More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_1556 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_1556  multi-sensor hybrid histidine kinase  100 
 
 		 1021 aa  2085    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4432  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.25 
 
 		 1002 aa  258  3e-67  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2420  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.85 
 
 		 933 aa  246  9.999999999999999e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.42243  hitchhiker  0.0000359369 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2145  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.57 
 
 		 1271 aa  238  4e-61  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.152151  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0647  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.49 
 
 		 944 aa  233  2e-59  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0902383 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2329  histidine kinase  35.17 
 
 		 470 aa  230  1e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0238  multi-component transcriptional regulator  29.62 
 
 		 1629 aa  225  3e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0839  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.35 
 
 		 1207 aa  225  3e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1555  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.86 
 
 		 1172 aa  224  7e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0698206 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1052  sensory transduction histidine kinase  32.24 
 
 		 1046 aa  218  4e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1526  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.01 
 
 		 975 aa  216  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0213  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.11 
 
 		 974 aa  215  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0934932  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1705  histidine kinase  32.64 
 
 		 910 aa  214  5.999999999999999e-54  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3446  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  32.63 
 
 		 791 aa  213  2e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.285515  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1057  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.93 
 
 		 718 aa  212  2e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.108149  normal  0.980645 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2208  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.88 
 
 		 823 aa  211  7e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.73393 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0412  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.76 
 
 		 695 aa  211  7e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3250  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.86 
 
 		 880 aa  207  8e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0748  GAF sensor signal transduction histidine kinase  30.56 
 
 		 815 aa  206  1e-51  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2453  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.22 
 
 		 969 aa  207  1e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.19952  normal  0.304956 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1437  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.86 
 
 		 785 aa  206  1e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3937  GAF sensor signal transduction histidine kinase  27.37 
 
 		 701 aa  207  1e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2295  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.84 
 
 		 905 aa  206  2e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0805  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.07 
 
 		 2161 aa  206  2e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.354922 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3764  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.27 
 
 		 917 aa  205  3e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.432635  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3552  Cache sensor hybrid histidine kinase  32.39 
 
 		 970 aa  205  4e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0980  GAF sensor signal transduction histidine kinase  28.11 
 
 		 725 aa  204  7e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.209286  normal  0.144143 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4452  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.75 
 
 		 2153 aa  203  9.999999999999999e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.758306 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0135  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  31.77 
 
 		 858 aa  201  9e-50  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.711395  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3138  sensor histidine kinase/response regulator  40.68 
 
 		 484 aa  200  1.0000000000000001e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.312332  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3876  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.64 
 
 		 1022 aa  200  1.0000000000000001e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2206  histidine kinase  33.25 
 
 		 556 aa  200  1.0000000000000001e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5073  CBS sensor hybrid histidine kinase  33.85 
 
 		 1118 aa  199  2.0000000000000003e-49  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.749087  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0204  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  33.06 
 
 		 687 aa  197  1e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.478023 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1816  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  32.64 
 
 		 977 aa  196  2e-48  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.218789  normal  0.39116 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4313  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.62 
 
 		 965 aa  196  2e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.975749 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4061  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.53 
 
 		 885 aa  196  3e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.193403  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4240  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.53 
 
 		 1064 aa  194  6e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1204  sensory box histidine kinase/response regulator  31.72 
 
 		 1177 aa  194  8e-48  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3648  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.2 
 
 		 1237 aa  194  9e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.289797  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4463  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.22 
 
 		 839 aa  193  1e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1740  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.56 
 
 		 1319 aa  192  2e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5353  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.16 
 
 		 1143 aa  193  2e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.385348 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1722  histidine kinase  34.11 
 
 		 1361 aa  193  2e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.169999 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0664  ATP-binding region, ATPase-like protein  34.44 
 
 		 853 aa  193  2e-47  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3600  histidine kinase  32.4 
 
 		 548 aa  192  2.9999999999999997e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.94225  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2194  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.56 
 
 		 1363 aa  192  2.9999999999999997e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2222  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.06 
 
 		 1120 aa  192  2.9999999999999997e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.201183 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0171  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.24 
 
 		 868 aa  192  2.9999999999999997e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.766824  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9103  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.01 
 
 		 1145 aa  191  5.999999999999999e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0587  ATP-binding region ATPase domain protein  34.29 
 
 		 1161 aa  191  5.999999999999999e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0350  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.28 
 
 		 482 aa  190  9e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000480808 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2216  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.06 
 
 		 812 aa  190  1e-46  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.368148  normal  0.0314025 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4119  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.36 
 
 		 1331 aa  190  1e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2159  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.57 
 
 		 796 aa  189  2e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.758044 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2143  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  31.16 
 
 		 755 aa  190  2e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0647  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.65 
 
 		 1137 aa  189  2e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3170  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.11 
 
 		 911 aa  189  3e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2805  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  30.23 
 
 		 927 aa  188  3e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1390  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.73 
 
 		 1977 aa  188  4e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2495  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  33.88 
 
 		 1362 aa  188  4e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1418  GAF sensor hybrid histidine kinase  34.29 
 
 		 853 aa  188  5e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.237881  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0626  histidine kinase  31.98 
 
 		 1137 aa  188  6e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0857  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.7 
 
 		 698 aa  187  7e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0897898 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2901  GAF sensor hybrid histidine kinase  33.96 
 
 		 733 aa  187  7e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.248575  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1160  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.16 
 
 		 829 aa  187  7e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.380489 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0022  GAF sensor hybrid histidine kinase  33.01 
 
 		 1356 aa  187  7e-46  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4701  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.85 
 
 		 1274 aa  187  9e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0613664  normal  0.609464 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1221  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.85 
 
 		 637 aa  186  1.0000000000000001e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2383  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.09 
 
 		 1177 aa  186  1.0000000000000001e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.467753 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0644  GAF sensor hybrid histidine kinase  35.85 
 
 		 754 aa  186  2.0000000000000003e-45  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4541  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.09 
 
 		 896 aa  186  2.0000000000000003e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1628  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  42.08 
 
 		 1026 aa  186  3e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.677715  normal  0.19967 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3699  histidine kinase  33.33 
 
 		 998 aa  185  3e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0932  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.01 
 
 		 827 aa  186  3e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.202098 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2683  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.29 
 
 		 546 aa  186  3e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000116014 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0009  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.42 
 
 		 754 aa  186  3e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0370  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.87 
 
 		 1070 aa  185  4.0000000000000006e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1648  histidine kinase  26.57 
 
 		 1374 aa  185  5.0000000000000004e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.102759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3771  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.02 
 
 		 1039 aa  184  6e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000191257 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0987  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.83 
 
 		 846 aa  184  7e-45  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.594505  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2076  GAF sensor hybrid histidine kinase  32.79 
 
 		 2107 aa  184  7e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5786  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  32.28 
 
 		 589 aa  184  7e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0113735 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1021  histidine kinase  31.85 
 
 		 1109 aa  184  9.000000000000001e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.103758 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0008  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.59 
 
 		 755 aa  184  9.000000000000001e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.865749 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0065  histidine kinase  33.7 
 
 		 578 aa  184  9.000000000000001e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0007  sensory box histidine kinase  33.69 
 
 		 762 aa  183  1e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1507  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.83 
 
 		 926 aa  184  1e-44  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3783  histidine kinase  30.61 
 
 		 544 aa  184  1e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.401083  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3802  histidine kinase  31.69 
 
 		 1121 aa  184  1e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.260095 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3445  Hpt sensor hybrid histidine kinase  31.66 
 
 		 717 aa  183  1e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.580231  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2814  GAF sensor hybrid histidine kinase  32.43 
 
 		 763 aa  183  1e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.155467  normal  0.302046 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.78 
 
 		 1352 aa  183  2e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2314  sensory box histidine kinase/response regulator  32.56 
 
 		 982 aa  183  2e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.581555  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0057  histidine kinase  33.06 
 
 		 588 aa  182  2e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000185994 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3302  GAF sensor hybrid histidine kinase  32.43 
 
 		 763 aa  183  2e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2672  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.16 
 
 		 991 aa  182  2e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.646953  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1825  Hpt sensor hybrid histidine kinase  34.04 
 
 		 932 aa  182  2e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2494  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.96 
 
 		 489 aa  182  2.9999999999999997e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.228009 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2587  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.38 
 
 		 1158 aa  182  2.9999999999999997e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>