More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_0012 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_0012  response regulator receiver  100 
 
 		 377 aa  768    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0552217 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3172  response regulator receiver  36.36 
 
 		 374 aa  220  3e-56  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0909  response regulator receiver protein  28 
 
 		 364 aa  152  1e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0924607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1383  response regulator  29.45 
 
 		 409 aa  149  9e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.697135  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1276  response regulator receiver protein  27.09 
 
 		 364 aa  149  9e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0129335  normal  0.0561968 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1514  response regulator receiver protein  29.82 
 
 		 382 aa  146  7.0000000000000006e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.222117  hitchhiker  0.00633337 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1181  response regulator receiver protein  28.32 
 
 		 364 aa  143  4e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.27125  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3594  response regulator receiver protein  25.88 
 
 		 376 aa  132  9e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1085  response regulator receiver protein  25.36 
 
 		 364 aa  129  7.000000000000001e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0724924  normal  0.0804122 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3110  response regulator receiver domain-containing protein  25.52 
 
 		 397 aa  102  2e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5066  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  34.71 
 
 		 338 aa  93.2  7e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0667  response regulator receiver domain-containing protein  32.41 
 
 		 1526 aa  87  5e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0280955  hitchhiker  0.000000898802 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4229  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  36.59 
 
 		 383 aa  85.9  0.000000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.599633  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3136  Signal transduction histidine kinase-like  33.56 
 
 		 389 aa  85.5  0.000000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3677  response regulator PleD  34.17 
 
 		 461 aa  85.1  0.000000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00345303  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3669  diguanylate cyclase  32.5 
 
 		 300 aa  85.1  0.000000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0119902  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2947  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.11 
 
 		 503 aa  85.1  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0424  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  31.21 
 
 		 469 aa  85.1  0.000000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.97349 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0634  DNA-binding response regulator  33.93 
 
 		 223 aa  84.3  0.000000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2978  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  28.48 
 
 		 369 aa  84.3  0.000000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.806511 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0360  response regulator receiver protein  30.08 
 
 		 204 aa  84  0.000000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000726536 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0809  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  35.07 
 
 		 367 aa  82.8  0.00000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0702  DNA-binding response regulator  33.04 
 
 		 223 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0378  response regulator receiver protein  30.83 
 
 		 204 aa  82  0.00000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0485  two component transcriptional regulator  33.04 
 
 		 223 aa  82  0.00000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1577  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  32.09 
 
 		 314 aa  82.8  0.00000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0748  response regulator receiver protein  33.58 
 
 		 312 aa  82.4  0.00000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0482  response regulator  33.04 
 
 		 223 aa  82  0.00000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0484  response regulator  33.04 
 
 		 229 aa  82  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2951  response regulator receiver protein  30.61 
 
 		 340 aa  81.6  0.00000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.129077 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3271  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.92 
 
 		 1691 aa  81.6  0.00000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0540  DNA-binding response regulator  33.04 
 
 		 223 aa  80.9  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0571  DNA-binding response regulator  33.04 
 
 		 223 aa  80.9  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0627  DNA-binding response regulator  33.04 
 
 		 223 aa  80.9  0.00000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6679  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  34.06 
 
 		 457 aa  81.3  0.00000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4030  response regulator receiver protein  35.19 
 
 		 216 aa  80.5  0.00000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000171088  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1750  response regulator PleD  32.03 
 
 		 457 aa  80.9  0.00000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.263569  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2188  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  28.89 
 
 		 384 aa  80.5  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00677544 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0967  diguanylate cyclase  34.04 
 
 		 457 aa  79.7  0.00000000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.555277  normal  0.0207283 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0931  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  34.04 
 
 		 457 aa  79.7  0.00000000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.436852  normal  0.104843 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1595  two component transcriptional regulator  37.76 
 
 		 227 aa  79.7  0.00000000000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.526383  normal  0.570373 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4225  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.39 
 
 		 1322 aa  79.7  0.00000000000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0124  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  30 
 
 		 470 aa  79.3  0.00000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0907  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  36.09 
 
 		 457 aa  79.7  0.00000000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.401363  normal  0.40647 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0610  response regulator PleD  34.17 
 
 		 461 aa  79  0.0000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.961713  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3702  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  36.3 
 
 		 863 aa  79  0.0000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.170309 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4702  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  32.61 
 
 		 381 aa  78.6  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0901362  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5089  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.47 
 
 		 242 aa  79  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.160869  normal  0.250223 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0608  DNA-binding response regulator  32.14 
 
 		 223 aa  79  0.0000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0737  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.62 
 
 		 224 aa  79  0.0000000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0629  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  29.25 
 
 		 339 aa  79  0.0000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0293  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.96 
 
 		 226 aa  79  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.591061  normal  0.658536 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0575  response regulator PleD  34.17 
 
 		 456 aa  78.6  0.0000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3818  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.69 
 
 		 1426 aa  78.2  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2476  two component transcriptional regulator  36.28 
 
 		 227 aa  78.6  0.0000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.210757  normal  0.512741 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3923  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.45 
 
 		 224 aa  78.6  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3071  response regulator receiver protein  30.08 
 
 		 390 aa  78.6  0.0000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000442652 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3141  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  28.46 
 
 		 338 aa  77.8  0.0000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4731  DNA-binding response regulator  32.14 
 
 		 223 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02505  putative response regulator  33.87 
 
 		 306 aa  77.4  0.0000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0981  response regulator receiver protein  36.36 
 
 		 155 aa  77.8  0.0000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1317  ATP-binding region ATPase domain protein  31.2 
 
 		 1370 aa  77  0.0000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3544  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  34.15 
 
 		 322 aa  77.4  0.0000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0106122 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0662  adenylate/guanylate cyclase  32.26 
 
 		 1130 aa  77.4  0.0000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0863  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  33.33 
 
 		 351 aa  77.4  0.0000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.297515  normal  0.141829 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2998  response regulator receiver protein  30.82 
 
 		 377 aa  77  0.0000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1373  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  34.4 
 
 		 365 aa  77  0.0000000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1864  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  38.89 
 
 		 457 aa  77  0.0000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.831894  normal  0.121309 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0926  response regulator PleD  31.54 
 
 		 455 aa  77  0.0000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.773886 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3359  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  29.55 
 
 		 395 aa  77  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.361398  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2743  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  29.55 
 
 		 395 aa  77  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1447  two component transcriptional regulator  33.33 
 
 		 224 aa  77  0.0000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0595481 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3187  two component transcriptional regulator  37.72 
 
 		 229 aa  76.6  0.0000000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0716  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  28.46 
 
 		 338 aa  76.6  0.0000000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3306  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  28.46 
 
 		 338 aa  76.6  0.0000000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0719  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.2 
 
 		 531 aa  76.6  0.0000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1944  histidine kinase  30.33 
 
 		 1278 aa  76.6  0.0000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.866742 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3418  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  28.46 
 
 		 338 aa  76.6  0.0000000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3199  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  30.47 
 
 		 339 aa  76.3  0.0000000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0860  response regulator  28.46 
 
 		 339 aa  76.3  0.0000000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7417  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  33.33 
 
 		 457 aa  76.3  0.0000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.196799  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2324  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.86 
 
 		 223 aa  76.3  0.0000000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.237639  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1483  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  31.97 
 
 		 374 aa  76.3  0.0000000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1510  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  31.97 
 
 		 374 aa  76.3  0.0000000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3523  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  34.13 
 
 		 363 aa  76.3  0.0000000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1047  two component transcriptional regulator  34.86 
 
 		 231 aa  76.3  0.0000000000009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2855  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  32 
 
 		 348 aa  75.5  0.000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2262  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  35.56 
 
 		 853 aa  75.9  0.000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3210  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  32.84 
 
 		 337 aa  75.5  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.32327  normal  0.712325 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0695  response regulator receiver  33.33 
 
 		 170 aa  75.5  0.000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.412637  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0878  response regulator receiver  32.31 
 
 		 302 aa  75.9  0.000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2762  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.85 
 
 		 225 aa  75.5  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1666  ATP-binding region, ATPase-like  35.97 
 
 		 1427 aa  75.5  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.207779 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0661  adenylate/guanylate cyclase  33.33 
 
 		 1133 aa  75.9  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1054  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  27.74 
 
 		 359 aa  75.9  0.000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01756  Response regulator CheB (receptor modification enzyme, protein-glutamate methylesterase)  30.88 
 
 		 337 aa  75.9  0.000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.844049  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0045  adenylate/guanylate cyclase  47.56 
 
 		 382 aa  75.9  0.000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3580  response regulator receiver protein  40.35 
 
 		 564 aa  75.5  0.000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2309  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  34.29 
 
 		 434 aa  75.1  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.484645  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1771  PAS:GGDEF  33.13 
 
 		 449 aa  74.7  0.000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>