More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan8802_0534 on replicon NC_013161
Organism: Cyanothece sp. PCC 8802



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_4868  amine oxidase  68.16 
 
 
645 aa  949    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0036  UDP-galactopyranose mutase  64.81 
 
 
647 aa  902    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.404508  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0534  amine oxidase  100 
 
 
647 aa  1342    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.666818  normal  0.352078 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0517  amine oxidase  99.38 
 
 
647 aa  1336    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3577  UDP-galactopyranose mutase  65.95 
 
 
648 aa  889    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0482479  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1875  Rieske (2Fe-2S) domain protein  34.24 
 
 
639 aa  351  3e-95  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0135993 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2256  Rieske (2Fe-2S) domain protein  34.37 
 
 
643 aa  340  2.9999999999999998e-92  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.429922  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1698  Rieske (2Fe-2S) domain protein  32.13 
 
 
640 aa  339  8e-92  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1747  Rieske (2Fe-2S) domain protein  33.83 
 
 
642 aa  336  7.999999999999999e-91  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0435  gamma-carotene desaturase  34.17 
 
 
639 aa  330  4e-89  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0659  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.8 
 
 
644 aa  318  1e-85  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2162  amine oxidase  35.91 
 
 
811 aa  140  4.999999999999999e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.352891  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4947  amine oxidase  32.61 
 
 
551 aa  132  3e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00497379  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0282  amine oxidase  34.36 
 
 
508 aa  127  8.000000000000001e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.112092  normal  0.233816 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5168  amine oxidase  30.91 
 
 
506 aa  127  9e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5080  amine oxidase  30.91 
 
 
506 aa  127  9e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.984429  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26460  hypothetical protein  35.21 
 
 
482 aa  126  1e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.214193  normal  0.663003 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5459  amine oxidase  30.68 
 
 
506 aa  124  6e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.723961  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3090  putative beta-carotene desaturase/methylase  34.67 
 
 
520 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0241  amine oxidase  31.23 
 
 
508 aa  123  9.999999999999999e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.363504 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3813  amine oxidase  30.83 
 
 
523 aa  120  9e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.966571  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1580  amine oxidase  30.33 
 
 
481 aa  118  3e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.128087  normal  0.0872032 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2500  amine oxidase  26.83 
 
 
519 aa  112  2.0000000000000002e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00015741  hitchhiker  0.0084988 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1844  amine oxidase  28.3 
 
 
511 aa  111  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3570  amine oxidase  32.38 
 
 
546 aa  110  7.000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.145794  normal 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_47627  Amine oxidase  32 
 
 
552 aa  90.5  9e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0599395 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1769  Carotene 7,8-desaturase  27.13 
 
 
453 aa  89  2e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0949  Carotene 7,8-desaturase  26.38 
 
 
453 aa  87.8  5e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0830  zeta-carotene desaturase  27.67 
 
 
453 aa  87.8  6e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.762196  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1524  Carotene 7,8-desaturase  26.69 
 
 
453 aa  87.4  7e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000615844  normal  0.187981 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1590  zeta-carotene desaturase  27.45 
 
 
455 aa  84.3  0.000000000000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_38345  predicted protein  30.63 
 
 
599 aa  82  0.00000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.526893  normal  0.29017 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0916  Carotene 7,8-desaturase  25.98 
 
 
453 aa  81.6  0.00000000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1415  carotene 7,8-desaturase  25.38 
 
 
453 aa  80.9  0.00000000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.979127 
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_55102  phytoene desaturase  29.21 
 
 
589 aa  81.3  0.00000000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.989776  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0368  amine oxidase  26.17 
 
 
503 aa  78.2  0.0000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4330  amine oxidase  26.15 
 
 
500 aa  77.4  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01591  phytoene desaturase  30.59 
 
 
472 aa  77  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01721  phytoene desaturase  30.74 
 
 
473 aa  75.9  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.69255  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0679  carotene 7,8-desaturase  25.55 
 
 
489 aa  76.3  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01311  zeta-carotene desaturase  29.63 
 
 
478 aa  75.5  0.000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0941429  normal  0.461178 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1157  phytoene desaturase  30.34 
 
 
471 aa  74.7  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01891  zeta-carotene desaturase  26.59 
 
 
486 aa  74.3  0.000000000007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.905208  normal  0.646889 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1188  phytoene desaturase  28.73 
 
 
461 aa  73.9  0.000000000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.045363  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3176  carotene 7,8-desaturase  28.41 
 
 
482 aa  73.6  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1484  zeta-carotene desaturase  26.79 
 
 
486 aa  72.8  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.22429  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0118  zeta-carotene desaturase  27.8 
 
 
499 aa  72.8  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45735  phytoene dehydrogenase  27.81 
 
 
624 aa  72.4  0.00000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3736  amine oxidase  28 
 
 
520 aa  72.4  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.595542  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01611  phytoene desaturase  29.96 
 
 
466 aa  72.4  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0307  amine oxidase  27.37 
 
 
448 aa  72.8  0.00000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0146  three-step phytoene desaturase / zeta-carotene desaturase  29.74 
 
 
465 aa  72.4  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4011  zeta-carotene desaturase / three-step phytoene desaturase  27.44 
 
 
459 aa  72  0.00000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3954  zeta-carotene desaturase  25.55 
 
 
483 aa  71.6  0.00000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.134571  normal  0.596487 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01631  phytoene desaturase  29.57 
 
 
466 aa  71.2  0.00000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1983  zeta-carotene desaturase / three-step phytoene desaturase  28.57 
 
 
474 aa  71.2  0.00000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.490957  normal  0.280593 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4788  carotene 7,8-desaturase  25.46 
 
 
479 aa  70.9  0.00000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2686  carotene 7,8-desaturase  24.36 
 
 
490 aa  70.9  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3430  carotene 7,8-desaturase  24.36 
 
 
490 aa  70.9  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01331  zeta-carotene desaturase  28.29 
 
 
484 aa  70.1  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1510  three-step phytoene desaturase / zeta-carotene desaturase  29.34 
 
 
464 aa  69.7  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2875  phytoene desaturase  29.21 
 
 
479 aa  70.5  0.0000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.202948  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0200  zeta-carotene desaturase  24.72 
 
 
479 aa  70.5  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0335  carotene 7,8-desaturase  26.24 
 
 
488 aa  70.1  0.0000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1197  Rieske (2Fe-2S) domain protein  45.45 
 
 
130 aa  70.1  0.0000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02161  phytoene desaturase  29.28 
 
 
462 aa  70.5  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4795  zeta-carotene desaturase / three-step phytoene desaturase  28.09 
 
 
479 aa  69.3  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000234203  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0308  phytoene desaturase  29.32 
 
 
475 aa  69.7  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.105357  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2395  zeta-carotene desaturase / three-step phytoene desaturase  29.21 
 
 
472 aa  69.3  0.0000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0308  phytoene desaturase  29.96 
 
 
475 aa  69.3  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01321  zeta-carotene desaturase  27.89 
 
 
484 aa  68.2  0.0000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0298  carotene 7,8-desaturase  28.57 
 
 
472 aa  68.2  0.0000000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_15806  pds-like3, phytoene desaturase-like protein  25.82 
 
 
506 aa  67.4  0.0000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.488175  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1523  amine oxidase  24.22 
 
 
438 aa  67  0.0000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.834861  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4188  phytoene desaturase  27.41 
 
 
477 aa  66.6  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.422832  normal  0.265876 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4135  carotene 7,8-desaturase  26.72 
 
 
451 aa  66.2  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.190171  normal  0.792405 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0457  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  49.12 
 
 
130 aa  66.2  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2356  zeta-carotene desaturase  24.72 
 
 
488 aa  65.5  0.000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0538  Rieske (2Fe-2S) region  47.46 
 
 
131 aa  64.7  0.000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.520467  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0884  Carotene 7,8-desaturase  47.3 
 
 
460 aa  64.7  0.000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000776733  normal  0.0521549 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_53974  zeta-carotene desaturase  38.2 
 
 
591 aa  63.5  0.00000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.246168  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4116  Rieske (2Fe-2S) domain protein  50 
 
 
130 aa  62.8  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.603301 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01291  zeta-carotene desaturase  27.49 
 
 
484 aa  62.8  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0273  amine oxidase  28.1 
 
 
449 aa  63.2  0.00000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2933  cytochrome b/b6 complex, iron-sulfur subunit  42.62 
 
 
131 aa  62.4  0.00000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4025  Rieske (2Fe-2S) domain protein  50.98 
 
 
130 aa  62.4  0.00000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3041  Carotene 7,8-desaturase  26.85 
 
 
463 aa  62  0.00000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000261003 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2880  hypothetical protein  30.53 
 
 
511 aa  62  0.00000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0436694 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0885  twin-arginine translocation pathway signal  46.43 
 
 
149 aa  61.6  0.00000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26651  phytoene desaturase  27.38 
 
 
472 aa  61.2  0.00000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0624  ubiquinol-cytochrome c reductase, iron-sulfur subunit  55.56 
 
 
173 aa  60.5  0.00000009  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.28707  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0051  Rieske (2Fe-2S) domain protein  35.38 
 
 
159 aa  60.5  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.782926  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0250  FAD dependent oxidoreductase  41.54 
 
 
516 aa  60.1  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0205  Rieske (2Fe-2S) domain protein  35.8 
 
 
148 aa  59.7  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01779  dehydrogenase  24.32 
 
 
409 aa  59.7  0.0000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0510493  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5205  amine oxidase  44.62 
 
 
565 aa  58.5  0.0000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3358  FAD dependent oxidoreductase  43.1 
 
 
592 aa  58.9  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0186054  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1655  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  53.06 
 
 
207 aa  58.5  0.0000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2861  hypothetical protein  26.73 
 
 
511 aa  58.2  0.0000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.245537 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0970  twin-arginine translocation pathway signal  51.06 
 
 
160 aa  57.4  0.0000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>