More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B1469 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B1469  outer membrane protein (porin)-like  100 
 
 		 360 aa  721    Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00910235  normal  0.207544 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0804  OmpC family outer membrane porin  61.18 
 
 		 363 aa  433  1e-120  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.554989  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6317  outer membrane protein, (porin)  56.36 
 
 		 358 aa  393  1e-108  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2963  porin  55.49 
 
 		 358 aa  386  1e-106  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2878  porin  54.85 
 
 		 358 aa  383  1e-105  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.636826 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3015  porin  54.85 
 
 		 358 aa  383  1e-105  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2968  porin  55.18 
 
 		 358 aa  383  1e-105  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2988  porin  55.18 
 
 		 358 aa  383  1e-105  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2354  porin  55.18 
 
 		 358 aa  383  1e-105  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.296881  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0154  porin  51.63 
 
 		 367 aa  380  1e-104  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.167447  normal  0.122543 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0429  porin Gram-negative type  55.62 
 
 		 361 aa  378  1e-104  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.568653 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4279  OmpC family outer membrane porin  55.32 
 
 		 361 aa  374  1e-102  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.115808 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0343  outer membrane porin  54.27 
 
 		 358 aa  371  1e-102  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0355  outer membrane porin  54.27 
 
 		 358 aa  370  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.17583  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0534  putative outer membrane porin protein precursor  54.27 
 
 		 387 aa  370  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0511105  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0305  outer membrane porin  53.33 
 
 		 358 aa  371  1e-101  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.460177  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5685  porin  50.6 
 
 		 357 aa  330  2e-89  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.523942  normal  0.0446871 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5908  porin  50.3 
 
 		 357 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.359102  decreased coverage  0.00179215 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3719  porin Gram-negative type  46.44 
 
 		 352 aa  298  7e-80  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0865217  normal  0.777538 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4796  porin Gram-negative type  46.44 
 
 		 352 aa  298  7e-80  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0944571 
 
 
-
 
NC_003296  RS00714  porin precursor transmembrane protein  47.43 
 
 		 351 aa  296  5e-79  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000654265  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1939  porin Gram-negative type  47.26 
 
 		 356 aa  290  2e-77  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.173023  normal  0.0269425 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2262  porin Gram-negative type  46.04 
 
 		 356 aa  284  1.0000000000000001e-75  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.865753  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2439  porin  41.24 
 
 		 359 aa  250  2e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3020  outer membrane protein (porin)  39.55 
 
 		 365 aa  250  2e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.377594 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0880  porin  41.81 
 
 		 361 aa  248  2e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0359628  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0153  porin Gram-negative type  41.79 
 
 		 344 aa  231  1e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0438  OmpC family outer membrane porin  40.17 
 
 		 344 aa  229  8e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.513218  normal  0.842946 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4258  porin  38.15 
 
 		 344 aa  215  9e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0937831  hitchhiker  0.000204948 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6742  porin  36.99 
 
 		 357 aa  196  7e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3229  porin  36.64 
 
 		 357 aa  194  2e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.484687 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4931  porin  36.64 
 
 		 357 aa  194  2e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1564  porin  36.44 
 
 		 357 aa  191  2e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.247151  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2920  porin  37.95 
 
 		 342 aa  191  2e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.281008 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6266  porin  36.44 
 
 		 357 aa  191  2e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1795  porin  36.44 
 
 		 362 aa  185  1.0000000000000001e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1479  porin Gram-negative type  35.89 
 
 		 341 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2452  porin Gram-negative type  37.98 
 
 		 340 aa  182  9.000000000000001e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5435  porin precursor transmembrane protein  38.32 
 
 		 332 aa  172  5.999999999999999e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1125  porin  37.35 
 
 		 341 aa  169  6e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7659  outer membrane protein (porin)  36.87 
 
 		 340 aa  168  1e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.24829  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05376  porin signal peptide protein  32.86 
 
 		 368 aa  117  3e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0326647 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0650  porin  29.84 
 
 		 369 aa  117  3e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  unclonable  0.000000349197  normal  0.162286 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0649  porin  31.44 
 
 		 344 aa  116  7.999999999999999e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.000220947  normal  0.240142 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1937  porin  30.86 
 
 		 386 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0139631 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4787  porin  31.15 
 
 		 357 aa  110  3e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0681178  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1338  porin  30.71 
 
 		 386 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.490298  normal  0.0334295 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3117  porin  32.4 
 
 		 360 aa  110  5e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.482889  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1357  porin  30.71 
 
 		 386 aa  109  6e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0495362  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0875  porin  30.71 
 
 		 386 aa  109  6e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0148  outer membrane protein (porin)  33.53 
 
 		 350 aa  108  1e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.268856 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5510  porin  33.53 
 
 		 350 aa  108  2e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2734  outer membrane protein (porin)  30.68 
 
 		 362 aa  108  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00626959  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5351  porin  33.53 
 
 		 350 aa  108  2e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0829  OmpC family outer membrane porin  32.93 
 
 		 362 aa  108  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0039007  normal  0.098536 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4762  porin  33.82 
 
 		 350 aa  108  2e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.821427  normal  0.658294 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1601  porin  32.05 
 
 		 374 aa  107  3e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.32825  normal  0.100291 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1240  porin  30.45 
 
 		 386 aa  107  3e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.382217  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1266  porin  30.45 
 
 		 386 aa  107  4e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.162269 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2894  OmpC family outer membrane porin  30.29 
 
 		 387 aa  107  5e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.33569  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0388  OmpC family outer membrane porin  30.03 
 
 		 384 aa  106  5e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.62464  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6406  porin Gram-negative type  30.16 
 
 		 381 aa  106  6e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6734  outer membrane protein (porin)  31.82 
 
 		 394 aa  106  7e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0780973  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0215  outer membrane porin OpcP  32.22 
 
 		 382 aa  106  7e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5219  porin  32.22 
 
 		 362 aa  106  8e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.10924  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4500  outer membrane protein, (porin)  29.97 
 
 		 386 aa  105  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.048827  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0527  porin  31.4 
 
 		 352 aa  104  2e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.0023989  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6067  porin  32.12 
 
 		 362 aa  104  3e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0168259  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3210  porin Gram-negative type  31.7 
 
 		 375 aa  104  3e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.114966  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3381  porin  32.04 
 
 		 362 aa  103  4e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.573075  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6321  porin  29.92 
 
 		 394 aa  103  4e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00119227  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6618  porin Gram-negative type  31.76 
 
 		 350 aa  103  5e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3435  porin  31.74 
 
 		 362 aa  103  5e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1582  porin  31.44 
 
 		 374 aa  102  7e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0636869  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2270  outer membrane porin OpcP  37.28 
 
 		 386 aa  102  7e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.272228  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0724  porin  30.61 
 
 		 348 aa  102  8e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5138  porin  31.08 
 
 		 396 aa  102  1e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0176797  normal  0.966332 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6771  porin Gram-negative type  30 
 
 		 379 aa  102  1e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0165431  normal  0.243338 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0620  OmpC family outer membrane porin  30.68 
 
 		 383 aa  102  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0145861 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2103  outer membrane protein (porin)  31.23 
 
 		 385 aa  101  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.938895  normal  0.317864 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3460  OmpC family outer membrane porin  29.38 
 
 		 383 aa  101  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.460184 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1228  OmpC family outer membrane porin  29.46 
 
 		 387 aa  101  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.208027 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4082  porin  30.7 
 
 		 362 aa  101  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0820071  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4291  porin Gram-negative type  29.12 
 
 		 383 aa  100  3e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.407078  normal  0.139177 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5115  porin Gram-negative type  30.25 
 
 		 335 aa  100  4e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0274682 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0528  porin  30.3 
 
 		 338 aa  100  4e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  unclonable  0.000000423032  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6127  porin  32.08 
 
 		 355 aa  99.8  6e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000616948  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2783  porin Gram-negative type  30.3 
 
 		 354 aa  99.8  7e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0106499  normal  0.0987784 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4962  porin Gram-negative type  30.3 
 
 		 354 aa  99.8  7e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0589815  normal  0.0680007 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3605  OmpC family outer membrane porin  31.4 
 
 		 355 aa  99.8  7e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000104312  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1413  OmpC family outer membrane porin  30.23 
 
 		 379 aa  99.4  9e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  unclonable  7.59024e-18  normal  0.238821 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2074  porin  31.04 
 
 		 360 aa  99  1e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3210  porin Gram-negative type  32.31 
 
 		 368 aa  98.6  1e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4522  porin  31.19 
 
 		 359 aa  99  1e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.243199  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2282  porin  36.77 
 
 		 357 aa  99  1e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0486  putative outer membrane porin  30.39 
 
 		 380 aa  98.2  2e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2123  outer membrane porin  30.39 
 
 		 380 aa  98.2  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0695  putative outer membrane porin  30.39 
 
 		 383 aa  97.8  2e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.336216  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2596  outer membrane protein (porin)  30.54 
 
 		 394 aa  97.8  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.121818  normal  0.826149 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5740  porin Gram-negative type  30.25 
 
 		 403 aa  98.2  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.917391  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>