More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_03550 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_03550  hypothetical protein  100 
 
 		 451 aa  907    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13850  hypothetical protein  62.47 
 
 		 437 aa  527  1e-148  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.0000318209  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1922  hypothetical protein  54.18 
 
 		 446 aa  469  1.0000000000000001e-131  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2162  hypothetical protein  55.17 
 
 		 434 aa  469  1.0000000000000001e-131  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.335606  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2253  hypothetical protein  54.42 
 
 		 441 aa  465  9.999999999999999e-131  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.630202  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1905  hypothetical protein  54.25 
 
 		 434 aa  461  1e-129  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000097088 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2015  peptidase M20  55.95 
 
 		 442 aa  450  1e-125  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.251609  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1474  peptidase M20  54.65 
 
 		 438 aa  445  1.0000000000000001e-124  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.739931  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17060  hypothetical protein  54.18 
 
 		 439 aa  446  1.0000000000000001e-124  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.760831 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4882  hypothetical protein  54.81 
 
 		 443 aa  444  1e-123  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.76417  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1192  hypothetical protein  51.48 
 
 		 439 aa  439  9.999999999999999e-123  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0330579  normal  0.0773998 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21030  acetylornithine deacetylase/succinyldiaminopimelate desuccinylase-like deacylase  52.61 
 
 		 445 aa  432  1e-120  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.575645 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11770  hypothetical protein  52.87 
 
 		 441 aa  434  1e-120  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.235527  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2768  hypothetical protein  51.61 
 
 		 449 aa  431  1e-119  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000530587  hitchhiker  0.000231767 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4547  peptidase M20  51.95 
 
 		 440 aa  426  1e-118  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3473  peptidase M20  51.49 
 
 		 432 aa  422  1e-117  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.407843  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9227  peptidase M20  50.23 
 
 		 435 aa  417  9.999999999999999e-116  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4949  peptidase M20  49.22 
 
 		 440 aa  417  9.999999999999999e-116  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.138857  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3037  hypothetical protein  53.23 
 
 		 451 aa  408  1e-113  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2654  hypothetical protein  48.98 
 
 		 452 aa  408  1e-113  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0469483  normal  0.0556402 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2787  hypothetical protein  49.32 
 
 		 433 aa  405  1.0000000000000001e-112  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3489  hypothetical protein  53.54 
 
 		 430 aa  407  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.919761 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2159  hypothetical protein  47.5 
 
 		 442 aa  402  1e-111  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3176  hypothetical protein  49.89 
 
 		 444 aa  402  1e-111  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.168778  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4903  hypothetical protein  48.53 
 
 		 462 aa  402  1e-111  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0308008  normal  0.0833293 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2313  hypothetical protein  48.41 
 
 		 442 aa  404  1e-111  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00701703 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3164  hypothetical protein  50.11 
 
 		 444 aa  405  1e-111  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.258961  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3226  hypothetical protein  50.11 
 
 		 444 aa  405  1e-111  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.236057  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12171  hypothetical protein  49.21 
 
 		 450 aa  400  9.999999999999999e-111  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.744068 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1165  hypothetical protein  48.53 
 
 		 429 aa  400  9.999999999999999e-111  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0235842  normal  0.624672 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2647  peptidase M20  49.66 
 
 		 442 aa  395  1e-109  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.490872  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2654  peptidase M20  49.2 
 
 		 443 aa  397  1e-109  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2128  peptidase M20  49.88 
 
 		 446 aa  397  1e-109  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.797778  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3604  peptidase M20  48.18 
 
 		 434 aa  398  1e-109  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.682601  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7887  hypothetical protein  48.02 
 
 		 444 aa  389  1e-107  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0760347  normal  0.0510662 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2619  hypothetical protein  49.43 
 
 		 444 aa  388  1e-107  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.913218  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2433  peptidase M20  50 
 
 		 448 aa  387  1e-106  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00897679  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19930  hypothetical protein  45.5 
 
 		 434 aa  362  8e-99  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.000000770232  decreased coverage  0.0000700572 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3160  peptidase M20  44.95 
 
 		 421 aa  352  7e-96  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.119571  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3211  peptidase M20  45.01 
 
 		 468 aa  335  1e-90  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3468  hypothetical protein  46.1 
 
 		 428 aa  331  2e-89  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6756  hypothetical protein  41.99 
 
 		 468 aa  325  7e-88  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.557555  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4600  peptidase M20  32.18 
 
 		 473 aa  172  1e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34350  acetylornithine deacetylase/succinyldiaminopimelate desuccinylase-like deacylase  33.26 
 
 		 477 aa  165  2.0000000000000002e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.174691  normal  0.112018 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5867  peptidase M20  31.46 
 
 		 434 aa  161  2e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1781  hypothetical protein  29.68 
 
 		 485 aa  159  1e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1820  hypothetical protein  32.44 
 
 		 494 aa  155  2e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0141  hypothetical protein  31.63 
 
 		 468 aa  150  6e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0813471  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3665  hypothetical protein  28.98 
 
 		 478 aa  148  2.0000000000000003e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0248  hypothetical protein  28.06 
 
 		 469 aa  145  1e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1670  hypothetical protein  30.87 
 
 		 467 aa  145  1e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0904676  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3309  hypothetical protein  28.54 
 
 		 472 aa  139  7e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0974288  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0989  hypothetical protein  28.01 
 
 		 476 aa  133  5e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.306467 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6284  peptidase M20  32.12 
 
 		 489 aa  129  1.0000000000000001e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2425  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  30.84 
 
 		 433 aa  124  3e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0216  hypothetical protein  28.12 
 
 		 457 aa  122  9.999999999999999e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.675958  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0450  hypothetical protein  26.29 
 
 		 477 aa  122  1.9999999999999998e-26  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000307009  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0416  hypothetical protein  28.86 
 
 		 493 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1037  peptidase M20  29.5 
 
 		 497 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3448  peptidase M20  30.82 
 
 		 419 aa  116  6.9999999999999995e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0695  hypothetical protein  28.39 
 
 		 493 aa  116  6.9999999999999995e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0107  hypothetical protein  28.78 
 
 		 493 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0982  hypothetical protein  27.85 
 
 		 508 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3615  hypothetical protein  30.03 
 
 		 494 aa  109  1e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00365  hypothetical protein  28.03 
 
 		 510 aa  108  2e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.174414  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1441  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.41 
 
 		 404 aa  105  1e-21  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1231  peptidase M20  27.94 
 
 		 485 aa  106  1e-21  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0553  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.2 
 
 		 413 aa  104  4e-21  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0770776 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0193  diaminopimelate aminotransferase  28.77 
 
 		 421 aa  103  4e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000572443  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2924  hypothetical protein  28.21 
 
 		 491 aa  102  1e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0110  hypothetical protein  28.47 
 
 		 549 aa  102  1e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.12324  normal  0.549417 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3627  hypothetical protein  26.8 
 
 		 507 aa  101  3e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.401936  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4704  hypothetical protein  26.8 
 
 		 507 aa  101  3e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0146867 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0180  diaminopimelate aminotransferase  26.85 
 
 		 415 aa  99.4  1e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.00038111  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_15083  predicted protein  27.34 
 
 		 374 aa  98.6  2e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4262  hypothetical protein  25.57 
 
 		 487 aa  99  2e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1103  diaminopimelate aminotransferase  23.83 
 
 		 407 aa  98.2  3e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2796  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  29.19 
 
 		 397 aa  96.7  8e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.884075 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1810  diaminopimelate aminotransferase  31.08 
 
 		 410 aa  96.3  1e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.803619  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0041  hypothetical protein  26.72 
 
 		 493 aa  96.3  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1905  acetylornithine deacetylase  30.82 
 
 		 397 aa  95.9  1e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.119437  normal  0.233853 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1125  diaminopimelate aminotransferase  28.31 
 
 		 396 aa  95.9  1e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000017221  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1641  acetylornithine deacetylase  30.15 
 
 		 397 aa  95.5  2e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.204001 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3753  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  29.18 
 
 		 387 aa  94.7  3e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.518187  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0268  acetylornithine deacetylase (ArgE)  27.23 
 
 		 398 aa  94.7  3e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.305714  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1576  acetylornithine deacetylase  30.5 
 
 		 397 aa  94  5e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.398543  normal  0.0213097 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4389  hypothetical protein  27.82 
 
 		 440 aa  94  6e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1275  diaminopimelate aminotransferase  26.61 
 
 		 415 aa  93.2  8e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.000199982  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0643  diaminopimelate aminotransferase  25.14 
 
 		 415 aa  93.2  9e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.166626  hitchhiker  0.00154424 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0113  diaminopimelate aminotransferase  27.33 
 
 		 413 aa  93.2  9e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.239854  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1065  hypothetical protein  24.37 
 
 		 490 aa  92.8  1e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.961267 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8178  peptidase M20  27.49 
 
 		 373 aa  91.7  3e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0709  diaminopimelate aminotransferase  25 
 
 		 415 aa  90.9  4e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.123026  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0234  diaminopimelate aminotransferase  23.53 
 
 		 411 aa  89.7  9e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00102405  normal  0.710692 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1163  diaminopimelate aminotransferase  27.65 
 
 		 396 aa  89.4  1e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00430339  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0836  diaminopimelate aminotransferase  23.41 
 
 		 423 aa  88.2  3e-16  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.0000246987  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2580  acetylornithine deacetylase or succinyl- diaminopimelate desuccinylase  30.19 
 
 		 357 aa  87.8  4e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1025  peptidase M20  34.01 
 
 		 362 aa  86.7  7e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2769  peptidase M20  27.87 
 
 		 399 aa  86.7  9e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.728292  normal  0.0329756 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0748  hypothetical protein  27.59 
 
 		 465 aa  86.3  0.000000000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000168707  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>