0.305972 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1586  translation initiation factor IF-2  58.97 
 
 		 884 aa  701    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000230757  normal  0.126599 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3162  translation initiation factor IF-2  49.72 
 
 		 984 aa  667    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3950  translation initiation factor IF-2  64.33 
 
 		 686 aa  759    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.373868  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4067  translation initiation factor IF-2  55.73 
 
 		 917 aa  639    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3417  translation initiation factor IF-2  54.8 
 
 		 880 aa  640    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0572462  hitchhiker  0.00115564 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3280  translation initiation factor IF-2  54.8 
 
 		 880 aa  640    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3781  translation initiation factor IF-2  50 
 
 		 873 aa  646    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.322768  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1050  translation initiation factor 2  49.55 
 
 		 903 aa  845    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000107022  unclonable  0.0000000303018 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2564  translation initiation factor IF-2  54.7 
 
 		 976 aa  637    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0419633  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0175  translation initiation factor IF-2  54.7 
 
 		 975 aa  637    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0986137  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0991  translation initiation factor IF-2  54.7 
 
 		 975 aa  637    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0637827  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1957  translation initiation factor IF-2  100 
 
 		 985 aa  1974    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1128  translation initiation factor IF-2  54.8 
 
 		 880 aa  640    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.247429  unclonable  0.0000000000185319 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2834  translation initiation factor IF-2  55.03 
 
 		 880 aa  644    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0067  translation initiation factor 2  55.03 
 
 		 907 aa  663    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00109363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0747  translation initiation factor IF-2  49.4 
 
 		 964 aa  659    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.152188  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2820  translation initiation factor IF-2  55.28 
 
 		 989 aa  639    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0105621  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1007  translation initiation factor IF-2  54.4 
 
 		 884 aa  641    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.605303  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0991  translation initiation factor 2  64.85 
 
 		 1035 aa  722    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0315386  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2827  translation initiation factor IF-2  55.14 
 
 		 885 aa  647    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00613346 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2465  translation initiation factor IF-2  64.49 
 
 		 689 aa  757    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000966946  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3635  translation initiation factor IF-2  65.74 
 
 		 688 aa  753    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0196676  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2031  translation initiation factor IF-2  54.13 
 
 		 979 aa  644    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00715867 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1632  translation initiation factor IF-2  54.95 
 
 		 986 aa  636    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00141337 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4217  translation initiation factor 2  51.41 
 
 		 1011 aa  647    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.726068  normal  0.0540264 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0489  translation initiation factor IF-2  53.72 
 
 		 895 aa  646    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.160314 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1507  translation initiation factor IF-2  54.7 
 
 		 975 aa  637    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1051  translation initiation factor IF-2  63.95 
 
 		 845 aa  743    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000251511  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3441  translation initiation factor IF-2  51.85 
 
 		 885 aa  656    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2077  translation initiation factor IF-2  48.42 
 
 		 990 aa  650    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.146331  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3930  translation initiation factor IF-2  55.5 
 
 		 856 aa  640    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3422  translation initiation factor IF-2  47.9 
 
 		 1008 aa  662    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1940  translation initiation factor IF-2  63.64 
 
 		 679 aa  764    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.995818  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1658  translation initiation factor IF-2  63.64 
 
 		 679 aa  764    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0821  translation initiation factor IF-2  56.71 
 
 		 831 aa  640    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.175155  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2513  translation initiation factor IF-2  57.96 
 
 		 1079 aa  660    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1026  translation initiation factor IF-2  55.28 
 
 		 885 aa  645    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.748082  hitchhiker  0.0000041871 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1091  translation initiation factor IF-2  55.28 
 
 		 885 aa  645    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.193665  normal  0.0905739 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0699  translation initiation factor IF-2  58.64 
 
 		 752 aa  690    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000680705  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0990  translation initiation factor IF-2  53.18 
 
 		 881 aa  648    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.106597  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0900  translation initiation factor IF-2  45.66 
 
 		 882 aa  770    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.437883  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0169  translation initiation factor IF-2  50.44 
 
 		 926 aa  641    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0174  translation initiation factor IF-2  54.49 
 
 		 898 aa  656    Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00015566  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0817  translation initiation factor IF-2  51.11 
 
 		 950 aa  641    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1901  translation initiation factor IF-2  52.88 
 
 		 882 aa  716    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.650972  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0814  translation initiation factor IF-2  53.77 
 
 		 882 aa  674    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.0318288 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1355  translation initiation factor IF-2  48.84 
 
 		 834 aa  656    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.723459  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0383  translation initiation factor IF-2  56.43 
 
 		 943 aa  659    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3389  translation initiation factor IF-2  55.11 
 
 		 896 aa  657    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.479948  hitchhiker  0.00172114 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1333  translation initiation factor IF-2  63.59 
 
 		 688 aa  753    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0112644  hitchhiker  0.000569775 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1228  translation initiation factor IF-2  56.29 
 
 		 962 aa  678    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00145036  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3727  translation initiation factor 2  51.85 
 
 		 949 aa  655    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1030  translation initiation factor IF-2  55.28 
 
 		 889 aa  644    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000967139 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2774  translation initiation factor IF-2  49.69 
 
 		 1131 aa  872    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0650084  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1355  translation initiation factor IF-2  63.19 
 
 		 705 aa  736    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.657841  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0963  translation initiation factor IF-2  57.1 
 
 		 921 aa  706    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0369  translation initiation factor IF-2  51.62 
 
 		 991 aa  642    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0109319  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3561  translation initiation factor IF-2  53.79 
 
 		 894 aa  644    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000180014 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3383  translation initiation factor IF-2  54.11 
 
 		 943 aa  648    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.121659  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0961  translation initiation factor IF-2  57.19 
 
 		 882 aa  644    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.875845  normal  0.117843 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0367  translation initiation factor IF-2  54.62 
 
 		 936 aa  652    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000368497  normal  0.59996 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>