175 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_2173 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RS01961  hypothetical protein  56.08 
 
 		 616 aa  694    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0957236  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2173  hypothetical protein  100 
 
 		 610 aa  1251    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0216331  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3640  hypothetical protein  54.06 
 
 		 612 aa  666    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.36511  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02049  EvpF  54.63 
 
 		 611 aa  680    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0842725  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0406  type VI secretion protein  56.05 
 
 		 611 aa  707    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.65912  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3563  hypothetical protein  56.05 
 
 		 611 aa  708    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2926  type VI secretion protein  56.37 
 
 		 611 aa  707    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4917  type VI secretion protein, VC_A0110 family  56.19 
 
 		 612 aa  704    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.263892  hitchhiker  0.00583234 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2960  hypothetical protein  54.06 
 
 		 612 aa  664    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2635  hypothetical protein  56.21 
 
 		 611 aa  710    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.881877  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0385  hypothetical protein  56.05 
 
 		 611 aa  706    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0449  type VI secretion protein  56.21 
 
 		 611 aa  710    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.869573 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0471  hypothetical protein  56.21 
 
 		 611 aa  710    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.056714  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0056  hypothetical protein  54.06 
 
 		 612 aa  667    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1711  hypothetical protein  54.06 
 
 		 612 aa  667    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3631  hypothetical protein  53.9 
 
 		 612 aa  663    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3656  hypothetical protein  54.06 
 
 		 612 aa  666    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2708  hypothetical protein  44.93 
 
 		 660 aa  500  1e-140  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1601  hypothetical protein  43.2 
 
 		 633 aa  482  1e-135  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0852  hypothetical protein  43.2 
 
 		 616 aa  481  1e-134  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1762  hypothetical protein  43.2 
 
 		 633 aa  482  1e-134  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1373  hypothetical protein  43.2 
 
 		 616 aa  481  1e-134  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.172997  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0502  hypothetical protein  43.2 
 
 		 616 aa  481  1e-134  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1575  hypothetical protein  43.2 
 
 		 616 aa  481  1e-134  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.3632  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7618  hypothetical protein  40.65 
 
 		 620 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.127687 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2271  hypothetical protein  40.33 
 
 		 611 aa  442  1e-123  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0951  hypothetical protein  39.38 
 
 		 605 aa  413  1e-114  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.854654  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0628  hypothetical protein  39.18 
 
 		 646 aa  412  1e-114  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0777  hypothetical protein  39.38 
 
 		 605 aa  413  1e-114  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0789  hypothetical protein  39.38 
 
 		 605 aa  412  1e-114  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.975565  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4956  hypothetical protein  36.06 
 
 		 610 aa  402  9.999999999999999e-111  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2625  hypothetical protein  36.9 
 
 		 606 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3097  hypothetical protein  36.39 
 
 		 606 aa  397  1e-109  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6433  type VI secretion protein  35.66 
 
 		 603 aa  398  1e-109  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2507  type VI secretion protein  36.77 
 
 		 606 aa  395  1e-108  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0116993  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2767  type VI secretion protein  36.61 
 
 		 606 aa  390  1e-107  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00399932  normal  0.648894 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1289  type VI secretion protein  35.07 
 
 		 603 aa  382  1e-104  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0391299 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1190  hypothetical protein  34.43 
 
 		 626 aa  365  2e-99  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3039  type VI secretion protein, VC_A0110 family  35.06 
 
 		 590 aa  331  3e-89  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1211  type VI secretion protein, VC_A0110 family  34.62 
 
 		 590 aa  323  8e-87  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3076  hypothetical protein  32.63 
 
 		 605 aa  303  4.0000000000000003e-81  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34010  hypothetical protein  34.16 
 
 		 597 aa  292  1e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.110029  normal  0.162624 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2892  hypothetical protein  34.16 
 
 		 597 aa  291  2e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3410  hypothetical protein  33.28 
 
 		 589 aa  288  1e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50840  hypothetical protein  34.05 
 
 		 597 aa  287  5e-76  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.232659  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5982  type VI secretion protein  32.17 
 
 		 589 aa  285  2.0000000000000002e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3030  hypothetical protein  32.52 
 
 		 592 aa  279  8e-74  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.104636  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2364  hypothetical protein  30.03 
 
 		 609 aa  275  2.0000000000000002e-72  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.843191  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00261  SciC protein  31.68 
 
 		 625 aa  268  2e-70  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.527979  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01070  hypothetical protein  31.9 
 
 		 619 aa  266  5.999999999999999e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.970936  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0198  type VI secretion protein, VC_A0110 family  30.77 
 
 		 623 aa  266  5.999999999999999e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1729  hypothetical protein  30.81 
 
 		 586 aa  265  2e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.162099  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0160  hypothetical protein  32.13 
 
 		 619 aa  263  4.999999999999999e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2329  hypothetical protein  31.34 
 
 		 619 aa  260  5.0000000000000005e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0250142  normal  0.0432073 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2124  hypothetical protein  30.22 
 
 		 588 aa  253  5.000000000000001e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.369008  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3227  type VI secretion protein  30.62 
 
 		 588 aa  252  1e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0407  hypothetical protein  33.17 
 
 		 623 aa  250  4e-65  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.941773  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1604  hypothetical protein  33.17 
 
 		 623 aa  250  4e-65  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1787  hypothetical protein  33.17 
 
 		 623 aa  250  4e-65  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.973782  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0457  hypothetical protein  33.17 
 
 		 623 aa  250  4e-65  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2831  hypothetical protein  33.28 
 
 		 623 aa  250  5e-65  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.843813  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2956  hypothetical protein  33.17 
 
 		 623 aa  250  7e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2621  hypothetical protein  30.05 
 
 		 588 aa  248  2e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.264727  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1196  hypothetical protein  33.12 
 
 		 623 aa  248  2e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2451  type VI secretion protein, VC_A0110 family  29.15 
 
 		 624 aa  248  2e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00678774  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3730  hypothetical protein  30.93 
 
 		 590 aa  248  2e-64  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6046  hypothetical protein  30.65 
 
 		 593 aa  248  2e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.739276  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0048  hypothetical protein  32.56 
 
 		 587 aa  248  3e-64  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1584  hypothetical protein  32.33 
 
 		 623 aa  247  4.9999999999999997e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.468978  normal  0.21502 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0095  hypothetical protein  32.39 
 
 		 596 aa  246  8e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1073  type VI secretion protein, VC_A0110 family  30.73 
 
 		 588 aa  246  9.999999999999999e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.889843  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2489  hypothetical protein  30.42 
 
 		 587 aa  244  1.9999999999999999e-63  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3252  type VI secretion protein, VC_A0110 family  30.56 
 
 		 588 aa  245  1.9999999999999999e-63  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2587  type VI secretion protein  30.42 
 
 		 587 aa  245  1.9999999999999999e-63  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0262  hypothetical protein  32.43 
 
 		 623 aa  244  3e-63  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2804  type VI secretion protein, VC_A0110 family  30.73 
 
 		 588 aa  244  3e-63  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0800  hypothetical protein  30.26 
 
 		 587 aa  242  2e-62  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2993  hypothetical protein  30.26 
 
 		 587 aa  241  2.9999999999999997e-62  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000448613 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3011  hypothetical protein  29.24 
 
 		 628 aa  239  9e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.548541  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1800  hypothetical protein  30.05 
 
 		 584 aa  239  1e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.765675  normal  0.114304 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000438  protein ImpG/VasA  30.13 
 
 		 582 aa  237  6e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.877491  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5273  hypothetical protein  30.73 
 
 		 608 aa  236  7e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2546  hypothetical protein  31.05 
 
 		 595 aa  235  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0583684  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0527  type VI secretion protein, VC_A0110 family  28.21 
 
 		 630 aa  234  3e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000025  protein ImpG/VasA  28.16 
 
 		 607 aa  233  1e-59  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.536282  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0635  hypothetical protein  30.74 
 
 		 606 aa  233  1e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0758526 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05860  hypothetical protein  29.92 
 
 		 582 aa  233  1e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5586  hypothetical protein  30.95 
 
 		 595 aa  229  9e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1690  type VI secretion protein, VC_A0110 family  28.82 
 
 		 626 aa  228  3e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.577908 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3612  hypothetical protein  31.55 
 
 		 595 aa  227  4e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.332362  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26630  hypothetical protein  30.41 
 
 		 620 aa  226  7e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.268806  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0028  hypothetical protein  30.77 
 
 		 589 aa  226  1e-57  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.167709  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3469  hypothetical protein  29.89 
 
 		 629 aa  225  2e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.136581  normal  0.824361 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1175  putative type VI secretion protein VasA-1  27.05 
 
 		 593 aa  225  2e-57  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.64258  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4077  hypothetical protein  29.12 
 
 		 588 aa  224  3e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0270196  unclonable  0.00000124343 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4431  hypothetical protein  28.85 
 
 		 630 aa  224  3e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.853044 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3903  type VI secretion protein  29.86 
 
 		 629 aa  223  8e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.795442  normal  0.757751 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1199  hypothetical protein  30.64 
 
 		 588 aa  222  9.999999999999999e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.241231  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0389  type VI secretion protein  28.53 
 
 		 606 aa  219  1e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0316  hypothetical protein  28.53 
 
 		 606 aa  219  1e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>