More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_5640 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_5640  ABC-2 type transporter  100 
 
 		 368 aa  737    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.332161 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2919  ABC-2 type transporter  61.14 
 
 		 368 aa  474  1e-132  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.856849  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0113  ABC-2 type transporter  55.16 
 
 		 376 aa  431  1e-119  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.816984  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1079  putative ABC transporter ATP-binding protein or permease protein  47.14 
 
 		 375 aa  345  5e-94  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1107  ABC-2 type transporter  46.59 
 
 		 368 aa  343  2e-93  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.502812 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0810  ABC-2 type transporter  36.89 
 
 		 366 aa  279  7e-74  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0919  ABC-2 type transporter  33.16 
 
 		 405 aa  236  4e-61  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.81116 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3460  hypothetical protein  34.44 
 
 		 373 aa  229  5e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2825  hypothetical protein  32.62 
 
 		 377 aa  226  5.0000000000000005e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0811  ABC-2 type transporter  31.47 
 
 		 377 aa  225  9e-58  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2906  ABC-2 type transporter  32.62 
 
 		 378 aa  221  9.999999999999999e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1589  ABC-2 type transporter  34.77 
 
 		 369 aa  219  6e-56  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.548124  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0656  hypothetical protein  30.24 
 
 		 377 aa  213  2.9999999999999995e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00117213 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1150  ABC-2 type transporter  30.93 
 
 		 377 aa  214  2.9999999999999995e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.950793  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2449  ABC-type multidrug transport system permease component  33.96 
 
 		 369 aa  213  5.999999999999999e-54  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0976  ABC-2 type transporter  32 
 
 		 377 aa  211  2e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1604  ABC transporter, permease protein, putative  30.93 
 
 		 377 aa  207  2e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.168111  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3273  ABC-2 type transporter  31.71 
 
 		 377 aa  207  3e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2826  hypothetical protein  32.78 
 
 		 376 aa  207  3e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1782  ABC-2 type transporter  35.47 
 
 		 364 aa  205  1e-51  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.926199  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1899  hypothetical protein  30.69 
 
 		 379 aa  204  2e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3252  ABC-2 type transporter  32.45 
 
 		 375 aa  204  2e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.432582  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0655  hypothetical protein  32.14 
 
 		 376 aa  203  3e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00126989 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1766  ABC-2 type transporter  33.88 
 
 		 370 aa  204  3e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.174884  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0977  ABC-2 type transporter  30.58 
 
 		 376 aa  203  4e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.750139 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3272  ABC-2 type transporter  30.3 
 
 		 376 aa  203  5e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3002  ABC-2 type transporter  31 
 
 		 375 aa  202  7e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.871422 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1151  ABC-2 type transporter  30.92 
 
 		 376 aa  199  3.9999999999999996e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.382414  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2479  ABC-2 type transporter  33.42 
 
 		 376 aa  200  3.9999999999999996e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.664004  normal  0.270232 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2358  ABC-2 type transporter  32.63 
 
 		 376 aa  199  3.9999999999999996e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.072295 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2368  hypothetical protein  30.81 
 
 		 379 aa  199  7e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.305787  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3461  hypothetical protein  31.61 
 
 		 369 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2808  ABC-2 type transporter  30.91 
 
 		 380 aa  197  3e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.514512 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0131  ABC-2 type transporter  30.52 
 
 		 378 aa  196  6e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.110874  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1791  ABC-2 transporter component  32.24 
 
 		 376 aa  195  1e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.386865  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1781  ABC-2 type transporter  31.29 
 
 		 381 aa  195  1e-48  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.290069  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4696  ABC-2 type transporter  33.73 
 
 		 384 aa  194  2e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.508179  normal  0.60669 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2907  ABC-2 type transporter  31.12 
 
 		 376 aa  194  2e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3104  ABC-2 type transporter  31.22 
 
 		 375 aa  194  3e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1512  ABC-2 type transporter  32.88 
 
 		 369 aa  192  6e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.179387  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4363  ABC-2 type transporter  30.71 
 
 		 367 aa  192  9e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001402  ABC-type multidrug transport system permease component  30.92 
 
 		 366 aa  191  2e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0920  ABC-2 type transporter  32.48 
 
 		 376 aa  190  2.9999999999999997e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.518017 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0585  ABC-2 type transporter  30.08 
 
 		 371 aa  190  4e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000556211 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0858  hypothetical protein  29.75 
 
 		 378 aa  190  4e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.137935  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4676  ABC-2 type transporter  32.23 
 
 		 379 aa  189  5.999999999999999e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1721  ABC multidrug efflux pump, inner membrane subunit  30.81 
 
 		 380 aa  189  8e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.759741  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3114  ABC transporter, inner membrane subunit  30.22 
 
 		 380 aa  187  3e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2837  ABC-2 type transporter  30.11 
 
 		 370 aa  187  3e-46  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.273381  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0698  putative transmembrane protein  30.19 
 
 		 376 aa  186  4e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1911  ABC multidrug efflux pump, inner membrane subunit  27.93 
 
 		 378 aa  186  4e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0168619  normal  0.0840076 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3308  ABC-2 type transporter  30.49 
 
 		 380 aa  186  6e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3223  ABC-2 type transporter  30.49 
 
 		 380 aa  185  1.0000000000000001e-45  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0649112  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0057  ABC-2 type transporter  29.87 
 
 		 387 aa  185  1.0000000000000001e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0054  ABC-2 type transporter  30.05 
 
 		 388 aa  184  1.0000000000000001e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0165  hypothetical protein  28.34 
 
 		 381 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0147217  normal  0.470058 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4695  ABC-2 type transporter  31.87 
 
 		 370 aa  184  2.0000000000000003e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.595113 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0348  multidrug ABC transporter permease component  30.16 
 
 		 384 aa  184  3e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1269  multidrug ABC transporter permease component  32.05 
 
 		 389 aa  183  5.0000000000000004e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0236284  normal  0.0534093 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1603  ABC transporter, permease protein, putative  29.32 
 
 		 378 aa  181  1e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3069  ABC-2 type transporter  30.48 
 
 		 373 aa  182  1e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.669525  normal  0.261942 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3539  ABC-2 type transporter  29.48 
 
 		 369 aa  181  2e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1018  ABC-2 type transporter  32.34 
 
 		 389 aa  181  2e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0425  ABC-2 type transporter  31.06 
 
 		 366 aa  180  2.9999999999999997e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1106  ABC-2 type transporter  30.32 
 
 		 379 aa  179  4.999999999999999e-44  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.762924 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06359  hypothetical protein  30.08 
 
 		 366 aa  179  8e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1037  hypothetical protein  32.87 
 
 		 382 aa  178  2e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.209314  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1265  ABC-type multidrug transport system, permease component  30.39 
 
 		 365 aa  178  2e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000431089  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1046  ABC-2 type transporter  29.1 
 
 		 383 aa  177  3e-43  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1746  ABC efflux pump, inner membrane subunit  30.81 
 
 		 384 aa  177  4e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0249268  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1294  ABC transporter, ATP-binding protein  29.74 
 
 		 378 aa  177  4e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.270477  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3105  ABC-2 type transporter  31.33 
 
 		 427 aa  176  4e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1303  ABC-2 type transporter  31.16 
 
 		 389 aa  176  5e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3039  hypothetical protein  28.69 
 
 		 382 aa  176  8e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.320364  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0255  ABC-2 type transporter  29.22 
 
 		 373 aa  174  9.999999999999999e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.889591 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1326  ABC-2 type transporter  31.78 
 
 		 368 aa  175  9.999999999999999e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4663  ABC-2 type transporter  29.72 
 
 		 390 aa  174  1.9999999999999998e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.000515456  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1790  ABC-2 transporter component  29.04 
 
 		 371 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.10213  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00590  ABC-2 type transport system hypothetical protein  30.41 
 
 		 380 aa  174  1.9999999999999998e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0115211  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0857  hypothetical protein  30.28 
 
 		 377 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3587  ABC transporter, permease protein, putative  30.73 
 
 		 375 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3253  ABC-2 type transporter  30.79 
 
 		 369 aa  174  2.9999999999999996e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0790326  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1340  ABC-2 type transporter  30.48 
 
 		 378 aa  173  3.9999999999999995e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3003  ABC-2 type transporter  30.79 
 
 		 370 aa  173  3.9999999999999995e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4327  ABC-2 type transporter  30.52 
 
 		 378 aa  173  5e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4677  ABC-2 type transporter  28.3 
 
 		 367 aa  172  6.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.521717  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1268  multidrug ABC transporter permease component  31.01 
 
 		 372 aa  172  7.999999999999999e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0273495  normal  0.0243743 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1017  ABC-2 type transporter  31.3 
 
 		 372 aa  172  7.999999999999999e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0407  hypothetical protein  28.73 
 
 		 382 aa  172  9e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.10374  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1356  ABC-2 type transporter  30.93 
 
 		 370 aa  172  9e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.000392503  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2484  ABC-2 type transporter  28.38 
 
 		 371 aa  172  1e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2863  ABC transporter, permease protein, putative  28.38 
 
 		 371 aa  172  1e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.633584  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1302  ABC-2 type transporter  31.01 
 
 		 372 aa  171  2e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2559  ABC-2 type transporter, permease protein  28.91 
 
 		 377 aa  171  2e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2849  ABC-2 type transporter  28.91 
 
 		 377 aa  170  3e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.478201  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0858  ABC-2 type transporter, permease protein  28.91 
 
 		 377 aa  170  3e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0112  ABC-2 type transporter  29.7 
 
 		 372 aa  170  3e-41  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0225544  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1047  ABC-2 type transporter  30.49 
 
 		 371 aa  171  3e-41  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3689  ABC-2 type transporter  30 
 
 		 384 aa  170  3e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.093618  normal  0.708678 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0941  ABC-2 type transporter, permease protein  28.91 
 
 		 377 aa  170  3e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.858923  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>