128 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_0072 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_0072  phage shock protein C, PspC  100 
 
 		 161 aa  319  9.999999999999999e-87  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3130  phage shock protein C, PspC  33.16 
 
 		 177 aa  78.6  0.00000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2350  phage shock protein C, PspC  32.37 
 
 		 194 aa  72.4  0.000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2330  phage shock protein C, PspC  45.78 
 
 		 92 aa  72.4  0.000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.399837 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0475  stress-responsive transcriptional regulator  51.72 
 
 		 61 aa  71.6  0.000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1594  phage shock protein C, PspC  33.55 
 
 		 127 aa  71.6  0.000000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1660  phage shock protein C, PspC  32.9 
 
 		 127 aa  71.2  0.000000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2855  putative stress-responsive transcriptional regulator  47.69 
 
 		 86 aa  69.3  0.00000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3459  PspC domain protein  25.26 
 
 		 244 aa  68.9  0.00000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0516361 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1273  phage shock protein C, PspC  51.67 
 
 		 58 aa  67.8  0.00000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000116909  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2843  phage shock protein C, PspC  50 
 
 		 68 aa  67.4  0.00000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000296758  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1233  phage shock protein C, PspC  31.88 
 
 		 152 aa  67  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.233266  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0822  stress-responsive transcriptional regulator  42.03 
 
 		 95 aa  66.2  0.0000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.55702  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3366  phage shock protein C  57.14 
 
 		 127 aa  65.9  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1174  PspC domain-containing protein  42.03 
 
 		 82 aa  65.5  0.0000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.447328  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0660  phage shock protein C, PspC  53.33 
 
 		 81 aa  65.5  0.0000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.765283  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1319  phage shock protein C, PspC  44 
 
 		 165 aa  65.5  0.0000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1339  phage shock protein C, PspC  52.63 
 
 		 62 aa  65.1  0.0000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00304001  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0579  hypothetical protein  45.16 
 
 		 240 aa  62.8  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.702691  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0661  phage shock protein C, PspC  42.42 
 
 		 119 aa  62  0.000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0912  phage shock protein C, PspC  41.46 
 
 		 85 aa  62  0.000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00715108 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1000  phage shock protein C, PspC  45.31 
 
 		 64 aa  61.2  0.000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.290499 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2157  phage shock protein C, PspC  48.33 
 
 		 138 aa  60.8  0.000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4864  phage shock protein C, PspC  37.08 
 
 		 184 aa  60.5  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0646459  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0849  phage shock protein C, PspC  32.91 
 
 		 147 aa  60.1  0.00000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2455  phage shock protein C, PspC  44.44 
 
 		 81 aa  59.3  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.129612  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4462  phage shock protein C, PspC  52.63 
 
 		 86 aa  59.3  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2420  phage shock protein C, PspC  45 
 
 		 65 aa  59.7  0.00000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0522  phage shock protein C, PspC  28.07 
 
 		 164 aa  58.5  0.00000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.854498  normal  0.422706 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5725  putative signal transduction histidine kinase  38.16 
 
 		 398 aa  58.2  0.00000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.333911  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1648  phage shock protein C, PspC  50 
 
 		 416 aa  58.2  0.00000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.530019  normal  0.368483 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4222  phage shock protein C, PspC  37.5 
 
 		 103 aa  57.8  0.00000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.155341  normal  0.0141639 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2935  phage shock protein C, PspC  41.94 
 
 		 71 aa  56.6  0.0000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000000394883  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2047  putative stress-responsive transcriptional regulator  40.51 
 
 		 87 aa  57  0.0000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0952  phage shock protein C, PspC  30.91 
 
 		 170 aa  57  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.441408  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1227  hypothetical protein  35.62 
 
 		 555 aa  55.8  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.584502  normal  0.010904 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1926  phage shock protein C, PspC  37.04 
 
 		 174 aa  56.2  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000470088  unclonable  0.00000000972351 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4630  hypothetical protein  37.7 
 
 		 61 aa  55.5  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4399  hypothetical protein  39.34 
 
 		 61 aa  55.5  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4239  stress-responsive transcriptional regulator PspC  39.34 
 
 		 61 aa  55.5  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4251  stress-responsive transcriptional regulator  39.34 
 
 		 61 aa  55.5  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4739  hypothetical protein  39.34 
 
 		 61 aa  55.5  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4820  phage shock protein C, PspC  44.64 
 
 		 66 aa  55.5  0.0000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3206  phage shock protein C, PspC  39.34 
 
 		 61 aa  55.8  0.0000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.849771  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1024  phage shock protein C, PspC  42.37 
 
 		 233 aa  55.5  0.0000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4632  hypothetical protein  37.7 
 
 		 61 aa  55.5  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4612  hypothetical protein  37.7 
 
 		 61 aa  55.8  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0623  hypothetical protein  37.7 
 
 		 61 aa  55.8  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.592118  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4616  hypothetical protein  39.34 
 
 		 61 aa  55.5  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2555  phage shock protein C, PspC  43.86 
 
 		 67 aa  55.1  0.0000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4332  phage shock protein C, PspC  37.7 
 
 		 61 aa  54.3  0.0000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1319  phage shock protein C, PspC  50 
 
 		 74 aa  53.9  0.0000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0768012  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4670  phage shock protein C, PspC  46.55 
 
 		 143 aa  53.1  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2822  phage shock protein C, PspC  43.33 
 
 		 97 aa  53.1  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0621  phage shock protein C, PspC  38.03 
 
 		 86 aa  52  0.000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4996  phage shock protein C, PspC  44.44 
 
 		 98 aa  52.4  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4529  phage shock protein C, PspC  42.17 
 
 		 400 aa  52  0.000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1324  phage shock protein C, PspC  42.62 
 
 		 107 aa  51.6  0.000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1735  PspC domain protein  44.44 
 
 		 445 aa  51.2  0.000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3035  phage shock protein C, PspC  49.12 
 
 		 497 aa  51.6  0.000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.177773  hitchhiker  0.0028338 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1775  putative stress-responsive transcriptional regulator, PspC  43.55 
 
 		 70 aa  51.2  0.000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.218822  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3236  PspC domain protein  35 
 
 		 129 aa  51.2  0.000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1045  hypothetical protein  43.33 
 
 		 79 aa  51.2  0.000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1057  phage shock protein C, PspC  65.71 
 
 		 64 aa  50.8  0.000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.471359  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00260  putative stress-responsive transcriptional regulator  31.62 
 
 		 248 aa  50.8  0.000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1297  phage shock protein C, PspC  35.71 
 
 		 86 aa  50.4  0.000009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.184221  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1110  phage shock protein C, PspC  41.67 
 
 		 190 aa  50.1  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000317198  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9060  Putative stress-responsive transcriptional regulator protein-like protein  41.07 
 
 		 178 aa  50.1  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2743  phage shock protein C, PspC  42.11 
 
 		 847 aa  50.1  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00338438  hitchhiker  0.000000294429 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3608  PspC domain-containing protein  44.64 
 
 		 419 aa  49.7  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1275  phage shock protein C, PspC  29.82 
 
 		 169 aa  49.3  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0715782  normal  0.19244 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0450  phage shock protein C, PspC  40.74 
 
 		 84 aa  49.7  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.902434  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0202  phage shock protein C, PspC  55.88 
 
 		 86 aa  48.1  0.00005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.183382  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0132  phage shock protein C, PspC  37.1 
 
 		 82 aa  48.1  0.00005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0723813  normal  0.142504 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17360  putative stress-responsive transcriptional regulator  42.11 
 
 		 354 aa  48.1  0.00005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4438  putative signal transduction histidine kinase  32.43 
 
 		 394 aa  48.1  0.00005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.175729  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0248  phage shock protein C, PspC  45.45 
 
 		 346 aa  47.8  0.00006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0367  phage shock protein C  37.93 
 
 		 70 aa  47.8  0.00007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4216  phage shock protein C, PspC  40.3 
 
 		 511 aa  47.8  0.00007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.041872  normal  0.0645369 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2712  phage shock protein C, PspC  40 
 
 		 512 aa  47.4  0.00008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00998877 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3205  phage shock protein C, PspC  38.98 
 
 		 96 aa  46.6  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.236376 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0708  phage shock protein C, PspC  35.9 
 
 		 552 aa  47  0.0001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4227  putative signal transduction histidine kinase  34.72 
 
 		 394 aa  47  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4619  phage shock protein C, PspC  41.07 
 
 		 67 aa  46.2  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0367  phage shock protein C, PspC  53.66 
 
 		 111 aa  45.8  0.0002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0686  phage shock protein C, PspC  45.24 
 
 		 96 aa  46.2  0.0002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.920802  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0280  hypothetical protein  43.1 
 
 		 491 aa  46.2  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.274206  normal  0.0175316 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0807  phage shock protein C, PspC  39.06 
 
 		 77 aa  45.8  0.0003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3932  phage shock protein C, PspC  37.29 
 
 		 96 aa  45.4  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.923929  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3000  phage shock protein C, PspC  38.33 
 
 		 547 aa  45.4  0.0004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0483  phage shock protein C  38.46 
 
 		 128 aa  45.1  0.0004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21470  phage shock protein C, PspC  38.16 
 
 		 140 aa  45.1  0.0004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3826  PspC domain-containing protein  39.71 
 
 		 445 aa  45.1  0.0005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2413  phage shock protein C, PspC  41.67 
 
 		 67 aa  44.7  0.0005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.249375  normal  0.561911 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1253  phage shock protein C, PspC  51.22 
 
 		 464 aa  44.7  0.0006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.21534  normal  0.216039 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04800  putative stress-responsive transcriptional regulator  26.15 
 
 		 418 aa  44.3  0.0007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.975328  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01260  putative stress-responsive transcriptional regulator  35 
 
 		 140 aa  44.3  0.0007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0794  phage shock protein C, PspC  33.33 
 
 		 61 aa  43.9  0.0009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2778  PspC domain-containing protein  45.65 
 
 		 77 aa  43.5  0.001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000150595  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1756  DNA-binding transcriptional activator PspC  31.86 
 
 		 119 aa  43.5  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>