251 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_1428 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013457  VEA_000945  chitinase  45.47 
 
 		 848 aa  665    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1284  glycoside hydrolase family 18  47.95 
 
 		 868 aa  711    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.113127  normal  0.562085 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3093  glycoside hydrolase family protein  48.07 
 
 		 868 aa  714    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.73338  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1100  glycoside hydrolase family protein  47.36 
 
 		 863 aa  723    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.167101  normal  0.565849 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2136  chitinase  46.92 
 
 		 869 aa  709    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000620509  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2805  glycosyl hydrolase family chitinase  48.02 
 
 		 868 aa  703    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2888  glycosyl hydrolase family chitinase  46.94 
 
 		 868 aa  668    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1428  chitinase  100 
 
 		 972 aa  1985    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06955  chitinase  45.36 
 
 		 855 aa  684    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2984  glycosyl hydrolase family chitinase  47.71 
 
 		 868 aa  697    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3236  glycoside hydrolase family protein  48.07 
 
 		 868 aa  713    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3083  glycoside hydrolase family 18  48.31 
 
 		 867 aa  720    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.204167  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0106  chitinase  47.87 
 
 		 848 aa  678    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0137  chitinase  53.11 
 
 		 563 aa  570  1e-161  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3870  glycosyl hydrolase family chitinase  43.16 
 
 		 1271 aa  361  3e-98  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.762403  normal  0.150806 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06254  chitinase  33.57 
 
 		 431 aa  228  3e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3196  glycosyl hydrolase family chitinase  28.53 
 
 		 861 aa  226  2e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0825971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0373  glycoside hydrolase family protein  29.79 
 
 		 674 aa  206  2e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0428  chitinase B  29.5 
 
 		 674 aa  203  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0362  chitinase  29.66 
 
 		 674 aa  202  1.9999999999999998e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0371  chitinase B  29.48 
 
 		 674 aa  201  5e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0359  chitinase  29.48 
 
 		 674 aa  201  5e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0385  chitinase B  29.48 
 
 		 674 aa  201  5e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0497  chitinase B  29.29 
 
 		 674 aa  200  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0450  chitinase B  28.96 
 
 		 674 aa  200  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.650007  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0498  chitinase B  29.11 
 
 		 674 aa  198  4.0000000000000005e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0366  glycoside hydrolase family protein  29.11 
 
 		 674 aa  198  4.0000000000000005e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4874  chitinase B  28.6 
 
 		 674 aa  197  6e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0360  glycoside hydrolase family 18  30.99 
 
 		 652 aa  182  2e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0020  exochitinase  28.23 
 
 		 699 aa  178  4e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.410319 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13161  hypothetical protein  31.38 
 
 		 1080 aa  178  5e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.421524 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0542  glycoside hydrolase family 18  32.73 
 
 		 703 aa  177  9.999999999999999e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.218928  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0019  exochitinase  28.06 
 
 		 699 aa  176  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.88911 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0020  exochitinase  28.06 
 
 		 699 aa  176  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.871167  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0021  exochitinase  28.06 
 
 		 699 aa  175  2.9999999999999996e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.822563  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG01720  cytoplasm protein, putative  32.43 
 
 		 505 aa  174  6.999999999999999e-42  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.256066  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0020  exochitinase  28.01 
 
 		 699 aa  172  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.857408  normal  0.13273 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7591  Chitinase-like protein  31.05 
 
 		 854 aa  166  2.0000000000000002e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0192661  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1472  Chitinase  30.79 
 
 		 540 aa  164  7e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4160  glycoside hydrolase family 18  28.57 
 
 		 762 aa  162  2e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.299546 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2175  Chitinase  28.88 
 
 		 639 aa  157  8e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0270  glycoside hydrolase family protein  29.18 
 
 		 484 aa  157  1e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1800  glycoside hydrolase family protein  25.88 
 
 		 652 aa  155  4e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0348048  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6206  glycoside hydrolase family 18  30.38 
 
 		 536 aa  155  5e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8171  endo-chitinase, putative, chi18D  30.19 
 
 		 532 aa  154  5e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.714461 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04871  ChitinasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q92222]  28.82 
 
 		 398 aa  154  8e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.207138 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2750  chitinase  29.01 
 
 		 521 aa  154  8e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3258  glycoside hydrolase family protein  30 
 
 		 540 aa  154  1e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.260959  normal  0.616625 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1550  glycoside hydrolase family 18  28.47 
 
 		 482 aa  152  2e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0322184  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3605  glycosyl hydrolase family chitinase  30.38 
 
 		 792 aa  153  2e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000852085  hitchhiker  0.0070526 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1345  glycoside hydrolase family 18  33.45 
 
 		 377 aa  150  1.0000000000000001e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3356  Chitinase  33.76 
 
 		 373 aa  149  2.0000000000000003e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.934755  normal  0.141475 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3086  glycoside hydrolase family 18  31.93 
 
 		 388 aa  149  3e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.800221  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3485  chitinase  29.76 
 
 		 539 aa  148  4.0000000000000006e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.686156  normal  0.0640253 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0201  chitinase like protein  36.78 
 
 		 1204 aa  148  4.0000000000000006e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.137759 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7134  Chitinase-like protein  28.67 
 
 		 662 aa  146  1e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0361  glycoside hydrolase family 18  27.13 
 
 		 559 aa  147  1e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1381  Chitinase  28.98 
 
 		 651 aa  146  2e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.456861  normal  0.0706322 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3591  chitinase  35.92 
 
 		 401 aa  146  2e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.21404 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6397  Chitinase  29.14 
 
 		 430 aa  144  9.999999999999999e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3442  glycosyl hydrolase family chitinase  29 
 
 		 414 aa  142  3e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0905047  normal  0.103323 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2862  family 18 glycoside hydrolase  28.27 
 
 		 542 aa  139  3.0000000000000003e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.857011  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2284  Chitinase  28.33 
 
 		 425 aa  137  9.999999999999999e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.455176 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05454  class V chitinase ChiB1 (AFU_orthologue; AFUA_8G01410)  27.34 
 
 		 463 aa  135  3.9999999999999996e-30  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.000620499  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4757  glycoside hydrolase family protein  31.46 
 
 		 364 aa  135  5e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.385862  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0260  basic endochitinase  42.08 
 
 		 553 aa  132  4.0000000000000003e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.361835 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0271  endochitinase  41.58 
 
 		 587 aa  130  9.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.527688  normal  0.775272 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0255  endochitinase  41.58 
 
 		 587 aa  130  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.931196 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0274  endochitinase  41.58 
 
 		 587 aa  129  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0255  endochitinase  41.58 
 
 		 587 aa  129  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.942643 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0868  glycosyl hydrolase family chitinase  27.9 
 
 		 451 aa  129  4.0000000000000003e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0763  Chitinase  26.35 
 
 		 439 aa  129  4.0000000000000003e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.713777  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2572  glycoside hydrolase family protein  31.23 
 
 		 355 aa  128  6e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0142654  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_31390  chitinase endochitinase 1 precursor  26.74 
 
 		 407 aa  128  6e-28  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.888541  normal  0.285609 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02194  hypothetical protein  32.97 
 
 		 985 aa  126  2e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1460  glycosyl hydrolase family chitinase  27.17 
 
 		 763 aa  124  8e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.860815 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0580  glycosyl hydrolase family chitinase  28.11 
 
 		 400 aa  122  3e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0523  Chitinase  26.05 
 
 		 372 aa  121  6e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2268  Chitinase  29.38 
 
 		 382 aa  121  7e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.149886 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3476  chitinase  26.98 
 
 		 499 aa  119  1.9999999999999998e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6134  glycoside hydrolase family 18  25.61 
 
 		 675 aa  118  6e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0040621 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1101  chitinase  38.55 
 
 		 565 aa  118  6e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0603  glycoside hydrolase family protein  28.57 
 
 		 472 aa  116  2.0000000000000002e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.238448  normal  0.0453952 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0218  glycoside hydrolase family 18  30.63 
 
 		 586 aa  114  8.000000000000001e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6135  glycoside hydrolase family 18  25.73 
 
 		 455 aa  114  8.000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0191903 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3148  glycoside hydrolase family 18  29.74 
 
 		 563 aa  112  2.0000000000000002e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00268374  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2070  glycoside hydrolase family protein  28.8 
 
 		 465 aa  112  5e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0638  chitodextrinase  25 
 
 		 1051 aa  110  1e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05077  conserved hypothetical protein  29.9 
 
 		 1782 aa  110  2e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.724169  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05945  chitinase  26.61 
 
 		 1053 aa  109  2e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000210  chitodextrinase precursor  26.16 
 
 		 1054 aa  110  2e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0800752  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2922  glycoside hydrolase family 18  24.52 
 
 		 657 aa  107  1e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.183514  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3982  glycosyl hydrolase family chitinase  24.17 
 
 		 1146 aa  105  3e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.317311 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4555  glycoside hydrolase family protein  26.49 
 
 		 1578 aa  106  3e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2809  glycoside hydrolase family 18  24.88 
 
 		 396 aa  105  6e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2184  Chitinase  26.21 
 
 		 1362 aa  103  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00723588 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1860  glycoside hydrolase family 18  26.57 
 
 		 1127 aa  102  3e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.686097  hitchhiker  0.0000000988456 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2974  PKD domain-containing protein  39.22 
 
 		 833 aa  102  4e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2491  glycoside hydrolase family 18  26.36 
 
 		 1127 aa  102  5e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2604  glycoside hydrolase family protein  26.57 
 
 		 1127 aa  101  7e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0488265  hitchhiker  0.00483231 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>