33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpet_1809 on replicon NC_009486
Organism: Thermotoga petrophila RKU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010483  TRQ2_1847  hypothetical protein  98.2 
 
 		 389 aa  783    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1809  hypothetical protein  100 
 
 		 389 aa  798    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1426  hypothetical protein  42.51 
 
 		 382 aa  273  4.0000000000000004e-72  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.757686  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0250  hypothetical protein  27.41 
 
 		 399 aa  109  7.000000000000001e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08230  WD40 domain protein beta Propeller  25.96 
 
 		 918 aa  49.3  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4129  WD40 domain-containing protein  26.09 
 
 		 572 aa  49.3  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000900599 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1101  transcriptional regulator domain-containing protein  25.85 
 
 		 713 aa  47.8  0.0003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000631181  hitchhiker  0.00725129 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2102  WD40 domain protein beta Propeller  30.51 
 
 		 1078 aa  47.4  0.0005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1737  WD-40-like beta propeller repeat-containing protein  40 
 
 		 1021 aa  47.4  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.349792  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1915  WD40 domain-containing protein  25 
 
 		 567 aa  47.4  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00146751  unclonable  0.0000119274 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19660  periplasmic component of the Tol biopolymer transport system  24.74 
 
 		 1059 aa  46.2  0.0009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.26793  hitchhiker  0.00572239 
 
 
-
 
NC_002978  WD0038  translocation protein TolB  31.15 
 
 		 420 aa  45.8  0.001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0823662  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1171  WD40 domain protein beta Propeller  25.58 
 
 		 947 aa  46.2  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2193  WD40 domain protein beta Propeller  25.75 
 
 		 1077 aa  46.2  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2755  WD40 domain-containing protein  31.07 
 
 		 160 aa  46.2  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3347  Periplasmic component of the Tol biopolymer transport system-like protein  31.07 
 
 		 160 aa  46.2  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.52168  normal  0.409524 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4178  WD40 domain protein beta Propeller  38.16 
 
 		 197 aa  45.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4531  serine/threonine protein kinase  24.38 
 
 		 646 aa  45.4  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.114343  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01610  translocation protein TolB  22.44 
 
 		 442 aa  45.4  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4138  WD40 domain protein beta Propeller  38.16 
 
 		 197 aa  45.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0847  periplasmic component of the Tol biopolymer transport system-like protein  26.7 
 
 		 700 aa  43.9  0.005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.704427  normal  0.802494 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3979  hypothetical protein  35.87 
 
 		 171 aa  43.9  0.005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2902  translocation protein TolB  23.61 
 
 		 428 aa  43.9  0.005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000513444  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4021  WD40 domain protein beta Propeller  35.87 
 
 		 171 aa  43.9  0.005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1429  translocation protein TolB  20.96 
 
 		 450 aa  43.9  0.005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.000000000000134537  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3544  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  26.09 
 
 		 471 aa  43.9  0.006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2360  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  28.14 
 
 		 446 aa  43.5  0.006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.28939 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2260  WD40 domain-containing protein  22.38 
 
 		 348 aa  43.9  0.006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00259667 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2230  hypothetical protein  32.14 
 
 		 1042 aa  43.5  0.007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.752909  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1731  translocation protein TolB  23.46 
 
 		 449 aa  43.1  0.007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.693647  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2060  WD40 domain-containing protein  33.72 
 
 		 1206 aa  43.1  0.009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.456517  normal  0.995925 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1577  serine/threonine protein kinase  22.54 
 
 		 969 aa  43.1  0.009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.713812 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0858  WD40 domain protein beta Propeller  31.08 
 
 		 439 aa  42.7  0.01  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000315652  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>