38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_1426 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009616  Tmel_1426  hypothetical protein  100 
 
 		 382 aa  764    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.757686  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1809  hypothetical protein  40.56 
 
 		 389 aa  280  3e-74  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1847  hypothetical protein  40.05 
 
 		 389 aa  273  5.000000000000001e-72  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0250  hypothetical protein  31.28 
 
 		 399 aa  89  1e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0038  translocation protein TolB  28.33 
 
 		 420 aa  73.2  0.000000000006  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0823662  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1111  translocation protein TolB  28.25 
 
 		 446 aa  53.9  0.000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00131159  normal  0.386204 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1812  translocation protein TolB  26.06 
 
 		 449 aa  53.5  0.000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.431319  normal  0.360787 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4147  translocation protein TolB  25.53 
 
 		 449 aa  52.4  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4436  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  26.42 
 
 		 442 aa  52  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.314306  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3387  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  25.41 
 
 		 442 aa  52  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.413738  normal  0.777637 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2122  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  23.86 
 
 		 446 aa  51.2  0.00003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.256883  normal  0.227077 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0562  translocation protein TolB  28.57 
 
 		 444 aa  51.2  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.271593  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2322  translocation protein TolB  22.12 
 
 		 444 aa  50.8  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0205331  normal  0.53419 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0669  translocation protein TolB  22.12 
 
 		 444 aa  50.8  0.00004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.303969  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5302  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  23.77 
 
 		 446 aa  50.8  0.00004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.842711 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1311  translocation protein TolB  24.47 
 
 		 444 aa  50.1  0.00007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1094  translocation protein TolB  23.72 
 
 		 443 aa  49.7  0.00008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4751  translocation protein TolB  25 
 
 		 450 aa  49.7  0.00008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5227  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  22.13 
 
 		 446 aa  49.3  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.175544  normal  0.115662 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4760  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  22.13 
 
 		 446 aa  49.3  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.577654  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0975  translocation protein TolB  31.91 
 
 		 445 aa  49.3  0.0001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0670772  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6881  translocation protein TolB  31.82 
 
 		 462 aa  48.5  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0464057 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3056  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  27.42 
 
 		 450 aa  48.1  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0557578  normal  0.412166 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2360  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  22.22 
 
 		 446 aa  47  0.0005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.28939 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3512  translocation protein TolB  26.14 
 
 		 450 aa  47.4  0.0005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1478  cell surface protein  29.77 
 
 		 675 aa  46.6  0.0007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2365  translocation protein TolB  26.86 
 
 		 441 aa  46.6  0.0007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2717  translocation protein TolB  32.18 
 
 		 450 aa  46.2  0.0009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.599754  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4129  WD40 domain-containing protein  25 
 
 		 572 aa  46.2  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000900599 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4427  translocation protein TolB  27.85 
 
 		 441 aa  45.4  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.500534 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2627  translocation protein TolB  22.86 
 
 		 436 aa  45.1  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2133  translocation protein TolB  24.48 
 
 		 439 aa  45.1  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1211  translocation protein TolB  24.03 
 
 		 462 aa  45.1  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.896355  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0566  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  24.83 
 
 		 428 aa  45.1  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.22163  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1915  WD40 domain-containing protein  24.57 
 
 		 567 aa  44.7  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00146751  unclonable  0.0000119274 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0744  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  23.77 
 
 		 445 aa  43.9  0.005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.950557  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0686  translocation protein TolB  24.54 
 
 		 461 aa  43.5  0.006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.223253  normal  0.228867 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1479  cell surface protein  24.5 
 
 		 669 aa  43.1  0.007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>