205 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DehaBAV1_0214 on replicon NC_009455
Organism: Dehalococcoides sp. BAV1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009455  DehaBAV1_0214  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 131 aa  264  4e-70  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_217  hypothetical protein  50.79 
 
 		 132 aa  129  2.0000000000000002e-29  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1064  transcriptional regulator, XRE family  42.25 
 
 		 206 aa  66.6  0.00000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0300833  n/a   
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_2954  transcriptional regulator, XRE family  42.86 
 
 		 223 aa  65.9  0.0000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.00000000000401895  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2395  XRE family transcriptional regulator  32.59 
 
 		 239 aa  65.5  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0962  transcriptional regulator, XRE family  44 
 
 		 109 aa  63.2  0.000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0119843  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1953  transcriptional regulator, XRE family  40 
 
 		 131 aa  57.4  0.00000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0316  XRE family transcriptional regulator  36.26 
 
 		 191 aa  57  0.00000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0379  XRE family transcriptional regulator  36.26 
 
 		 191 aa  56.6  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0164716 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1142  transcriptional regulator, XRE family  30.91 
 
 		 111 aa  55.1  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000709447  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0315  helix-turn-helix domain-containing protein  41.77 
 
 		 133 aa  54.3  0.0000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000138688  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0336  DNA-binding protein, putative  41.77 
 
 		 133 aa  53.9  0.0000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00628261  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_277  DNA-binding protein  42.86 
 
 		 133 aa  53.9  0.0000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000765574  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0300  XRE family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 146 aa  53.1  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.223259  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1096  XRE family transcriptional regulator  37.63 
 
 		 483 aa  53.1  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4201  helix-turn-helix domain-containing protein  42.65 
 
 		 128 aa  53.1  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4200  XRE family transcriptional regulator  41.77 
 
 		 481 aa  52  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.306631  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4054  hypothetical protein  41.77 
 
 		 480 aa  52.4  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.568607  normal  0.0971132 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0663  transcriptional regulator, XRE family  30.77 
 
 		 145 aa  52.4  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1378  XRE family transcriptional regulator  41.77 
 
 		 480 aa  51.6  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.151662  normal  0.880216 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4879  transcriptional regulator, XRE family  41.77 
 
 		 480 aa  52  0.000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.80038  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2986  XRE family transcriptional regulator  37.63 
 
 		 483 aa  51.2  0.000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.199434  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2254  XRE family transcriptional regulator  41.77 
 
 		 482 aa  51.6  0.000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3659  transcriptional regulator, XRE family  38.03 
 
 		 128 aa  51.2  0.000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.391703  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4622  transcriptional regulator, XRE family  40.28 
 
 		 170 aa  50.8  0.000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.759922  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0025  transcriptional regulator, XRE family  40.28 
 
 		 183 aa  50.8  0.000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.401315  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10482  transcriptional regulator  35.06 
 
 		 140 aa  50.4  0.000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1195  transcriptional regulator SinR  40 
 
 		 107 aa  50.1  0.000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00148794  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1174  transcriptional regulator  40 
 
 		 107 aa  50.1  0.000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1176  transcriptional regulator  40 
 
 		 107 aa  50.1  0.000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000910939  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1197  XRE family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 107 aa  50.1  0.000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0325651  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1292  transcriptional regulator SinR  40 
 
 		 107 aa  50.1  0.000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00598951  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1333  transcriptional regulator SinR  39.34 
 
 		 107 aa  50.4  0.000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.248023  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0773  helix-turn-helix domain protein  39.44 
 
 		 141 aa  50.4  0.000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1371  transcriptional regulator SinR  40 
 
 		 107 aa  50.1  0.000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000100854 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1393  transcriptional regulator SinR  40 
 
 		 107 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.111718  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0488  XRE family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 145 aa  50.1  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.578439  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1435  transcriptional regulator SinR  40 
 
 		 107 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000395729  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2325  helix-turn-helix domain-containing protein  40.32 
 
 		 89 aa  49.7  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.665096  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0840  transcriptional regulator, XRE family  38.03 
 
 		 162 aa  50.1  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1448  transcriptional regulator, XRE family  31.4 
 
 		 117 aa  50.1  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.458013 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0101  XRE family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 182 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0310115  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0949  putative transcriptional regulator, XRE family  37.5 
 
 		 175 aa  49.7  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.596696  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1378  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  29.6 
 
 		 481 aa  49.3  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.84072  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0460  XRE family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 325 aa  49.3  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.321413 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0642  XRE family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 161 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.112362  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3450  transcriptional regulator protein-like protein  29.41 
 
 		 489 aa  49.3  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.168406  normal  0.18413 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8227  transcriptional regulator, XRE family  33.88 
 
 		 165 aa  49.3  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.556785  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0655  XRE family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 161 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0535888  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0635  XRE family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 161 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.453741  normal  0.0430623 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4011  transcriptional regulator SinR  40 
 
 		 107 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0025622  hitchhiker  0.000000000000530943 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6157  XRE family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 277 aa  48.9  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.540338  normal  0.674007 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0807  XRE family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 176 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.163665  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2489  transcriptional regulator, XRE family  30.25 
 
 		 478 aa  48.5  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00109484  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1003  XRE family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 107 aa  48.5  0.00003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.77905  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0148  transcriptional regulator, XRE family  36.36 
 
 		 134 aa  47.8  0.00005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0267  XRE family transcriptional regulator  28.81 
 
 		 118 aa  47.8  0.00006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.257195  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2373  XRE family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 107 aa  47.4  0.00006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.859226  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02480  Helix-turn-helix protein  39.13 
 
 		 156 aa  47.4  0.00007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.251654  normal  0.974666 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1864  XRE family transcriptional regulator  26.19 
 
 		 490 aa  47  0.00008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0337  XRE family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 76 aa  47  0.00008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0583349  normal  0.335191 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3803  XRE family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 76 aa  47  0.00008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.151697  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20950  putative prophage repressor  41.79 
 
 		 200 aa  46.2  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000578065  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2276  transcriptional regulator, XRE family  42.03 
 
 		 271 aa  46.6  0.0001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1438  transcriptional regulator, XRE family  39.13 
 
 		 284 aa  46.6  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.161381  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6774  transcriptional regulator, XRE family  38.24 
 
 		 128 aa  46.6  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.314572  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0336  XRE family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 140 aa  45.8  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  unclonable  0.000000000838003  normal  0.0169736 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0048  XRE family transcriptional regulator  36.71 
 
 		 488 aa  46.2  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3945  transcriptional regulator, XRE family  36.21 
 
 		 125 aa  45.8  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0101  XRE family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 71 aa  45.8  0.0002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000391644  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0299  XRE family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 71 aa  45.8  0.0002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000289962  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4271  transcriptional regulator, XRE family  36.21 
 
 		 125 aa  45.1  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.313399 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17420  predicted transcriptional regulator  37.31 
 
 		 414 aa  45.1  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.697974  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2997  XRE family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 477 aa  45.1  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.940113  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2614  XRE family transcriptional regulator  32.91 
 
 		 127 aa  45.4  0.0003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.105443  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2662  XRE family transcriptional regulator  32.91 
 
 		 128 aa  45.4  0.0003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2854  XRE family transcriptional regulator  32.91 
 
 		 128 aa  45.4  0.0003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0770075  normal  0.3412 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02070  predicted transcriptional regulator  32.43 
 
 		 488 aa  45.1  0.0003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_67  hypothetical protein  39.06 
 
 		 72 aa  45.1  0.0003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2085  XRE family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 207 aa  45.1  0.0004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.323846  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1148  XRE family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 99 aa  44.7  0.0004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.406355  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4661  XRE family transcriptional regulator  29.75 
 
 		 128 aa  44.7  0.0004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.749996  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3624  XRE family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 75 aa  45.1  0.0004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2927  transcriptional regulator, XRE family  38.81 
 
 		 130 aa  44.7  0.0005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.298234 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3096  transcriptional regulator, XRE family  35.48 
 
 		 477 aa  44.7  0.0005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2305  XRE family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 130 aa  44.7  0.0005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0843666 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1028  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 464 aa  44.3  0.0005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3219  XRE family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 125 aa  44.3  0.0005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1193  helix-turn-helix domain-containing protein  35.38 
 
 		 68 aa  44.3  0.0006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.67349  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4240  hypothetical protein  29.79 
 
 		 472 aa  44.3  0.0006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.726169  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4333  XRE family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 190 aa  43.9  0.0006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4631  DNA-binding protein  35.38 
 
 		 190 aa  43.9  0.0007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4400  DNA-binding protein  35.38 
 
 		 190 aa  43.9  0.0007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4240  DNA-binding protein  35.38 
 
 		 190 aa  43.9  0.0007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4252  DNA-binding protein  35.38 
 
 		 190 aa  43.9  0.0007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1263  XRE family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 117 aa  43.9  0.0007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.197496  normal  0.35007 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4740  DNA-binding protein  35.38 
 
 		 190 aa  43.9  0.0007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2613  XRE family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 219 aa  43.9  0.0007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.629122 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4617  DNA-binding protein  35.38 
 
 		 190 aa  43.9  0.0007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4633  DNA-binding protein  35.38 
 
 		 190 aa  43.9  0.0007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>