More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_3136 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_3136  Signal transduction histidine kinase-like  100 
 
 		 389 aa  787    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3384  Signal transduction histidine kinase-like  33.33 
 
 		 761 aa  133  6.999999999999999e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.411252 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.02 
 
 		 1352 aa  122  8e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0644  GAF sensor hybrid histidine kinase  33.08 
 
 		 754 aa  122  9.999999999999999e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2189  histidine kinase  31.9 
 
 		 482 aa  121  1.9999999999999998e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1885  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.87 
 
 		 792 aa  120  3e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3985  signal transduction histidine protein kinase  30.67 
 
 		 1156 aa  120  3.9999999999999996e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0386149 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0419  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.38 
 
 		 1260 aa  120  3.9999999999999996e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.784662  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3403  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.51 
 
 		 957 aa  120  4.9999999999999996e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0204  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  30.77 
 
 		 687 aa  119  7e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.478023 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1705  histidine kinase  30.04 
 
 		 910 aa  119  7e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0606  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.78 
 
 		 785 aa  119  7.999999999999999e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2032  hybrid sensory histidine kinase BarA  32.1 
 
 		 927 aa  117  3.9999999999999997e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0864566  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0636  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.42 
 
 		 535 aa  116  5e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.318643  normal  0.125988 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002502  BarA sensory histidine kinase  32.38 
 
 		 932 aa  116  6e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00899  sensory box histidine kinase/response regulator  31.47 
 
 		 1070 aa  116  6.9999999999999995e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1268  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.44 
 
 		 1069 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2521  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  29.88 
 
 		 597 aa  115  1.0000000000000001e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03530  hybrid sensory histidine kinase BarA  32.38 
 
 		 932 aa  114  2.0000000000000002e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2953  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.6 
 
 		 1202 aa  115  2.0000000000000002e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.999143  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52260  sensor/response regulator hybrid  31.69 
 
 		 925 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.173365 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4843  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.62 
 
 		 574 aa  114  3e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1180  hybrid sensory histidine kinase BarA  28.72 
 
 		 929 aa  114  3e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.175711  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4142  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.17 
 
 		 916 aa  114  3e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4582  sensor/response regulator hybrid  31.69 
 
 		 925 aa  114  3e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1012  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.08 
 
 		 1029 aa  114  3e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.135444  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1052  sensory transduction histidine kinase  31.65 
 
 		 1046 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0833  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.17 
 
 		 682 aa  113  4.0000000000000004e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0832804 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2194  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.36 
 
 		 1363 aa  114  4.0000000000000004e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2536  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.83 
 
 		 801 aa  114  4.0000000000000004e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.087707 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1949  two component hybrid histidine kinase/sensor response regulator  27.57 
 
 		 833 aa  113  6e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2689  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.36 
 
 		 646 aa  113  6e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.119288 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3652  Signal transduction histidine kinase-like  27.17 
 
 		 765 aa  113  6e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.471696  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0135  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  29.36 
 
 		 858 aa  112  9e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.711395  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0047  histidine kinase  29.67 
 
 		 508 aa  112  1.0000000000000001e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3699  histidine kinase  27.55 
 
 		 998 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0083  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.96 
 
 		 763 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.172925  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2282  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.61 
 
 		 685 aa  112  1.0000000000000001e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1550  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.92 
 
 		 995 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4928  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.43 
 
 		 889 aa  111  2.0000000000000002e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.338102 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4515  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.29 
 
 		 386 aa  111  2.0000000000000002e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000238922  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2145  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.57 
 
 		 1271 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.152151  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0903  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.22 
 
 		 977 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.393558  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2663  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.92 
 
 		 1369 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2995  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.12 
 
 		 1002 aa  110  3e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.175208  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2022  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.38 
 
 		 1258 aa  110  3e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.250401  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3595  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.46 
 
 		 744 aa  110  3e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3314  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.91 
 
 		 1582 aa  110  3e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.660804  hitchhiker  0.0000234203 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2955  Hpt sensor hybrid histidine kinase  29.5 
 
 		 764 aa  110  3e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2947  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.33 
 
 		 503 aa  111  3e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1820  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.8 
 
 		 780 aa  110  3e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00145182  normal  0.723891 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5576  sensor/response regulator hybrid  28.74 
 
 		 962 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1816  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  29.54 
 
 		 977 aa  110  4.0000000000000004e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.218789  normal  0.39116 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1526  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.27 
 
 		 975 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0965  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  30.29 
 
 		 1331 aa  110  4.0000000000000004e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4061  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.17 
 
 		 885 aa  110  4.0000000000000004e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.193403  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3000  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.85 
 
 		 968 aa  110  4.0000000000000004e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2639  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.7 
 
 		 641 aa  110  4.0000000000000004e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0858  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.54 
 
 		 1792 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0859  sensory box histidine kinase/response regulator  28.27 
 
 		 1765 aa  110  5e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0835  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.18 
 
 		 1165 aa  110  5e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2929  histidine kinase  28.45 
 
 		 606 aa  110  5e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0720  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.28 
 
 		 882 aa  110  5e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.488385  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2520  hybrid sensory histidine kinase BarA  29.63 
 
 		 929 aa  110  5e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.314221  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0800  histidine kinase  28.69 
 
 		 882 aa  110  5e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.127646  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2663  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.81 
 
 		 784 aa  110  5e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.501852  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3007  two component system histidine kinase  31.14 
 
 		 729 aa  110  6e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0422303  hitchhiker  0.00299589 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0620  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.71 
 
 		 645 aa  110  6e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0628  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.29 
 
 		 1765 aa  109  6e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1561  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  29.91 
 
 		 443 aa  109  7.000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.414952 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2979  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.48 
 
 		 1340 aa  109  7.000000000000001e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.698765 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0416  histidine kinase  31.54 
 
 		 896 aa  109  7.000000000000001e-23  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2406  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  28.69 
 
 		 1301 aa  109  7.000000000000001e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3723  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  30.45 
 
 		 903 aa  109  7.000000000000001e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.803649  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1548  Hpt sensor hybrid histidine kinase  29.89 
 
 		 929 aa  109  7.000000000000001e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2814  GAF sensor hybrid histidine kinase  30.15 
 
 		 763 aa  109  8.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.155467  normal  0.302046 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2539  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.15 
 
 		 554 aa  109  8.000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.787523  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0594  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.67 
 
 		 880 aa  109  8.000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.333457  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1850  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.56 
 
 		 946 aa  109  8.000000000000001e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0866059  normal  0.191772 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1555  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.3 
 
 		 1172 aa  109  8.000000000000001e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0698206 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2759  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.07 
 
 		 785 aa  109  8.000000000000001e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1926  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.31 
 
 		 697 aa  109  8.000000000000001e-23  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1418  GAF sensor hybrid histidine kinase  29.79 
 
 		 853 aa  109  8.000000000000001e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.237881  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0647  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.38 
 
 		 944 aa  109  9.000000000000001e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0902383 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3505  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.54 
 
 		 1784 aa  109  9.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0641  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.75 
 
 		 772 aa  109  9.000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.544021 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0185  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.51 
 
 		 691 aa  108  1e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.483444  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0616  sensory box histidine kinase  28.1 
 
 		 783 aa  108  1e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.260748  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4585  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.33 
 
 		 1350 aa  108  1e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.20208  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6296  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.2 
 
 		 673 aa  108  1e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.312585  normal  0.564635 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0835  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.54 
 
 		 1782 aa  109  1e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1644  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.11 
 
 		 789 aa  109  1e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.841521  normal  0.594738 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0847  hybrid sensory histidine kinase BarA  29.83 
 
 		 918 aa  108  1e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0185431  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1918  ATP-binding region, ATPase-like protein  32.35 
 
 		 935 aa  108  1e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3302  GAF sensor hybrid histidine kinase  30.15 
 
 		 763 aa  109  1e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0870  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.54 
 
 		 1786 aa  109  1e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4574  histidine kinase  26.91 
 
 		 900 aa  108  1e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0643273  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0615  sensory box histidine kinase  28.1 
 
 		 783 aa  108  1e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3362  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  29.15 
 
 		 575 aa  107  2e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.516975 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0404  Signal transduction histidine kinase-like  30 
 
 		 498 aa  108  2e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>