More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_0112 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013739  Cwoe_0112  extracellular solute-binding protein family 5  100 
 
 		 524 aa  1064    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.214652  normal  0.175509 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5121  extracellular solute-binding protein family 5  42.22 
 
 		 522 aa  389  1e-107  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.969979 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5116  extracellular solute-binding protein family 5  32.91 
 
 		 532 aa  263  8e-69  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.682235 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1288  extracellular solute-binding protein  31.02 
 
 		 492 aa  188  2e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.213997  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16530  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  31.01 
 
 		 510 aa  182  1e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.564688 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1012  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  30.15 
 
 		 492 aa  179  9e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.622148  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0954  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  30.15 
 
 		 479 aa  179  1e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1669  extracellular solute-binding protein  30.31 
 
 		 510 aa  177  4e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3437  extracellular solute-binding protein  30.07 
 
 		 492 aa  174  3.9999999999999995e-42  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.58601  normal  0.852102 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4243  solute-binding family 5 protein  25.32 
 
 		 521 aa  171  4e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4390  solute-binding family 5 protein  25.32 
 
 		 521 aa  169  1e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4231  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  25.32 
 
 		 521 aa  169  1e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4729  solute-binding family 5 protein  25.32 
 
 		 521 aa  169  1e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4608  extracellular solute-binding protein  25.32 
 
 		 521 aa  169  1e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0953  extracellular solute-binding protein family 5  27.55 
 
 		 532 aa  165  1.0000000000000001e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.509853  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2587  extracellular solute-binding protein family 5  27.33 
 
 		 502 aa  161  2e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1313  extracellular solute-binding protein  27.79 
 
 		 493 aa  162  2e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1661  extracellular solute-binding protein  29.84 
 
 		 511 aa  159  1e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.226847 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0431  extracellular solute-binding protein  27.94 
 
 		 522 aa  158  2e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3773  extracellular solute-binding protein  29.05 
 
 		 510 aa  157  3e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.434805  normal  0.505457 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0810  extracellular solute-binding protein  26.33 
 
 		 489 aa  155  1e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2408  extracellular solute-binding protein  27.83 
 
 		 505 aa  155  2e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.000286915  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1352  extracellular solute-binding protein family 5  26.31 
 
 		 534 aa  152  1e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2761  extracellular solute-binding protein  27.6 
 
 		 515 aa  152  2e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.364418  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3391  extracellular solute-binding protein  28.07 
 
 		 512 aa  150  5e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3401  extracellular solute-binding protein  28.07 
 
 		 512 aa  150  5e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.475057 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3453  extracellular solute-binding protein  28.07 
 
 		 512 aa  150  5e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0954042  normal  0.238639 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0782  extracellular solute-binding protein  26.33 
 
 		 494 aa  149  1.0000000000000001e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.319175  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3152  extracellular solute-binding protein family 5  32.02 
 
 		 506 aa  149  1.0000000000000001e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3713  putative ABC transporter (substrate binding component)  26.56 
 
 		 516 aa  149  2.0000000000000003e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5072  extracellular solute-binding protein  26.96 
 
 		 519 aa  148  2.0000000000000003e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.236333  normal  0.758542 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2097  4-phytase  26.42 
 
 		 546 aa  148  3e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000775897  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3635  extracellular solute-binding protein  25.88 
 
 		 515 aa  147  4.0000000000000006e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.014259  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0161  extracellular solute-binding protein family 5  27.85 
 
 		 505 aa  146  8.000000000000001e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0748  extracellular solute-binding protein  25.66 
 
 		 535 aa  146  8.000000000000001e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6591  extracellular solute-binding protein  23.29 
 
 		 540 aa  146  1e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.476219 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0249  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  25.94 
 
 		 545 aa  145  1e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1933  extracellular solute-binding protein family 5  26.73 
 
 		 505 aa  146  1e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.22177  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1870  dipeptide transport protein  25.79 
 
 		 540 aa  145  2e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3074  extracellular solute-binding protein  25.65 
 
 		 536 aa  145  2e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0483936 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2187  extracellular solute-binding protein  27.21 
 
 		 519 aa  145  2e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.843737  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0271  extracellular solute-binding protein family 5  28.02 
 
 		 516 aa  143  7e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.848307  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2405  extracellular solute-binding protein family 5  25.92 
 
 		 532 aa  143  8e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000184044  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0745  extracellular solute-binding protein  24.54 
 
 		 534 aa  143  9e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6105  extracellular solute-binding protein family 5  26.18 
 
 		 518 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.0000312198  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0813  extracellular solute-binding protein  26.84 
 
 		 531 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.125368  normal  0.209584 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2571  extracellular solute-binding protein family 5  26.87 
 
 		 529 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.13754  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0750  extracellular solute-binding protein  24.46 
 
 		 535 aa  142  9.999999999999999e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2945  extracellular solute-binding protein  25.43 
 
 		 509 aa  142  1.9999999999999998e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2655  extracellular solute-binding protein  27.17 
 
 		 539 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000125789  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0409  extracellular solute-binding protein  23.85 
 
 		 520 aa  142  1.9999999999999998e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.533743 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0157  twin-arginine translocation pathway signal  25.35 
 
 		 545 aa  141  3e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.695568  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3133  twin-arginine translocation pathway signal  26.7 
 
 		 529 aa  141  3e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.362143 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0479  4-phytase  25.88 
 
 		 535 aa  141  3e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0187568  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1982  putative ABC transporter, periplasmic binding protein  26.98 
 
 		 524 aa  140  4.999999999999999e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0990283  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1543  extracellular solute-binding protein family 5  26.34 
 
 		 513 aa  140  6e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.397228  normal  0.410252 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0387  extracellular solute-binding protein family 5  25.3 
 
 		 503 aa  140  7.999999999999999e-32  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000000219856  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3490  extracellular solute-binding protein  26.16 
 
 		 529 aa  139  8.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2843  extracellular solute-binding protein  28.02 
 
 		 535 aa  139  1e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.430895 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5070  extracellular solute-binding protein  26.26 
 
 		 495 aa  139  1e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.27843  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3746  extracellular solute-binding protein family 5  23.78 
 
 		 513 aa  138  2e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4491  extracellular solute-binding protein family 5  26.5 
 
 		 509 aa  139  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1234  extracellular solute-binding protein  26.26 
 
 		 538 aa  138  2e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.871598  normal  0.318753 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2644  extracellular solute-binding protein family 5  26.03 
 
 		 533 aa  139  2e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0361873  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0750  ABC transporter, periplasmic solute-binding protein  27.75 
 
 		 559 aa  138  3.0000000000000003e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0146598  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3175  extracellular solute-binding protein family 5  25.25 
 
 		 554 aa  137  4e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000918408 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1979  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  26.27 
 
 		 516 aa  137  5e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0925  extracellular solute-binding protein  26.19 
 
 		 536 aa  137  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1590  extracellular solute-binding protein family 5  26.41 
 
 		 534 aa  137  6.0000000000000005e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3169  extracellular solute-binding protein  28.02 
 
 		 535 aa  137  7.000000000000001e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.116403 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3804  extracellular solute-binding protein  30.14 
 
 		 501 aa  137  7.000000000000001e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000726853  hitchhiker  0.0000406829 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2178  extracellular solute-binding protein  27.23 
 
 		 529 aa  136  8e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.246301  normal  0.618007 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4561  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  26.72 
 
 		 531 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4392  extracellular solute-binding protein  26.27 
 
 		 521 aa  135  9.999999999999999e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.779012 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1988  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  26.21 
 
 		 505 aa  136  9.999999999999999e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.693495  normal  0.584075 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3845  extracellular solute-binding protein  24.46 
 
 		 564 aa  135  1.9999999999999998e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.267838  normal  0.0712114 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3525  ABC peptide transporter, periplasmic binding protein  27.78 
 
 		 535 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0058  extracellular solute-binding protein  25.54 
 
 		 539 aa  135  1.9999999999999998e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.112335  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1443  extracellular solute-binding protein  27.41 
 
 		 517 aa  135  1.9999999999999998e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.13157 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1820  twin-arginine translocation pathway signal  27.35 
 
 		 527 aa  135  1.9999999999999998e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.575663  normal  0.77509 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4254  extracellular solute-binding protein  25.83 
 
 		 527 aa  134  3e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.340537  normal  0.123719 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4238  extracellular solute-binding protein  26.94 
 
 		 531 aa  134  3e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0301487  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3737  extracellular solute-binding protein  27.42 
 
 		 517 aa  134  3e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5641  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  26.67 
 
 		 508 aa  134  3.9999999999999996e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.543478  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5235  extracellular solute-binding protein family 5  25.15 
 
 		 522 aa  134  5e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1495  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  24.36 
 
 		 538 aa  133  6e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.045715  hitchhiker  0.00127227 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2032  ABC transporter, periplasmic binding protein  25.46 
 
 		 524 aa  133  6.999999999999999e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.662418  normal  0.30348 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1797  extracellular solute-binding protein family 5  29.88 
 
 		 551 aa  133  6.999999999999999e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.645119  normal  0.0256709 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18790  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  27.44 
 
 		 540 aa  133  7.999999999999999e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00232176  normal  0.206883 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5594  extracellular solute-binding protein  25.21 
 
 		 535 aa  133  9e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.459863  normal  0.392289 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2781  extracellular solute-binding protein family 5  25.41 
 
 		 519 aa  132  1.0000000000000001e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.187703  normal  0.0364487 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4201  extracellular solute-binding protein family 5  26.67 
 
 		 508 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1807  extracellular solute-binding protein family 5  26.52 
 
 		 528 aa  133  1.0000000000000001e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1086  extracellular solute-binding protein  25.75 
 
 		 523 aa  133  1.0000000000000001e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0611  extracellular solute-binding protein family 5  25.6 
 
 		 527 aa  132  2.0000000000000002e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2107  extracellular solute-binding protein  26.89 
 
 		 532 aa  132  2.0000000000000002e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0790  ABC oligopeptide/dipeptide transporter, periplasmic ligand binding protein  25.14 
 
 		 554 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.245293  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1433  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  25.57 
 
 		 538 aa  131  3e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.948157  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3126  extracellular solute-binding protein  27.06 
 
 		 510 aa  131  3e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2653  extracellular solute-binding protein  24.8 
 
 		 517 aa  130  4.0000000000000003e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.0051152  normal  0.33796 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>