78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C0201 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007953  Bxe_C0201  chitinase like protein  100 
 
 		 1204 aa  2444    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.137759 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1428  chitinase  36.78 
 
 		 972 aa  145  3e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0260  basic endochitinase  36.14 
 
 		 553 aa  99.8  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.361835 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0271  endochitinase  36.14 
 
 		 587 aa  98.6  6e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.527688  normal  0.775272 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0255  endochitinase  35.64 
 
 		 587 aa  97.4  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.942643 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0274  endochitinase  35.64 
 
 		 587 aa  97.4  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2254  PKD domain-containing protein  30.62 
 
 		 1011 aa  97.8  1e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000165849  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0255  endochitinase  35.64 
 
 		 587 aa  97.8  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.931196 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1101  chitinase  40.51 
 
 		 565 aa  95.1  8e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3714  PKD domain containing protein  28.99 
 
 		 1771 aa  86.7  0.000000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.333758  normal  0.0659323 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4085  chitinase A  50.67 
 
 		 699 aa  84.7  0.00000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3160  PKD repeat-containing protein  27.25 
 
 		 396 aa  83.6  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.843652  hitchhiker  0.0000187562 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0023  PKD repeat-containing protein  26.67 
 
 		 385 aa  83.2  0.00000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.347453  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0422  hypothetical protein  24.7 
 
 		 476 aa  78.2  0.0000000000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0260128  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05656  chitinase  40.19 
 
 		 565 aa  77.4  0.000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3655  glycoside hydrolase family protein  40.78 
 
 		 727 aa  77.4  0.000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0257  hypothetical protein  54.43 
 
 		 378 aa  75.9  0.000000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00548  chitinase  47.22 
 
 		 729 aa  73.2  0.00000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05899  chitinase  47.22 
 
 		 729 aa  73.2  0.00000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3605  glycosyl hydrolase family chitinase  37.5 
 
 		 792 aa  68.9  0.0000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000852085  hitchhiker  0.0070526 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2984  glycosyl hydrolase family chitinase  39.13 
 
 		 868 aa  68.6  0.0000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2805  glycosyl hydrolase family chitinase  36.55 
 
 		 868 aa  67.8  0.000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1501  peptidase-like  27.25 
 
 		 1376 aa  66.6  0.000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0114  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2888  glycosyl hydrolase family chitinase  36.04 
 
 		 868 aa  66.2  0.000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1540  chitinase  41.05 
 
 		 846 aa  65.5  0.000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.987868  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1100  glycoside hydrolase family protein  34.55 
 
 		 863 aa  65.1  0.000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.167101  normal  0.565849 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02448  protease  25.23 
 
 		 482 aa  65.1  0.000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002720  chitinase  31.55 
 
 		 848 aa  63.2  0.00000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.548595  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3196  glycosyl hydrolase family chitinase  27.21 
 
 		 861 aa  62.4  0.00000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0825971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3236  glycoside hydrolase family protein  37.86 
 
 		 868 aa  59.3  0.0000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1284  glycoside hydrolase family 18  37.86 
 
 		 868 aa  58.5  0.0000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.113127  normal  0.562085 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3083  glycoside hydrolase family 18  37.86 
 
 		 867 aa  58.5  0.0000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.204167  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3093  glycoside hydrolase family protein  37.86 
 
 		 868 aa  58.5  0.0000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.73338  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2974  PKD domain-containing protein  26.85 
 
 		 833 aa  57.4  0.000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03258  chitinase  39.47 
 
 		 846 aa  57.8  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4239  N-acetylglucosamine-binding protein A  26.42 
 
 		 471 aa  57  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.225029 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3878  chitin-binding domain 3 protein  51.85 
 
 		 391 aa  57  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.785227 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1670  PKD domain containing protein  30.49 
 
 		 635 aa  56.2  0.000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  unclonable  0.00387943  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4057  carbohydrate-binding family V/XII protein  29.3 
 
 		 600 aa  55.8  0.000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.770883  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1030  N-acetylglucosamine-binding protein A  51.92 
 
 		 481 aa  55.5  0.000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2136  chitinase  38.41 
 
 		 869 aa  55.1  0.000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000620509  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0757  endochitinase ChiA  38.75 
 
 		 846 aa  54.7  0.000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04739  N-acetylglucosamine-binding protein A  34.02 
 
 		 487 aa  54.7  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4108  N-acetylglucosamine-binding protein A  54 
 
 		 473 aa  53.9  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2824  PKD domain containing protein  26.54 
 
 		 734 aa  53.5  0.00003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4667  chitin-binding protein CbpD precursor  37.93 
 
 		 388 aa  52.8  0.00004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.353514  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1419  N-acetylglucosamine-binding protein A  47.17 
 
 		 497 aa  52.8  0.00004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.28582  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3877  chitin-binding domain 3 protein  44.44 
 
 		 390 aa  52.4  0.00005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.770078 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53250  chitin-binding protein CbpD precursor  52.17 
 
 		 389 aa  52  0.00007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.889986 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2204  PKD  29.29 
 
 		 634 aa  52  0.00008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.541832  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3390  N-acetylglucosamine-binding protein A  42.65 
 
 		 481 aa  51.2  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0338  cytochrome c5530 family protein  38.74 
 
 		 969 aa  51.2  0.0001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.808886  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3589  N-acetylglucosamine-binding protein A  49.02 
 
 		 481 aa  51.2  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05607  hypothetical protein  36.26 
 
 		 962 aa  50.8  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0636  carbohydrate-binding family V/XII protein  32.08 
 
 		 765 aa  50.1  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.393474  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3027  N-acetylglucosamine-binding protein A  47.06 
 
 		 491 aa  49.7  0.0003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.483728 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1072  N-acetylglucosamine-binding protein A  49.02 
 
 		 491 aa  50.1  0.0003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001124  chitin binding protein  46.43 
 
 		 487 aa  50.1  0.0003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.177583  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1569  helix-turn-helix, AraC type  44.26 
 
 		 1113 aa  50.1  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0947  N-acetylglucosamine-binding protein A  47.06 
 
 		 491 aa  50.1  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.809737  normal  0.0565044 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3466  N-acetylglucosamine-binding protein A  46.15 
 
 		 481 aa  50.1  0.0003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.266116  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3879  N-acetylglucosamine-binding protein A  46.15 
 
 		 477 aa  50.1  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000531215  unclonable  0.0000000195953 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0896  N-acetylglucosamine-binding protein A  47.06 
 
 		 481 aa  49.3  0.0004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1644  PKD domain containing protein  29.03 
 
 		 820 aa  49.3  0.0004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1155  xyloglucanase  30.79 
 
 		 1288 aa  48.9  0.0006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2953  periplasmic protein TonB links inner and outer membranes-like  38.53 
 
 		 1004 aa  48.9  0.0007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.5475 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1704  glycosyl hydrolase family chitinase  44.23 
 
 		 543 aa  48.5  0.0008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.861913 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0423  N-acetylglucosamine-binding protein A  48.08 
 
 		 485 aa  47.8  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0208095  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2087  DNA/RNA non-specific endonuclease  27.04 
 
 		 724 aa  47.4  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.29894  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0841  hypothetical protein  26.52 
 
 		 2416 aa  47.8  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4740  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.22 
 
 		 1217 aa  47.8  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.51333  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3305  chitin binding domain-containing protein  28.86 
 
 		 534 aa  47.4  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000109771  hitchhiker  0.000135909 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3154  chitin binding domain-containing protein  28.86 
 
 		 534 aa  47.4  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3293  chitin-binding domain-containing protein  28.86 
 
 		 534 aa  47.4  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.494487  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4457  PKD domain containing protein  27.54 
 
 		 1565 aa  46.2  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2158  NHL repeat-containing protein  27.76 
 
 		 1750 aa  46.6  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0134  N-acetylglucosamine-binding protein A  48 
 
 		 491 aa  45.4  0.007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.271889  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2887  cytochrome c family protein  38.04 
 
 		 884 aa  45.1  0.008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0141387  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>