106 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_0616 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_0616  Microbial collagenase  100 
 
 		 787 aa  1602    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00460764  normal  0.253983 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7152  Peptidase M9A collagenase domain protein  49.71 
 
 		 855 aa  634  1e-180  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.766617  normal  0.500432 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3516  Microbial collagenase  48.36 
 
 		 852 aa  550  1e-155  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2903  Microbial collagenase  42.18 
 
 		 632 aa  533  1e-150  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.439593 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0648  collagenase  33.29 
 
 		 1005 aa  377  1e-103  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000132044  unclonable  0.0000000383591 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3732  collagenase  32.83 
 
 		 1041 aa  363  5.0000000000000005e-99  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0630  collagenase  32.83 
 
 		 1070 aa  363  7.0000000000000005e-99  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0657  collagenase  32.69 
 
 		 1070 aa  362  2e-98  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0653  Microbial collagenase  32.56 
 
 		 1041 aa  360  8e-98  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0639  collagenase family protein  32.12 
 
 		 1037 aa  357  5e-97  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1578  collagenase, putative  32.81 
 
 		 602 aa  289  1e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.285851  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0900  collagenase  32.55 
 
 		 645 aa  289  1e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003663  microbial collagenase secreted  30.35 
 
 		 814 aa  288  2e-76  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2419  peptidase  33.45 
 
 		 602 aa  288  2.9999999999999996e-76  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.337269  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0773  putative collagenase  33.45 
 
 		 647 aa  288  2.9999999999999996e-76  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.293551  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1142  collagenase  33.45 
 
 		 647 aa  288  2.9999999999999996e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1736  putative collagenase  33.45 
 
 		 645 aa  288  2.9999999999999996e-76  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2230  peptidase  32.38 
 
 		 605 aa  287  4e-76  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.596045  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0988  collagenase  32.2 
 
 		 661 aa  288  4e-76  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.244986  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1216  collagenase  33.27 
 
 		 645 aa  287  5e-76  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  unclonable  0.0000000000787421  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0694  putative collagenase  33.45 
 
 		 632 aa  286  1.0000000000000001e-75  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.117227  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6876  collagenase  31.75 
 
 		 658 aa  282  1e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000000039324  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1685  collagenase  27.41 
 
 		 968 aa  273  9e-72  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000629981  unclonable  0.00000468189 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001372  microbial collagenase secreted  26.64 
 
 		 808 aa  230  8e-59  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00032964  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01786  hypothetical protein  26.63 
 
 		 785 aa  223  1.9999999999999999e-56  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2754  collagenase  27.26 
 
 		 972 aa  220  7e-56  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1256  collagenase  28.41 
 
 		 539 aa  167  6.9999999999999995e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000029967  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2743  collagenase  34.21 
 
 		 293 aa  142  1.9999999999999998e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.981604  hitchhiker  0.0000597817 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1077  collagenase  32.37 
 
 		 301 aa  141  4.999999999999999e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000014464  normal  0.459952 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1458  collagenase  31.43 
 
 		 322 aa  139  2e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.446603  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3300  collagenase  31.62 
 
 		 294 aa  132  4.0000000000000003e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000170282  decreased coverage  0.0000000275437 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2237  collagenase  29.41 
 
 		 667 aa  130  8.000000000000001e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.971967  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2966  collagenase  30.66 
 
 		 304 aa  129  2.0000000000000002e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.194174  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3449  collagenase  29.74 
 
 		 292 aa  122  3e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.649774  hitchhiker  0.000527325 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1517  collagenase  29.32 
 
 		 313 aa  119  1.9999999999999998e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000383276  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3732  collagenase  30.34 
 
 		 603 aa  117  1.0000000000000001e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00527905  hitchhiker  0.00286894 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0039  collagenase  28.4 
 
 		 590 aa  116  1.0000000000000001e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000449009  normal  0.0513701 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0035  collagenase  27.65 
 
 		 519 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0042  collagenase  27.57 
 
 		 587 aa  114  9e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.53761  normal  0.627345 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04561  extracellular protease  37.37 
 
 		 560 aa  65.1  0.000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.550722  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02449  hypothetical protein  34.09 
 
 		 489 aa  59.7  0.0000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3396  endonuclease I  36.17 
 
 		 539 aa  60.1  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0556  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  32.46 
 
 		 494 aa  59.7  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0947915  normal  0.29276 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1016  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.71 
 
 		 630 aa  58.5  0.0000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1255  collagenase  25.24 
 
 		 252 aa  58.2  0.0000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000048292  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2341  alkaline serine protease  35.87 
 
 		 535 aa  58.5  0.0000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00532226  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2692  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.95 
 
 		 818 aa  57  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4257  endonuclease I  30.95 
 
 		 558 aa  56.2  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0097  endonuclease I  30.16 
 
 		 558 aa  56.6  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0712  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  33.33 
 
 		 579 aa  56.2  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.482553 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3636  putative microbial collagenase  20.04 
 
 		 971 aa  56.2  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1680  putative microbial collagenase  20.04 
 
 		 971 aa  56.2  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0340823  hitchhiker  1.3122e-17 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4623  peptidase domain-containing protein  41.03 
 
 		 658 aa  55.1  0.000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.272632  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2185  cold-active serine alkaline protease  37.04 
 
 		 803 aa  53.9  0.00001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000390899  decreased coverage  0.00433013 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3200  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  34.02 
 
 		 629 aa  53.1  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2477  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.91 
 
 		 823 aa  53.1  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000447493  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3194  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  34.02 
 
 		 629 aa  53.1  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3338  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  34.02 
 
 		 629 aa  53.1  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1173  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  34.02 
 
 		 629 aa  52.8  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0188  putative surface protein  25.81 
 
 		 1013 aa  52.8  0.00003  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2443  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30 
 
 		 807 aa  52.4  0.00003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000415164  unclonable  0.00000378434 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000274  neutral protease precursor  27.68 
 
 		 701 aa  52  0.00004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0684  putative microbial collagenase  21.98 
 
 		 965 aa  51.6  0.00005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000922762  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0427  peptidase domain-containing protein  27.83 
 
 		 553 aa  50.8  0.00009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3041  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  32.63 
 
 		 807 aa  50.1  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.022997  normal  0.0310863 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3106  cold-active serine alkaline protease  33.33 
 
 		 807 aa  48.9  0.0003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001489  alkaline serine exoprotease A precursor  30.25 
 
 		 534 aa  49.3  0.0003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1611  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  33.33 
 
 		 802 aa  49.3  0.0003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0326681 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1578  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  32.69 
 
 		 819 aa  49.3  0.0003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000462777  hitchhiker  0.00000000445269 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2373  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  35.8 
 
 		 628 aa  48.5  0.0005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.200632  normal  0.503534 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0751  cold-active alkaline serine protease  31.46 
 
 		 789 aa  48.1  0.0006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1409  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.73 
 
 		 803 aa  48.1  0.0006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000345823  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2779  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.73 
 
 		 819 aa  48.1  0.0007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000279348  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2799  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.73 
 
 		 819 aa  48.1  0.0007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000118341  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2874  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.73 
 
 		 819 aa  48.1  0.0007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000394785  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0115  lysyl endopeptidase  31.18 
 
 		 823 aa  47.8  0.0009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.585546  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1390  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  33.33 
 
 		 805 aa  47  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000278441  hitchhiker  0.0000000134181 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1455  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  33.33 
 
 		 805 aa  47.4  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00029067  hitchhiker  0.000623133 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1443  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  33.33 
 
 		 809 aa  47  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000125277  hitchhiker  0.0000000821824 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2871  cold-active alkaline serine protease  30.09 
 
 		 789 aa  46.2  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3021  endonuclease I  30.34 
 
 		 553 aa  46.6  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00455766  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0468  collagenase  21.14 
 
 		 965 aa  47  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3323  collagenase  26.23 
 
 		 971 aa  45.8  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3286  collagenase  26.23 
 
 		 971 aa  45.8  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.238892  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3238  collagenase  26.23 
 
 		 1018 aa  45.8  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3584  collagenase  26.23 
 
 		 971 aa  45.8  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.629747  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3538  putative microbial collagenase  26.23 
 
 		 971 aa  45.8  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.60161e-19 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0428  peptidase M4, thermolysin  31.46 
 
 		 775 aa  45.4  0.004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2821  collagenase  26.77 
 
 		 878 aa  45.4  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.342528  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03458  cold-active serine alkaline protease  32.61 
 
 		 533 aa  45.4  0.004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0416206  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3539  collagenase, putative  26.23 
 
 		 971 aa  45.1  0.005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3027  microbial collagenase  26.83 
 
 		 878 aa  45.1  0.005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3060  collagenase  27.78 
 
 		 960 aa  44.7  0.006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0837435  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0466  microbial collagenase  27.78 
 
 		 965 aa  44.7  0.006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3299  collagenase  27.78 
 
 		 960 aa  44.7  0.006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.675823  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0486  collagenase  27.78 
 
 		 967 aa  45.1  0.006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.008095  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5655  collagenase  28.35 
 
 		 878 aa  45.1  0.006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  0.123468 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0611  putative microbial collagenase  27.78 
 
 		 965 aa  44.7  0.006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0523  collagenase,putative  27.78 
 
 		 965 aa  44.7  0.007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.415307  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3542  putative microbial collagenase  26.23 
 
 		 971 aa  44.7  0.007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>