97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_2115 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_2115  major facilitator transporter  100 
 
 		 386 aa  774    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2967  major facilitator transporter  63.38 
 
 		 392 aa  501  1e-141  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0419  major facilitator transporter  64.51 
 
 		 394 aa  492  9.999999999999999e-139  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.664236  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0439  major facilitator transporter  64.23 
 
 		 394 aa  474  1e-133  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.116076  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0694  transporter, major facilitator family protein  56.28 
 
 		 393 aa  421  1e-117  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0299  fucose permease  55.15 
 
 		 408 aa  423  1e-117  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.482849  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05760  fucose permease  49.63 
 
 		 414 aa  408  1e-113  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0598938  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1115  major facilitator superfamily MFS_1  51.7 
 
 		 393 aa  407  1.0000000000000001e-112  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.948444  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1662  major facilitator superfamily MFS_1  51.42 
 
 		 388 aa  392  1e-108  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0309  major facilitator superfamily MFS_1  52.88 
 
 		 394 aa  389  1e-107  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.265647  normal  0.0116051 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1174  major facilitator transporter  45.93 
 
 		 389 aa  333  2e-90  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0776  major facilitator transporter  51.28 
 
 		 326 aa  297  2e-79  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1304  major facilitator transporter  36.98 
 
 		 390 aa  223  4e-57  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1480  major facilitator transporter  31.15 
 
 		 395 aa  207  3e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1068  major facilitator transporter  31.11 
 
 		 395 aa  195  1e-48  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.355091 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13440  major facilitator superfamily MFS_1  32.98 
 
 		 425 aa  194  3e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1293  major facilitator superfamily MFS_1  30.37 
 
 		 407 aa  174  1.9999999999999998e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.180985  normal  0.234354 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1163  hypothetical protein  22.87 
 
 		 391 aa  80.5  0.00000000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.38877  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3689  major facilitator transporter  25.69 
 
 		 395 aa  74.7  0.000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.890108  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0680  major facilitator superfamily MFS_1  26.22 
 
 		 384 aa  72  0.00000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.668541  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_11209  hypothetical protein  24.92 
 
 		 440 aa  71.6  0.00000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.873381  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08768  conserved hypothetical protein  24.06 
 
 		 433 aa  69.7  0.00000000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0863373  normal  0.186532 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2533  hypothetical protein  25 
 
 		 398 aa  64.3  0.000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0651893  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0909  major facilitator superfamily MFS_1  22.08 
 
 		 377 aa  63.9  0.000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3989  major facilitator transporter  22.56 
 
 		 406 aa  62  0.00000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0137476  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28819  predicted protein  22.3 
 
 		 505 aa  61.6  0.00000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00143526 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3096  major facilitator superfamily MFS_1  24.3 
 
 		 431 aa  60.5  0.00000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00556654 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_59900  predicted protein  23.6 
 
 		 274 aa  60.1  0.00000007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.787504  normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_58946  predicted protein  25.25 
 
 		 419 aa  59.7  0.00000009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.314593 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1174  major facilitator transporter  23.54 
 
 		 379 aa  58.9  0.0000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.394628  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND01310  conserved hypothetical protein  22.65 
 
 		 529 aa  58.5  0.0000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_45095  conserved hypothetical membrane protein  21.78 
 
 		 433 aa  57.4  0.0000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.562888 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0065  major facilitator transporter  22.31 
 
 		 406 aa  54.7  0.000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.596651  decreased coverage  0.0000000729069 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0068  transporter, putative  19.66 
 
 		 391 aa  54.3  0.000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0010  major facilitator transporter  23.42 
 
 		 376 aa  54.7  0.000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000260757 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0130  major facilitator transporter  23.46 
 
 		 398 aa  54.7  0.000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.453953  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0065  major facilitator family transporter  19.66 
 
 		 388 aa  53.9  0.000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01506  MFS transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G05090)  23.18 
 
 		 417 aa  53.9  0.000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.898615 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0063  major facilitator transporter  22.72 
 
 		 406 aa  53.5  0.000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0580428  unclonable  0.0000312687 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5723  major facilitator superfamily MFS_1  22.51 
 
 		 378 aa  53.5  0.000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.871136 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0067  major facilitator transporter  22.05 
 
 		 406 aa  53.1  0.000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.700351  unclonable  0.0000000000855622 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2920  major facilitator transporter  23.53 
 
 		 382 aa  53.5  0.000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.146582 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1567  major facilitator transporter  30.19 
 
 		 392 aa  53.1  0.000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.251372 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3964  transporter, putative  24.85 
 
 		 407 aa  52.4  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000523123  normal  0.125467 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1762  major facilitator superfamily (MFS)transporter  21.34 
 
 		 401 aa  52.4  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0112506  normal  0.0259533 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3084  major facilitator superfamily MFS_1  28.86 
 
 		 415 aa  52  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.11728  normal  0.436987 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4432  major facilitator transporter  24.75 
 
 		 419 aa  51.6  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0534  major facilitator transporter  21.15 
 
 		 391 aa  52  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.479778 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2211  glucose/galactose transporter  21.86 
 
 		 424 aa  50.8  0.00004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.17788  hitchhiker  0.00147708 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0962  major facilitator transporter  24.59 
 
 		 415 aa  50.4  0.00005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.419565 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0062  major facilitator transporter  23.41 
 
 		 406 aa  50.1  0.00007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.7183  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0067  major facilitator transporter  21.93 
 
 		 406 aa  49.7  0.00008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.37883  hitchhiker  0.00294151 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0275  major facilitator superfamily MFS_1  26.85 
 
 		 371 aa  49.7  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1877  major facilitator superfamily MFS_1  24.31 
 
 		 392 aa  49.3  0.0001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2123  major facilitator superfamily MFS_1  21.86 
 
 		 395 aa  48.9  0.0001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.226237  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3265  major facilitator transporter  29.06 
 
 		 384 aa  48.1  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.025013  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0066  major facilitator superfamily MFS_1  21.93 
 
 		 406 aa  48.5  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.574631  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0200  major facilitator superfamily MFS_1  25.37 
 
 		 415 aa  48.5  0.0002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1162  major facilitator transporter  23.61 
 
 		 384 aa  48.9  0.0002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.019331  normal  0.470763 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0090  major facilitator transporter  21.37 
 
 		 422 aa  48.5  0.0002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000497214  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1336  major facilitator transporter  23.37 
 
 		 404 aa  47.8  0.0003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.160012 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1266  L-fucose-proton symporter  21.61 
 
 		 403 aa  47.8  0.0003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4287  major facilitator transporter  21.93 
 
 		 406 aa  47.8  0.0003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000504378  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2088  major facilitator superfamily MFS_1  22.34 
 
 		 398 aa  47.4  0.0005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2374  major facilitator superfamily MFS_1  24.09 
 
 		 401 aa  47  0.0006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8644  major facilitator superfamily MFS_1  21.26 
 
 		 407 aa  45.8  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.700499 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3819  major facilitator transporter  23.39 
 
 		 425 aa  45.8  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000056973  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15630  hypothetical protein  21.47 
 
 		 432 aa  45.4  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0399318  hitchhiker  3.8947399999999994e-20 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7075  major facilitator family transporter  21.61 
 
 		 370 aa  46.2  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.240881  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36380  sugar phosphate permease  21.87 
 
 		 447 aa  45.8  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3279  hypothetical protein  23.05 
 
 		 400 aa  45.1  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.763123  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3044  hypothetical protein  23.05 
 
 		 400 aa  45.1  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00880496  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3270  hypothetical protein  23.05 
 
 		 400 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4044  L-fucose transporter  19.61 
 
 		 420 aa  45.4  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09450  major facilitator superfamily MFS_1  22.81 
 
 		 422 aa  45.1  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00253075  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0551  major facilitator transporter  24.69 
 
 		 407 aa  45.1  0.002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000114988  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1020  inner membrane protein YbjJ  22.81 
 
 		 403 aa  45.1  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.241467  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2285  major facilitator transporter  23.92 
 
 		 386 aa  45.1  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0777  major facilitator transporter  44 
 
 		 59 aa  44.7  0.003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0904  inner membrane protein YbjJ  22.81 
 
 		 403 aa  44.3  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1860  major facilitator superfamily MFS_1  22.69 
 
 		 385 aa  43.9  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2027  glucose/galactose transporter  22.83 
 
 		 415 aa  44.3  0.004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5362  major facilitator superfamily MFS_1  22.62 
 
 		 403 aa  43.9  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1001  hypothetical protein  22.81 
 
 		 403 aa  44.3  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.705543  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00677  transporter, putative  25.22 
 
 		 405 aa  43.9  0.004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00179637  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3705  glucose/galactose transporter family protein  21.17 
 
 		 407 aa  43.9  0.005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2856  major facilitator transporter  21.51 
 
 		 374 aa  43.9  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7621  major facilitator superfamily permease  22.12 
 
 		 398 aa  43.5  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.262333 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4247  major facilitator transporter  20.86 
 
 		 429 aa  43.5  0.006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03795  glucose/galactose transporter family protein  25.12 
 
 		 420 aa  43.5  0.007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.268682  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1181  transporter, putative  25.19 
 
 		 377 aa  43.1  0.008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.510237  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07240  MFS transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G17270)  21.68 
 
 		 411 aa  43.1  0.009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4261  major facilitator superfamily MFS_1  21.23 
 
 		 427 aa  42.7  0.009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.426527  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12450  Major Facilitator Superfamily transporter  27.13 
 
 		 428 aa  43.1  0.009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0744182  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6376  major facilitator transporter  23.19 
 
 		 449 aa  43.1  0.009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000765522  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1499  major facilitator superfamily MFS_1  25.34 
 
 		 379 aa  43.1  0.009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.276684  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1792  major facilitator superfamily MFS_1  31.82 
 
 		 386 aa  42.7  0.009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>