228 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_4226 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_4226  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 162 aa  329  1e-89  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6695  NUDIX hydrolase  69.18 
 
 		 175 aa  229  1e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.412462  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6646  NUDIX hydrolase  37.33 
 
 		 155 aa  110  6e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2221  NUDIX hydrolase  37.25 
 
 		 146 aa  54.3  0.0000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.25917 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0815  NUDIX hydrolase  32.23 
 
 		 230 aa  52.4  0.000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5262  NUDIX hydrolase  36.19 
 
 		 240 aa  51.6  0.000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5351  NUDIX hydrolase  36.19 
 
 		 239 aa  51.6  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5641  NUDIX hydrolase  36.19 
 
 		 239 aa  51.6  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7955  hypothetical protein  48.33 
 
 		 172 aa  51.6  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1805  NUDIX hydrolase  33.65 
 
 		 253 aa  51.6  0.000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5733  NUDIX hydrolase  56.41 
 
 		 218 aa  50.1  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6512  NUDIX hydrolase  44.16 
 
 		 167 aa  49.3  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.877846  normal  0.0950137 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2885  NUDIX hydrolase  38.38 
 
 		 175 aa  49.7  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000755007  normal  0.649673 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1537  hypothetical protein  36.44 
 
 		 162 aa  48.9  0.00003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.156028  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6876  putative ATP/GTP-binding protein  55.32 
 
 		 175 aa  48.9  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2310  NUDIX hydrolase  30.83 
 
 		 138 aa  48.5  0.00004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.288899 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8547  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 156 aa  48.5  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00677981  hitchhiker  0.000239658 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1398  NUDIX hydrolase  57.14 
 
 		 153 aa  48.5  0.00004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7377  NUDIX hydrolase  34.85 
 
 		 169 aa  47.8  0.00006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3659  hypothetical protein  38.71 
 
 		 316 aa  47.8  0.00006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.817347  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0620  NUDIX hydrolase  35.85 
 
 		 282 aa  47.8  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.253457 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2415  NUDIX hydrolase  33.02 
 
 		 169 aa  47.8  0.00007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000842745  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1487  NUDIX hydrolase  45.71 
 
 		 147 aa  47  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000137627 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0183  ADP-ribose diphosphatase NudE  31.76 
 
 		 183 aa  46.6  0.0001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.572666 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2939  NUDIX hydrolase  35.94 
 
 		 130 aa  47  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15110  NUDIX family protein  33.33 
 
 		 153 aa  46.6  0.0001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3354  mutT/nudix family protein  30 
 
 		 173 aa  45.8  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0189  NUDIX hydrolase  48.94 
 
 		 161 aa  46.6  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2153  NUDIX hydrolase  43.28 
 
 		 176 aa  46.2  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.399297 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2090  NUDIX hydrolase  35.42 
 
 		 141 aa  46.6  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.147471  normal  0.280778 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0403  mutator MutT protein  41.07 
 
 		 329 aa  46.2  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0220424 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3492  NUDIX hydrolase  53.19 
 
 		 157 aa  46.2  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0590  NUDIX hydrolase  28.8 
 
 		 181 aa  46.6  0.0002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0227  mutator mutT protein/thiamine-phosphate pyrophosphorylase family protein  41.07 
 
 		 329 aa  46.2  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.199837  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001880  ADP compounds hydrolase NudE  31.82 
 
 		 189 aa  45.8  0.0003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0097  NUDIX hydrolase  37.5 
 
 		 151 aa  45.4  0.0003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1573  hypothetical protein  51.28 
 
 		 160 aa  45.8  0.0003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1166  NTP pyrophosphohydrolase  60 
 
 		 132 aa  45.4  0.0003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3049  NUDIX hydrolase  37.5 
 
 		 182 aa  45.4  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2828  mutator MutT protein  60 
 
 		 132 aa  45.4  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.623153  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1043  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 238 aa  45.4  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1025  mutator MutT protein  56.67 
 
 		 138 aa  45.4  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1939  mutator mutT protein, putative  56.67 
 
 		 138 aa  45.1  0.0004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3038  NUDIX hydrolase  40.98 
 
 		 140 aa  45.1  0.0004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.492198  normal  0.600491 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1866  putative mutator mutT protein  56.67 
 
 		 138 aa  45.1  0.0004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.452444  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0285  NUDIX hydrolase  31.76 
 
 		 164 aa  44.7  0.0005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.1016 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6631  NUDIX hydrolase  31.13 
 
 		 169 aa  44.7  0.0005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.101767 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1496  NUDIX hydrolase  34.34 
 
 		 174 aa  44.7  0.0005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.174494 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0963  NUDIX hydrolase  33.91 
 
 		 139 aa  44.7  0.0005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1757  NUDIX hydrolase  34.94 
 
 		 144 aa  45.1  0.0005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.207601  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1638  NUDIX hydrolase  30.09 
 
 		 179 aa  44.7  0.0006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0167  ADP-ribose diphosphatase NudE  38.33 
 
 		 193 aa  44.3  0.0006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1185  ADP-ribose pyrophosphatase  33.33 
 
 		 164 aa  44.7  0.0006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.792217  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0119  ADP-ribose diphosphatase NudE  39.06 
 
 		 185 aa  44.7  0.0006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00596251  normal  0.391787 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1775  NUDIX hydrolase  31.45 
 
 		 166 aa  44.7  0.0006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.108748  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4188  ADP-ribose diphosphatase NudE  38.33 
 
 		 183 aa  44.7  0.0006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0171  ADP-ribose diphosphatase NudE  38.33 
 
 		 183 aa  44.7  0.0006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0570071 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2758  NUDIX hydrolase  60 
 
 		 132 aa  44.7  0.0006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00613  ADP-ribose diphosphatase NudE  31.82 
 
 		 188 aa  44.3  0.0007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0910  NUDIX hydrolase  29.73 
 
 		 141 aa  44.3  0.0007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.479251  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3976  NTP pyrophosphohydrolase MutT family  56.67 
 
 		 135 aa  44.3  0.0007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.495493  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2596  mutator MutT protein  60 
 
 		 132 aa  44.3  0.0007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.202287  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3827  mutator MutT protein  56.67 
 
 		 137 aa  44.3  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.9578  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0064  A/G-specific adenine glycosylase  34.02 
 
 		 435 aa  44.3  0.0008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3536  mutator MutT protein  56.67 
 
 		 142 aa  44.3  0.0008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2186  NUDIX hydrolase  30.58 
 
 		 165 aa  43.9  0.0008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0794  NUDIX family hydrolase  45.45 
 
 		 171 aa  44.3  0.0008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.147035  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0058  NUDIX hydrolase  43.33 
 
 		 183 aa  44.3  0.0008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.993982  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1047  NUDIX hydrolase  46.43 
 
 		 158 aa  44.3  0.0008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0268  NUDIX hydrolase  30.1 
 
 		 165 aa  43.9  0.0009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.880251  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3914  NUDIX hydrolase  32.18 
 
 		 140 aa  43.9  0.0009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.434564 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2289  mutT/nudix family protein  38.18 
 
 		 149 aa  43.9  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.401788  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3290  NUDIX hydrolase  46.67 
 
 		 120 aa  43.5  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1221  NUDIX hydrolase  53.85 
 
 		 221 aa  43.5  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.365989  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0029  NUDIX hydrolase  56.67 
 
 		 137 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.999066 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0831  NUDIX hydrolase  46.15 
 
 		 166 aa  43.5  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.556383  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0782  MutT/nudix family protein, putative  45.45 
 
 		 171 aa  43.9  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.180522  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3407  NUDIX hydrolase  32.18 
 
 		 140 aa  43.9  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.107532 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2293  mutator MutT protein  40 
 
 		 129 aa  43.5  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.192428  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1300  NUDIX family hydrolase  54.29 
 
 		 118 aa  43.5  0.001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.898276  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1103  NUDIX hydrolase  46.94 
 
 		 169 aa  43.9  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0237  NUDIX hydrolase  60 
 
 		 146 aa  43.9  0.001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.135862 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24710  ADP-ribose pyrophosphatase  42.55 
 
 		 255 aa  43.5  0.001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3658  mutator MutT protein  53.12 
 
 		 135 aa  43.5  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.236932  normal  0.362443 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3028  NUDIX hydrolase  30.56 
 
 		 174 aa  43.1  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0037  NUDIX hydrolase  53.12 
 
 		 229 aa  42.4  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2286  mutT/nudix family protein  38.18 
 
 		 149 aa  43.1  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.02194e-25 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2105  mutT/nudix family protein  38.18 
 
 		 140 aa  43.1  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2044  MutT/Nudix family protein  38.18 
 
 		 149 aa  43.1  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00937843  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3081  mutT/nudix family protein  38.18 
 
 		 149 aa  43.1  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000075135 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1932  NUDIX hydrolase  51.28 
 
 		 221 aa  42.7  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00450491 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2285  NUDIX hydrolase  43.33 
 
 		 178 aa  43.1  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2371  mutT/nudix family protein  38.18 
 
 		 149 aa  43.1  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0511564  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0117  ADP-ribose diphosphatase NudE  40 
 
 		 195 aa  42.7  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3015  NUDIX hydrolase  30.93 
 
 		 351 aa  42.4  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.771324  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0924  NUDIX hydrolase  29.37 
 
 		 133 aa  42.7  0.002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0620  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  40 
 
 		 132 aa  43.1  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00509721  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2607  NUDIX hydrolase  58.82 
 
 		 157 aa  42.7  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0976086 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2202  NUDIX hydrolase  34.62 
 
 		 143 aa  42.7  0.002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2482  NUDIX hydrolase  43.18 
 
 		 138 aa  42.7  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>