202 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan8802_1132 on replicon NC_013161
Organism: Cyanothece sp. PCC 8802



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013161  Cyan8802_1132  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  100 
 
 		 157 aa  322  9e-88  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.000469648  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1105  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  98.73 
 
 		 157 aa  318  1.9999999999999998e-86  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3666  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  80.65 
 
 		 160 aa  266  1e-70  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2413  condensin subunit ScpB  69.54 
 
 		 177 aa  213  5.9999999999999996e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000581218  unclonable  0.0000000885843 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0308  chromosome segregation and condensation protein ScpB  67.74 
 
 		 191 aa  212  1.9999999999999998e-54  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.160964  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1721  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  63.4 
 
 		 164 aa  211  1.9999999999999998e-54  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000287131  hitchhiker  0.000910071 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1880  condensin subunit ScpB  63.82 
 
 		 173 aa  208  2e-53  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.379678  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0426  condensin subunit ScpB  65.54 
 
 		 183 aa  202  1e-51  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.897375 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1432  condensin subunit ScpB  50.98 
 
 		 165 aa  155  2e-37  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.118163 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1067  putative transcriptional regulator  49.67 
 
 		 165 aa  155  3e-37  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.714115  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08501  transcription regulator  45.86 
 
 		 179 aa  154  6e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.152979  hitchhiker  0.00163569 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09701  transcription regulator  47.4 
 
 		 168 aa  150  5e-36  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0684332  normal  0.14111 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0298  condensin subunit ScpB  47.4 
 
 		 168 aa  150  5.9999999999999996e-36  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15391  transcription regulator  47.06 
 
 		 177 aa  143  7.0000000000000006e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.41005 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09921  transcription regulator  41.61 
 
 		 160 aa  140  9e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0891  condensin subunit ScpB  40.88 
 
 		 154 aa  129  2.0000000000000002e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0594  condensin subunit ScpB  36.17 
 
 		 371 aa  90.9  6e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1497  condensin subunit ScpB  28.97 
 
 		 367 aa  86.7  1e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000476925  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0592  putative transcriptional regulator  31.21 
 
 		 343 aa  85.1  3e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.641435  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1099  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  32.64 
 
 		 165 aa  84  8e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0366895  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09521  hypothetical protein  53.62 
 
 		 85 aa  83.6  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.522022  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09501  hypothetical protein  53.62 
 
 		 85 aa  82.8  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.781091  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1360  condensin subunit ScpB  28.12 
 
 		 195 aa  68.6  0.00000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0521  chromosome segregation and condensation protein ScpB  32.88 
 
 		 192 aa  66.6  0.0000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1651  segregation and condensation protein B  27.67 
 
 		 183 aa  61.6  0.000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.742726 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1166  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  25.32 
 
 		 209 aa  61.2  0.000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2759  segregation and condensation protein B  25 
 
 		 299 aa  60.8  0.000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.331589  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1773  segregation and condensation protein B  25.62 
 
 		 195 aa  58.5  0.00000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07180  putative transcriptional regulator  29.11 
 
 		 179 aa  58.5  0.00000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000744296  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2059  segregation and condensation protein B  25.62 
 
 		 195 aa  58.5  0.00000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.830333  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1955  putative transcriptional regulator  26.54 
 
 		 219 aa  57  0.00000009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22860  putative transcriptional regulator  31.52 
 
 		 330 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.184233 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1594  segregation and condensation protein B  27.78 
 
 		 194 aa  55.8  0.0000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2173  segregation and condensation protein B  25.64 
 
 		 372 aa  56.2  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2262  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  25.64 
 
 		 387 aa  55.8  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.421554  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2874  segregation and condensation protein B  32.28 
 
 		 206 aa  56.2  0.0000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1929  segregation and condensation protein B  31.52 
 
 		 332 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0678384  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0794  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  25.75 
 
 		 179 aa  55.1  0.0000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0308  segregation and condensation protein B  27.39 
 
 		 193 aa  55.5  0.0000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3424  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  25.79 
 
 		 196 aa  55.1  0.0000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2190  segregation and condensation protein B  28.19 
 
 		 212 aa  54.7  0.0000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1401  hypothetical protein  24.85 
 
 		 193 aa  54.7  0.0000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1595  hypothetical protein  24.85 
 
 		 193 aa  54.7  0.0000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2399  putative transcriptional regulator  26.51 
 
 		 198 aa  53.9  0.0000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.093672  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2718  putative transcriptional regulator  26.51 
 
 		 198 aa  53.5  0.000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.752294  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1683  condensin subunit ScpB  24.36 
 
 		 387 aa  53.1  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0662969  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2697  putative transcriptional regulator  25.9 
 
 		 198 aa  53.1  0.000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1668  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  26.51 
 
 		 198 aa  53.5  0.000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000398849  hitchhiker  0.000392902 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2797  putative transcriptional regulator  26.51 
 
 		 198 aa  53.5  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0239  putative transcriptional regulator  24.26 
 
 		 238 aa  52.4  0.000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.475258  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1752  putative transcriptional regulator  26.09 
 
 		 186 aa  52.8  0.000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.178756  normal  0.0679167 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1084  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  29.11 
 
 		 234 aa  53.1  0.000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.104912  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1164  condensin subunit ScpB  29.11 
 
 		 234 aa  53.1  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1024  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  25.15 
 
 		 176 aa  52  0.000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09630  segregation and condensation protein B  22.01 
 
 		 243 aa  52.4  0.000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0854022  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1466  condensin subunit ScpB  26.06 
 
 		 198 aa  52  0.000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1532  condensin subunit ScpB  26.06 
 
 		 198 aa  52  0.000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.104314  normal  0.016321 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1524  condensin subunit ScpB  26.06 
 
 		 198 aa  52  0.000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00434208 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3014  hypothetical protein  26.06 
 
 		 198 aa  52  0.000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2181  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  30.38 
 
 		 281 aa  51.6  0.000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1866  putative transcriptional regulator  26.49 
 
 		 221 aa  51.2  0.000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.00902439  normal  0.534464 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2121  putative transcriptional regulator  25.95 
 
 		 352 aa  51.2  0.000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.221388  normal  0.149139 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1443  putative transcriptional regulator  25 
 
 		 185 aa  50.8  0.000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00199789  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1417  putative transcriptional regulator  22.5 
 
 		 171 aa  50.8  0.000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.134964  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1297  condensin subunit ScpB  26.67 
 
 		 199 aa  50.4  0.000009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.784926  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0874  transcriptional regulator, putative  21.94 
 
 		 171 aa  49.7  0.00001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000406554  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1570  condensin subunit ScpB  25.47 
 
 		 183 aa  50.1  0.00001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.343062  normal  0.779197 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2446  chromosome segregation and condensation protein ScpB  23.78 
 
 		 206 aa  50.1  0.00001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1072  segregation and condensation protein B  25 
 
 		 190 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1397  segregation and condensation protein B  26.38 
 
 		 188 aa  50.1  0.00001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.186018  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0822  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  25.62 
 
 		 193 aa  50.1  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06810  segregation and condensation protein B  25 
 
 		 284 aa  50.4  0.00001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.477325  normal  0.365601 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2206  segregation and condensation protein B  27.78 
 
 		 201 aa  49.7  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1690  putative transcriptional regulator  25.44 
 
 		 214 aa  49.3  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.706761  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1418  segregation and condensation protein B  28.97 
 
 		 340 aa  49.3  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.201173 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4637  condensin subunit ScpB  28.97 
 
 		 343 aa  48.9  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0490684  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1368  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  26.92 
 
 		 177 aa  49.7  0.00002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0982  segregation and condensation protein  26.54 
 
 		 209 aa  49.3  0.00002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2313  putative transcriptional regulator  28.48 
 
 		 230 aa  49.7  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.31706  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2614  condensin subunit ScpB  29.11 
 
 		 244 aa  49.3  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00467525  normal  0.609016 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1015  putative transcriptional regulator  28.97 
 
 		 345 aa  49.3  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1378  putative transcriptional regulator  28.97 
 
 		 340 aa  49.7  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.477089  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1496  putative transcriptional regulator  28.97 
 
 		 345 aa  49.3  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0493  condensin subunit ScpB  23.6 
 
 		 202 aa  49.7  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0906  putative transcriptional regulator  24.83 
 
 		 211 aa  49.7  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.195503  normal  0.0577759 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1472  segregation and condensation protein B  28.97 
 
 		 345 aa  49.3  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4124  segregation and condensation protein B  25.62 
 
 		 190 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.308467  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5640  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  24.53 
 
 		 534 aa  48.5  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.90406  normal  0.854183 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0392  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  27.5 
 
 		 273 aa  48.5  0.00003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1098  segregation and condensation protein B  28.23 
 
 		 246 aa  48.5  0.00004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0722  condensin subunit ScpB  28.91 
 
 		 194 aa  48.5  0.00004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1433  putative transcriptional regulator  24.85 
 
 		 245 aa  48.5  0.00004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1231  putative transcriptional regulator  26.21 
 
 		 254 aa  48.1  0.00004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.457118  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2125  putative transcriptional regulator  24.07 
 
 		 198 aa  48.5  0.00004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.676693 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0582  putative transcriptional regulator  28.36 
 
 		 210 aa  48.1  0.00004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.571381  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2002  condensin subunit ScpB  28.14 
 
 		 261 aa  48.5  0.00004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0508753  normal  0.414408 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2247  putative transcriptional regulator  26.63 
 
 		 210 aa  48.5  0.00004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0043002 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1135  putative transcriptional regulator  24.53 
 
 		 181 aa  48.1  0.00004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1040  chromosome segregation and condensation protein ScpB  26.67 
 
 		 222 aa  48.1  0.00005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.190306  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4188  segregation and condensation protein B  25.62 
 
 		 190 aa  47.8  0.00005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0691194  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>