More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_0897 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_0897  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
447 aa  836    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0894914  normal  0.147269 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4019  major facilitator superfamily MFS_1  66.82 
 
 
435 aa  498  1e-139  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000381325  normal  0.201783 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2255  major facilitator superfamily MFS_1  61.3 
 
 
473 aa  485  1e-136  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1377  major facilitator superfamily MFS_1  66.44 
 
 
445 aa  486  1e-136  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29790  sugar phosphate permease  59.27 
 
 
485 aa  475  1e-133  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21330  sugar phosphate permease  60.94 
 
 
477 aa  449  1e-125  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.428425  hitchhiker  0.00018034 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0245  putative permease  54.87 
 
 
449 aa  409  1e-113  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0461827  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1482  major facilitator superfamily MFS_1  49.64 
 
 
451 aa  378  1e-103  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000115751  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2413  major facilitator transporter  46.74 
 
 
447 aa  369  1e-101  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000787137  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5212  major facilitator transporter  45.52 
 
 
399 aa  350  3e-95  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000114177  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5543  major facilitator family transporter  45.04 
 
 
399 aa  348  1e-94  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000723204  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1523  major facilitator transporter  47.7 
 
 
438 aa  348  1e-94  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.295641  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5409  major facilitator family transporter  44.79 
 
 
399 aa  347  2e-94  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000725853  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5547  major facilitator family transporter  44.74 
 
 
399 aa  346  4e-94  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000869498  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5271  major facilitator family transporter  44.79 
 
 
399 aa  345  7e-94  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000222558  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5098  major facilitator family transporter  44.79 
 
 
399 aa  345  7e-94  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.20566e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5668  major facilitator family transporter  44.79 
 
 
399 aa  345  7e-94  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000000480591  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5513  major facilitator family transporter  44.79 
 
 
399 aa  345  7e-94  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5115  major facilitator family transporter  44.79 
 
 
399 aa  345  8e-94  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000159613  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5599  major facilitator family transporter  45.04 
 
 
399 aa  345  1e-93  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000105464  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3933  major facilitator transporter  44.79 
 
 
399 aa  345  1e-93  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000233422  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3497  major facilitator superfamily MFS_1  47.86 
 
 
398 aa  343  4e-93  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3374  major facilitator superfamily MFS_1  46.8 
 
 
398 aa  342  7e-93  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000527195  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2078  major facilitator superfamily MFS_1  44.83 
 
 
404 aa  324  2e-87  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5172  major facilitator transporter  41.39 
 
 
474 aa  291  1e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0809503 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5109  major facilitator transporter  41.39 
 
 
474 aa  291  1e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3259  major facilitator transporter  41.39 
 
 
474 aa  290  3e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.331503  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3242  major facilitator superfamily MFS_1  73.39 
 
 
539 aa  289  6e-77  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00325514  normal  0.76951 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2088  major facilitator superfamily MFS_1  41.42 
 
 
456 aa  288  2e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.565943 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5053  major facilitator superfamily MFS_1  39.82 
 
 
472 aa  286  4e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.122247 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0539  major facilitator transporter  41.16 
 
 
473 aa  286  7e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1595  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  40.18 
 
 
472 aa  283  5.000000000000001e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4638  major facilitator superfamily MFS_1  35.46 
 
 
451 aa  279  6e-74  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000178504  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3533  major facilitator transporter  41.61 
 
 
473 aa  278  1e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02027  metabolite transporter  39.15 
 
 
476 aa  275  1.0000000000000001e-72  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.158134 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0670  general substrate transporter  36.43 
 
 
459 aa  273  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.753041 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19270  putative MFS transporter  35.57 
 
 
455 aa  271  2e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.149627  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3311  major facilitator transporter  38.43 
 
 
474 aa  268  2e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.799238  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1875  major facilitator transporter  41.71 
 
 
459 aa  262  8e-69  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.473892  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0379  major facilitator family transporter  40.45 
 
 
478 aa  262  1e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1660  MFS family transporter  35.73 
 
 
455 aa  261  1e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4651  major facilitator superfamily MFS_1  40.34 
 
 
470 aa  262  1e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5178  major facilitator transporter  36.92 
 
 
457 aa  261  2e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8056  major facilitator superfamily MFS_1  37.9 
 
 
451 aa  259  8e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1431  major facilitator family transporter  40.22 
 
 
478 aa  258  1e-67  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.475934  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0471  major facilitator family transporter  40.22 
 
 
478 aa  258  1e-67  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0177  major facilitator family transporter  40.22 
 
 
478 aa  258  1e-67  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1931  major facilitator superfamily permease  40 
 
 
478 aa  258  2e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0979116  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1841  major facilitator family transporter  40 
 
 
478 aa  258  2e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0911  major facilitator family transporter  40 
 
 
478 aa  257  3e-67  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.577596  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2754  major facilitator superfamily MFS_1  40.2 
 
 
465 aa  256  5e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.182715  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2073  major facilitator superfamily transporter  38.53 
 
 
467 aa  254  2.0000000000000002e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0013865 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0547  major facilitator superfamily transporter  37.9 
 
 
456 aa  253  5.000000000000001e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.392915  normal  0.285749 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1992  major facilitator transporter  40.05 
 
 
436 aa  241  2e-62  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.252047  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1326  major facilitator transporter  42.04 
 
 
464 aa  241  2e-62  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.367254  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1856  major facilitator transporter  36.12 
 
 
438 aa  238  2e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3924  major facilitator superfamily transporter  35.28 
 
 
438 aa  236  5.0000000000000005e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.496152  normal  0.0457831 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1414  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  37.04 
 
 
468 aa  236  7e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000198546  normal  0.095851 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0911  major facilitator superfamily permease  34.3 
 
 
388 aa  232  1e-59  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000338401  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4993  MFS family membrane efflux protein  35.81 
 
 
526 aa  230  4e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.521864 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1543  major facilitator transporter  38.35 
 
 
382 aa  229  5e-59  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0259552 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1561  major facilitator transporter  35 
 
 
509 aa  228  2e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.141298  normal  0.174962 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3564  major facilitator transporter  39.1 
 
 
436 aa  228  2e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1671  major facilitator transporter  39.06 
 
 
381 aa  226  5.0000000000000005e-58  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    decreased coverage  0.0000914056 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0532  major facilitator family transporter  36.9 
 
 
436 aa  225  1e-57  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0462  major facilitator family transporter  36.9 
 
 
436 aa  225  1e-57  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.450318  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1683  major facilitator transporter  39.47 
 
 
415 aa  224  2e-57  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.249309  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2518  major facilitator transporter  37.17 
 
 
437 aa  224  2e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2900  major facilitator transporter  36.06 
 
 
514 aa  223  6e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.473738  normal  0.0138886 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1076  major facilitator transporter  38.77 
 
 
382 aa  209  8e-53  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.197988  normal  0.0589295 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5083  major facilitator transporter  36.52 
 
 
437 aa  209  1e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.418338  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1010  major facilitator family transporter  40.5 
 
 
398 aa  206  7e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1972  major facilitator transporter  39.09 
 
 
372 aa  205  1e-51  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.106436  hitchhiker  0.000000141049 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0285  major facilitator superfamily sugar transporter  33.67 
 
 
464 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.192742  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1548  major facilitator superfamily MFS_1  34.11 
 
 
380 aa  195  1e-48  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1266  major facilitator transporter  33.99 
 
 
422 aa  194  3e-48  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.693096  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0090  major facilitator transporter  32.77 
 
 
422 aa  193  6e-48  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000497214  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1189  major facilitator transporter  33.74 
 
 
422 aa  192  1e-47  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00252456  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1166  major facilitator superfamily MFS_1  34.29 
 
 
450 aa  187  4e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000374507 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1414  major facilitator transporter  31.41 
 
 
424 aa  183  5.0000000000000004e-45  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04490  sugar phosphate permease  37.96 
 
 
469 aa  182  1e-44  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6200  major facilitator transporter  30.84 
 
 
492 aa  179  1e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0622411 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4040  major facilitator transporter  33.71 
 
 
435 aa  179  1e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.248694  decreased coverage  0.0016848 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3655  major facilitator superfamily MFS_1  28.76 
 
 
447 aa  178  2e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.304643  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5172  major facilitator superfamily MFS_1  34.06 
 
 
466 aa  176  5e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3653  major facilitator superfamily MFS_1  28.92 
 
 
446 aa  172  7.999999999999999e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1089  major facilitator transporter  33.1 
 
 
450 aa  172  1e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.10347  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6205  major facilitator superfamily MFS_1  33.62 
 
 
471 aa  171  2e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0914  major facilitator transporter  33.17 
 
 
434 aa  171  3e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00481205  normal  0.205021 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1633  general substrate transporter  28.9 
 
 
476 aa  170  4e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.904084  normal  0.408822 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0828  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  33.33 
 
 
450 aa  170  5e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.420618  normal  0.255495 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0613  major facilitator superfamily MFS_1  33.17 
 
 
473 aa  169  1e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0274336 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0967  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  32.06 
 
 
462 aa  168  2e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0528  major facilitator transporter  33.94 
 
 
467 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0826405  hitchhiker  0.00770286 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4090  major facilitator superfamily metabolite(sugar)/H(+) symporter  33.4 
 
 
471 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.94274  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3410  major facilitator superfamily MFS_1  31.66 
 
 
484 aa  166  9e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5470  major facilitator transporter  31.11 
 
 
461 aa  165  1.0000000000000001e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0970  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  33.58 
 
 
470 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00262609  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0434  major facilitator superfamily MFS_1  30.51 
 
 
446 aa  165  1.0000000000000001e-39  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000104713  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1996  major facilitator superfamily MFS_1  34.21 
 
 
485 aa  165  2.0000000000000002e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.512683 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>