190 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_0268 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_3381  amidohydrolase  68.25 
 
 		 455 aa  644    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.936479  normal  0.571146 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0268  amidohydrolase  100 
 
 		 451 aa  927    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.863034  normal  0.27554 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1790  amidohydrolase  37.05 
 
 		 440 aa  316  6e-85  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1105  amidohydrolase  33.26 
 
 		 478 aa  225  1e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.310318 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3066  amidohydrolase  29.68 
 
 		 490 aa  166  1.0000000000000001e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2344  amidohydrolase  29 
 
 		 485 aa  145  2e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.684912  normal  0.818181 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2922  amidohydrolase  29.25 
 
 		 511 aa  142  1.9999999999999998e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.802626 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2365  amidohydrolase  27.73 
 
 		 470 aa  140  4.999999999999999e-32  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1186  amidohydrolase  27.29 
 
 		 512 aa  139  7e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000825037 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0618  amidohydrolase  27.03 
 
 		 496 aa  122  1.9999999999999998e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.210154 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2556  amidohydrolase  27.31 
 
 		 483 aa  113  9e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0971  amidohydrolase 3  25.37 
 
 		 666 aa  107  3e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.59323  normal  0.0406107 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1901  amidohydrolase  26.62 
 
 		 1084 aa  106  7e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0535  amidohydrolase family protein  24.94 
 
 		 672 aa  102  1e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3211  amidohydrolase  25.22 
 
 		 680 aa  100  8e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.361649  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2681  amidohydrolase  26.84 
 
 		 692 aa  99.4  1e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.398807  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5176  amidohydrolase  24.23 
 
 		 686 aa  98.6  2e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.167618  normal  0.830849 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3085  amidohydrolase family protein  25 
 
 		 694 aa  97.4  4e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2661  amidohydrolase  25.05 
 
 		 484 aa  97.4  5e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2711  amidohydrolase  24.08 
 
 		 400 aa  96.7  8e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.959959  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1680  amidohydrolase  26.21 
 
 		 1062 aa  94  5e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.345185  normal  0.0835555 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2410  amidohydrolase  23.39 
 
 		 438 aa  91.3  3e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0002152  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2801  amidohydrolase  23.23 
 
 		 585 aa  90.1  6e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2416  amidohydrolase  24.39 
 
 		 702 aa  89.4  1e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.0066037  normal  0.0385776 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19660  periplasmic component of the Tol biopolymer transport system  26.12 
 
 		 1059 aa  84.7  0.000000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.26793  hitchhiker  0.00572239 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1826  Pro-Hyp dipeptidase  22.52 
 
 		 426 aa  82.8  0.00000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2716  amidohydrolase  22.97 
 
 		 407 aa  82.8  0.00000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0458  amidohydrolase  24.89 
 
 		 1138 aa  82  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.455594 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0011  amidohydrolase  23.97 
 
 		 1065 aa  80.5  0.00000000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000114616  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5049  amidohydrolase  25.06 
 
 		 1031 aa  79.3  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.424824  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11210  amidohydrolase  21.83 
 
 		 456 aa  79  0.0000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.170748  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2825  amidohydrolase  27.32 
 
 		 433 aa  77.8  0.0000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.886429  normal  0.061566 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1062  amidohydrolase  23.23 
 
 		 426 aa  76.3  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.574986 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3987  amidohydrolase  22.15 
 
 		 435 aa  76.3  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.589739 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00030  conserved hypothetical protein  21.9 
 
 		 443 aa  74.7  0.000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.215737 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0626  amidohydrolase  22.05 
 
 		 433 aa  74.7  0.000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.151482 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5427  amidohydrolase  23.66 
 
 		 432 aa  73.9  0.000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.726254  normal  0.0808338 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1775  amidohydrolase  25.61 
 
 		 1010 aa  73.9  0.000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0563559  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0745  amidohydrolase  25.07 
 
 		 1005 aa  73.2  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2224  amidohydrolase  22.07 
 
 		 459 aa  71.6  0.00000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.331693  normal  0.75215 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2719  amidohydrolase  22.32 
 
 		 440 aa  71.2  0.00000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0258  amidohydrolase  27.12 
 
 		 441 aa  69.3  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0639139  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4304  amidohydrolase  21.12 
 
 		 470 aa  69.3  0.0000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1597  amidohydrolase  21.03 
 
 		 477 aa  68.6  0.0000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.080388  normal  0.526129 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4905  amidohydrolase  24.13 
 
 		 381 aa  68.9  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0270368  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5309  amidohydrolase  23.87 
 
 		 543 aa  68.9  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.700694  normal  0.749654 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0479  amidohydrolase  22.3 
 
 		 401 aa  68.2  0.0000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0868  amidohydrolase  40.86 
 
 		 351 aa  68.2  0.0000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5667  amidohydrolase:amidohydrolase-like  22.76 
 
 		 529 aa  67.8  0.0000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0466  amidohydrolase  22.35 
 
 		 1113 aa  67.8  0.0000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.83396  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4277  amidohydrolase  22.25 
 
 		 431 aa  67.8  0.0000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0533  amidohydrolase  22.67 
 
 		 444 aa  67.4  0.0000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.200592  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0913  amidohydrolase  20.47 
 
 		 438 aa  67  0.0000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.887966  normal  0.946432 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0087  amidohydrolase  23.57 
 
 		 423 aa  65.9  0.000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0161193  normal  0.19517 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3036  amidohydrolase  22.17 
 
 		 407 aa  65.9  0.000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0015  amidohydrolase  29.37 
 
 		 1062 aa  65.1  0.000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000711997 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0015  amidohydrolase  29.37 
 
 		 1062 aa  65.1  0.000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0180602 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03499  amidohydrolase  21.88 
 
 		 1111 aa  65.1  0.000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4683  amidohydrolase  22.86 
 
 		 540 aa  64.7  0.000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.524351  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0011  amidohydrolase  29.37 
 
 		 1062 aa  64.7  0.000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2573  amidohydrolase family protein  21.82 
 
 		 1071 aa  64.3  0.000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.186395  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4215  amidohydrolase  35.9 
 
 		 412 aa  64.3  0.000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.33185  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13368  Xaa-Pro dipeptidase family enzyme  22.06 
 
 		 426 aa  63.5  0.000000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.256749  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2475  amidohydrolase  22.98 
 
 		 397 aa  63.5  0.000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0009  amidohydrolase  29.37 
 
 		 1062 aa  63.5  0.000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3738  amidohydrolase  22.51 
 
 		 432 aa  63.2  0.000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.185832  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4676  amidohydrolase  21.78 
 
 		 414 aa  62.8  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0192807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0681  amidohydrolase  21.09 
 
 		 432 aa  62.8  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.312549  normal  0.59002 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01184  conserved hypothetical protein  19.78 
 
 		 445 aa  62  0.00000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1644  amidohydrolase  24.03 
 
 		 1042 aa  62  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0718903  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1717  amidohydrolase  24.03 
 
 		 1040 aa  62  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.654125  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2230  hypothetical protein  24.02 
 
 		 1042 aa  62  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.752909  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2377  amidohydrolase  22.86 
 
 		 421 aa  62  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.134161  normal  0.652305 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0009  amidohydrolase  29.37 
 
 		 1060 aa  62  0.00000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0015  amidohydrolase  28.67 
 
 		 598 aa  61.2  0.00000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0013  amidohydrolase  30.07 
 
 		 1067 aa  61.2  0.00000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.137513 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2093  amidohydrolase  29.03 
 
 		 568 aa  61.2  0.00000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.351411  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0028  amidohydrolase  29.86 
 
 		 1062 aa  60.5  0.00000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.847177  hitchhiker  0.00656795 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1661  hypothetical protein  20.65 
 
 		 436 aa  60.5  0.00000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2334  amidohydrolase  21.95 
 
 		 455 aa  60.5  0.00000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.202717 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0015  amidohydrolase  29.94 
 
 		 1069 aa  60.5  0.00000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000661642 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0268  putative Xaa-Pro dipeptidase  22.55 
 
 		 451 aa  59.7  0.0000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.309565  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0010  amidohydrolase  28.97 
 
 		 1066 aa  58.5  0.0000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0331  Imidazolonepropionase  21.54 
 
 		 448 aa  58.5  0.0000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4565  amidohydrolase  23.17 
 
 		 423 aa  58.9  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.244661  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0594  amidohydrolase  28.97 
 
 		 480 aa  58.5  0.0000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00251478 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1408  amidohydrolase  30.97 
 
 		 402 aa  58.2  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.321357  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3412  amidohydrolase  29.05 
 
 		 409 aa  58.2  0.0000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3982  amidohydrolase  26.92 
 
 		 445 aa  58.2  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2771  amidohydrolase  22.58 
 
 		 413 aa  58.2  0.0000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3749  amidohydrolase  31.9 
 
 		 408 aa  58.2  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.468026  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3822  amidohydrolase  31.9 
 
 		 408 aa  58.2  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.28333  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3761  amidohydrolase  31.9 
 
 		 408 aa  58.2  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.225154  normal  0.880819 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1803  amidohydrolase  35.35 
 
 		 1052 aa  57.8  0.0000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000234818 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0017  amidohydrolase  27.97 
 
 		 1049 aa  57.4  0.0000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0011  amidohydrolase  27.27 
 
 		 1062 aa  57.4  0.0000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000193716 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6603  amidohydrolase  22.9 
 
 		 423 aa  57.4  0.0000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.18808  normal  0.171207 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12678  Secreted enzyme  29.34 
 
 		 988 aa  57.4  0.0000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2115  amidohydrolase  32.5 
 
 		 426 aa  57  0.0000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3308  amidohydrolase  33.65 
 
 		 419 aa  56.6  0.0000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.692035  normal  0.417277 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>