129 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan8802_4178 on replicon NC_013161
Organism: Cyanothece sp. PCC 8802



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013161  Cyan8802_4178  WD40 domain protein beta Propeller  100 
 
 		 197 aa  402  1e-111  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4138  WD40 domain protein beta Propeller  99.49 
 
 		 197 aa  398  9.999999999999999e-111  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4021  WD40 domain protein beta Propeller  48.32 
 
 		 171 aa  144  6e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3979  hypothetical protein  48.32 
 
 		 171 aa  144  6e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2014  hypothetical protein  40.88 
 
 		 197 aa  143  1e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.598603 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0522  WD-40-like beta propeller repeat-containing protein  39.88 
 
 		 172 aa  127  8.000000000000001e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0520  WD-40-like beta propeller repeat-containing protein  41.76 
 
 		 186 aa  127  2.0000000000000002e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.118512  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2651  Periplasmic component of the Tol biopolymer transport system-like protein  40.11 
 
 		 190 aa  126  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.136026 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3466  WD40 domain protein beta Propeller  40.11 
 
 		 190 aa  126  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4016  WD40 domain protein beta Propeller  39.51 
 
 		 169 aa  123  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.392857 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0057  WD40 domain-containing protein  43.17 
 
 		 175 aa  122  2e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0056  WD40 domain-containing protein  39.89 
 
 		 184 aa  123  2e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3347  Periplasmic component of the Tol biopolymer transport system-like protein  44.03 
 
 		 160 aa  120  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.52168  normal  0.409524 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2755  WD40 domain-containing protein  44.03 
 
 		 160 aa  120  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4015  WD40 domain protein beta Propeller  38.89 
 
 		 174 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.482104 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2013  hypothetical protein  38.51 
 
 		 175 aa  100  1e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.57132 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03171  hypothetical protein  29.6 
 
 		 168 aa  65.9  0.0000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.954075 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0010  WD40 domain-containing protein  28.7 
 
 		 560 aa  63.5  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.348529  normal  0.0411544 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0416  hypothetical protein  31.13 
 
 		 146 aa  60.8  0.00000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2264  hypothetical protein  27.93 
 
 		 158 aa  58.2  0.00000008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.607727 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1585  WD40 domain protein beta Propeller  30.23 
 
 		 437 aa  58.2  0.00000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.637887  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0562  translocation protein TolB  33.81 
 
 		 444 aa  56.6  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.271593  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0669  translocation protein TolB  33.81 
 
 		 444 aa  55.8  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.303969  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2322  translocation protein TolB  33.81 
 
 		 444 aa  55.8  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0205331  normal  0.53419 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0834  periplasmic component of the Tol biopolymer transport system-like  32.86 
 
 		 1202 aa  55.5  0.0000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  decreased coverage  0.00874286  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0686  translocation protein TolB  35.34 
 
 		 461 aa  54.7  0.0000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.223253  normal  0.228867 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3632  tolB protein, putative  30.71 
 
 		 441 aa  52.8  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000231281  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1212  Ig domain-containing protein  28.32 
 
 		 1279 aa  52.4  0.000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0639  PKD domain-containing protein  37.17 
 
 		 769 aa  52  0.000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.292646  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1279  WD40 domain-containing protein  29.3 
 
 		 428 aa  51.6  0.000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0278  WD40 domain-containing protein  25.58 
 
 		 463 aa  50.8  0.00001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00000605867  unclonable  0.0000100324 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2194  translocation protein TolB  28.03 
 
 		 432 aa  51.2  0.00001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.246481  normal  0.294233 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0494  periplasmic component of the Tol biopolymer transport system-like protein  31.74 
 
 		 171 aa  50.8  0.00001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1213  Ig domain-containing protein  30.51 
 
 		 1361 aa  50.4  0.00002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.406135  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0588  WD40 domain protein beta Propeller  28.12 
 
 		 439 aa  50.1  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000301748  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0467  TolB domain-containing protein  33.64 
 
 		 450 aa  49.3  0.00004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.84052  normal  0.495381 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3406  translocation protein TolB  29.03 
 
 		 438 aa  48.9  0.00005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.569267 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2260  WD40 domain-containing protein  29.79 
 
 		 348 aa  48.9  0.00005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00259667 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1910  TolB protein, putative  33.33 
 
 		 440 aa  48.5  0.00006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0755  TolB domain-containing protein  32.77 
 
 		 457 aa  48.5  0.00007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.242927  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2050  translocation protein TolB  30.95 
 
 		 429 aa  48.5  0.00007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2360  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  27.08 
 
 		 446 aa  48.1  0.00007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.28939 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0275  translocation protein TolB  26.62 
 
 		 436 aa  48.1  0.00007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00839364  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2161  WD40 domain protein beta Propeller  32.28 
 
 		 440 aa  48.1  0.00007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000041437  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1984  translocation protein TolB  30.95 
 
 		 426 aa  48.1  0.00008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.517365  normal  0.378967 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4129  WD40 domain-containing protein  30.51 
 
 		 572 aa  48.1  0.00008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000900599 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2060  WD40 domain-containing protein  27.2 
 
 		 1206 aa  48.1  0.00009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.456517  normal  0.995925 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1111  translocation protein TolB  29.81 
 
 		 446 aa  48.1  0.00009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00131159  normal  0.386204 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0303  translocation protein TolB  26.62 
 
 		 403 aa  47.4  0.0001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.307961  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2440  PKD  32.17 
 
 		 1042 aa  46.6  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.120372  normal  0.562563 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1723  translocation protein TolB  26.9 
 
 		 443 aa  47  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0502645 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0012  WD40 domain-containing protein  27.41 
 
 		 620 aa  47  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3394  translocation protein TolB  26.03 
 
 		 441 aa  47.4  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0076717 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0747  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  30.4 
 
 		 444 aa  46.6  0.0002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.00000000000257607  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51720  translocation protein TolB  35.83 
 
 		 432 aa  46.2  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000109745  hitchhiker  0.0000339249 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2229  translocation protein TolB  33.06 
 
 		 435 aa  46.2  0.0003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4536  translocation protein TolB  35.83 
 
 		 432 aa  46.2  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1981  translocation protein TolB  26.9 
 
 		 440 aa  46.2  0.0003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19660  periplasmic component of the Tol biopolymer transport system  30.7 
 
 		 1059 aa  46.2  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.26793  hitchhiker  0.00572239 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1011  translocation protein TolB  27.42 
 
 		 421 aa  45.8  0.0004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6416  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  28.1 
 
 		 362 aa  45.8  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1631  WD40 domain-containing protein  29.08 
 
 		 347 aa  45.4  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0888  translocation protein TolB  26.59 
 
 		 426 aa  45.4  0.0006  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4436  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  30.17 
 
 		 442 aa  45.4  0.0006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.314306  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1809  hypothetical protein  38.16 
 
 		 389 aa  45.4  0.0006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3513  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  29.03 
 
 		 407 aa  44.7  0.0009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000266488  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0745  amidohydrolase  35.21 
 
 		 1005 aa  43.9  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1746  translocation protein TolB  26.32 
 
 		 442 aa  43.9  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000149314  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0925  WD40 domain protein beta Propeller  32.91 
 
 		 629 aa  44.3  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.775889  normal  0.417234 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1607  translocation protein TolB  26.32 
 
 		 442 aa  43.9  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000108344  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1277  translocation protein TolB  38.36 
 
 		 432 aa  44.3  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.154906  normal  0.476044 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1915  WD40 domain-containing protein  29.63 
 
 		 567 aa  44.7  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00146751  unclonable  0.0000119274 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1742  translocation protein TolB  26.32 
 
 		 442 aa  43.9  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000714613  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2019  TolB  29.2 
 
 		 440 aa  44.7  0.001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.636869  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1785  translocation protein TolB  26.32 
 
 		 442 aa  43.9  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000978843  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0175  TolB protein  29.2 
 
 		 437 aa  44.7  0.001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.313268  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3387  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  29.31 
 
 		 442 aa  44.3  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.413738  normal  0.777637 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2538  translocation protein TolB  26.32 
 
 		 442 aa  43.9  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000186682  hitchhiker  0.0000162747 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2692  translocation protein TolB  27.05 
 
 		 408 aa  43.5  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.319845  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0417  hypothetical protein  23.39 
 
 		 165 aa  43.5  0.002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0446  WD-40-like beta propeller repeat-containing protein  26.47 
 
 		 340 aa  43.5  0.002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2939  translocation protein TolB  29.75 
 
 		 451 aa  43.1  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00432408  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0677  translocation protein TolB  26.27 
 
 		 431 aa  43.5  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.814489  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0924  WD40 domain protein beta Propeller  28.91 
 
 		 618 aa  43.1  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0358135  normal  0.463223 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0203  WD40 domain-containing protein  26.15 
 
 		 427 aa  43.5  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000381605  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3116  WD40 domain-containing protein  26.42 
 
 		 544 aa  43.1  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000226644  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3117  WD40 domain-containing protein  25.53 
 
 		 548 aa  43.5  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000028868  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2587  translocation protein TolB  26.27 
 
 		 431 aa  43.5  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0694  translocation protein TolB  26.27 
 
 		 431 aa  43.1  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.125399  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0811  translocation protein TolB  25 
 
 		 431 aa  43.5  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.188067  normal  0.784941 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0875  translocation protein TolB  25 
 
 		 431 aa  43.5  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0139765  normal  0.325318 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0907  translocation protein TolB  25 
 
 		 431 aa  43.5  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.077859  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0784  translocation protein TolB  25 
 
 		 431 aa  43.5  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000303788  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0844  translocation protein TolB  25 
 
 		 431 aa  43.5  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0211285  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2206  translocation protein TolB  28.83 
 
 		 427 aa  42.7  0.003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00281817 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4402  translocation protein TolB  31.91 
 
 		 414 aa  42.7  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.145947  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0898  TolB-like  33.63 
 
 		 432 aa  43.1  0.003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000336659  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0317  translocation protein TolB  25.42 
 
 		 431 aa  43.1  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0520547  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2008  outer membrane protein  28.23 
 
 		 509 aa  42.7  0.003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.206588  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0800  translocation protein TolB  25.42 
 
 		 431 aa  43.1  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.665253  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>