More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_1652 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_1652  MATE efflux family protein  100 
 
 
454 aa  901    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000778713  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0313  hypothetical protein  64.35 
 
 
455 aa  578  1e-164  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00088835  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2080  MATE efflux family protein  64.56 
 
 
454 aa  570  1e-161  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.634791 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2651  MATE efflux family protein  65.54 
 
 
449 aa  567  1e-160  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000524124  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2656  MATE efflux family protein  44.12 
 
 
455 aa  359  6e-98  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000320959  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2859  MATE efflux family protein  44.62 
 
 
455 aa  357  1.9999999999999998e-97  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2544  MATE efflux family protein  44.62 
 
 
455 aa  357  1.9999999999999998e-97  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1925  MATE efflux family protein  40.35 
 
 
455 aa  350  2e-95  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.16171  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1274  Na+ driven multidrug efflux protein  39.34 
 
 
456 aa  333  3e-90  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.605029  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0012  MATE efflux family protein  39.6 
 
 
477 aa  326  6e-88  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000348389  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0006  MATE efflux family protein  37.16 
 
 
442 aa  320  3e-86  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0243937 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1409  MATE efflux family protein  38.44 
 
 
460 aa  311  1e-83  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.851568  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1483  MATE efflux family protein  39.86 
 
 
456 aa  311  1e-83  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.820235  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2890  MATE efflux family protein  38.16 
 
 
466 aa  309  5e-83  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.831923  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0185  MATE efflux family protein  37.44 
 
 
449 aa  301  1e-80  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02070  putative efflux protein, MATE family  38.58 
 
 
496 aa  300  2e-80  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1726  MATE efflux family protein  36.61 
 
 
447 aa  301  2e-80  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0877  MATE efflux family protein  37.07 
 
 
447 aa  298  1e-79  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.371074  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02200  Na+-driven multidrug efflux pump  36.62 
 
 
466 aa  295  8e-79  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1569  MATE efflux family protein  36.62 
 
 
493 aa  295  1e-78  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.144103 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1218  Na+ driven multidrug efflux pump  38.96 
 
 
464 aa  294  2e-78  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.530621  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2347  MATE efflux family protein  34.06 
 
 
466 aa  293  3e-78  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000304243  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1204  MATE efflux family protein  37.33 
 
 
461 aa  287  2.9999999999999996e-76  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0400  MATE efflux family protein  38.62 
 
 
456 aa  286  4e-76  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.163354 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1796  MATE efflux family protein  35.81 
 
 
448 aa  285  1.0000000000000001e-75  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  unclonable  0.00000000911844 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2307  MATE efflux family protein  34.02 
 
 
451 aa  278  2e-73  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000000873712  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1813  MATE efflux family protein  37.96 
 
 
461 aa  277  4e-73  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.000000145997  normal  0.0820418 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3319  MATE efflux family protein  36.92 
 
 
460 aa  276  4e-73  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00330578  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1577  MATE efflux family protein  36.16 
 
 
447 aa  275  2.0000000000000002e-72  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.283423  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1800  MATE efflux family protein  35.83 
 
 
455 aa  273  4.0000000000000004e-72  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03665  C-5 cytosine-specific DNA methylase:Multi antimicrobial extrusion (MatE) protein  35.89 
 
 
455 aa  263  4.999999999999999e-69  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1225  MATE efflux family protein  33.26 
 
 
452 aa  259  7e-68  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3704  hypothetical protein  33.33 
 
 
496 aa  258  1e-67  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.546893 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1387  MATE efflux family protein  35.23 
 
 
454 aa  258  1e-67  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00032817  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0255  MATE efflux family protein  31.93 
 
 
448 aa  251  1e-65  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.392054  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1959  multi antimicrobial extrusion protein MatE  33.33 
 
 
472 aa  250  3e-65  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.849908  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0582  MATE efflux family protein  35.81 
 
 
466 aa  248  2e-64  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0814  MATE efflux family protein subfamily  38.25 
 
 
451 aa  247  3e-64  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0013446  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0849  MATE efflux family protein  31.03 
 
 
447 aa  247  4e-64  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1448  MATE efflux family protein  35.63 
 
 
470 aa  244  1.9999999999999999e-63  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0333  MATE efflux family protein  35.39 
 
 
451 aa  241  1e-62  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0189347  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3207  putative transmembrane efflux protein  32.3 
 
 
467 aa  241  2e-62  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.00227095 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1754  multi anti extrusion protein MatE  30.13 
 
 
452 aa  240  4e-62  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.580282  normal  0.069865 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1604  MATE efflux family protein  29.65 
 
 
450 aa  230  5e-59  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1678  putative MATE efflux family protein  30.29 
 
 
451 aa  229  8e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.131479  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3666  putative MATE efflux family protein  30.29 
 
 
451 aa  228  1e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.269496  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03390  multidrug efflux pump VmrA  31.26 
 
 
448 aa  229  1e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002616  multidrug resistance efflux pump  31.21 
 
 
448 aa  228  1e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0153  MATE efflux family protein  31.17 
 
 
447 aa  227  3e-58  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.226722  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2869  MATE efflux family protein  33.73 
 
 
451 aa  226  5.0000000000000005e-58  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000172656  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1486  Na+ driven multidrug efflux pump  30.29 
 
 
451 aa  225  1e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1524  MATE efflux family protein  30.07 
 
 
451 aa  224  2e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.942742  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1496  Na+ driven multidrug efflux pump  30.07 
 
 
451 aa  224  2e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00660126  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1642  MATE efflux family protein  30.07 
 
 
451 aa  224  2e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1732  MATE efflux family protein, putative  30.07 
 
 
451 aa  224  3e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0426272  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1709  putative MATE efflux family protein  30.07 
 
 
451 aa  223  7e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1528  MATE efflux family protein  30.51 
 
 
452 aa  222  9.999999999999999e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1783  putative MATE efflux family protein  29.62 
 
 
451 aa  218  1e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0827  MATE efflux family protein  29.84 
 
 
452 aa  216  9e-55  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1446  MATE efflux family protein  30.33 
 
 
439 aa  214  1.9999999999999998e-54  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.484247 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1593  MATE efflux family protein  31.08 
 
 
460 aa  213  3.9999999999999995e-54  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000199125  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3000  MATE efflux family protein  29.13 
 
 
458 aa  212  1e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.649705  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2775  MATE efflux family protein  29.4 
 
 
456 aa  212  1e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2825  multi anti extrusion protein MatE  29.88 
 
 
450 aa  210  3e-53  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2747  multi anti extrusion protein MatE  29.88 
 
 
450 aa  210  4e-53  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1053  MATE efflux family protein  29.98 
 
 
462 aa  209  1e-52  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  1.2115099999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2445  multi anti extrusion protein MatE  28.94 
 
 
443 aa  208  1e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1506  MATE efflux family protein  29.41 
 
 
448 aa  208  2e-52  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3482  multi anti extrusion protein MatE  28.35 
 
 
449 aa  208  2e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.456655  normal  0.0775956 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2923  multi anti extrusion protein MatE  29.51 
 
 
450 aa  207  3e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3333  multi anti extrusion protein MatE  27.83 
 
 
448 aa  207  3e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0107095  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1368  multi anti extrusion protein MatE  28.41 
 
 
451 aa  206  6e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1332  multi anti extrusion protein MatE  28.41 
 
 
451 aa  206  6e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.478618  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1463  MATE efflux family protein  31.76 
 
 
440 aa  205  1e-51  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0174433  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1735  MATE efflux family protein  31.18 
 
 
442 aa  201  1.9999999999999998e-50  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00244827  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3016  multi antimicrobial extrusion protein MatE  28.05 
 
 
451 aa  199  9e-50  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.160373  normal  0.416485 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1259  multi anti extrusion protein MatE  28.54 
 
 
449 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0548  MATE efflux family protein  28.89 
 
 
459 aa  199  1.0000000000000001e-49  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.0000824418  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0181  multidrug efflux pump VmrA  30.22 
 
 
446 aa  197  2.0000000000000003e-49  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1342  multi anti extrusion protein MatE  28.05 
 
 
451 aa  198  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.934996  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0111  MATE efflux family protein  31.38 
 
 
464 aa  196  5.000000000000001e-49  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3175  multi anti extrusion protein MatE  28.6 
 
 
472 aa  197  5.000000000000001e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000666598  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3092  MATE efflux family protein  29.91 
 
 
472 aa  192  9e-48  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.755141 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4053  multidrug efflux pump VmrA  26.46 
 
 
465 aa  191  2e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0140  multidrug efflux pump VmrA  28.84 
 
 
464 aa  189  7e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2975  multidrug efflux pump VmrA  28.44 
 
 
459 aa  188  2e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0592966 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0307  MATE efflux family protein  27.29 
 
 
451 aa  188  2e-46  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1583  MATE efflux family protein  28.21 
 
 
445 aa  183  5.0000000000000004e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000267124  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0305  MATE efflux family protein  31.96 
 
 
467 aa  183  6e-45  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2060  MATE efflux family protein  30.18 
 
 
456 aa  180  4.999999999999999e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000022927  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2291  MATE efflux family protein  28.41 
 
 
460 aa  176  8e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2404  MATE efflux family protein  27.25 
 
 
440 aa  175  9.999999999999999e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000448098  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1582  multi antimicrobial extrusion protein MatE  27.07 
 
 
467 aa  174  2.9999999999999996e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000200155  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3395  MATE efflux family protein  28.13 
 
 
461 aa  173  5e-42  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0743  MATE efflux family protein  30.09 
 
 
454 aa  173  5e-42  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000193663  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0350  MATE efflux family protein  29.75 
 
 
455 aa  171  2e-41  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1822  MATE efflux family protein  29.04 
 
 
440 aa  171  2e-41  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.286977  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0160  multidrug efflux pump VmrA  27.29 
 
 
468 aa  170  6e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04830  MATE efflux family protein  27.69 
 
 
468 aa  167  2.9999999999999998e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000202645  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0835  Na+-driven multidrug efflux pump  29.98 
 
 
452 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.552719  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>