More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_2453 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_0867  FecA-like outer membrane receptor  51.39 
 
 		 809 aa  687    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.272294  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0897  TonB-dependent siderophore receptor  51.53 
 
 		 809 aa  687    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.448435  normal  0.28892 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2453  TonB-dependent siderophore receptor  100 
 
 		 720 aa  1470    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.591762  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3784  TonB-dependent siderophore receptor  50.56 
 
 		 807 aa  683    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.894959 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4311  TonB-dependent siderophore receptor  51.05 
 
 		 809 aa  683    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0939329 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5169  TonB-dependent siderophore receptor  67.36 
 
 		 723 aa  963    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5806  ferric citrate outer membrane transporter  59.61 
 
 		 731 aa  852    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5807  ferric citrate outer membrane transporter  59.08 
 
 		 717 aa  847    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1853  TonB-dependent receptor  50.89 
 
 		 721 aa  663    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.80471  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21730  putative TonB-dependent receptor  50.2 
 
 		 721 aa  666    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0911  TonB-dependent siderophore receptor  51.39 
 
 		 809 aa  688    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.11228 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3231  TonB-dependent siderophore receptor  48.12 
 
 		 687 aa  610  1e-173  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.854124  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3709  TonB-dependent siderophore receptor  44.51 
 
 		 774 aa  562  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0483354  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0743  TonB-dependent siderophore receptor  44.51 
 
 		 774 aa  563  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.689224  normal  0.515767 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04157  ferric citrate outer membrane transporter  44.36 
 
 		 774 aa  561  1e-158  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4868  iron(III) dicitrate transport protein FecA  44.36 
 
 		 774 aa  560  1e-158  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04120  hypothetical protein  44.36 
 
 		 774 aa  561  1e-158  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4613  outer membrane iron(III) dicitrate receptor  45.51 
 
 		 774 aa  558  1e-157  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4596  TonB-dependent siderophore receptor  45.51 
 
 		 774 aa  558  1e-157  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1207  iron(III) dicitrate transport protein fecA  44.16 
 
 		 782 aa  544  1e-153  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1038  TonB-dependent siderophore receptor  44.67 
 
 		 782 aa  543  1e-153  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.85232 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0923  TonB-dependent siderophore receptor  43.38 
 
 		 777 aa  545  1e-153  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1204  Fe(III) dicitrate transport protein FecA  45.44 
 
 		 784 aa  538  1e-151  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.814963  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4646  TonB-dependent siderophore receptor  41.67 
 
 		 708 aa  532  1e-150  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13430  Fe(III) dicitrate transport protein FecA  45.3 
 
 		 784 aa  535  1e-150  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2308  TonB-dependent siderophore receptor  44.44 
 
 		 693 aa  524  1e-147  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00270239  normal  0.034674 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47190  Fe(III) dicitrate transport protein FecA  42.84 
 
 		 784 aa  478  1e-133  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0722  TonB-dependent siderophore receptor  32.43 
 
 		 675 aa  303  5.000000000000001e-81  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.534189 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09350  TonB-dependent siderophore receptor  31.1 
 
 		 704 aa  290  6e-77  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4787  TonB-dependent siderophore receptor  33.24 
 
 		 696 aa  290  8e-77  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0049  TonB-dependent siderophore receptor  30.73 
 
 		 703 aa  276  9e-73  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.627674  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001068  vibrioferrin receptor PvuA  31.56 
 
 		 712 aa  272  1e-71  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0609  TonB-dependent siderophore receptor  29.48 
 
 		 710 aa  263  6e-69  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3090  ferric vibrioferrin receptor  29.57 
 
 		 690 aa  258  2e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0290295  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01932  TonB-dependent outer membrane Receptor  30.25 
 
 		 713 aa  258  2e-67  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3851  TonB-dependent siderophore receptor  29.22 
 
 		 711 aa  258  3e-67  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1280  TonB-dependent siderophore receptor  29.22 
 
 		 731 aa  248  3e-64  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0800812  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3142  TonB-dependent siderophore receptor  30.48 
 
 		 688 aa  248  3e-64  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1512  TonB-dependent receptor  27.4 
 
 		 782 aa  187  5e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.116652 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02035  outer membrane iron(III) dicitrate receptor  24.42 
 
 		 705 aa  147  1e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0865  TonB-dependent receptor  26.43 
 
 		 700 aa  128  4.0000000000000003e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0848071  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2724  TonB-dependent receptor  24.71 
 
 		 709 aa  126  1e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.424768 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3399  TonB-dependent receptor  25.85 
 
 		 727 aa  118  3e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.186836  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0630  TonB-dependent receptor  25.59 
 
 		 727 aa  114  5e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0349605  normal  0.294722 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3888  TonB-dependent receptor  24.9 
 
 		 730 aa  110  6e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000154411  decreased coverage  0.00438264 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3787  TonB-dependent receptor  24.86 
 
 		 751 aa  110  7.000000000000001e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000153626  decreased coverage  0.00000099878 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0818  TonB-dependent receptor, plug  26.61 
 
 		 518 aa  109  2e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000136965  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0718  hydroxamate-type ferrisiderophore receptor  23.94 
 
 		 724 aa  104  6e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0713  TonB-dependent receptor  24.45 
 
 		 729 aa  103  1e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000508975  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4030  TonB-dependent receptor:Lipocalin  23.86 
 
 		 713 aa  98.6  3e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2786  TonB-dependent receptor  23.93 
 
 		 644 aa  96.3  2e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.934768  normal  0.0544871 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0607  TonB-dependent siderophore receptor  25.56 
 
 		 706 aa  95.5  3e-18  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6883  TonB-dependent receptor  23.7 
 
 		 821 aa  94.7  5e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3324  TonB-dependent outer membrane ferric coprogen receptor FitA  28.26 
 
 		 713 aa  94.4  7e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.992566  normal  0.497085 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4343  TonB-dependent outer membrane ferric coprogen receptor FitA  27.95 
 
 		 713 aa  93.6  1e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5373  TonB-dependent outer-membrane transporter  33.17 
 
 		 661 aa  93.2  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0456572  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0312  iron(III) dicitrate transport protein, outer membrane receptor  25.47 
 
 		 807 aa  91.7  4e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.670307  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0651  tonB-dependent receptor  23.4 
 
 		 656 aa  92  4e-17  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0646495  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0931  TonB-dependent siderophore receptor  22.35 
 
 		 809 aa  91.7  5e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.79278  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0582  TonB-dependent receptor plug  23.8 
 
 		 664 aa  91.7  5e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000848459  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2301  TonB-dependent receptor  23.24 
 
 		 706 aa  90.9  7e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.216228 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3576  TonB-dependent receptor  21.51 
 
 		 653 aa  90.9  7e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.313951  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0008  TonB-dependent siderophore receptor  22.49 
 
 		 713 aa  90.5  9e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000108759 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2772  TonB-dependent receptor  23.35 
 
 		 794 aa  89  3e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.600395  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2675  TonB-dependent siderophore receptor  23.45 
 
 		 802 aa  88.6  4e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0824  TonB-dependent receptor, plug  27.92 
 
 		 659 aa  88.2  4e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2309  TonB-dependent outer membrane cobalamin receptor  23.74 
 
 		 666 aa  88.6  4e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2099  TonB-dependent siderophore receptor  24.89 
 
 		 728 aa  88.6  4e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0104822  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1766  TonB-dependent receptor yncD  24.54 
 
 		 706 aa  88.6  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3109  TonB-dependent receptor  27.53 
 
 		 738 aa  88.2  5e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0242785  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3519  TonB-dependent siderophore receptor  24.89 
 
 		 681 aa  87.8  6e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.302801  normal  0.288365 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001067  ferric siderophore receptor PsuA  23.07 
 
 		 678 aa  87.4  8e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1705  probable TonB-dependent receptor yncD  24.33 
 
 		 706 aa  86.7  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.714131  normal  0.179613 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0878  TonB-dependent receptor  24.13 
 
 		 773 aa  87  0.000000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32740  TonB-dependent receptor  22.83 
 
 		 820 aa  87  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.014522  hitchhiker  0.000022757 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1266  TonB-dependent receptor  23.73 
 
 		 679 aa  86.7  0.000000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0152296  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0590  putative TonB-dependent receptor protein  24.36 
 
 		 737 aa  86.7  0.000000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000188689  decreased coverage  0.000190482 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1754  TonB-dependent receptor YncD  24.09 
 
 		 721 aa  85.5  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.460893  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1573  probable TonB-dependent receptor yncD  24.26 
 
 		 706 aa  85.5  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000253157  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1968  TonB-dependent heme receptor  23.17 
 
 		 690 aa  85.1  0.000000000000004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3577  hydroxamate-type ferrisiderophore receptor  23.91 
 
 		 718 aa  85.1  0.000000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.601026  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4532  TonB-dependent receptor  24.88 
 
 		 813 aa  85.1  0.000000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.885203  normal  0.799433 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3302  TonB-dependent siderophore receptor  27.41 
 
 		 653 aa  85.1  0.000000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00384842  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0651  TonB-dependent siderophore receptor  27.03 
 
 		 653 aa  85.1  0.000000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.68611  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5052  TonB-dependent receptor  22.33 
 
 		 726 aa  85.1  0.000000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0923716  normal  0.422268 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3327  TonB-dependent siderophore receptor  24.36 
 
 		 799 aa  84.7  0.000000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3472  TonB-dependent siderophore receptor  27.03 
 
 		 653 aa  84.3  0.000000000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0503687  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1702  putative TonB-dependent receptor yncD  23.94 
 
 		 706 aa  84  0.000000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.770108  normal  0.940102 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0815  TonB-dependent receptor domain-containing protein  21.79 
 
 		 653 aa  84  0.00000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0493  TonB-dependent siderophore receptor  21.6 
 
 		 696 aa  84  0.00000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.478973 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4665  TonB-dependent receptor  26.67 
 
 		 739 aa  82.4  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.785854 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2926  TonB-dependent receptor  25.83 
 
 		 715 aa  82.8  0.00000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.0000000198793  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1076  iron transporter  24.11 
 
 		 743 aa  82.4  0.00000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.337763 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3037  TonB-dependent receptor  31.67 
 
 		 736 aa  82.8  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.117014 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5189  TonB-dependent siderophore receptor  21.71 
 
 		 808 aa  82.4  0.00000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.435834  normal  0.330016 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1720  TonB-dependent receptor  23.92 
 
 		 700 aa  82  0.00000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000201404 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1538  TonB-dependent receptor  23.87 
 
 		 700 aa  82  0.00000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1601  TonB-dependent heme receptor  22.86 
 
 		 702 aa  81.6  0.00000000000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10440  TonB-dependent siderophore receptor  23.73 
 
 		 810 aa  81.6  0.00000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0438512  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63960  putative uter membrane protein precursor  27.51 
 
 		 708 aa  81.6  0.00000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>