286 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_5087 on replicon NC_007949
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007949  Bpro_5087  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 78 aa  161  3e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00000142264  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3421  transcriptional regulator, XRE family  44.12 
 
 		 154 aa  73.6  0.0000000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3593  XRE family transcriptional regulator  48.53 
 
 		 76 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.283454  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5795  putative transcription regulator  44.12 
 
 		 154 aa  68.6  0.00000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.372775  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1154  transcriptional regulator, XRE family  38.81 
 
 		 72 aa  60.1  0.00000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2573  transcriptional regulator, XRE family  38.81 
 
 		 77 aa  60.1  0.00000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0002  type II restriction-modification system activator, putative  40.91 
 
 		 75 aa  58.5  0.00000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00243501  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1878  transcriptional regulator, XRE family  41.54 
 
 		 70 aa  58.2  0.00000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2572  transcriptional regulator, XRE family  40 
 
 		 76 aa  57.4  0.00000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1921  transcriptional regulator, XRE family  38.03 
 
 		 78 aa  57  0.00000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.339052  normal  0.010603 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1155  transcriptional regulator, XRE family  40 
 
 		 76 aa  56.2  0.0000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2951  DNA-binding protein  40.98 
 
 		 186 aa  55.5  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000726653  hitchhiker  0.00000000446905 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2380  DNA-binding protein  40.98 
 
 		 186 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.801132  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_67  hypothetical protein  35.29 
 
 		 72 aa  55.5  0.0000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2228  XRE family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 197 aa  55.5  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.386344  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1555  DNA-binding protein  35.29 
 
 		 72 aa  54.7  0.0000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00000236293  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0267  XRE family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 118 aa  54.3  0.0000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.257195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0101  XRE family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 71 aa  54.3  0.0000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000391644  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0299  XRE family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 71 aa  54.3  0.0000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000289962  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0336  XRE family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 140 aa  53.1  0.000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  unclonable  0.000000000838003  normal  0.0169736 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1912  putative prophage repressor  39.34 
 
 		 196 aa  53.1  0.000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2250  DNA-binding protein  39.34 
 
 		 186 aa  52.8  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2432  DNA-binding protein  39.34 
 
 		 186 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.164998 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2170  MerR family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 186 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.22299  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2414  DNA-binding protein  39.34 
 
 		 186 aa  52.8  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2513  DNA-binding protein  39.34 
 
 		 152 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00277307  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0713  ribulose-phosphate 3-epimerase  36.67 
 
 		 81 aa  52  0.000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.625561 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2195  XRE family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 83 aa  51.2  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0679  transcriptional regulator, XRE family  40.32 
 
 		 105 aa  51.2  0.000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2305  XRE family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 130 aa  51.2  0.000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0843666 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0995  transcriptional regulator, XRE family  34.85 
 
 		 72 aa  50.8  0.000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.651052 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1136  helix-turn-helix domain-containing protein  37.29 
 
 		 77 aa  50.8  0.000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1812  XRE family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 72 aa  50.8  0.000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.330526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1574  XRE family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 57 aa  50.4  0.000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4255  transcriptional regulator, XRE family  32 
 
 		 333 aa  50.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000524025 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0914  transcriptional regulator, XRE family  35.48 
 
 		 96 aa  49.7  0.00001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0885  XRE family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 218 aa  49.7  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0891  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 106 aa  50.1  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4216  transcriptional regulator, XRE family  32 
 
 		 333 aa  50.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3248  transcriptional regulator, XRE family  38.57 
 
 		 110 aa  49.3  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2004  MerR family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 178 aa  49.3  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00158357  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4237  transcriptional regulator, XRE family  39.68 
 
 		 140 aa  49.3  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.55821  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4003  transcriptional regulator, XRE family  38.98 
 
 		 61 aa  48.9  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2524  transcriptional regulator, XRE family  37.7 
 
 		 76 aa  49.3  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000972778  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1854  DNA-binding protein  30 
 
 		 181 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.653009  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3546  DNA-binding protein  30 
 
 		 181 aa  48.1  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1831  DNA-binding protein  30 
 
 		 181 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1629  MerR family transcriptional regulator  30 
 
 		 181 aa  48.5  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000044317  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1599  MerR family transcriptional regulator  30 
 
 		 181 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1795  DNA-binding protein  30 
 
 		 181 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0273  XRE family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 176 aa  48.5  0.00003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000144131  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4136  XRE family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 78 aa  48.5  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.527123  normal  0.419565 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1906  DNA-binding protein  30 
 
 		 181 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0011859  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0275  cupin 2 domain-containing protein  32.31 
 
 		 188 aa  47.8  0.00004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000353927  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4004  transcriptional regulator, XRE family  33.87 
 
 		 181 aa  48.1  0.00004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3201  XRE family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 78 aa  48.1  0.00004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000000878656  hitchhiker  0.0000000379296 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0887  XRE family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 218 aa  48.1  0.00004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1649  XRE family transcriptional regulator  30 
 
 		 181 aa  48.1  0.00004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.176921  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5036  XRE family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 72 aa  47.8  0.00006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.899436  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0677  XRE family transcriptional regulator  28.38 
 
 		 85 aa  47.4  0.00006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00589237 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2085  XRE family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 207 aa  47.8  0.00006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.323846  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5417  XRE family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 72 aa  47.8  0.00006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.602876  normal  0.653324 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4257  transcriptional regulator, XRE family  33.82 
 
 		 189 aa  47.4  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.166003  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4589  transcriptional regulator, XRE family  33.8 
 
 		 188 aa  47  0.00008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1650  DNA-binding protein  28.57 
 
 		 181 aa  47  0.00009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000412674  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1781  DNA-binding protein  28.57 
 
 		 181 aa  47  0.00009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2483  transcriptional regulator, XRE family  33.87 
 
 		 143 aa  46.6  0.0001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0697  transcriptional regulator, XRE family  32.86 
 
 		 90 aa  46.6  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0802  transcriptional regulator, XRE family  36.23 
 
 		 106 aa  46.6  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.237035 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0791  transcriptional regulator, XRE family  40.48 
 
 		 213 aa  46.6  0.0001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  7.49267e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1135  XRE family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 99 aa  46.2  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1414  XRE family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 179 aa  46.6  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0298473 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2458  XRE family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 72 aa  46.2  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.282719  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2434  transcriptional regulator, XRE family  36.07 
 
 		 77 aa  46.6  0.0001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1301  XRE family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 96 aa  46.2  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.405872  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2792  transcriptional regulator, XRE family  44.07 
 
 		 72 aa  46.6  0.0001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0572  cupin 2 domain-containing protein  32.26 
 
 		 178 aa  45.4  0.0002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1890  XRE family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 120 aa  45.4  0.0002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00515298  normal  1 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7274  transcriptional regulator, XRE family  38.98 
 
 		 79 aa  45.8  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.21577  normal  0.150525 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0172  XRE family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 75 aa  45.8  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.134297  normal  0.353283 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0364  XRE family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 100 aa  45.4  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000740846  normal  1 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1799  transcriptional regulator, XRE family  38.6 
 
 		 78 aa  45.8  0.0002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3268  XRE family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 91 aa  45.8  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2753  XRE family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 81 aa  46.2  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0921  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 132 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000830973  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1907  XRE family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 107 aa  45.8  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0889  XRE family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 210 aa  45.8  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4268  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 		 188 aa  45.4  0.0003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1879  transcriptional regulator, XRE family  35 
 
 		 182 aa  45.4  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2927  transcriptional regulator, XRE family  35.59 
 
 		 130 aa  45.1  0.0003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.298234 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2711  XRE family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 112 aa  45.4  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.256888  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1021  DNA-binding protein  29.51 
 
 		 180 aa  45.4  0.0003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000053147  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3995  XRE family transcriptional regulator  27.94 
 
 		 120 aa  45.4  0.0003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1033  transcriptional regulator, XRE family  30.88 
 
 		 195 aa  45.4  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4019  XRE family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 72 aa  44.7  0.0004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0671372 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1871  putative HTH-type transcriptional regulator  32.84 
 
 		 215 aa  44.7  0.0004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0589891  normal  0.573197 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0274  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 		 205 aa  44.7  0.0004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.64998  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3313  transcriptional regulator, XRE family  35 
 
 		 201 aa  44.7  0.0004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3411  transcriptional regulator, XRE family  35 
 
 		 183 aa  45.1  0.0004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2435  transcriptional regulator, XRE family  31.94 
 
 		 105 aa  44.7  0.0004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>