More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_1896 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013421  Pecwa_2345  ROK family protein  80.25 
 
 		 405 aa  702    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.397454  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1981  ROK family protein  76.54 
 
 		 405 aa  662    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1869  Mlc protein  76.54 
 
 		 405 aa  662    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0472832  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2283  ROK family protein  76.54 
 
 		 405 aa  663    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.060664 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1896  ROK family protein  100 
 
 		 405 aa  834    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.865808  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2044  ROK family protein  80.74 
 
 		 405 aa  702    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.463852  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2133  ROK family protein  85.43 
 
 		 405 aa  733    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1919  ROK family protein  73.02 
 
 		 407 aa  625  1e-178  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01563  DNA-binding transcriptional repressor  71.67 
 
 		 406 aa  611  9.999999999999999e-175  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2049  ROK familiy protein  71.67 
 
 		 406 aa  611  9.999999999999999e-175  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.688141  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1658  transcriptional regulator Mic  70.69 
 
 		 406 aa  610  9.999999999999999e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2304  transcriptional regulator Mic  71.67 
 
 		 406 aa  613  9.999999999999999e-175  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0485397 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1606  transcriptional regulator Mic  71.67 
 
 		 406 aa  612  9.999999999999999e-175  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2036  ROK family protein  71.67 
 
 		 406 aa  611  9.999999999999999e-175  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01553  hypothetical protein  71.67 
 
 		 406 aa  611  9.999999999999999e-175  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1668  transcriptional regulator Mic  71.67 
 
 		 406 aa  611  9.999999999999999e-175  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1801  transcriptional regulator Mic  71.67 
 
 		 406 aa  613  9.999999999999999e-175  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1590  transcriptional regulator Mic  70.69 
 
 		 406 aa  610  1e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0384401 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1599  transcriptional regulator Mic  70.69 
 
 		 406 aa  610  1e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.510024  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1780  transcriptional regulator Mic  71.43 
 
 		 406 aa  610  1e-173  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.905565  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1684  transcriptional regulator Mic  70.44 
 
 		 406 aa  607  9.999999999999999e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.886112  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1851  transcriptional regulator Mic  70.44 
 
 		 406 aa  607  9.999999999999999e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003012  Mlc transcriptional repressor of MalT (the transcriptional activator of maltose regulon) and manXYZ operon  49.88 
 
 		 405 aa  429  1e-119  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02870  hypothetical protein  50.12 
 
 		 434 aa  431  1e-119  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1593  ROK family transcriptional regulator  49.13 
 
 		 405 aa  422  1e-117  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0581  protein mlc (making large colonies protein)  47.25 
 
 		 416 aa  415  9.999999999999999e-116  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.960707  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00633  DNA-binding transcriptional dual regulator, repressor of N-acetylglucosamine  41.35 
 
 		 406 aa  323  2e-87  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00296536  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2961  ROK familiy protein  41.35 
 
 		 406 aa  323  2e-87  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00551957  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0696  N-acetylglucosamine repressor  41.35 
 
 		 406 aa  323  2e-87  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00225291  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0767  N-acetylglucosamine repressor  41.35 
 
 		 406 aa  323  2e-87  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000547022  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0575  N-acetylglucosamine repressor  41.35 
 
 		 406 aa  323  2e-87  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.20725  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00624  hypothetical protein  41.35 
 
 		 406 aa  323  2e-87  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00267666  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2980  ROK family protein  41.35 
 
 		 406 aa  323  2e-87  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00049785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0720  N-acetylglucosamine repressor  41.35 
 
 		 406 aa  323  2e-87  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00253244  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0701  N-acetylglucosamine repressor  41.35 
 
 		 406 aa  323  2e-87  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000639309  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0801  N-acetylglucosamine repressor  40.85 
 
 		 406 aa  318  7.999999999999999e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0729  N-acetylglucosamine repressor  40.85 
 
 		 406 aa  318  7.999999999999999e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0110065  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0788  N-acetylglucosamine repressor  40.85 
 
 		 406 aa  318  7.999999999999999e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.808469  normal  0.447439 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0837  N-acetylglucosamine repressor  40.85 
 
 		 406 aa  318  7.999999999999999e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0741  N-acetylglucosamine repressor  40.85 
 
 		 406 aa  318  7.999999999999999e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.388075  normal  0.560523 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0829  N-acetylglucosamine repressor  39.45 
 
 		 404 aa  315  9.999999999999999e-85  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.933569  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1191  ROK family protein  40.51 
 
 		 406 aa  315  9.999999999999999e-85  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.417916  hitchhiker  0.000194034 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2944  ROK family protein  39.85 
 
 		 407 aa  313  2.9999999999999996e-84  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0669477  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1225  ROK family protein  40.1 
 
 		 406 aa  312  5.999999999999999e-84  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.619428  normal  0.0842391 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004130  N-acetylglucosamine-6P-responsive transcriptional repressor NagC ROK family  37.66 
 
 		 404 aa  310  4e-83  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01334  transcriptional regulator  36.88 
 
 		 404 aa  305  9.000000000000001e-82  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1112  ROK family protein  38.31 
 
 		 407 aa  298  8e-80  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.677334  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2999  ROK family protein  39.35 
 
 		 408 aa  298  1e-79  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.609089  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0336  N-acetylglucosamine repressor  39.35 
 
 		 408 aa  298  2e-79  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0129193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2911  N-acetylglucosamine repressor  39.35 
 
 		 408 aa  298  2e-79  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0186288  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3130  ROK family protein  37.25 
 
 		 407 aa  293  3e-78  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.224994  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1201  ROK family protein  37.59 
 
 		 407 aa  293  3e-78  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0872056  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0514  N-acetylglucosamine repressor  36.14 
 
 		 404 aa  292  8e-78  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0488  ROK family protein  32.31 
 
 		 408 aa  259  6e-68  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0318886  normal  0.538791 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0421  ROK  25.74 
 
 		 410 aa  163  4.0000000000000004e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0799462 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2512  ROK family protein  28.85 
 
 		 401 aa  162  8.000000000000001e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27980  transcriptional regulator/sugar kinase  29.09 
 
 		 420 aa  157  2e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0812883  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0752  ROK family protein  26.18 
 
 		 408 aa  155  1e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000087715  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2517  ROK family protein  28.27 
 
 		 418 aa  152  8.999999999999999e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1923  putative transcriptional repressor protein  29.52 
 
 		 389 aa  152  1e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.585113  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2855  ROK family protein  27.81 
 
 		 396 aa  152  1e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.133469  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1089  ROK family protein  26.25 
 
 		 396 aa  151  2e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3041  ROK family protein  27.73 
 
 		 410 aa  149  7e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0418823 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1858  NagC family Transcriptional regulator  29.36 
 
 		 389 aa  147  3e-34  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00000905056  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5188  ROK family protein  28.69 
 
 		 401 aa  147  3e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0518111  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0693  ROK family protein  28.26 
 
 		 402 aa  147  5e-34  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1684  ROK family protein  26.92 
 
 		 400 aa  146  5e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2995  ROK family protein  27.3 
 
 		 393 aa  145  1e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1772  ROK family protein  27.16 
 
 		 386 aa  145  1e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.415249  normal  0.404833 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22750  ROK family protein  26.89 
 
 		 396 aa  142  9.999999999999999e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0757  NagC-like transcriptional regulator  26.59 
 
 		 405 aa  141  1.9999999999999998e-32  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00860509  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19540  ROK family protein  25.13 
 
 		 391 aa  141  1.9999999999999998e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0076  putative glucokinase  27.02 
 
 		 315 aa  141  3e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0098  glucose kinase  27.02 
 
 		 315 aa  141  3e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3199  ROK family protein  28.16 
 
 		 407 aa  140  3.9999999999999997e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.845236 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0286  ROK family protein  25.54 
 
 		 402 aa  140  6e-32  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.162895  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16050  glucokinase  27.65 
 
 		 322 aa  139  1e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2995  ROK family protein  25.14 
 
 		 408 aa  138  2e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.403237  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1182  ROK family protein  26.35 
 
 		 386 aa  137  2e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1294  transcriptional repressor of the xylose operon  29.82 
 
 		 401 aa  136  6.0000000000000005e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1181  xylose operon repressor  30 
 
 		 425 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1302  ROK family protein  29.4 
 
 		 400 aa  135  9.999999999999999e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.107905  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2843  ROK family protein  30 
 
 		 425 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5341  ROK family protein  26.6 
 
 		 404 aa  133  6e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3295  ROK family protein  24.81 
 
 		 428 aa  132  6.999999999999999e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5335  ROK family protein  24.66 
 
 		 401 aa  133  6.999999999999999e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.123634  normal  0.740513 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3264  ROK family protein  26.44 
 
 		 387 aa  132  1.0000000000000001e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.198191  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4279  ROK family protein  27.97 
 
 		 390 aa  132  2.0000000000000002e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.141771 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2407  ROK family protein  26.72 
 
 		 403 aa  130  4.0000000000000003e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.200641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0116  ROK family protein  25.82 
 
 		 398 aa  130  4.0000000000000003e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0217  ROK family protein  25.78 
 
 		 395 aa  129  9.000000000000001e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1491  ROK family protein  26.96 
 
 		 410 aa  129  1.0000000000000001e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2629  ROK family protein  25.39 
 
 		 409 aa  129  1.0000000000000001e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2656  ROK family protein  26.84 
 
 		 418 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1126  ROK family protein  28.09 
 
 		 371 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2001  putative xylose repressor  28.17 
 
 		 414 aa  128  2.0000000000000002e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.244297  normal  0.176601 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20690  ROK family protein  25.14 
 
 		 383 aa  127  3e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3430  ROK family protein  24.16 
 
 		 399 aa  127  3e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0904  ROK domain-containing protein  31.32 
 
 		 408 aa  127  4.0000000000000003e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2620  ROK family protein  31.36 
 
 		 425 aa  126  6e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.92 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>