More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_4537 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_4537  hypothetical protein  100 
 
 		 319 aa  646    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000308592  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2999  hypothetical protein  64.86 
 
 		 324 aa  409  1e-113  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.272534 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0578  hypothetical protein  59.87 
 
 		 327 aa  380  1e-104  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1547  hypothetical protein  59.47 
 
 		 324 aa  376  1e-103  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0112  hypothetical protein  54.39 
 
 		 338 aa  337  9.999999999999999e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.25815  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4779  hypothetical protein  52.16 
 
 		 324 aa  321  9.000000000000001e-87  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1128  hypothetical protein  49.37 
 
 		 324 aa  312  3.9999999999999997e-84  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.794936  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4631  hypothetical protein  50.17 
 
 		 325 aa  299  5e-80  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0744  hypothetical protein  48.99 
 
 		 325 aa  298  1e-79  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.61051  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3597  hypothetical protein  49.2 
 
 		 323 aa  293  3e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5277  hypothetical protein  47.65 
 
 		 327 aa  291  9e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.450812  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3347  hypothetical protein  45.09 
 
 		 330 aa  290  2e-77  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.261888  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5108  hypothetical protein  45.48 
 
 		 324 aa  290  3e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.031393  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4931  extra-cytoplasmic solute receptor  47.3 
 
 		 330 aa  289  6e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.875929 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1021  hypothetical protein  47.87 
 
 		 323 aa  286  2e-76  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.345353  normal  0.559311 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0688  hypothetical protein  47.02 
 
 		 326 aa  278  1e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.502545  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0441  hypothetical protein  49.66 
 
 		 322 aa  273  4.0000000000000004e-72  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0368157  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0450  hypothetical protein  49.32 
 
 		 322 aa  267  2e-70  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.697568  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  42.27 
 
 		 331 aa  263  3e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4821  hypothetical protein  44.59 
 
 		 330 aa  261  8.999999999999999e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0062  hypothetical protein  45.05 
 
 		 341 aa  259  5.0000000000000005e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0983  hypothetical protein  45.03 
 
 		 339 aa  258  7e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0200  hypothetical protein  45.08 
 
 		 349 aa  257  2e-67  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  43.92 
 
 		 328 aa  257  2e-67  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  43.92 
 
 		 328 aa  257  2e-67  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3801  hypothetical protein  43.45 
 
 		 335 aa  251  8.000000000000001e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.694709  normal  0.119002 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0161  hypothetical protein  44.11 
 
 		 330 aa  249  3e-65  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0143  hypothetical protein  44.11 
 
 		 330 aa  249  3e-65  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.627963 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4876  extra-cytoplasmic solute receptor  44.41 
 
 		 328 aa  249  5e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.748926  normal  0.754985 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0795  hypothetical protein  41.46 
 
 		 346 aa  248  1e-64  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5584  hypothetical protein  42.23 
 
 		 337 aa  248  1e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0384253  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4073  extra-cytoplasmic solute receptor  41.4 
 
 		 332 aa  247  1e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000509768  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2117  hypothetical protein  43.1 
 
 		 327 aa  247  2e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299705  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3331  hypothetical protein  43.58 
 
 		 336 aa  246  3e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5112  hypothetical protein  41.22 
 
 		 325 aa  246  4e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386337  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3271  hypothetical protein  43.92 
 
 		 338 aa  245  9e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.448127 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2570  hypothetical protein  42.22 
 
 		 339 aa  245  9e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.052781 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1578  hypothetical protein  42.53 
 
 		 395 aa  244  9.999999999999999e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00383459 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3558  hypothetical protein  41.89 
 
 		 327 aa  244  1.9999999999999999e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4422  hypothetical protein  42.72 
 
 		 352 aa  244  1.9999999999999999e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386029  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4082  hypothetical protein  42.23 
 
 		 331 aa  243  3.9999999999999997e-63  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0823  hypothetical protein  40.51 
 
 		 325 aa  242  5e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0213458 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  41.8 
 
 		 328 aa  242  6e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3983  extra-cytoplasmic solute receptor  42.27 
 
 		 328 aa  242  6e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0104878 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4611  hypothetical protein  41.46 
 
 		 332 aa  241  1e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.214044  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5894  extra-cytoplasmic solute receptor  41.14 
 
 		 358 aa  241  1e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3830  hypothetical protein  40.74 
 
 		 330 aa  241  1e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.956859  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0638  twin-arginine translocation pathway signal  40.88 
 
 		 330 aa  241  2e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5370  extra-cytoplasmic solute receptor  41.03 
 
 		 322 aa  240  2e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.114035  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3927  extra-cytoplasmic solute receptor  42.91 
 
 		 329 aa  239  2.9999999999999997e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000102175  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3664  hypothetical protein  40.79 
 
 		 324 aa  239  5e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  38.51 
 
 		 330 aa  239  5e-62  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  38.51 
 
 		 330 aa  238  8e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0060  hypothetical protein  40.2 
 
 		 322 aa  238  1e-61  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0843  hypothetical protein  40.74 
 
 		 324 aa  237  2e-61  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.593129  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4081  hypothetical protein  40.38 
 
 		 335 aa  237  2e-61  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3614  hypothetical protein  41.22 
 
 		 355 aa  236  3e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.380289  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3884  hypothetical protein  41.77 
 
 		 328 aa  236  3e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0797  hypothetical protein  43.49 
 
 		 386 aa  236  4e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4286  extra-cytoplasmatic solute receptor  40.88 
 
 		 353 aa  236  4e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.85012 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4610  hypothetical protein  40.06 
 
 		 322 aa  236  4e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0432088  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  39.55 
 
 		 327 aa  236  4e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4520  hypothetical protein  41.75 
 
 		 326 aa  236  5.0000000000000005e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3894  hypothetical protein  41.49 
 
 		 321 aa  236  5.0000000000000005e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0107663  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1885  hypothetical protein  37.69 
 
 		 323 aa  235  6e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.369065 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5278  extra-cytoplasmic solute receptor  38.69 
 
 		 331 aa  235  6e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.777708  normal  0.21823 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4280  hypothetical protein  39.51 
 
 		 333 aa  235  8e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.711918  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0842  hypothetical protein  40.88 
 
 		 325 aa  235  9e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3056  hypothetical protein  41.36 
 
 		 332 aa  235  9e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.176831  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5438  hypothetical protein  40.49 
 
 		 326 aa  235  9e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1691  hypothetical protein  42.37 
 
 		 331 aa  234  1.0000000000000001e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3868  hypothetical protein  40.88 
 
 		 324 aa  234  1.0000000000000001e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.231863  normal  0.156504 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0363  hypothetical protein  38.68 
 
 		 322 aa  234  1.0000000000000001e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.732087 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0843  hypothetical protein  40.13 
 
 		 323 aa  234  1.0000000000000001e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0159621  normal  0.161906 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  39.4 
 
 		 327 aa  234  2.0000000000000002e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4279  hypothetical protein  40.4 
 
 		 356 aa  234  2.0000000000000002e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.877893  normal  0.56539 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4213  extra-cytoplasmic solute receptor  39.44 
 
 		 326 aa  233  2.0000000000000002e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3797  twin-arginine translocation pathway signal  41.86 
 
 		 329 aa  233  3e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.800124  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0596  hypothetical protein  39.58 
 
 		 336 aa  233  3e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2127  hypothetical protein  41.32 
 
 		 332 aa  233  3e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00713348 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0599  hypothetical protein  42.76 
 
 		 325 aa  232  5e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.127348  normal  0.507852 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3216  hypothetical protein  40.45 
 
 		 332 aa  232  6e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4004  hypothetical protein  40.88 
 
 		 339 aa  232  6e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.506172  normal  0.0371737 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  40.2 
 
 		 339 aa  232  7.000000000000001e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2597  hypothetical protein  39.14 
 
 		 331 aa  231  1e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0909173  normal  0.221055 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5751  hypothetical protein  41.67 
 
 		 327 aa  231  1e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0796477  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2095  hypothetical protein  38.85 
 
 		 324 aa  230  2e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3966  hypothetical protein  38.05 
 
 		 356 aa  231  2e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0682449  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3580  hypothetical protein  40.2 
 
 		 336 aa  231  2e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.082795  normal  0.0103715 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2997  hypothetical protein  39.86 
 
 		 343 aa  231  2e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0266851  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1657  hypothetical protein  38.75 
 
 		 331 aa  229  6e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.129303  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1815  hypothetical protein  37.81 
 
 		 325 aa  228  8e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00540737  normal  0.0160042 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3949  hypothetical protein  40 
 
 		 339 aa  228  1e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.187886  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0187  hypothetical protein  39.53 
 
 		 332 aa  228  1e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2776  hypothetical protein  36.84 
 
 		 332 aa  228  1e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.918758  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1449  twin-arginine translocation pathway signal  40.07 
 
 		 331 aa  228  1e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0404058  normal  0.58438 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3214  hypothetical protein  41.45 
 
 		 323 aa  228  1e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4972  hypothetical protein  39.39 
 
 		 328 aa  227  2e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.345918  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1161  hypothetical protein  40.14 
 
 		 323 aa  227  2e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.334484  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2142  hypothetical protein  39.86 
 
 		 332 aa  227  2e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.980907  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>