121 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_1753 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_1753  cyclic nucleotide-binding protein  100 
 
 
357 aa  721  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1134  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  36.62 
 
 
364 aa  229  6e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.081073 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1592  cyclic nucleotide-binding protein  31.97 
 
 
368 aa  171  1e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.116595 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0090  cyclic nucleotide-binding protein  34.76 
 
 
177 aa  98.6  2e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.247588  normal  0.0443693 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4022  cyclic nucleotide-binding protein  31.01 
 
 
166 aa  81.6  2e-14  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1814  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.22 
 
 
225 aa  56.2  9e-07  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7320  cyclic nucleotide-binding protein  28.26 
 
 
169 aa  55.8  1e-06  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.376819  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2357  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  35.96 
 
 
212 aa  54.7  2e-06  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1814  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  34.38 
 
 
242 aa  55.1  2e-06  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.38579  normal  0.245711 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0517  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.07 
 
 
224 aa  55.1  2e-06  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0664  cyclic nucleotide-binding  29.84 
 
 
449 aa  54.3  3e-06  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0101822  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0079  hypothetical protein  30.58 
 
 
169 aa  53.9  4e-06  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.26747 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4460  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.44 
 
 
171 aa  53.1  7e-06  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18160  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.57 
 
 
219 aa  52.4  1e-05  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  6.07267e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25400  cAMP-binding protein  28.67 
 
 
225 aa  52  2e-05  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2323  CRP/FNR family transcriptional regulator  24.49 
 
 
233 aa  51.2  3e-05  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00053006  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2911  cyclic nucleotide-binding protein  35.19 
 
 
1124 aa  51.2  3e-05  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.965385  normal  0.0176228 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2894  cyclic nucleotide-binding protein  27.12 
 
 
482 aa  50.8  4e-05  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00660929  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1461  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  34.29 
 
 
159 aa  50.1  6e-05  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1598  hypothetical protein  28.68 
 
 
407 aa  50.1  6e-05  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.303519  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1763  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.82 
 
 
223 aa  50.1  6e-05  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.796832  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1294  cyclic nucleotide-binding: regulatory protein, Crp  26.36 
 
 
220 aa  50.1  6e-05  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.957461  normal  0.413121 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_63653  Leucine rich repeat protein, contains F-box  21.73 
 
 
868 aa  49.7  7e-05  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.422768  normal  0.952681 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3152  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.89 
 
 
487 aa  49.7  8e-05  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.833452  normal  0.47191 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0723  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.29 
 
 
228 aa  49.7  8e-05  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.362046  normal  0.190371 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5417  cyclic nucleotide-binding protein  29.17 
 
 
419 aa  49.7  8e-05  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0881735  normal  0.0681678 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0755  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.72 
 
 
222 aa  49.3  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.2571 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1061  Crp family transcriptional regulator  27.21 
 
 
214 aa  48.9  0.0001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0336611  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_3120  predicted protein  23.17 
 
 
241 aa  48.1  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1780  cyclic nucleotide-binding protein  29.09 
 
 
156 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.489231  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3166  cyclic nucleotide-binding protein  27.39 
 
 
482 aa  48.1  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00363184  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0468  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.36 
 
 
226 aa  48.9  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.974187 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4730  cyclic nucleotide-binding protein  27.04 
 
 
286 aa  48.1  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.813554  normal  0.722063 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1358  Ion transport protein  24.34 
 
 
419 aa  48.5  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1546  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  32.35 
 
 
479 aa  48.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.514924  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1472  CAAX amino terminal protease family  27.13 
 
 
381 aa  48.1  0.0003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.407531  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6433  cyclic nucleotide-regulated FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  29.06 
 
 
561 aa  47.8  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.751963 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0750  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.3 
 
 
238 aa  47.8  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2700  cyclic nucleotide-binding protein  27.94 
 
 
215 aa  47.8  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00108848  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1049  cyclic nucleotide-binding protein  26.19 
 
 
210 aa  47.8  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.085615  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2122  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  25.6 
 
 
489 aa  47.8  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.510942  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0324  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.67 
 
 
226 aa  47.4  0.0004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.105795  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1772  cyclic nucleotide-binding protein  22.39 
 
 
161 aa  47.4  0.0004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0691544 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2102  CRP/FNR family transcriptional regulator  25.19 
 
 
227 aa  47.4  0.0004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2624  cyclic nucleotide-binding protein  28.1 
 
 
1177 aa  47  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4039  cyclic nucleotide-binding protein  26.52 
 
 
161 aa  47  0.0005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.17311  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1668  cyclic nucleotide-binding protein  25.19 
 
 
209 aa  47  0.0005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.796246  normal  0.637535 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2607  cyclic nucleotide-binding protein  27.94 
 
 
215 aa  47  0.0005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1119  catabolite gene activator (cAMP receptor protein) (cAMP-regulatory protein)  29.71 
 
 
222 aa  47  0.0005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.106899 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26230  cAMP-binding protein  29.25 
 
 
225 aa  46.6  0.0006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.466611  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0258  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  30.77 
 
 
492 aa  47  0.0006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.986681 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2419  cyclic nucleotide-binding protein  32.32 
 
 
563 aa  46.6  0.0006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.871595  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1284  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.95 
 
 
224 aa  47  0.0006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.304913  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3831  cyclic nucleotide-binding protein  24.14 
 
 
435 aa  46.6  0.0006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0387698 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0929  bacteriocin-processing peptidase  21.94 
 
 
1040 aa  46.6  0.0007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.247839  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3494  cyclic nucleotide-binding protein  26.52 
 
 
173 aa  46.6  0.0007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0204  Crp/Fnr family transcriptional regulator  30.51 
 
 
226 aa  46.6  0.0007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0718939  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2725  cyclic nucleotide binding/GGDEF domain-containing protein  27.18 
 
 
322 aa  46.2  0.0008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.792666  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3345  cyclic nucleotide-binding protein  30.09 
 
 
417 aa  46.2  0.0008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.254717  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0349  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.49 
 
 
219 aa  45.8  0.001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000181532  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4137  cyclic nucleotide-binding protein  27.21 
 
 
177 aa  45.8  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.252066 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5745  transcriptional regulator  25 
 
 
243 aa  45.8  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.810963  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4045  GntR family transcriptional regulator  27.63 
 
 
260 aa  45.8  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.385107  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3368  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.18 
 
 
503 aa  46.2  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00879958  normal  0.135189 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2627  cyclic nucleotide-binding protein  27.27 
 
 
168 aa  46.2  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04006  cAMP-regulatory protein  27.66 
 
 
222 aa  44.7  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3095  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.66 
 
 
220 aa  44.7  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  1.48221e-05 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4894  cyclic nucleotide-regulated FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  26.32 
 
 
588 aa  44.7  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0608959 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2016  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.58 
 
 
229 aa  44.7  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0776172  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0841  cyclic nucleotide-binding protein  27.21 
 
 
160 aa  45.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.108052 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1256  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  31.63 
 
 
215 aa  44.7  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5645  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  34.02 
 
 
240 aa  44.7  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0700  CRP/FNR family transcriptional regulator  29.71 
 
 
228 aa  44.7  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.259996 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0049  Crp/FNR family transcriptional regulator  32.53 
 
 
252 aa  45.1  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.422683  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0139  cAMP-regulatory protein  31.82 
 
 
214 aa  45.1  0.002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5315  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.39 
 
 
228 aa  44.7  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.527594 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2034  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23.57 
 
 
243 aa  44.3  0.003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.663242  normal  0.0439569 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0435  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.17 
 
 
226 aa  44.3  0.003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.376669 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4596  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.97 
 
 
230 aa  44.7  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3296  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23.15 
 
 
229 aa  44.3  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.721133  normal  0.844961 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2804  cyclic nucleotide-binding protein  23.15 
 
 
229 aa  44.3  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3212  CRP/FNR family transcriptional regulator  32.53 
 
 
229 aa  43.9  0.004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0543887  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1995  transcriptional regulator  26.8 
 
 
224 aa  44.3  0.004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0388  cAMP-regulatory protein  26.67 
 
 
212 aa  44.3  0.004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0189183  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3689  cyclic nucleotide-binding protein  28.93 
 
 
454 aa  43.9  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.120597  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0452  cAMP-binding protein  25.6 
 
 
160 aa  43.5  0.005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  4.5265e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1802  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  20.17 
 
 
238 aa  43.5  0.005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3804  MscS Mechanosensitive ion channel  28.45 
 
 
495 aa  43.9  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1954  putative Crp/Fnr family transcriptional regulator  25.38 
 
 
141 aa  43.5  0.005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2760  cyclic nucleotide-binding protein  27.16 
 
 
174 aa  43.5  0.006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.378531  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2199  cyclic nucleotide-binding protein  28.32 
 
 
357 aa  43.5  0.006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2448  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  20.17 
 
 
238 aa  43.5  0.006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6888  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  29.71 
 
 
506 aa  43.5  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1573  cyclic nucleotide-binding  26.43 
 
 
158 aa  43.1  0.006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.490025  hitchhiker  0.00990577 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1570  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  27.84 
 
 
424 aa  43.1  0.006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3190  cAMP-regulatory protein  26.14 
 
 
211 aa  43.5  0.006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  2.13612e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4002  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  21.64 
 
 
1018 aa  43.5  0.006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04890  cAMP-binding protein  26.57 
 
 
226 aa  43.1  0.007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.84759 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1111  cyclic nucleotide-binding  28.16 
 
 
729 aa  43.1  0.007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.804267  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4356  cyclic nucleotide-regulated FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  25.69 
 
 
568 aa  43.1  0.007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>