More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan8802_0087 on replicon NC_013161
Organism: Cyanothece sp. PCC 8802



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013161  Cyan8802_0087  UspA domain protein  100 
 
 
137 aa  275  2e-73  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.270919 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0090  UspA domain protein  98.54 
 
 
137 aa  270  4.0000000000000004e-72  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1585  UspA domain protein  79.56 
 
 
137 aa  226  8e-59  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0149125 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0771  hypothetical protein  67.88 
 
 
135 aa  195  2.0000000000000003e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.584879  normal  0.0448473 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4276  UspA domain-containing protein  68.84 
 
 
135 aa  194  4.0000000000000005e-49  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.413814  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0959  UspA domain protein  59.29 
 
 
131 aa  160  8.000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0112634  normal  0.295172 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1115  hypothetical protein  59.12 
 
 
126 aa  157  3e-38  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.198517  normal  0.698975 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3375  hypothetical protein  58.39 
 
 
136 aa  151  2.9999999999999998e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27981  universal stress protein  51.09 
 
 
127 aa  135  2e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2716  UspA domain protein  35.82 
 
 
154 aa  76.3  0.0000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2714  UspA domain protein  33.83 
 
 
154 aa  71.2  0.000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4568  hypothetical protein  32.28 
 
 
173 aa  66.2  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1466  UspA domain-containing protein  31.03 
 
 
144 aa  65.5  0.0000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.838968  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3775  UspA domain-containing protein  32.17 
 
 
138 aa  64.7  0.0000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.309835  normal  0.427023 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4298  hypothetical protein  32.65 
 
 
155 aa  63.9  0.0000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.248208  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16290  universal stress protein UspA-like protein  26.32 
 
 
148 aa  62.4  0.000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.0000127865  hitchhiker  0.0000372029 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0913  UspA domain-containing protein  32.65 
 
 
138 aa  61.2  0.000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0346302 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1933  UspA domain-containing protein  29.86 
 
 
141 aa  60.8  0.000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3987  UspA domain protein  29.82 
 
 
164 aa  58.9  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4652  hypothetical protein  28.48 
 
 
180 aa  58.9  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.741195 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2767  UspA domain protein  28.06 
 
 
139 aa  58.9  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1851  UspA domain-containing protein  30.99 
 
 
142 aa  59.3  0.00000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4486  hypothetical protein  32.62 
 
 
306 aa  58.5  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3427  UspA domain protein  29.79 
 
 
156 aa  58.5  0.00000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4029  UspA domain protein  29.41 
 
 
164 aa  58.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0913  UspA domain-containing protein  30.22 
 
 
138 aa  58.2  0.00000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.455185 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3773  UspA domain protein  29.8 
 
 
152 aa  57.8  0.00000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0352  UspA domain-containing protein  30.99 
 
 
159 aa  57.8  0.00000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.818544 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2109  UspA domain-containing protein  31.88 
 
 
128 aa  57  0.00000009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2171  UspA domain-containing protein  27.78 
 
 
145 aa  56.6  0.0000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.198814  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5241  UspA domain protein  27.85 
 
 
154 aa  56.6  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.639442 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2559  UspA domain protein  33.09 
 
 
295 aa  56.2  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3401  UspA domain protein  30.15 
 
 
288 aa  56.6  0.0000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4083  UspA domain-containing protein  31.69 
 
 
172 aa  55.5  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.391845  normal  0.267182 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0384  UspA domain protein  29.58 
 
 
142 aa  55.5  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000150335  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3096  UspA domain protein  29.5 
 
 
207 aa  55.5  0.0000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.286  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1589  UspA domain-containing protein  30.07 
 
 
140 aa  55.5  0.0000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.000251397  normal  0.0131871 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0620  UspA domain-containing protein  29.53 
 
 
144 aa  55.1  0.0000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4076  UspA domain protein  35.48 
 
 
287 aa  54.7  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.686885  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3798  UspA domain protein  33.57 
 
 
281 aa  54.7  0.0000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0713  UspA domain-containing protein  31.69 
 
 
145 aa  54.7  0.0000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00140239  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0098  universal stress protein  30.99 
 
 
140 aa  53.9  0.0000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.45012  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2008  UspA domain-containing protein  27.89 
 
 
141 aa  54.3  0.0000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3681  UspA domain protein  28.97 
 
 
301 aa  53.9  0.0000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.429907  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1603  UspA domain protein  27.94 
 
 
208 aa  53.9  0.0000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3816  UspA domain protein  31.39 
 
 
142 aa  53.5  0.0000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0222227  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3164  UspA domain protein  28.57 
 
 
156 aa  53.9  0.0000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5263  UspA domain protein  28.47 
 
 
138 aa  53.9  0.0000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.179366  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3112  UspA domain-containing protein  33.09 
 
 
290 aa  53.9  0.0000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.615607  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3141  hypothetical protein  48.15 
 
 
297 aa  53.5  0.0000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2826  UspA domain protein  29.2 
 
 
286 aa  53.5  0.0000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.232825  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0473  hypothetical protein  30.15 
 
 
282 aa  52.8  0.000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.203309  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2678  hypothetical protein  27.59 
 
 
149 aa  53.1  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.348095 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0308  UspA domain-containing protein  31.47 
 
 
145 aa  53.1  0.000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1409  UspA domain protein  29.86 
 
 
140 aa  53.1  0.000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.554815 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2701  UspA domain protein  28.57 
 
 
149 aa  53.1  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4368  UspA domain protein  28.48 
 
 
175 aa  52  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.2229 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1803  UspA domain protein  31.47 
 
 
143 aa  52.4  0.000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0501  UspA domain-containing protein  30.5 
 
 
283 aa  52.8  0.000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2454  UspA domain protein  26.47 
 
 
283 aa  52.4  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8721  UspA domain protein  37.25 
 
 
166 aa  52.4  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0485057  normal  0.0484371 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3732  UspA domain protein  32.17 
 
 
152 aa  52.4  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.212348  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1858  UspA domain protein  32.65 
 
 
147 aa  52.4  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3655  UspA domain protein  26.47 
 
 
283 aa  52.4  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00313868  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2088  UspA domain-containing protein  29.33 
 
 
153 aa  52.4  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0358891 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1861  hypothetical protein  31.43 
 
 
282 aa  52  0.000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3655  UspA domain protein  30.34 
 
 
147 aa  52  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.850888  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0624  UspA domain-containing protein  30.43 
 
 
139 aa  52  0.000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1009  UspA domain protein  30.14 
 
 
304 aa  51.6  0.000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3274  UspA domain-containing protein  26.62 
 
 
160 aa  51.2  0.000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0533854 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1529  UspA domain protein  28.26 
 
 
141 aa  51.6  0.000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4225  UspA domain protein  26.28 
 
 
182 aa  51.6  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.109852  normal  0.228049 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3847  UspA domain protein  28.97 
 
 
145 aa  51.6  0.000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000916772  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1606  UspA domain-containing protein  30.56 
 
 
145 aa  51.6  0.000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.198066  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1706  UspA domain protein  30.34 
 
 
290 aa  51.6  0.000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.873691  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4186  UspA domain protein  26.28 
 
 
182 aa  51.6  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1925  UspA domain-containing protein  29.29 
 
 
144 aa  51.2  0.000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1307  UspA domain protein  28.28 
 
 
153 aa  51.2  0.000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.476613  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2727  universal stress protein  29.29 
 
 
140 aa  51.2  0.000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.671125  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0700  hypothetical protein  31.91 
 
 
306 aa  51.2  0.000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00113643  normal  0.292289 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3500  UspA domain protein  46.3 
 
 
283 aa  50.8  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0589  universal stress protein  27.66 
 
 
140 aa  50.8  0.000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.558284  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27450  hypothetical protein  30.41 
 
 
148 aa  50.4  0.000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0135503  normal  0.368725 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1585  UspA domain protein  29.86 
 
 
142 aa  50.4  0.000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0174  UspA domain protein  32.87 
 
 
144 aa  50.4  0.000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.102969  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1022  UspA domain-containing protein  30.56 
 
 
145 aa  50.1  0.000009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.335236  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1457  UspA domain-containing protein  30.56 
 
 
145 aa  50.1  0.000009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2322  hypothetical protein  33.33 
 
 
148 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.566925  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1082  UspA domain protein  29.79 
 
 
158 aa  50.1  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.731229  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2675  universal stress protein UspA  28.89 
 
 
134 aa  49.7  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1334  UspA domain-containing protein  28 
 
 
148 aa  49.7  0.00001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000527962 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0570  UspA domain protein  30.37 
 
 
141 aa  49.7  0.00001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.932953  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1229  hypothetical protein  27.89 
 
 
146 aa  49.7  0.00001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0870  UspA domain protein  28.47 
 
 
140 aa  49.7  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0954  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  27.46 
 
 
141 aa  49.7  0.00001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0631  UspA domain protein  28.67 
 
 
160 aa  49.7  0.00001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000113911  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1489  UspA domain-containing protein  30.83 
 
 
137 aa  50.1  0.00001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.854212 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2330  UspA domain protein  31.62 
 
 
157 aa  48.9  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2060  UspA domain protein  30.43 
 
 
145 aa  49.7  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000482374  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2474  hypothetical protein  31.03 
 
 
141 aa  48.9  0.00002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>