238 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_2133 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_2133  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 
1144 aa  2300    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.283843  normal  0.156102 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7540  Beta-galactosidase/beta- glucuronidase family protein  35.68 
 
 
962 aa  464  1e-129  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.263418  normal  0.712319 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2275  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  30.06 
 
 
878 aa  383  1e-104  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4811  coagulation factor 5/8 type domain protein  31.61 
 
 
971 aa  371  1e-101  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000406891  unclonable  0.000000000000101535 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2861  coagulation factor 5/8 type domain protein  29.81 
 
 
984 aa  358  2.9999999999999997e-97  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00229986  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1359  glycoside hydrolase family protein  28.74 
 
 
906 aa  343  1e-92  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1052  coagulation factor 5/8 type domain protein  35.58 
 
 
1362 aa  326  1e-87  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.311777  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7497  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  24.48 
 
 
1243 aa  206  2e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.122838  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1802  Beta-mannosidase  23.55 
 
 
813 aa  187  1.0000000000000001e-45  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0128  glycoside hydrolase family protein  22.58 
 
 
871 aa  172  3e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0227  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  24.53 
 
 
813 aa  172  4e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4671  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  26.67 
 
 
845 aa  167  1.0000000000000001e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10160  beta-mannosidase  26.18 
 
 
846 aa  160  1e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.998616 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2440  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  25.5 
 
 
845 aa  160  1e-37  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.21652  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02824  glycosyl hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G03830)  22.99 
 
 
1270 aa  153  2e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0680096  normal  0.245277 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6180  beta-mannosidase protein  26.06 
 
 
812 aa  153  2e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.981115  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4827  Beta-mannosidase  26.01 
 
 
824 aa  153  2e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7055  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  23.98 
 
 
842 aa  152  5e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0167983  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0037  beta-mannosidase  25.59 
 
 
831 aa  150  2.0000000000000003e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.306104  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01640  beta-mannosidase  24.32 
 
 
860 aa  149  3e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.587297  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0915  beta-mannosidase  23.99 
 
 
840 aa  149  4.0000000000000006e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.765709  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4242  beta-mannosidase  24.22 
 
 
864 aa  143  9.999999999999999e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0302  glycoside hydrolase family protein  21.8 
 
 
863 aa  142  3.9999999999999997e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2588  glycoside hydrolase family 2 immunoglobulin domain protein beta-sandwich  23.46 
 
 
819 aa  137  9.999999999999999e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2004  beta-mannosidase precursor  23.97 
 
 
891 aa  132  4.0000000000000003e-29  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  decreased coverage  0.000805644  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4085  glycoside hydrolase family protein  24.39 
 
 
763 aa  132  4.0000000000000003e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.128468  normal  0.559819 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1779  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  25.63 
 
 
872 aa  130  1.0000000000000001e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.345477  normal  0.305712 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1288  glycoside hydrolase family protein  23.77 
 
 
785 aa  130  2.0000000000000002e-28  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1928  glycoside hydrolase family protein  24.11 
 
 
891 aa  129  5e-28  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.000726308  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2314  glycoside hydrolase family protein  22.62 
 
 
897 aa  127  1e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.742782  normal  0.0316012 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03368  Beta-mannosidase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q1HFT6]  24.28 
 
 
837 aa  127  2e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.73086  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0140  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  24.3 
 
 
818 aa  127  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.143076 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0884  Beta-mannosidase  21.98 
 
 
823 aa  125  4e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0006  glycoside hydrolase family protein  23.09 
 
 
734 aa  124  9.999999999999999e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1576  Beta-mannosidase  25.36 
 
 
839 aa  123  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.177969  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3722  beta-mannosidase  24.5 
 
 
829 aa  122  3.9999999999999996e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.225844  normal  0.26439 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0146  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  25.17 
 
 
817 aa  122  6e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1167  glycoside hydrolase family protein  23.11 
 
 
786 aa  120  9.999999999999999e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01360  beta-galactosidase/beta-glucuronidase  23.92 
 
 
843 aa  119  1.9999999999999998e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1466  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  27.18 
 
 
835 aa  117  2.0000000000000002e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.13243  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0497  glycoside hydrolase family protein  21.63 
 
 
793 aa  113  2.0000000000000002e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0032  beta-mannosidase, putative  23.14 
 
 
861 aa  112  4.0000000000000004e-23  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15570  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  21.05 
 
 
744 aa  112  6e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2418  beta-mannosidase  24.05 
 
 
875 aa  110  1e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13110  beta-mannosidase  29 
 
 
837 aa  109  2e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1724  Beta-mannosidase  23.5 
 
 
824 aa  110  2e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.46466  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1756  Beta-mannosidase  23.12 
 
 
880 aa  102  3e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.994744  normal  0.0432556 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2405  beta-mannosidase precursor  22.77 
 
 
815 aa  91.7  7e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06535  hypothetical protein  22.51 
 
 
802 aa  87.8  0.000000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2094  Beta-mannosidase  25.1 
 
 
819 aa  87.4  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.494102 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4450  beta-mannosidase  24.44 
 
 
845 aa  87  0.000000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2333  beta-mannosidase protein  24.58 
 
 
819 aa  86.7  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2644  Beta-mannosidase  28.57 
 
 
833 aa  86.3  0.000000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0554464  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0268  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  21.84 
 
 
843 aa  84  0.00000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.617215  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20490  Beta-galactosidase  24.75 
 
 
750 aa  82.4  0.00000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000040433  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1750  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  28.8 
 
 
799 aa  81.6  0.00000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.266085  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0290  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  25.41 
 
 
986 aa  80.1  0.0000000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2757  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  25.79 
 
 
805 aa  79.3  0.0000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.000135785  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1095  Beta-galactosidase  25.19 
 
 
743 aa  78.6  0.0000000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0169  mannosidase  23.34 
 
 
821 aa  77.8  0.000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1715  glycoside hydrolase family 2 immunoglobulin domain protein beta-sandwich  24.55 
 
 
882 aa  77.8  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_29300  Beta-mannosidase precursor (Mannanase)  23.57 
 
 
847 aa  77.8  0.000000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1816  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  27.27 
 
 
800 aa  77.8  0.000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0827193  decreased coverage  0.000000000316153 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2654  Beta-galactosidase  27.3 
 
 
704 aa  76.3  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0659127  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5307  Beta-mannosidase  28.33 
 
 
799 aa  76.3  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2713  glycoside hydrolase family protein  25.5 
 
 
663 aa  74.7  0.000000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0942684  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3194  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  25.3 
 
 
905 aa  74.7  0.000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.163194  normal  0.106396 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1474  beta-galactosidase  26.74 
 
 
1355 aa  73.9  0.00000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000658  beta-mannosidase  23.82 
 
 
802 aa  74.3  0.00000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1473  glycoside hydrolase family protein  22.73 
 
 
816 aa  73.9  0.00000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4492  Beta-galactosidase  25.2 
 
 
889 aa  73.9  0.00000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  decreased coverage  0.00800189  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6190  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  29.2 
 
 
640 aa  72  0.00000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0684  DNA primase  23.76 
 
 
785 aa  71.6  0.00000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.113069  hitchhiker  0.000000509357 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0106  Beta-galactosidase  23.62 
 
 
815 aa  71.6  0.00000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2605  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  24.04 
 
 
757 aa  70.5  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0289193 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6868  Beta-galactosidase  37.76 
 
 
707 aa  70.1  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_43820  Glycoside hydrolase family 2 (Mannanase, beta-galactosidase)  20.35 
 
 
838 aa  70.5  0.0000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.893374  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3669  glycoside hydrolase family protein  27.01 
 
 
888 aa  70.5  0.0000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3794  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  27.1 
 
 
623 aa  69.7  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.012505  normal  0.0216504 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20590  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  26.29 
 
 
892 aa  68.9  0.0000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1239  Carbohydrate binding family 6  26.51 
 
 
1015 aa  68.9  0.0000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000298242  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2021  glycoside hydrolase family protein  27.8 
 
 
724 aa  68.6  0.0000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0134  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  26 
 
 
884 aa  67.8  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0490  Beta-glucuronidase  22.83 
 
 
564 aa  68.2  0.000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0061  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  22.99 
 
 
901 aa  67.4  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0102  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  22.89 
 
 
1781 aa  67.4  0.000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.432951 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4208  Beta-galactosidase  27.82 
 
 
587 aa  66.6  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0779  glycoside hydrolase family protein  23.05 
 
 
827 aa  66.6  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00239  beta-galactosidase  23.46 
 
 
763 aa  67  0.000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1740  glycoside hydrolase family protein  26.94 
 
 
739 aa  66.6  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.336236 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1013  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  22.89 
 
 
1033 aa  66.2  0.000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.188379  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0824  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  25.89 
 
 
1264 aa  66.6  0.000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.0000954733  decreased coverage  0.00757756 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0022  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  23.29 
 
 
609 aa  66.2  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2520  glycoside hydrolase family protein  23.62 
 
 
925 aa  66.6  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01742  beta-1,4-mannosidase (Eurofung)  23.66 
 
 
940 aa  65.1  0.000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.875366  normal  0.643329 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4102  Beta-galactosidase  24.51 
 
 
1108 aa  65.1  0.000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.283499  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1177  threonine synthase  22.22 
 
 
859 aa  64.7  0.000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0725955  hitchhiker  0.0000211988 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3378  glycoside hydrolase family protein  25.69 
 
 
919 aa  64.7  0.00000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.825793  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2816  Beta-galactosidase  26.92 
 
 
1171 aa  64.7  0.00000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1433  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  31.85 
 
 
1003 aa  64.7  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>