More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_0114 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_0114  ABC transporter related  100 
 
 		 270 aa  564  1e-160  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2918  ABC transporter related  74.27 
 
 		 247 aa  392  1e-108  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.79893  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5639  ABC transporter related  73.14 
 
 		 248 aa  389  1e-107  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.307001 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1108  ABC transporter related  62.86 
 
 		 255 aa  338  7e-92  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.298542 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1080  ATPase  65.55 
 
 		 275 aa  337  9e-92  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0809  ABC transporter-related protein  55.27 
 
 		 257 aa  287  1e-76  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1149  ABC transporter related  54.43 
 
 		 324 aa  282  3.0000000000000004e-75  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.283923  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3106  ABC transporter related  53.25 
 
 		 510 aa  278  1e-73  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1900  ABC transporter related  56.62 
 
 		 314 aa  277  1e-73  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0657  ABC transporter-related protein  54.78 
 
 		 320 aa  275  5e-73  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00186139 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1780  ABC transporter related protein  51.74 
 
 		 312 aa  274  1.0000000000000001e-72  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.150839  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1761  ABC transporter related  55.71 
 
 		 322 aa  273  3e-72  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.726529  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2905  ABC transporter related  52.3 
 
 		 512 aa  268  7e-71  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.725658  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2108  ABC transporter related  54.34 
 
 		 325 aa  265  5.999999999999999e-70  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.947862  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0894  ABC transporter related  55.5 
 
 		 314 aa  264  1e-69  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3462  ABC transporter-related protein  52.38 
 
 		 308 aa  260  1e-68  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3222  ABC transporter-related protein  53.39 
 
 		 322 aa  260  2e-68  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.209487  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0918  ABC transporter related  54.42 
 
 		 333 aa  259  4e-68  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.800734 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1605  ABC transporter, ATP-binding protein  51.83 
 
 		 309 aa  259  4e-68  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.692946  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0973  ABC transporter related  52.49 
 
 		 319 aa  258  7e-68  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0859  ABC transporter related  50.91 
 
 		 319 aa  257  1e-67  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0838587  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3307  ABC transporter related  53.67 
 
 		 322 aa  257  2e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3276  ABC transporter related protein  52.49 
 
 		 319 aa  255  5e-67  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3113  ABC transporter, ATPase subunit  53.21 
 
 		 322 aa  254  1.0000000000000001e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1912  ABC multidrug efflux pump, ATPase subunit  50.91 
 
 		 316 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0244419  normal  0.149204 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3706  ABC transporter related  48.95 
 
 		 594 aa  253  2.0000000000000002e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1293  ABC transporter, ATP-binding protein  49.55 
 
 		 350 aa  249  4e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.906267  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1304  ABC transporter related  46.8 
 
 		 590 aa  248  1e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00761  fused predicted transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  47.35 
 
 		 578 aa  247  2e-64  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2848  ABC transporter related protein  47.35 
 
 		 578 aa  247  2e-64  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0942  ABC transporter, ATP-binding protein  47.35 
 
 		 578 aa  247  2e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1328  ABC transporter-related protein  46.25 
 
 		 576 aa  247  2e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0817  ABC transporter, ATP-binding protein  47.35 
 
 		 578 aa  246  2e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00778  hypothetical protein  47.35 
 
 		 578 aa  247  2e-64  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0848  ABC transporter, ATP-binding protein  47.35 
 
 		 578 aa  247  2e-64  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0859  ABC transporter, ATP-binding protein  47.35 
 
 		 578 aa  247  2e-64  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2849  ABC transporter related  47.35 
 
 		 578 aa  247  2e-64  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.037407 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2558  ABC transporter, ATP-binding protein  47.35 
 
 		 578 aa  247  2e-64  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.943618  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8103  ABC transporter related  44.09 
 
 		 578 aa  246  3e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1019  ABC transporter related  46.4 
 
 		 590 aa  245  4e-64  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1588  ABC transporter related  48.7 
 
 		 307 aa  244  9e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.187855  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3251  ABC transporter related  45.38 
 
 		 581 aa  244  9.999999999999999e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1779  ABC transporter, ATPase subunit  48.96 
 
 		 579 aa  243  1.9999999999999999e-63  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001403  ABC-type multidrug transport system ATPase component  47.37 
 
 		 308 aa  243  1.9999999999999999e-63  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2901  ABC transporter related  46.91 
 
 		 580 aa  243  1.9999999999999999e-63  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3001  ABC transporter related  45.42 
 
 		 585 aa  243  1.9999999999999999e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1264  putative ABC transporter, ATP-binding protein  47.37 
 
 		 308 aa  244  1.9999999999999999e-63  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000993133  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2813  ABC transporter, ATP-binding protein  46.91 
 
 		 580 aa  243  1.9999999999999999e-63  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1479  ABC transporter related protein  48.09 
 
 		 589 aa  242  3.9999999999999997e-63  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1285  ABC transporter related  50.22 
 
 		 579 aa  242  5e-63  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06358  ABC transporter component  47.37 
 
 		 308 aa  242  5e-63  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0852  ABC transporter, ATP-binding protein  48.9 
 
 		 578 aa  242  6e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0944  ABC transporter ATP-binding protein  48.9 
 
 		 578 aa  242  6e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1740  ABC transporter related  43.87 
 
 		 593 aa  241  6e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.733872  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0965  ABC transporter ATP-binding protein  48.9 
 
 		 578 aa  241  7e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0880  ABC transporter ATP-binding protein  48.9 
 
 		 578 aa  241  7e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0912  ABC transporter ATP-binding protein  48.9 
 
 		 578 aa  241  9e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1045  ABC transporter related  49.79 
 
 		 311 aa  240  2e-62  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2421  ABC transporter related  49.1 
 
 		 582 aa  240  2e-62  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.259147  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4062  ABC transporter related protein  47.66 
 
 		 583 aa  240  2e-62  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4697  ABC transporter related  43.78 
 
 		 582 aa  238  5.999999999999999e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.793973  normal  0.717601 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4202  ABC transporter related  45.92 
 
 		 335 aa  238  9e-62  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.933672  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0130  ABC transporter related  45.1 
 
 		 576 aa  238  9e-62  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00600  ABC transporter, ATP binding component  44.86 
 
 		 593 aa  238  1e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.248095  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1249  ABC transporter, ATP-binding protein  48.17 
 
 		 323 aa  237  2e-61  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2943  ABC transporter related protein  46.31 
 
 		 585 aa  237  2e-61  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.773013  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2369  ABC transporter related  46.49 
 
 		 575 aa  237  2e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.296305  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2512  ABC transporter related  46.52 
 
 		 583 aa  236  3e-61  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.58848  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3690  ABC transporter related  47.95 
 
 		 323 aa  236  3e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1083  ABC transport system ATPase component  47.51 
 
 		 304 aa  234  9e-61  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.323648 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4163  ABC transporter related  47.49 
 
 		 323 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.417858  normal  0.351966 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1520  ABC transporter related  45.9 
 
 		 580 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.226797  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4328  ABC transporter related  47.91 
 
 		 318 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.786292 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3538  ABC transporter related  47.14 
 
 		 323 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1745  ABC transporter, ATPase subunit  47.49 
 
 		 322 aa  233  3e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0173616  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1720  ABC transporter, ATPase subunit  50 
 
 		 315 aa  233  3e-60  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.062047  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4678  ABC transporter related  47.96 
 
 		 667 aa  232  6e-60  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2809  ABC transporter related  46.32 
 
 		 255 aa  231  7.000000000000001e-60  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.640321 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1792  ABC transporter component  45.08 
 
 		 580 aa  231  7.000000000000001e-60  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.380874  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2391  ABC transporter related  44.94 
 
 		 599 aa  231  7.000000000000001e-60  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0714  hypothetical protein  45.27 
 
 		 580 aa  231  9e-60  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0696  hypothetical protein  45.27 
 
 		 580 aa  231  1e-59  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1795  ABC transporter related  48.64 
 
 		 578 aa  230  2e-59  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2448  ABC transporter-related protein  47.44 
 
 		 314 aa  230  2e-59  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1355  ABC transporter related  42.92 
 
 		 315 aa  229  4e-59  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000405969  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1421  ABC transporter related  44.72 
 
 		 599 aa  229  4e-59  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.316011  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0256  heme exporter protein CcmA  45.15 
 
 		 291 aa  229  4e-59  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.197051  normal  0.658869 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0164  ABC transporter ATP-binding protein  46.51 
 
 		 321 aa  228  7e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0222802  normal  0.939633 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0874  ABC transporter related  47.51 
 
 		 313 aa  228  9e-59  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.32724 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0053  ABC transporter related  46.98 
 
 		 326 aa  228  1e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5056  ABC transporter related  50.95 
 
 		 302 aa  227  1e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.844299 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0350  ABC transporter, ATP-binding protein  46.61 
 
 		 541 aa  227  2e-58  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2926  ABC transporter related  49.53 
 
 		 316 aa  227  2e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2574  ABC transporter related  43.57 
 
 		 346 aa  226  2e-58  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2749  ABC transporter related  43.57 
 
 		 346 aa  226  2e-58  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3463  ABC transporter-related protein  46.44 
 
 		 305 aa  226  3e-58  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2832  ABC transporter related  45.18 
 
 		 318 aa  226  3e-58  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.442904  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1514  ABC transporter related  45.18 
 
 		 318 aa  226  3e-58  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2641  ABC transporter related  43.57 
 
 		 346 aa  226  3e-58  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1523  ABC transporter related  45.18 
 
 		 318 aa  226  3e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>