245 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_3450 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_3450  hypothetical protein  100 
 
 		 1068 aa  2164    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0554556 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0594  hypothetical protein  45.94 
 
 		 1053 aa  916    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0985  hypothetical protein  46.31 
 
 		 1052 aa  939    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3262  hypothetical protein  44.95 
 
 		 1067 aa  922    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0637  hypothetical protein  45.13 
 
 		 1066 aa  866    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0627569 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5296  hypothetical protein  44.04 
 
 		 1071 aa  871    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.774342  normal  0.228264 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0171  hypothetical protein  28.17 
 
 		 1077 aa  272  2.9999999999999997e-71  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0330  TonB-dependent outer membrane receptor precursor  27.23 
 
 		 1041 aa  265  4e-69  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.000673436  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5935  TonB-dependent receptor plug  25.71 
 
 		 1097 aa  256  1.0000000000000001e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.545401  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3010  hypothetical protein  26.78 
 
 		 1129 aa  253  2e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2076  hypothetical protein  25.93 
 
 		 1074 aa  249  3e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5072  OmpA-related protein  25.32 
 
 		 1125 aa  229  2e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.813038  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1376  TonB-dependent outer membrane receptor  25.23 
 
 		 1081 aa  226  2e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00784128  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3920  hypothetical protein  24.29 
 
 		 1071 aa  214  5.999999999999999e-54  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.818859  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1306  TonB-dependent receptor plug  25.09 
 
 		 1100 aa  212  3e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.634411 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2739  TonB-dependent receptor plug  24.38 
 
 		 1074 aa  206  2e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.84904  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01318  TonB-dependent outer membrane Receptor/Oar-like protein  24.89 
 
 		 1056 aa  193  2e-47  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.529934  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3841  hypothetical protein  24.43 
 
 		 1105 aa  187  1.0000000000000001e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0143  Oar protein  23.26 
 
 		 1068 aa  183  2e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0467162  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2744  putative outer membrane protein with a TonB box  24.55 
 
 		 1061 aa  166  2.0000000000000002e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.111846 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3218  hypothetical protein  25.94 
 
 		 1075 aa  156  2e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.158023  normal  0.188502 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3841  TonB-dependent receptor  26.61 
 
 		 1123 aa  135  3e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1968  putative OmpA family protein  23.07 
 
 		 1051 aa  132  3e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1116  TonB-dependent receptor, plug  24.75 
 
 		 1116 aa  130  1.0000000000000001e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.880967  normal  0.249969 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1545  TonB-dependent receptor  33.54 
 
 		 1105 aa  129  2.0000000000000002e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.222059 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0783  TonB-dependent receptor  24.43 
 
 		 1041 aa  126  2e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.149411  normal  0.179647 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1538  TonB-dependent receptor  30 
 
 		 1232 aa  127  2e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.000318851  normal  0.580638 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0638  hypothetical protein  23.73 
 
 		 1069 aa  125  4e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.000046909  normal  0.0437117 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0784  hypothetical protein  25.98 
 
 		 1075 aa  122  3.9999999999999996e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.410737  normal  0.275915 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3506  Cna B-type protein  24.11 
 
 		 1195 aa  122  4.9999999999999996e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.378795  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0368  OmpA family Oar-like outer membrane protein protein  22.65 
 
 		 1066 aa  120  9.999999999999999e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.73574  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0536  OmpA family Oar-like outer membrane protein protein  22.59 
 
 		 1008 aa  120  1.9999999999999998e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00733  putative Outer membrane protein with a TonB box  21.8 
 
 		 1057 aa  119  1.9999999999999998e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.250529  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4190  TonB-dependent receptor  22.99 
 
 		 1114 aa  119  3e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.351423 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0663  TonB-dependent receptor  29.45 
 
 		 1176 aa  117  1.0000000000000001e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00550591  normal  0.789281 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1549  TonB-dependent receptor  30.52 
 
 		 1065 aa  117  1.0000000000000001e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.114571 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0417  TonB-dependent receptor  23.8 
 
 		 1167 aa  114  9e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0498154 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03611  TonB-dependent outer membrane receptor  22.81 
 
 		 1012 aa  111  8.000000000000001e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0348  hypothetical protein  27.42 
 
 		 1008 aa  111  9.000000000000001e-23  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.300848  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2685  TonB-dependent receptor  21.58 
 
 		 1026 aa  111  9.000000000000001e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0315  hypothetical protein  27.34 
 
 		 1125 aa  110  1e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.269975  normal  0.693881 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0428  hypothetical protein  30.79 
 
 		 1196 aa  110  1e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.211152  normal  0.0171632 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3895  TonB-dependent receptor  30.77 
 
 		 1149 aa  109  3e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0561409 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0423  hypothetical protein  30.72 
 
 		 1162 aa  108  4e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.000804756  normal  0.0470711 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2573  Cna B-type protein  29.49 
 
 		 511 aa  107  9e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3909  TonB-dependent receptor  26.56 
 
 		 1153 aa  107  1e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.0000652763  hitchhiker  0.00581227 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0313  TonB-dependent receptor  26.88 
 
 		 1008 aa  107  1e-21  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4189  TonB-dependent receptor  22.93 
 
 		 1105 aa  107  2e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.316829  normal  0.196574 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3525  Cna B-type protein  23 
 
 		 966 aa  106  3e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00878  TonB-dependent outer membrane receptor  24.53 
 
 		 992 aa  103  2e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.556038  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0918  Cna B-type protein  29.97 
 
 		 1203 aa  102  3e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.133902  normal  0.024731 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1501  TonB-dependent receptor  28.61 
 
 		 1123 aa  102  3e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.175276  normal  0.273267 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3840  hypothetical protein  24.31 
 
 		 1122 aa  102  3e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1678  hypothetical protein  22.87 
 
 		 986 aa  101  9e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.675955 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4154  TonB-dependent receptor  25.78 
 
 		 1206 aa  100  1e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.592663 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0933  Cna B-type protein  31.41 
 
 		 1194 aa  100  2e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.000219871  decreased coverage  0.000250734 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2388  Cna B-type protein  28.99 
 
 		 1162 aa  99.8  3e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.315243  normal  0.974277 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0445  hypothetical protein  27.72 
 
 		 1173 aa  98.6  5e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0367904 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03612  TonB-dependent outer membrane receptor  25.49 
 
 		 1010 aa  98.6  5e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0395  hypothetical protein  24.83 
 
 		 1257 aa  98.6  6e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3831  hypothetical protein  23.23 
 
 		 1141 aa  98.2  8e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0885568  normal  0.451604 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2698  TonB-dependent receptor  22.98 
 
 		 1010 aa  95.9  4e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.396614 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1015  TonB-dependent receptor  30.43 
 
 		 1016 aa  94  1e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.501659  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0281  TonB-dependent receptor  32.03 
 
 		 952 aa  94  1e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0691  hypothetical protein  26.46 
 
 		 979 aa  92.8  3e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2136  TonB-dependent receptor  26.95 
 
 		 1124 aa  90.5  1e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0917219  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0532  hypothetical protein  27.42 
 
 		 1161 aa  90.5  2e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.909749  normal  0.440813 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2674  hypothetical protein  24.22 
 
 		 1132 aa  89  4e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3213  putative oar protein  26.48 
 
 		 1001 aa  87.4  0.000000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000600939  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0910  Cna B-type protein  25.94 
 
 		 1210 aa  86.7  0.000000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0761407  normal  0.0249052 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0625  Cna B-type protein  25.8 
 
 		 1298 aa  85.9  0.000000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.320234 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1319  TonB-dependent receptor plug  26.62 
 
 		 1066 aa  83.6  0.00000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0274612  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0342  TonB-dependent receptor plug  24.77 
 
 		 1007 aa  83.2  0.00000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.557003 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2819  TonB-dependent receptor  26.71 
 
 		 897 aa  82.4  0.00000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0401  TonB-dependent receptor  26.71 
 
 		 993 aa  82  0.00000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00163541  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0270  hypothetical protein  24.19 
 
 		 1126 aa  82  0.00000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0970  TonB-dependent receptor  26.6 
 
 		 991 aa  81.6  0.00000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5509  TonB-dependent receptor plug  26.71 
 
 		 1054 aa  80.1  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.180232 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0355  TonB-dependent receptor  26.37 
 
 		 888 aa  79.7  0.0000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.66622  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0281  hypothetical protein  23.55 
 
 		 1120 aa  79.7  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0292  hypothetical protein  23.55 
 
 		 1122 aa  79.7  0.0000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.740643  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02276  TonB-dependent outer membrane Receptor  26.61 
 
 		 1050 aa  77  0.000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0292  hypothetical protein  24.68 
 
 		 1109 aa  74.7  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1148  TonB-dependent receptor, plug  25 
 
 		 1007 aa  73.6  0.00000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01883  TonB-dependent Receptor/Oar-like protein  25.12 
 
 		 1037 aa  72.8  0.00000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.144968  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0168  TonB-dependent receptor  26.84 
 
 		 1066 aa  70.5  0.0000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0687  TonB-dependent receptor plug  28.04 
 
 		 1066 aa  70.1  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000368549  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4805  TonB-dependent siderophore receptor  33.33 
 
 		 791 aa  68.2  0.0000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0410465  normal  0.0531231 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2398  TonB-dependent receptor  25 
 
 		 966 aa  68.2  0.0000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4791  putative oar protein  26.44 
 
 		 997 aa  67.8  0.000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3060  TonB-dependent receptor, plug  23.46 
 
 		 972 aa  66.6  0.000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000347806  normal  0.043287 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4107  putative oar protein  25.95 
 
 		 994 aa  66.6  0.000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000254754  hitchhiker  0.000800061 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0763  TonB-dependent receptor plug  28.29 
 
 		 783 aa  65.9  0.000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.945699  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1758  TonB-dependent receptor  23.58 
 
 		 1089 aa  65.5  0.000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.208023  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1077  TonB-dependent receptor plug  25.78 
 
 		 1147 aa  63.9  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.139666  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0782  TonB-dependent receptor, plug  29.45 
 
 		 1043 aa  63.9  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0300  TonB-dependent receptor plug  28.06 
 
 		 1079 aa  63.9  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.11238 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1750  TonB-dependent receptor  27.54 
 
 		 1087 aa  62.8  0.00000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1428  TonB-dependent receptor plug  23.85 
 
 		 791 aa  62.8  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000022223  normal  0.0329458 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2470  TonB-dependent siderophore receptor  33.77 
 
 		 794 aa  61.6  0.00000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.555764  normal  0.521946 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>